RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000441222.7

USP46-201, Transcript of ubiquitin specific peptidase 46, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene USP46, Length 7,954 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP46-201ENST00000441222 USP12O75317 370 aa6.64□□□□□ -1.35
USP46-201ENST00000441222 CYP3A4P08684 503 aa6.64□□□□□ -1.35
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USP46-201ENST00000441222 GRK6P43250 576 aa6.64□□□□□ -1.35
USP46-201ENST00000441222 SLC5A9Q2M3M2 681 aa6.64□□□□□ -1.35
USP46-201ENST00000441222 EIF2S3LQ2VIR3 472 aaKnown RBP6.64□□□□□ -1.35
USP46-201ENST00000441222 VSTM1Q6UX27 236 aa6.64□□□□□ -1.35
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USP46-201ENST00000441222 CREG2Q8IUH2 290 aa6.64□□□□□ -1.35
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USP46-201ENST00000441222 CNTD1Q8N815 330 aa6.64□□□□□ -1.35
USP46-201ENST00000441222 CHST4Q8NCG5 386 aa6.64□□□□□ -1.35
USP46-201ENST00000441222 OR2T34Q8NGX1 318 aa6.64□□□□□ -1.35
USP46-201ENST00000441222 OR2T3Q8NH03 318 aa6.64□□□□□ -1.35
USP46-201ENST00000441222 HDAC10Q969S8 669 aa6.64□□□□□ -1.35
USP46-201ENST00000441222 PDGFDQ9GZP0 370 aaPredicted RBP6.64□□□□□ -1.35
USP46-201ENST00000441222 IGFLR1Q9H665 355 aa6.64□□□□□ -1.35
USP46-201ENST00000441222 DHX33Q9H6R0 707 aaKnown RBP6.64□□□□□ -1.35
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USP46-201ENST00000441222 CPA4Q9UI42 421 aa6.64□□□□□ -1.35
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USP46-201ENST00000441222 A0A0J9YYE9 177 aa6.64□□□□□ -1.35
USP46-201ENST00000441222 ELOVL7A1L3X0 281 aa6.64□□□□□ -1.35
USP46-201ENST00000441222 PITPNM1O00562 1244 aa6.64□□□□□ -1.35
USP46-201ENST00000441222 CLDN11O75508 207 aa6.64□□□□□ -1.35
USP46-201ENST00000441222 CCNB2O95067 398 aa6.64□□□□□ -1.35
USP46-201ENST00000441222 TACSTD2P09758 323 aa6.64□□□□□ -1.35
USP46-201ENST00000441222 DPEP1P16444 411 aa6.64□□□□□ -1.35
USP46-201ENST00000441222 TIE1P35590 1138 aa6.64□□□□□ -1.35
USP46-201ENST00000441222 ACAP2Q15057 778 aa6.64□□□□□ -1.35
USP46-201ENST00000441222 TTMPQ5BVD1 217 aa6.64□□□□□ -1.35
USP46-201ENST00000441222 NATD1Q8N6N6 113 aa6.64□□□□□ -1.35
USP46-201ENST00000441222 DCAKDQ8WVC6 231 aa6.64□□□□□ -1.35
USP46-201ENST00000441222 DNASE1L2Q92874 299 aa6.64□□□□□ -1.35
USP46-201ENST00000441222 TESCQ96BS2 214 aa6.64□□□□□ -1.35
USP46-201ENST00000441222 CORO1BQ9BR76 489 aa6.64□□□□□ -1.35
USP46-201ENST00000441222 HTATIP2Q9BUP3 242 aa6.64□□□□□ -1.35
USP46-201ENST00000441222 CDH19Q9H159 772 aa6.64□□□□□ -1.35
USP46-201ENST00000441222 ACSS3Q9H6R3 686 aa6.64□□□□□ -1.35
USP46-201ENST00000441222 RC3H2Q9HBD1 1191 aaKnown RBP6.64□□□□□ -1.35
USP46-201ENST00000441222 THUMPD1Q9NXG2 353 aaKnown RBP6.64□□□□□ -1.35
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USP46-201ENST00000441222 CLDN9O95484 217 aa6.64□□□□□ -1.35
USP46-201ENST00000441222 RB1P06400 928 aa6.64□□□□□ -1.35
USP46-201ENST00000441222 NR2C1P13056 603 aa6.64□□□□□ -1.35
USP46-201ENST00000441222 ZNF823P16415 610 aa6.64□□□□□ -1.35
USP46-201ENST00000441222 UBA1P22314 1058 aaKnown RBP6.64□□□□□ -1.35
USP46-201ENST00000441222 CRHR1P34998 444 aa6.64□□□□□ -1.35
USP46-201ENST00000441222 MAPK10P53779 464 aa6.64□□□□□ -1.35
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USP46-201ENST00000441222 TSPAN5P62079 268 aa6.64□□□□□ -1.35
USP46-201ENST00000441222 ZC3H12AQ5D1E8 599 aaKnown RBP6.64□□□□□ -1.35
USP46-201ENST00000441222 CPNE9Q8IYJ1 553 aa6.64□□□□□ -1.35
USP46-201ENST00000441222 ZNF615Q8N8J6 731 aa6.64□□□□□ -1.35
USP46-201ENST00000441222 MINDY2Q8NBR6 621 aa6.64□□□□□ -1.35
USP46-201ENST00000441222 PRICKLE1Q96MT3 831 aaPredicted RBP6.64□□□□□ -1.35
USP46-201ENST00000441222 MIR1-1HGQ9H1L0 117 aa6.64□□□□□ -1.35
USP46-201ENST00000441222 CHMP1AQ9HD42 196 aaPredicted RBP6.64□□□□□ -1.35
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USP46-201ENST00000441222 H3BM21 787 aa6.64□□□□□ -1.35
USP46-201ENST00000441222 OR1I1O60431 355 aa6.64□□□□□ -1.35
USP46-201ENST00000441222 VIPP01282 170 aa6.64□□□□□ -1.35
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USP46-201ENST00000441222 MAGEA2P43356 314 aa6.64□□□□□ -1.35
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USP46-201ENST00000441222 ARF1P84077 181 aaKnown RBP6.64□□□□□ -1.35
USP46-201ENST00000441222 SLC25A52Q3SY17 297 aa6.64□□□□□ -1.35
USP46-201ENST00000441222 XKR4Q5GH76 650 aa6.64□□□□□ -1.35
USP46-201ENST00000441222 OLFML1Q6UWY5 402 aa6.64□□□□□ -1.35
USP46-201ENST00000441222 BBS12Q6ZW61 710 aa6.64□□□□□ -1.35
USP46-201ENST00000441222 TMPRSS11BQ86T26 416 aa6.64□□□□□ -1.35
USP46-201ENST00000441222 RIOX2Q8IUF8 465 aa6.64□□□□□ -1.35
USP46-201ENST00000441222 ZNF433Q8N7K0 673 aaPredicted RBP6.64□□□□□ -1.35
USP46-201ENST00000441222 DIRAS2Q96HU8 199 aa6.64□□□□□ -1.35
USP46-201ENST00000441222 ZC3H10Q96K80 434 aaKnown RBP6.64□□□□□ -1.35
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USP46-201ENST00000441222 MAF1Q9H063 256 aa6.64□□□□□ -1.35
USP46-201ENST00000441222 SP140LQ9H930 580 aa6.64□□□□□ -1.35
USP46-201ENST00000441222 ZNF490Q9ULM2 529 aaPredicted RBP6.64□□□□□ -1.35
USP46-201ENST00000441222 FADS3Q9Y5Q0 445 aa6.64□□□□□ -1.35
USP46-201ENST00000441222 AP4B1Q9Y6B7 739 aa6.64□□□□□ -1.35
USP46-201ENST00000441222 TEX13CA0A0J9YWL9 993 aa6.64□□□□□ -1.35
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USP46-201ENST00000441222 EFR3AQ14156 821 aa6.64□□□□□ -1.35
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USP46-201ENST00000441222 GALNTL5Q7Z4T8 443 aa6.64□□□□□ -1.35
USP46-201ENST00000441222 ZNF554Q86TJ5 538 aa6.64□□□□□ -1.35
USP46-201ENST00000441222 LAPTM4BQ86VI4 370 aa6.64□□□□□ -1.35
USP46-201ENST00000441222 EPS8L1Q8TE68 723 aa6.64□□□□□ -1.35
USP46-201ENST00000441222 PPP1R14BQ96C90 147 aa6.64□□□□□ -1.35
USP46-201ENST00000441222 BTN2A3PQ96KV6 586 aa6.64□□□□□ -1.35
USP46-201ENST00000441222 PSKH2Q96QS6 385 aa6.64□□□□□ -1.35
USP46-201ENST00000441222 GPATCH1Q9BRR8 931 aaKnown RBP6.64□□□□□ -1.35
USP46-201ENST00000441222 MTFR1LQ9H019 292 aa6.64□□□□□ -1.35
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