RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000465425.1

SYNE4-204, Transcript of spectrin repeat containing nuclear envelope family member 4, humanhuman

TSL 2

Gene SYNE4, Length 2,339 nt, Biotype retained intron.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYNE4-204ENST00000465425 H6PDO95479 791 aa18.2■□□□□ 0.5
SYNE4-204ENST00000465425 CHRM3P20309 590 aa18.2■□□□□ 0.5
SYNE4-204ENST00000465425 LPOP22079 712 aaPredicted RBP18.2■□□□□ 0.5
SYNE4-204ENST00000465425 RPS24P62847 133 aaKnown RBP18.2■□□□□ 0.5
SYNE4-204ENST00000465425 PRKCQQ04759 706 aa18.2■□□□□ 0.5
SYNE4-204ENST00000465425 FOXM1Q08050 763 aa18.2■□□□□ 0.5
SYNE4-204ENST00000465425 NFYCQ13952 458 aa18.2■□□□□ 0.5
SYNE4-204ENST00000465425 RBBP7Q16576 425 aa18.2■□□□□ 0.5
SYNE4-204ENST00000465425 C5orf22Q49AR2 442 aa18.2■□□□□ 0.5
SYNE4-204ENST00000465425 OGFOD2Q6N063 350 aa18.2■□□□□ 0.5
SYNE4-204ENST00000465425 PPP4R4Q6NUP7 873 aa18.2■□□□□ 0.5
SYNE4-204ENST00000465425 TXNDC11Q6PKC3 985 aa18.2■□□□□ 0.5
SYNE4-204ENST00000465425 RSPO2Q6UXX9 243 aaPredicted RBP18.2■□□□□ 0.5
SYNE4-204ENST00000465425 CYP2S1Q96SQ9 504 aa18.2■□□□□ 0.5
SYNE4-204ENST00000465425 TDRD1Q9BXT4 1180 aaKnown RBP18.2■□□□□ 0.5
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SYNE4-204ENST00000465425 ACTR3BQ9P1U1 418 aa18.2■□□□□ 0.5
SYNE4-204ENST00000465425 TRMT6Q9UJA5 497 aaKnown RBP18.2■□□□□ 0.5
SYNE4-204ENST00000465425 IKZF3Q9UKT9 509 aa18.2■□□□□ 0.5
SYNE4-204ENST00000465425 MYRFQ9Y2G1 1151 aa18.2■□□□□ 0.5
SYNE4-204ENST00000465425 OAS3Q9Y6K5 1087 aaKnown RBP18.2■□□□□ 0.5
SYNE4-204ENST00000465425 SLC38A8A6NNN8 435 aa18.19■□□□□ 0.5
SYNE4-204ENST00000465425 FXYD1O00168 92 aa18.19■□□□□ 0.5
SYNE4-204ENST00000465425 SOCS2O14508 198 aa18.19■□□□□ 0.5
SYNE4-204ENST00000465425 STX16O14662 325 aa18.19■□□□□ 0.5
SYNE4-204ENST00000465425 BAIAP3O94812 1187 aa18.19■□□□□ 0.5
SYNE4-204ENST00000465425 ESRRBO95718 433 aa18.19■□□□□ 0.5
SYNE4-204ENST00000465425 UROSP10746 265 aa18.19■□□□□ 0.5
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SYNE4-204ENST00000465425 RMND5BQ96G75 393 aaPredicted RBP18.19■□□□□ 0.5
SYNE4-204ENST00000465425 ZNF512Q96ME7 567 aaPredicted RBP18.19■□□□□ 0.5
SYNE4-204ENST00000465425 HGH1Q9BTY7 390 aa18.19■□□□□ 0.5
SYNE4-204ENST00000465425 NUSAP1Q9BXS6 441 aaKnown RBP18.19■□□□□ 0.5
SYNE4-204ENST00000465425 TRIM54Q9BYV2 358 aa18.19■□□□□ 0.5
SYNE4-204ENST00000465425 RBM38Q9H0Z9 239 aaKnown RBP18.19■□□□□ 0.5
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SYNE4-204ENST00000465425 GPR45Q9Y5Y3 372 aa18.19■□□□□ 0.5
SYNE4-204ENST00000465425 VWA8A3KMH1 1905 aa18.19■□□□□ 0.5
SYNE4-204ENST00000465425 A0A1W2PP18 115 aa18.18■□□□□ 0.5
SYNE4-204ENST00000465425 SAC3D1A6NKF1 404 aa18.18■□□□□ 0.5
SYNE4-204ENST00000465425 CBX4O00257 560 aa18.18■□□□□ 0.5
SYNE4-204ENST00000465425 KDELR3O43731 214 aa18.18■□□□□ 0.5
SYNE4-204ENST00000465425 RHOCP08134 193 aa18.18■□□□□ 0.5
SYNE4-204ENST00000465425 PKMP14618 531 aaKnown RBP18.18■□□□□ 0.5
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SYNE4-204ENST00000465425 FUT10Q6P4F1 479 aa18.18■□□□□ 0.5
SYNE4-204ENST00000465425 TRAF7Q6Q0C0 670 aa18.18■□□□□ 0.5
SYNE4-204ENST00000465425 CAMK1DQ8IU85 385 aa18.18■□□□□ 0.5
SYNE4-204ENST00000465425 DENND1CQ8IV53 801 aa18.18■□□□□ 0.5
SYNE4-204ENST00000465425 DIS3LQ8TF46 1054 aaKnown RBP18.18■□□□□ 0.5
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SYNE4-204ENST00000465425 ANKRD60Q9BZ19 345 aa18.18■□□□□ 0.5
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SYNE4-204ENST00000465425 E5RI56 91 aa18.18■□□□□ 0.5
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SYNE4-204ENST00000465425 TPST1O60507 370 aa18.18■□□□□ 0.5
SYNE4-204ENST00000465425 CLDN11O75508 207 aa18.18■□□□□ 0.5
SYNE4-204ENST00000465425 VNN2O95498 520 aa18.18■□□□□ 0.5
SYNE4-204ENST00000465425 NELFEP18615 380 aaKnown RBP18.18■□□□□ 0.5
SYNE4-204ENST00000465425 FASP25445 335 aa18.18■□□□□ 0.5
SYNE4-204ENST00000465425 PRDX3P30048 256 aaKnown RBP18.18■□□□□ 0.5
SYNE4-204ENST00000465425 MC4RP32245 332 aa18.18■□□□□ 0.5
SYNE4-204ENST00000465425 AGTR2P50052 363 aa18.18■□□□□ 0.5
SYNE4-204ENST00000465425 IL2P60568 153 aa18.18■□□□□ 0.5
SYNE4-204ENST00000465425 PLOD1Q02809 727 aaPredicted RBP18.18■□□□□ 0.5
SYNE4-204ENST00000465425 SPATS1Q496A3 300 aa18.18■□□□□ 0.5
SYNE4-204ENST00000465425 ZRANB3Q5FWF4 1079 aa18.18■□□□□ 0.5
SYNE4-204ENST00000465425 RTP2Q5QGT7 225 aa18.18■□□□□ 0.5
SYNE4-204ENST00000465425 SYVN1Q86TM6 617 aa18.18■□□□□ 0.5
SYNE4-204ENST00000465425 GOLM1Q8NBJ4 401 aa18.18■□□□□ 0.5
SYNE4-204ENST00000465425 SIDT2Q8NBJ9 832 aaKnown RBP18.18■□□□□ 0.5
SYNE4-204ENST00000465425 OR56A4Q8NGH8 313 aa18.18■□□□□ 0.5
SYNE4-204ENST00000465425 DNAJB14Q8TBM8 379 aa18.18■□□□□ 0.5
SYNE4-204ENST00000465425 FAM110BQ8TC76 370 aa18.18■□□□□ 0.5
SYNE4-204ENST00000465425 VPS33AQ96AX1 596 aa18.18■□□□□ 0.5
SYNE4-204ENST00000465425 ADGRE3Q9BY15 652 aa18.18■□□□□ 0.5
SYNE4-204ENST00000465425 CD274Q9NZQ7 290 aa18.18■□□□□ 0.5
SYNE4-204ENST00000465425 PCTPQ9UKL6 214 aa18.18■□□□□ 0.5
SYNE4-204ENST00000465425 PCDHB7Q9Y5E2 793 aa18.18■□□□□ 0.5
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SYNE4-204ENST00000465425 H7C4K7 107 aa18.17■□□□□ 0.5
SYNE4-204ENST00000465425 ARPC2O15144 300 aa18.17■□□□□ 0.5
SYNE4-204ENST00000465425 ZNF177Q13360 481 aaPredicted RBP18.17■□□□□ 0.5
SYNE4-204ENST00000465425 RCAN2Q14206 197 aa18.17■□□□□ 0.5
SYNE4-204ENST00000465425 PSAPL1Q6NUJ1 521 aa18.17■□□□□ 0.5
SYNE4-204ENST00000465425 IFNEQ86WN2 208 aa18.17■□□□□ 0.5
SYNE4-204ENST00000465425 PACRGLQ8N7B6 248 aa18.17■□□□□ 0.5
SYNE4-204ENST00000465425 EFHBQ8N7U6 833 aa18.17■□□□□ 0.5
SYNE4-204ENST00000465425 NSMCE3Q96MG7 304 aa18.17■□□□□ 0.5
SYNE4-204ENST00000465425 C1QTNF3Q9BXJ4 246 aa18.17■□□□□ 0.5
SYNE4-204ENST00000465425 ALG2Q9H553 416 aa18.17■□□□□ 0.5
SYNE4-204ENST00000465425 GALPQ9UBC7 116 aa18.17■□□□□ 0.5
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