RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000442563.5

RABGEF1-204, Transcript of RAB guanine nucleotide exchange factor 1, humanhuman

TSL 4

Gene RABGEF1, Length 553 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGEF1-204ENST00000442563 CCL4L1Q8NHW4 92 aa16.69■□□□□ 0.26
RABGEF1-204ENST00000442563 STYXQ8WUJ0 223 aa16.69■□□□□ 0.26
RABGEF1-204ENST00000442563 CASS4Q9NQ75 786 aa16.69■□□□□ 0.26
RABGEF1-204ENST00000442563 SMOXQ9NWM0 555 aa16.69■□□□□ 0.26
RABGEF1-204ENST00000442563 RNF14Q9UBS8 474 aa16.69■□□□□ 0.26
RABGEF1-204ENST00000442563 GPR34Q9UPC5 381 aa16.69■□□□□ 0.26
RABGEF1-204ENST00000442563 GPSM3Q9Y4H4 160 aa16.69■□□□□ 0.26
RABGEF1-204ENST00000442563 KCTD3Q9Y597 815 aa16.69■□□□□ 0.26
RABGEF1-204ENST00000442563 MROH6A6NGR9 719 aa16.68■□□□□ 0.26
RABGEF1-204ENST00000442563 AGAP14A8MT82 685 aa16.68■□□□□ 0.26
RABGEF1-204ENST00000442563 H7C0S8 307 aa16.68■□□□□ 0.26
RABGEF1-204ENST00000442563 CHUKO15111 745 aa16.68■□□□□ 0.26
RABGEF1-204ENST00000442563 GRID2O43424 1007 aa16.68■□□□□ 0.26
RABGEF1-204ENST00000442563 PHF2O75151 1096 aa16.68■□□□□ 0.26
RABGEF1-204ENST00000442563 ZNF8P17098 575 aaPredicted RBP16.68■□□□□ 0.26
RABGEF1-204ENST00000442563 XIAPP98170 497 aa16.68■□□□□ 0.26
RABGEF1-204ENST00000442563 CTBSQ01459 385 aa16.68■□□□□ 0.26
RABGEF1-204ENST00000442563 SMAD1Q15797 465 aaKnown RBP16.68■□□□□ 0.26
RABGEF1-204ENST00000442563 LDLRAP1Q5SW96 308 aa16.68■□□□□ 0.26
RABGEF1-204ENST00000442563 CCDC137Q6PK04 289 aaKnown RBP16.68■□□□□ 0.26
RABGEF1-204ENST00000442563 FAM151BQ6UXP7 276 aa16.68■□□□□ 0.26
RABGEF1-204ENST00000442563 PPP1R21Q6ZMI0 780 aa16.68■□□□□ 0.26
RABGEF1-204ENST00000442563 MARK2Q7KZI7 788 aaKnown RBP16.68■□□□□ 0.26
RABGEF1-204ENST00000442563 TMPRSS7Q7RTY8 843 aa16.68■□□□□ 0.26
RABGEF1-204ENST00000442563 CREG2Q8IUH2 290 aa16.68■□□□□ 0.26
RABGEF1-204ENST00000442563 CACTIN-AS1Q8N1I8 211 aa16.68■□□□□ 0.26
RABGEF1-204ENST00000442563 CHCHD4Q8N4Q1 142 aa16.68■□□□□ 0.26
RABGEF1-204ENST00000442563 DNAAF3Q8N9W5 541 aa16.68■□□□□ 0.26
RABGEF1-204ENST00000442563 GPR156Q8NFN8 814 aa16.68■□□□□ 0.26
RABGEF1-204ENST00000442563 OR6C4Q8NGE1 309 aa16.68■□□□□ 0.26
RABGEF1-204ENST00000442563 GRK7Q8WTQ7 553 aa16.68■□□□□ 0.26
RABGEF1-204ENST00000442563 NAT6Q93015 286 aa16.68■□□□□ 0.26
RABGEF1-204ENST00000442563 RANBP9Q96S59 729 aa16.68■□□□□ 0.26
RABGEF1-204ENST00000442563 NLE1Q9NVX2 485 aaPredicted RBP16.68■□□□□ 0.26
RABGEF1-204ENST00000442563 SMARCAL1Q9NZC9 954 aa16.68■□□□□ 0.26
RABGEF1-204ENST00000442563 ZNHIT2Q9UHR6 403 aa16.68■□□□□ 0.26
RABGEF1-204ENST00000442563 ANGPTL2Q9UKU9 493 aa16.68■□□□□ 0.26
RABGEF1-204ENST00000442563 RIMKLBQ9ULI2 386 aa16.68■□□□□ 0.26
RABGEF1-204ENST00000442563 PADI4Q9UM07 663 aa16.68■□□□□ 0.26
RABGEF1-204ENST00000442563 NEU2Q9Y3R4 380 aa16.68■□□□□ 0.26
RABGEF1-204ENST00000442563 SPTBN2O15020 2390 aa16.68■□□□□ 0.26
RABGEF1-204ENST00000442563 LRP4O75096 1905 aa16.67■□□□□ 0.26
RABGEF1-204ENST00000442563 UGT1A9O60656 530 aa16.67■□□□□ 0.26
RABGEF1-204ENST00000442563 SRP72O76094 671 aaKnown RBP16.67■□□□□ 0.26
RABGEF1-204ENST00000442563 CDK14O94921 469 aa16.67■□□□□ 0.26
RABGEF1-204ENST00000442563 KRT14P02533 472 aa16.67■□□□□ 0.26
RABGEF1-204ENST00000442563 UGT1A6P19224 532 aa16.67■□□□□ 0.26
RABGEF1-204ENST00000442563 UGT1A1P22309 533 aa16.67■□□□□ 0.26
RABGEF1-204ENST00000442563 UGT1A4P22310 534 aa16.67■□□□□ 0.26
RABGEF1-204ENST00000442563 ADRA1DP25100 572 aa16.67■□□□□ 0.26
RABGEF1-204ENST00000442563 UGT1A3P35503 534 aa16.67■□□□□ 0.26
RABGEF1-204ENST00000442563 UGT1A5P35504 534 aa16.67■□□□□ 0.26
RABGEF1-204ENST00000442563 MAGEA6P43360 314 aa16.67■□□□□ 0.26
RABGEF1-204ENST00000442563 CLCNKAP51800 687 aa16.67■□□□□ 0.26
RABGEF1-204ENST00000442563 TMEM115Q12893 351 aaPredicted RBP16.67■□□□□ 0.26
RABGEF1-204ENST00000442563 POU6F1Q14863 301 aa16.67■□□□□ 0.26
RABGEF1-204ENST00000442563 SKIDA1Q1XH10 827 aa16.67■□□□□ 0.26
RABGEF1-204ENST00000442563 TMPRSS12Q86WS5 348 aa16.67■□□□□ 0.26
RABGEF1-204ENST00000442563 C17orf82Q86X59 251 aaPredicted RBP16.67■□□□□ 0.26
RABGEF1-204ENST00000442563 GALNT15Q8N3T1 639 aa16.67■□□□□ 0.26
RABGEF1-204ENST00000442563 DDHD1Q8NEL9 900 aa16.67■□□□□ 0.26
RABGEF1-204ENST00000442563 OR13C4Q8NGS5 318 aa16.67■□□□□ 0.26
RABGEF1-204ENST00000442563 OR2AG1Q9H205 316 aa16.67■□□□□ 0.26
RABGEF1-204ENST00000442563 DPEP2Q9H4A9 486 aa16.67■□□□□ 0.26
RABGEF1-204ENST00000442563 UGT1A7Q9HAW7 530 aa16.67■□□□□ 0.26
RABGEF1-204ENST00000442563 UGT1A10Q9HAW8 530 aa16.67■□□□□ 0.26
RABGEF1-204ENST00000442563 UGT1A8Q9HAW9 530 aa16.67■□□□□ 0.26
RABGEF1-204ENST00000442563 SPATS2LQ9NUQ6 558 aaKnown RBP16.67■□□□□ 0.26
RABGEF1-204ENST00000442563 TAAR2Q9P1P5 351 aa16.67■□□□□ 0.26
RABGEF1-204ENST00000442563 GULP1Q9UBP9 304 aa16.67■□□□□ 0.26
RABGEF1-204ENST00000442563 FKBPLQ9UIM3 349 aa16.67■□□□□ 0.26
RABGEF1-204ENST00000442563 NEUROG3Q9Y4Z2 214 aa16.67■□□□□ 0.26
RABGEF1-204ENST00000442563 ST14Q9Y5Y6 855 aa16.67■□□□□ 0.26
RABGEF1-204ENST00000442563 HEATR9A2RTY3 570 aa16.66■□□□□ 0.26
RABGEF1-204ENST00000442563 HYAL3O43820 417 aaPredicted RBP16.66■□□□□ 0.26
RABGEF1-204ENST00000442563 NOBOXO60393 691 aa16.66■□□□□ 0.26
RABGEF1-204ENST00000442563 PRAMEF1O95521 474 aa16.66■□□□□ 0.26
RABGEF1-204ENST00000442563 MYF5P13349 255 aa16.66■□□□□ 0.26
RABGEF1-204ENST00000442563 TPSB2P20231 275 aa16.66■□□□□ 0.26
RABGEF1-204ENST00000442563 AK4P27144 223 aaPredicted RBP16.66■□□□□ 0.26
RABGEF1-204ENST00000442563 GRIA1P42261 906 aa16.66■□□□□ 0.26
RABGEF1-204ENST00000442563 NPY2RP49146 381 aa16.66■□□□□ 0.26
RABGEF1-204ENST00000442563 ETF1P62495 437 aaKnown RBP16.66■□□□□ 0.26
RABGEF1-204ENST00000442563 BASP1P80723 227 aaKnown RBP16.66■□□□□ 0.26
RABGEF1-204ENST00000442563 NFATC2Q13469 925 aa16.66■□□□□ 0.26
RABGEF1-204ENST00000442563 TCEA2Q15560 299 aa16.66■□□□□ 0.26
RABGEF1-204ENST00000442563 TPSAB1Q15661 275 aa16.66■□□□□ 0.26
RABGEF1-204ENST00000442563 GPR33Q49SQ1 333 aa16.66■□□□□ 0.26
RABGEF1-204ENST00000442563 CERCAMQ5T4B2 595 aa16.66■□□□□ 0.26
RABGEF1-204ENST00000442563 ZNF648Q5T619 568 aaPredicted RBP16.66■□□□□ 0.26
RABGEF1-204ENST00000442563 DHRS13Q6UX07 377 aa16.66■□□□□ 0.26
RABGEF1-204ENST00000442563 NLRP9Q7RTR0 991 aa16.66■□□□□ 0.26
RABGEF1-204ENST00000442563 IFI44Q8TCB0 444 aa16.66■□□□□ 0.26
RABGEF1-204ENST00000442563 PEX13Q92968 403 aa16.66■□□□□ 0.26
RABGEF1-204ENST00000442563 ULK4Q96C45 1275 aa16.66■□□□□ 0.26
RABGEF1-204ENST00000442563 CDKN2AIPNLQ96HQ2 116 aa16.66■□□□□ 0.26
RABGEF1-204ENST00000442563 SCNM1Q9BWG6 230 aa16.66■□□□□ 0.26
RABGEF1-204ENST00000442563 ZCCHC2Q9C0B9 1178 aaKnown RBP16.66■□□□□ 0.26
RABGEF1-204ENST00000442563 ASB8Q9H765 288 aa16.66■□□□□ 0.26
RABGEF1-204ENST00000442563 SUDS3Q9H7L9 328 aaPredicted RBP16.66■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 22.1 ms