RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000478087.5

HPS1-211, Transcript of HPS1, biogenesis of lysosomal organelles complex 3 subunit 1, humanhuman

TSL 5

Gene HPS1, Length 971 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HPS1-211ENST00000478087 IGF2-ASQ6U949 168 aa12.9□□□□□ -0.34
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HPS1-211ENST00000478087 GOLGA6L9A6NEM1 432 aa12.87□□□□□ -0.35
HPS1-211ENST00000478087 GPR39O43194 453 aa12.87□□□□□ -0.35
HPS1-211ENST00000478087 GRID2O43424 1007 aa12.87□□□□□ -0.35
HPS1-211ENST00000478087 NUAK1O60285 661 aa12.87□□□□□ -0.35
HPS1-211ENST00000478087 PRAMEF10O60809 474 aa12.87□□□□□ -0.35
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