RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000439984.7

PCNX1-202, Transcript of pecanex 1, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene PCNX1, Length 6,988 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCNX1-202ENST00000439984 SGTAO43765 313 aa14.58□□□□□ -0.08
PCNX1-202ENST00000439984 HPCAL1P37235 193 aa14.58□□□□□ -0.08
PCNX1-202ENST00000439984 GTF2BQ00403 316 aa14.58□□□□□ -0.08
PCNX1-202ENST00000439984 LAPTM5Q13571 262 aa14.58□□□□□ -0.08
PCNX1-202ENST00000439984 GPR180Q86V85 440 aa14.58□□□□□ -0.08
PCNX1-202ENST00000439984 SLC9A7Q96T83 725 aa14.58□□□□□ -0.08
PCNX1-202ENST00000439984 MAF1Q9H063 256 aa14.58□□□□□ -0.08
PCNX1-202ENST00000439984 TMEM233B4DJY2 109 aa14.58□□□□□ -0.08
PCNX1-202ENST00000439984 H3BNH8 94 aa14.58□□□□□ -0.08
PCNX1-202ENST00000439984 CBX4O00257 560 aa14.58□□□□□ -0.08
PCNX1-202ENST00000439984 FABP3P05413 133 aa14.58□□□□□ -0.08
PCNX1-202ENST00000439984 GBE1Q04446 702 aa14.58□□□□□ -0.08
PCNX1-202ENST00000439984 USF2Q15853 346 aaPredicted RBP14.58□□□□□ -0.08
PCNX1-202ENST00000439984 PLEKHG6Q3KR16 790 aa14.58□□□□□ -0.08
PCNX1-202ENST00000439984 ZNF773Q6PK81 442 aa14.58□□□□□ -0.08
PCNX1-202ENST00000439984 SLC37A3Q8NCC5 494 aa14.58□□□□□ -0.08
PCNX1-202ENST00000439984 TMBIM1Q969X1 311 aa14.58□□□□□ -0.08
PCNX1-202ENST00000439984 ZBTB24O43167 697 aaPredicted RBP14.57□□□□□ -0.08
PCNX1-202ENST00000439984 ECHS1P30084 290 aa14.57□□□□□ -0.08
PCNX1-202ENST00000439984 PNPLA4P41247 253 aa14.57□□□□□ -0.08
PCNX1-202ENST00000439984 PPP2R2DQ66LE6 453 aa14.57□□□□□ -0.08
PCNX1-202ENST00000439984 R3HCC1LQ7Z5L2 792 aaKnown RBP14.57□□□□□ -0.08
PCNX1-202ENST00000439984 BPIFB1Q8TDL5 484 aa14.57□□□□□ -0.08
PCNX1-202ENST00000439984 STARD8Q92502 1023 aa14.57□□□□□ -0.08
PCNX1-202ENST00000439984 MRPL48Q96GC5 212 aaKnown RBP14.57□□□□□ -0.08
PCNX1-202ENST00000439984 MUC13Q9H3R2 512 aa14.57□□□□□ -0.08
PCNX1-202ENST00000439984 CHMP1AQ9HD42 196 aaPredicted RBP14.57□□□□□ -0.08
PCNX1-202ENST00000439984 TMEM9Q9P0T7 183 aa14.57□□□□□ -0.08
PCNX1-202ENST00000439984 DYRK1BQ9Y463 629 aa14.57□□□□□ -0.08
PCNX1-202ENST00000439984 A8MX80 341 aa14.57□□□□□ -0.08
PCNX1-202ENST00000439984 ARPC2O15144 300 aa14.57□□□□□ -0.08
PCNX1-202ENST00000439984 TULP3O75386 442 aa14.57□□□□□ -0.08
PCNX1-202ENST00000439984 RENBPP51606 427 aa14.57□□□□□ -0.08
PCNX1-202ENST00000439984 ZNF404Q494X3 552 aa14.57□□□□□ -0.08
PCNX1-202ENST00000439984 ANKRD13BQ86YJ7 626 aa14.57□□□□□ -0.08
PCNX1-202ENST00000439984 ZDHHC17Q8IUH5 632 aa14.57□□□□□ -0.08
PCNX1-202ENST00000439984 GHDCQ8N2G8 530 aa14.57□□□□□ -0.08
PCNX1-202ENST00000439984 HSFY1Q96LI6 401 aa14.57□□□□□ -0.08
PCNX1-202ENST00000439984 ARL15Q9NXU5 204 aa14.57□□□□□ -0.08
PCNX1-202ENST00000439984 A8MU76 341 aa14.57□□□□□ -0.08
PCNX1-202ENST00000439984 TNFSF9P41273 254 aa14.57□□□□□ -0.08
PCNX1-202ENST00000439984 RORCP51449 518 aa14.57□□□□□ -0.08
PCNX1-202ENST00000439984 ITCHQ96J02 903 aa14.57□□□□□ -0.08
PCNX1-202ENST00000439984 ZNF347Q96SE7 839 aa14.57□□□□□ -0.08
PCNX1-202ENST00000439984 RACGAP1Q9H0H5 632 aa14.57□□□□□ -0.08
PCNX1-202ENST00000439984 HEMK1Q9Y5R4 338 aaPredicted RBP14.57□□□□□ -0.08
PCNX1-202ENST00000439984 GRK4P32298 578 aa14.57□□□□□ -0.08
PCNX1-202ENST00000439984 CDK20Q8IZL9 346 aa14.57□□□□□ -0.08
PCNX1-202ENST00000439984 PRICKLE1Q96MT3 831 aaPredicted RBP14.57□□□□□ -0.08
PCNX1-202ENST00000439984 ZNF559-ZNF177A0A0A6YYI6 481 aaPredicted RBP14.57□□□□□ -0.08
PCNX1-202ENST00000439984 KRBA1A5PL33 1030 aa14.57□□□□□ -0.08
PCNX1-202ENST00000439984 LRCH4O75427 683 aa14.57□□□□□ -0.08
PCNX1-202ENST00000439984 SLC2A2P11168 524 aaPredicted RBP14.57□□□□□ -0.08
PCNX1-202ENST00000439984 GDI2P50395 445 aaKnown RBP14.57□□□□□ -0.08
PCNX1-202ENST00000439984 LIMK2P53671 638 aa14.57□□□□□ -0.08
PCNX1-202ENST00000439984 ZNF177Q13360 481 aaPredicted RBP14.57□□□□□ -0.08
PCNX1-202ENST00000439984 NOTUMQ6P988 496 aa14.57□□□□□ -0.08
PCNX1-202ENST00000439984 SVOPLQ8N434 492 aa14.57□□□□□ -0.08
PCNX1-202ENST00000439984 ZDHHC15Q96MV8 337 aa14.57□□□□□ -0.08
PCNX1-202ENST00000439984 ZNF696Q9H7X3 374 aa14.57□□□□□ -0.08
PCNX1-202ENST00000439984 KLHL28Q9NXS3 571 aa14.57□□□□□ -0.08
PCNX1-202ENST00000439984 TOPAZ1Q8N9V7 1692 aa14.57□□□□□ -0.08
PCNX1-202ENST00000439984 PIP5K1BO14986 540 aa14.57□□□□□ -0.08
PCNX1-202ENST00000439984 DHX15O43143 795 aaKnown RBP14.57□□□□□ -0.08
PCNX1-202ENST00000439984 HBP1O60381 514 aa14.57□□□□□ -0.08
PCNX1-202ENST00000439984 ZBTB7AO95365 584 aa14.57□□□□□ -0.08
PCNX1-202ENST00000439984 ASS1P00966 412 aaKnown RBP14.57□□□□□ -0.08
PCNX1-202ENST00000439984 MSL3P1P0C860 447 aa14.57□□□□□ -0.08
PCNX1-202ENST00000439984 FDX1P10109 184 aa14.57□□□□□ -0.08
PCNX1-202ENST00000439984 ITGA2P17301 1181 aa14.57□□□□□ -0.08
PCNX1-202ENST00000439984 EPORP19235 508 aa14.57□□□□□ -0.08
PCNX1-202ENST00000439984 CPSF6Q16630 551 aaKnown RBP eCLIP14.57□□□□□ -0.08
PCNX1-202ENST00000439984 GPR158Q5T848 1215 aa14.57□□□□□ -0.08
PCNX1-202ENST00000439984 SPATA19Q7Z5L4 167 aa14.57□□□□□ -0.08
PCNX1-202ENST00000439984 FSTL5Q8N475 847 aaPredicted RBP14.57□□□□□ -0.08
PCNX1-202ENST00000439984 TRUB1Q8WWH5 349 aaKnown RBP14.57□□□□□ -0.08
PCNX1-202ENST00000439984 BARD1Q99728 777 aaKnown RBP14.57□□□□□ -0.08
PCNX1-202ENST00000439984 VWA7Q9Y334 891 aa14.57□□□□□ -0.08
PCNX1-202ENST00000439984 ABCB7O75027 752 aa14.56□□□□□ -0.08
PCNX1-202ENST00000439984 PRAMEF1O95521 474 aa14.56□□□□□ -0.08
PCNX1-202ENST00000439984 MAN2A2P49641 1150 aa14.56□□□□□ -0.08
PCNX1-202ENST00000439984 CAMK2GQ13555 558 aaPredicted RBP14.56□□□□□ -0.08
PCNX1-202ENST00000439984 MSS51Q4VC12 460 aa14.56□□□□□ -0.08
PCNX1-202ENST00000439984 TBC1D19Q8N5T2 526 aa14.56□□□□□ -0.08
PCNX1-202ENST00000439984 PLD5Q8N7P1 536 aa14.56□□□□□ -0.08
PCNX1-202ENST00000439984 FAM151AQ8WW52 585 aa14.56□□□□□ -0.08
PCNX1-202ENST00000439984 GTPBP3Q969Y2 492 aaKnown RBP14.56□□□□□ -0.08
PCNX1-202ENST00000439984 CCDC106Q9BWC9 280 aa14.56□□□□□ -0.08
PCNX1-202ENST00000439984 GPN1Q9HCN4 374 aaPredicted RBP14.56□□□□□ -0.08
PCNX1-202ENST00000439984 FARP1Q9Y4F1 1045 aaPredicted RBP14.56□□□□□ -0.08
PCNX1-202ENST00000439984 F5H5T6 163 aa14.56□□□□□ -0.08
PCNX1-202ENST00000439984 USP17L7P0C7H9 530 aa14.56□□□□□ -0.08
PCNX1-202ENST00000439984 MAB21L1Q13394 359 aa14.56□□□□□ -0.08
PCNX1-202ENST00000439984 PPP1R26Q5T8A7 1209 aaPredicted RBP14.56□□□□□ -0.08
PCNX1-202ENST00000439984 PIK3R6Q5UE93 754 aa14.56□□□□□ -0.08
PCNX1-202ENST00000439984 TP53INP1Q96A56 240 aa14.56□□□□□ -0.08
PCNX1-202ENST00000439984 EDARQ9UNE0 448 aa14.56□□□□□ -0.08
PCNX1-202ENST00000439984 NPM3O75607 178 aaKnown RBP14.56□□□□□ -0.08
PCNX1-202ENST00000439984 BCAS2O75934 225 aaPredicted RBP14.56□□□□□ -0.08
PCNX1-202ENST00000439984 SORBS2O94875 1100 aaKnown RBP14.56□□□□□ -0.08
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 22 ms