RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000463533.1

ANKRD28-208, Transcript of ankyrin repeat domain 28, humanhuman

TSL 3

Gene ANKRD28, Length 742 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ANKRD28-208ENST00000463533 TCAF1Q9Y4C2 921 aa8.38□□□□□ -1.07
ANKRD28-208ENST00000463533 V9GYY5 206 aaPredicted RBP8.38□□□□□ -1.07
ANKRD28-208ENST00000463533 A0A0C4DFX4 3053 aa8.38□□□□□ -1.07
ANKRD28-208ENST00000463533 TMEM131Q92545 1883 aa8.38□□□□□ -1.07
ANKRD28-208ENST00000463533 POM121BA6NF01 834 aa8.37□□□□□ -1.07
ANKRD28-208ENST00000463533 MROH6A6NGR9 719 aa8.37□□□□□ -1.07
ANKRD28-208ENST00000463533 PRAMEF26H0Y7S4 382 aa8.37□□□□□ -1.07
ANKRD28-208ENST00000463533 H0Y8X5 98 aa8.37□□□□□ -1.07
ANKRD28-208ENST00000463533 TGFBR3LH3BV60 316 aa8.37□□□□□ -1.07
ANKRD28-208ENST00000463533 K7ESM1 405 aa8.37□□□□□ -1.07
ANKRD28-208ENST00000463533 NDC80O14777 642 aa8.37□□□□□ -1.07
ANKRD28-208ENST00000463533 PPFIA2O75334 1257 aa8.37□□□□□ -1.07
ANKRD28-208ENST00000463533 WNT1P04628 370 aa8.37□□□□□ -1.07
ANKRD28-208ENST00000463533 HNRNPA2B1P22626 353 aaKnown RBP8.37□□□□□ -1.07
ANKRD28-208ENST00000463533 NMBRP28336 390 aa8.37□□□□□ -1.07
ANKRD28-208ENST00000463533 AKT2P31751 481 aa8.37□□□□□ -1.07
ANKRD28-208ENST00000463533 ELK3P41970 407 aa8.37□□□□□ -1.07
ANKRD28-208ENST00000463533 MAGEA3P43357 314 aa8.37□□□□□ -1.07
ANKRD28-208ENST00000463533 CARSP49589 748 aaKnown RBP8.37□□□□□ -1.07
ANKRD28-208ENST00000463533 CREB5Q02930 508 aa8.37□□□□□ -1.07
ANKRD28-208ENST00000463533 SPEM2Q0P670 501 aa8.37□□□□□ -1.07
ANKRD28-208ENST00000463533 PDIA2Q13087 525 aaKnown RBP8.37□□□□□ -1.07
ANKRD28-208ENST00000463533 HLTFQ14527 1009 aaKnown RBP eCLIP8.37□□□□□ -1.07
ANKRD28-208ENST00000463533 INPP5AQ14642 412 aa8.37□□□□□ -1.07
ANKRD28-208ENST00000463533 DNAJC21Q5F1R6 531 aaKnown RBP8.37□□□□□ -1.07
ANKRD28-208ENST00000463533 SPDYCQ5MJ68 293 aa8.37□□□□□ -1.07
ANKRD28-208ENST00000463533 TSTD2Q5T7W7 516 aa8.37□□□□□ -1.07
ANKRD28-208ENST00000463533 ESRP1Q6NXG1 681 aaKnown RBP8.37□□□□□ -1.07
ANKRD28-208ENST00000463533 PNCKQ6P2M8 343 aa8.37□□□□□ -1.07
ANKRD28-208ENST00000463533 LAYNQ6UX15 382 aa8.37□□□□□ -1.07
ANKRD28-208ENST00000463533 FAM151BQ6UXP7 276 aa8.37□□□□□ -1.07
ANKRD28-208ENST00000463533 GCNT7Q6ZNI0 430 aa8.37□□□□□ -1.07
ANKRD28-208ENST00000463533 CHSY3Q70JA7 882 aa8.37□□□□□ -1.07
ANKRD28-208ENST00000463533 IGDCC3Q8IVU1 814 aa8.37□□□□□ -1.07
ANKRD28-208ENST00000463533 IFT20Q8IY31 132 aa8.37□□□□□ -1.07
ANKRD28-208ENST00000463533 NRSN1Q8IZ57 195 aa8.37□□□□□ -1.07
ANKRD28-208ENST00000463533 PDIK1LQ8N165 341 aa8.37□□□□□ -1.07
ANKRD28-208ENST00000463533 ZCCHC9Q8N567 271 aaKnown RBP8.37□□□□□ -1.07
ANKRD28-208ENST00000463533 STYXQ8WUJ0 223 aa8.37□□□□□ -1.07
ANKRD28-208ENST00000463533 DNASE2BQ8WZ79 361 aa8.37□□□□□ -1.07
ANKRD28-208ENST00000463533 AP2M1Q96CW1 435 aa8.37□□□□□ -1.07
ANKRD28-208ENST00000463533 BMFQ96LC9 184 aa8.37□□□□□ -1.07
ANKRD28-208ENST00000463533 LENG8Q96PV6 779 aaPredicted RBP8.37□□□□□ -1.07
ANKRD28-208ENST00000463533 RANBP9Q96S59 729 aa8.37□□□□□ -1.07
ANKRD28-208ENST00000463533 SPATA16Q9BXB7 569 aa8.37□□□□□ -1.07
ANKRD28-208ENST00000463533 C1QTNF7Q9BXJ2 289 aa8.37□□□□□ -1.07
ANKRD28-208ENST00000463533 IL22Q9GZX6 179 aa8.37□□□□□ -1.07
ANKRD28-208ENST00000463533 KCNH6Q9H252 994 aa8.37□□□□□ -1.07
ANKRD28-208ENST00000463533 SUDS3Q9H7L9 328 aaPredicted RBP8.37□□□□□ -1.07
ANKRD28-208ENST00000463533 TM9SF3Q9HD45 589 aa8.37□□□□□ -1.07
ANKRD28-208ENST00000463533 GDF3Q9NR23 364 aa8.37□□□□□ -1.07
ANKRD28-208ENST00000463533 ZDHHC18Q9NUE0 388 aa8.37□□□□□ -1.07
ANKRD28-208ENST00000463533 TMEM74BQ9NUR3 256 aa8.37□□□□□ -1.07
ANKRD28-208ENST00000463533 NLE1Q9NVX2 485 aaPredicted RBP8.37□□□□□ -1.07
ANKRD28-208ENST00000463533 RAB23Q9ULC3 237 aa8.37□□□□□ -1.07
ANKRD28-208ENST00000463533 SOX13Q9UN79 622 aa8.37□□□□□ -1.07
ANKRD28-208ENST00000463533 SMG5Q9UPR3 1016 aaKnown RBP8.37□□□□□ -1.07
ANKRD28-208ENST00000463533 MAD1L1Q9Y6D9 718 aa8.37□□□□□ -1.07
ANKRD28-208ENST00000463533 CACNA1EQ15878 2313 aa8.36□□□□□ -1.07
ANKRD28-208ENST00000463533 PIKFYVEQ9Y2I7 2098 aa8.36□□□□□ -1.07
ANKRD28-208ENST00000463533 RGSL1A5PLK6 1076 aa8.36□□□□□ -1.07
ANKRD28-208ENST00000463533 OR51F1A6NGY5 319 aa8.36□□□□□ -1.07
ANKRD28-208ENST00000463533 FADS2P1A8MWK0 482 aa8.36□□□□□ -1.07
ANKRD28-208ENST00000463533 GAPDHSO14556 408 aaPredicted RBP8.36□□□□□ -1.07
ANKRD28-208ENST00000463533 FPGTO14772 594 aa8.36□□□□□ -1.07
ANKRD28-208ENST00000463533 INPP4BO15327 924 aa8.36□□□□□ -1.07
ANKRD28-208ENST00000463533 UGT1A9O60656 530 aa8.36□□□□□ -1.07
ANKRD28-208ENST00000463533 EPN2O95208 641 aa8.36□□□□□ -1.07
ANKRD28-208ENST00000463533 SOD1P00441 154 aa8.36□□□□□ -1.07
ANKRD28-208ENST00000463533 HOXB4P17483 251 aaPredicted RBP8.36□□□□□ -1.07
ANKRD28-208ENST00000463533 UGT1A6P19224 532 aa8.36□□□□□ -1.07
ANKRD28-208ENST00000463533 UGT1A1P22309 533 aa8.36□□□□□ -1.07
ANKRD28-208ENST00000463533 UGT1A4P22310 534 aa8.36□□□□□ -1.07
ANKRD28-208ENST00000463533 CA5AP35218 305 aa8.36□□□□□ -1.07
ANKRD28-208ENST00000463533 UGT1A3P35503 534 aa8.36□□□□□ -1.07
ANKRD28-208ENST00000463533 UGT1A5P35504 534 aa8.36□□□□□ -1.07
ANKRD28-208ENST00000463533 NUDT1P36639 197 aa8.36□□□□□ -1.07
ANKRD28-208ENST00000463533 SPAM1P38567 509 aa8.36□□□□□ -1.07
ANKRD28-208ENST00000463533 GPR1P46091 355 aa8.36□□□□□ -1.07
ANKRD28-208ENST00000463533 CSNK1EP49674 416 aaKnown RBP8.36□□□□□ -1.07
ANKRD28-208ENST00000463533 ARSDP51689 593 aa8.36□□□□□ -1.07
ANKRD28-208ENST00000463533 XIAPP98170 497 aa8.36□□□□□ -1.07
ANKRD28-208ENST00000463533 PDE1BQ01064 536 aa8.36□□□□□ -1.07
ANKRD28-208ENST00000463533 CAV1Q03135 178 aa8.36□□□□□ -1.07
ANKRD28-208ENST00000463533 PEX6Q13608 980 aa8.36□□□□□ -1.07
ANKRD28-208ENST00000463533 LAMB3Q13751 1172 aa8.36□□□□□ -1.07
ANKRD28-208ENST00000463533 STAT4Q14765 748 aa8.36□□□□□ -1.07
ANKRD28-208ENST00000463533 NAA30Q147X3 362 aaPredicted RBP8.36□□□□□ -1.07
ANKRD28-208ENST00000463533 FASTKD3Q14CZ7 662 aaKnown RBP8.36□□□□□ -1.07
ANKRD28-208ENST00000463533 SMAD1Q15797 465 aaKnown RBP8.36□□□□□ -1.07
ANKRD28-208ENST00000463533 CHRNA6Q15825 494 aa8.36□□□□□ -1.07
ANKRD28-208ENST00000463533 CCDC6Q16204 474 aa8.36□□□□□ -1.07
ANKRD28-208ENST00000463533 SKIDA1Q1XH10 827 aa8.36□□□□□ -1.07
ANKRD28-208ENST00000463533 HENMT1Q5T8I9 393 aaKnown RBP8.36□□□□□ -1.07
ANKRD28-208ENST00000463533 RAET1GQ6H3X3 334 aa8.36□□□□□ -1.07
ANKRD28-208ENST00000463533 Q6ZSR6 202 aa8.36□□□□□ -1.07
ANKRD28-208ENST00000463533 ZNF765Q7L2R6 523 aa8.36□□□□□ -1.07
ANKRD28-208ENST00000463533 NLRP9Q7RTR0 991 aa8.36□□□□□ -1.07
ANKRD28-208ENST00000463533 CCDC25Q86WR0 208 aa8.36□□□□□ -1.07
ANKRD28-208ENST00000463533 SUMF1Q8NBK3 374 aa8.36□□□□□ -1.07
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 32.1 ms