RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000439561.6

COPB1-202, Transcript of coatomer protein complex subunit beta 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene COPB1, Length 3,382 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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COPB1-202ENST00000439561 TMC5Q6UXY8 1006 aa9□□□□□ -0.97
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COPB1-202ENST00000439561 TMEM151AQ8N4L1 468 aa9□□□□□ -0.97
COPB1-202ENST00000439561 PSD4Q8NDX1 1056 aa9□□□□□ -0.97
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COPB1-202ENST00000439561 OR6J1Q8NGC5 347 aa9□□□□□ -0.97
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COPB1-202ENST00000439561 CLHC1Q8NHS4 586 aa9□□□□□ -0.97
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COPB1-202ENST00000439561 CEP19Q96LK0 163 aa9□□□□□ -0.97
COPB1-202ENST00000439561 C12orf42Q96LP6 360 aa9□□□□□ -0.97
COPB1-202ENST00000439561 REXO4Q9GZR2 422 aaKnown RBP9□□□□□ -0.97
COPB1-202ENST00000439561 NANOGQ9H9S0 305 aa9□□□□□ -0.97
COPB1-202ENST00000439561 HACD3Q9P035 362 aa9□□□□□ -0.97
COPB1-202ENST00000439561 SPATA7Q9P0W8 599 aa9□□□□□ -0.97
COPB1-202ENST00000439561 MARCH4Q9P2E8 410 aaPredicted RBP9□□□□□ -0.97
COPB1-202ENST00000439561 AKAP8LQ9ULX6 646 aaKnown RBP eCLIP9□□□□□ -0.971e-15■□□□□ 8.8
COPB1-202ENST00000439561 CPQQ9Y646 472 aa9□□□□□ -0.97
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COPB1-202ENST00000439561 C1RP00736 705 aa8.99□□□□□ -0.97
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COPB1-202ENST00000439561 PCED1BQ96HM7 432 aa8.99□□□□□ -0.97
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COPB1-202ENST00000439561 KCNAB2Q13303 367 aa8.99□□□□□ -0.97
COPB1-202ENST00000439561 NOL9Q5SY16 702 aaKnown RBP8.99□□□□□ -0.97
COPB1-202ENST00000439561 DHRS4L2Q6PKH6 230 aa8.99□□□□□ -0.97
COPB1-202ENST00000439561 AKAP14Q86UN6 197 aa8.99□□□□□ -0.97
COPB1-202ENST00000439561 CLIP4Q8N3C7 705 aa8.99□□□□□ -0.97
COPB1-202ENST00000439561 MTMR14Q8NCE2 650 aa8.99□□□□□ -0.97
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