RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000428284.2

HOXA4-202, Transcript of homeobox A4, humanhuman

APPRIS P1 TSL 2 BASIC

Gene HOXA4, Length 1,595 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXA4-202ENST00000428284 PIAS1O75925 651 aa20.43■□□□□ 0.86
HOXA4-202ENST00000428284 SLC25A14O95258 325 aaPredicted RBP20.43■□□□□ 0.86
HOXA4-202ENST00000428284 ABHD2P08910 425 aa20.43■□□□□ 0.86
HOXA4-202ENST00000428284 ITPKAP23677 461 aa20.43■□□□□ 0.86
HOXA4-202ENST00000428284 PMLP29590 882 aa20.43■□□□□ 0.86
HOXA4-202ENST00000428284 SLC1A2P43004 574 aa20.43■□□□□ 0.86
HOXA4-202ENST00000428284 CDK3Q00526 305 aa20.43■□□□□ 0.86
HOXA4-202ENST00000428284 KYAT3Q6YP21 454 aaKnown RBP20.43■□□□□ 0.86
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HOXA4-202ENST00000428284 DENND6AQ8IWF6 608 aa20.43■□□□□ 0.86
HOXA4-202ENST00000428284 LMNTD2Q8IXW0 634 aa20.43■□□□□ 0.86
HOXA4-202ENST00000428284 PNPLA1Q8N8W4 532 aa20.43■□□□□ 0.86
HOXA4-202ENST00000428284 GPR150Q8NGU9 434 aa20.43■□□□□ 0.86
HOXA4-202ENST00000428284 BMFQ96LC9 184 aa20.43■□□□□ 0.86
HOXA4-202ENST00000428284 TTC1Q99614 292 aa20.43■□□□□ 0.86
HOXA4-202ENST00000428284 EPB41L4BQ9H329 900 aa20.43■□□□□ 0.86
HOXA4-202ENST00000428284 TMPRSS11EQ9UL52 423 aa20.43■□□□□ 0.86
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HOXA4-202ENST00000428284 AKT1P31749 480 aa20.42■□□□□ 0.86
HOXA4-202ENST00000428284 TRIM23P36406 574 aa20.42■□□□□ 0.86
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HOXA4-202ENST00000428284 SLC29A2Q14542 456 aa20.42■□□□□ 0.86
HOXA4-202ENST00000428284 UAP1Q16222 522 aaPredicted RBP20.42■□□□□ 0.86
HOXA4-202ENST00000428284 KBTBD12Q3ZCT8 623 aa20.42■□□□□ 0.86
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HOXA4-202ENST00000428284 CYS1Q717R9 158 aa20.42■□□□□ 0.86
HOXA4-202ENST00000428284 CTAGE3PQ8IX95 158 aa20.42■□□□□ 0.86
HOXA4-202ENST00000428284 FUBP1Q96AE4 644 aaKnown RBP20.42■□□□□ 0.86
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HOXA4-202ENST00000428284 TEX101Q9BY14 249 aa20.42■□□□□ 0.86
HOXA4-202ENST00000428284 ACSS3Q9H6R3 686 aa20.42■□□□□ 0.86
HOXA4-202ENST00000428284 ARFGAP3Q9NP61 516 aa20.42■□□□□ 0.86
HOXA4-202ENST00000428284 SMYD2Q9NRG4 433 aa20.42■□□□□ 0.86
HOXA4-202ENST00000428284 RABGEF1Q9UJ41 708 aa20.42■□□□□ 0.86
HOXA4-202ENST00000428284 CNOT6Q9ULM6 557 aaKnown RBP20.42■□□□□ 0.86
HOXA4-202ENST00000428284 CACNA1HO95180 2353 aa20.42■□□□□ 0.86
HOXA4-202ENST00000428284 FAM159BA6NKW6 160 aa20.42■□□□□ 0.86
HOXA4-202ENST00000428284 CACNB4O00305 520 aaPredicted RBP20.42■□□□□ 0.86
HOXA4-202ENST00000428284 MTX2O75431 263 aa20.42■□□□□ 0.86
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HOXA4-202ENST00000428284 PPARGP37231 505 aaPredicted RBP20.42■□□□□ 0.86
HOXA4-202ENST00000428284 RACK1P63244 317 aaKnown RBP20.42■□□□□ 0.86
HOXA4-202ENST00000428284 EFTUD2Q15029 972 aaKnown RBP eCLIP20.42■□□□□ 0.863e-6■■■■□ 23.5
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HOXA4-202ENST00000428284 CYTH2Q99418 400 aa20.42■□□□□ 0.86
HOXA4-202ENST00000428284 LGR4Q9BXB1 951 aa20.42■□□□□ 0.86
HOXA4-202ENST00000428284 TM9SF3Q9HD45 589 aa20.42■□□□□ 0.86
HOXA4-202ENST00000428284 FBXO5Q9UKT4 447 aa20.42■□□□□ 0.86
HOXA4-202ENST00000428284 LRP4O75096 1905 aa20.41■□□□□ 0.86
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HOXA4-202ENST00000428284 CXorf49A8MYA2 514 aaPredicted RBP20.41■□□□□ 0.86
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HOXA4-202ENST00000428284 NDUFS3O75489 264 aa20.41■□□□□ 0.86
HOXA4-202ENST00000428284 MYCLP1P12525 358 aaPredicted RBP20.41■□□□□ 0.86
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HOXA4-202ENST00000428284 THOP1P52888 689 aa20.41■□□□□ 0.86
HOXA4-202ENST00000428284 PFN3P60673 137 aa20.41■□□□□ 0.86
HOXA4-202ENST00000428284 MPP1Q00013 466 aa20.41■□□□□ 0.86
HOXA4-202ENST00000428284 LPAL2Q16609 132 aa20.41■□□□□ 0.86
HOXA4-202ENST00000428284 TYSND1Q2T9J0 566 aa20.41■□□□□ 0.86
HOXA4-202ENST00000428284 LDLRAP1Q5SW96 308 aa20.41■□□□□ 0.86
HOXA4-202ENST00000428284 DOK6Q6PKX4 331 aa20.41■□□□□ 0.86
HOXA4-202ENST00000428284 Q6ZSR6 202 aa20.41■□□□□ 0.86
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HOXA4-202ENST00000428284 DDHD1Q8NEL9 900 aa20.41■□□□□ 0.86
HOXA4-202ENST00000428284 OR13H1Q8NG92 308 aa20.41■□□□□ 0.86
HOXA4-202ENST00000428284 COPS8Q99627 209 aa20.41■□□□□ 0.86
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HOXA4-202ENST00000428284 ZDHHC3Q9NYG2 299 aa20.41■□□□□ 0.86
HOXA4-202ENST00000428284 TDRD6O60522 2096 aaKnown RBP20.4■□□□□ 0.86
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HOXA4-202ENST00000428284 CD38P28907 300 aa20.4■□□□□ 0.86
HOXA4-202ENST00000428284 YPEL5P62699 121 aa20.4■□□□□ 0.86
HOXA4-202ENST00000428284 BEND6Q5SZJ8 279 aaPredicted RBP20.4■□□□□ 0.86
HOXA4-202ENST00000428284 ZNF648Q5T619 568 aaPredicted RBP20.4■□□□□ 0.86
HOXA4-202ENST00000428284 RNF187Q5TA31 235 aaPredicted RBP20.4■□□□□ 0.86
HOXA4-202ENST00000428284 KIAA0408Q6ZU52 694 aa20.4■□□□□ 0.86
HOXA4-202ENST00000428284 C2CD4AQ8NCU7 369 aaPredicted RBP20.4■□□□□ 0.86
HOXA4-202ENST00000428284 C1orf216Q8TAB5 229 aa20.4■□□□□ 0.86
HOXA4-202ENST00000428284 FAM174AQ8TBP5 190 aa20.4■□□□□ 0.86
HOXA4-202ENST00000428284 KLHDC7BQ96G42 594 aa20.4■□□□□ 0.86
HOXA4-202ENST00000428284 DCUN1D1Q96GG9 259 aa20.4■□□□□ 0.86
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