RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000422770.5

HERC3-204, Transcript of HECT and RLD domain containing E3 ubiquitin protein ligase 3, humanhuman

TSL 4

Gene HERC3, Length 579 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERC3-204ENST00000422770 GORASP1Q9BQQ3 440 aa9.6□□□□□ -0.87
HERC3-204ENST00000422770 LRRC1Q9BTT6 524 aa9.6□□□□□ -0.87
HERC3-204ENST00000422770 ZSCAN5AQ9BUG6 496 aa9.6□□□□□ -0.87
HERC3-204ENST00000422770 GSDMCQ9BYG8 508 aa9.6□□□□□ -0.87
HERC3-204ENST00000422770 FRMD8Q9BZ67 464 aaPredicted RBP9.6□□□□□ -0.87
HERC3-204ENST00000422770 ZMYND15Q9H091 742 aa9.6□□□□□ -0.87
HERC3-204ENST00000422770 RAB17Q9H0T7 212 aa9.6□□□□□ -0.87
HERC3-204ENST00000422770 OR2AG1Q9H205 316 aa9.6□□□□□ -0.87
HERC3-204ENST00000422770 DPEP2Q9H4A9 486 aa9.6□□□□□ -0.87
HERC3-204ENST00000422770 TRABDQ9H4I3 376 aa9.6□□□□□ -0.87
HERC3-204ENST00000422770 LRRC40Q9H9A6 602 aa9.6□□□□□ -0.87
HERC3-204ENST00000422770 TOR4AQ9NXH8 423 aa9.6□□□□□ -0.87
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HERC3-204ENST00000422770 ARL5AQ9Y689 179 aa9.6□□□□□ -0.87
HERC3-204ENST00000422770 OAS3Q9Y6K5 1087 aaKnown RBP9.6□□□□□ -0.87
HERC3-204ENST00000422770 DGKBQ9Y6T7 804 aa9.6□□□□□ -0.87
HERC3-204ENST00000422770 ARID1BQ8NFD5 2236 aaPredicted RBP9.6□□□□□ -0.87
HERC3-204ENST00000422770 ARHGEF17Q96PE2 2063 aaPredicted RBP9.6□□□□□ -0.87
HERC3-204ENST00000422770 UQCRHLA0A096LP55 91 aa9.59□□□□□ -0.87
HERC3-204ENST00000422770 GLYATL1P3A0A0U1RQE8 302 aa9.59□□□□□ -0.87
HERC3-204ENST00000422770 RGSL1A5PLK6 1076 aa9.59□□□□□ -0.87
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HERC3-204ENST00000422770 PSMD3O43242 534 aa9.59□□□□□ -0.87
HERC3-204ENST00000422770 MTX2O75431 263 aa9.59□□□□□ -0.87
HERC3-204ENST00000422770 METTL18O95568 372 aa9.59□□□□□ -0.87
HERC3-204ENST00000422770 CRTAMO95727 393 aa9.59□□□□□ -0.87
HERC3-204ENST00000422770 SOD1P00441 154 aa9.59□□□□□ -0.87
HERC3-204ENST00000422770 EPOP01588 193 aa9.59□□□□□ -0.87
HERC3-204ENST00000422770 UQCRHP07919 91 aa9.59□□□□□ -0.87
HERC3-204ENST00000422770 JUPP14923 745 aa9.59□□□□□ -0.87
HERC3-204ENST00000422770 TPH1P17752 444 aa9.59□□□□□ -0.87
HERC3-204ENST00000422770 AK4P27144 223 aaPredicted RBP9.59□□□□□ -0.87
HERC3-204ENST00000422770 TEAD1P28347 426 aa9.59□□□□□ -0.87
HERC3-204ENST00000422770 AKT1P31749 480 aa9.59□□□□□ -0.87
HERC3-204ENST00000422770 STIP1P31948 543 aaKnown RBP9.59□□□□□ -0.87
HERC3-204ENST00000422770 HMGCLP35914 325 aa9.59□□□□□ -0.87
HERC3-204ENST00000422770 SPAM1P38567 509 aa9.59□□□□□ -0.87
HERC3-204ENST00000422770 ACTR1BP42025 376 aa9.59□□□□□ -0.87
HERC3-204ENST00000422770 DCDC1P59894 354 aa9.59□□□□□ -0.87
HERC3-204ENST00000422770 ACTR1AP61163 376 aa9.59□□□□□ -0.87
HERC3-204ENST00000422770 BASP1P80723 227 aaKnown RBP9.59□□□□□ -0.87
HERC3-204ENST00000422770 GUCY2DQ02846 1103 aa9.59□□□□□ -0.87
HERC3-204ENST00000422770 GPS1Q13098 491 aa9.59□□□□□ -0.87
HERC3-204ENST00000422770 GTF2H3Q13889 308 aa9.59□□□□□ -0.87
HERC3-204ENST00000422770 PTPRCAPQ14761 206 aa9.59□□□□□ -0.87
HERC3-204ENST00000422770 NAA30Q147X3 362 aaPredicted RBP9.59□□□□□ -0.87
HERC3-204ENST00000422770 ERCC6LQ2NKX8 1250 aa9.59□□□□□ -0.87
HERC3-204ENST00000422770 HES3Q5TGS1 186 aa9.59□□□□□ -0.87
HERC3-204ENST00000422770 IZUMO3Q5VZ72 239 aa9.59□□□□□ -0.87
HERC3-204ENST00000422770 GUSBP11Q6P575 273 aa9.59□□□□□ -0.87
HERC3-204ENST00000422770 SYDE1Q6ZW31 735 aaPredicted RBP9.59□□□□□ -0.87
HERC3-204ENST00000422770 CHST15Q7LFX5 561 aaPredicted RBP9.59□□□□□ -0.87
HERC3-204ENST00000422770 RAB44Q7Z6P3 723 aaPredicted RBP9.59□□□□□ -0.87
HERC3-204ENST00000422770 MARCH9Q86YJ5 346 aa9.59□□□□□ -0.87
HERC3-204ENST00000422770 SLC35F3Q8IY50 421 aa9.59□□□□□ -0.87
HERC3-204ENST00000422770 GALNT15Q8N3T1 639 aa9.59□□□□□ -0.87
HERC3-204ENST00000422770 TTC30BQ8N4P2 665 aa9.59□□□□□ -0.87
HERC3-204ENST00000422770 TRAM1L1Q8N609 369 aa9.59□□□□□ -0.87
HERC3-204ENST00000422770 DNAAF3Q8N9W5 541 aa9.59□□□□□ -0.87
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HERC3-204ENST00000422770 EID2BQ96D98 161 aa9.59□□□□□ -0.87
HERC3-204ENST00000422770 TBATAQ96M53 351 aa9.59□□□□□ -0.87
HERC3-204ENST00000422770 TTC25Q96NG3 672 aa9.59□□□□□ -0.87
HERC3-204ENST00000422770 OSGEPL1Q9H4B0 414 aa9.59□□□□□ -0.87
HERC3-204ENST00000422770 RAB6BQ9NRW1 208 aa9.59□□□□□ -0.87
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HERC3-204ENST00000422770 NCKIPSDQ9NZQ3 722 aa9.59□□□□□ -0.87
HERC3-204ENST00000422770 PADI4Q9UM07 663 aa9.59□□□□□ -0.87
HERC3-204ENST00000422770 UTP11Q9Y3A2 253 aaKnown RBP9.59□□□□□ -0.87
HERC3-204ENST00000422770 PLEKHM1Q9Y4G2 1056 aa9.59□□□□□ -0.87
HERC3-204ENST00000422770 KCTD3Q9Y597 815 aa9.59□□□□□ -0.87
HERC3-204ENST00000422770 PCDHGA1Q9Y5H4 931 aa9.59□□□□□ -0.87
HERC3-204ENST00000422770 ACACBO00763 2458 aa9.59□□□□□ -0.87
HERC3-204ENST00000422770 GOLGA4Q13439 2230 aaKnown RBP9.59□□□□□ -0.87
HERC3-204ENST00000422770 EPG5Q9HCE0 2579 aa9.59□□□□□ -0.87
HERC3-204ENST00000422770 GPR39O43194 453 aa9.58□□□□□ -0.88
HERC3-204ENST00000422770 SNX2O60749 519 aa9.58□□□□□ -0.88
HERC3-204ENST00000422770 IVLP07476 585 aa9.58□□□□□ -0.88
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HERC3-204ENST00000422770 CKMT1AP12532 417 aa9.58□□□□□ -0.88
HERC3-204ENST00000422770 ACP5P13686 325 aa9.58□□□□□ -0.88
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HERC3-204ENST00000422770 ACP1P24666 158 aa9.58□□□□□ -0.88
HERC3-204ENST00000422770 ADRA1AP35348 466 aa9.58□□□□□ -0.88
HERC3-204ENST00000422770 FDFT1P37268 417 aa9.58□□□□□ -0.88
HERC3-204ENST00000422770 ADCY8P40145 1251 aa9.58□□□□□ -0.88
HERC3-204ENST00000422770 CTBSQ01459 385 aa9.58□□□□□ -0.88
HERC3-204ENST00000422770 HLTFQ14527 1009 aaKnown RBP eCLIP9.58□□□□□ -0.88
HERC3-204ENST00000422770 POU6F1Q14863 301 aa9.58□□□□□ -0.88
HERC3-204ENST00000422770 TAF1AQ15573 450 aaPredicted RBP9.58□□□□□ -0.88
HERC3-204ENST00000422770 CHRNA6Q15825 494 aa9.58□□□□□ -0.88
HERC3-204ENST00000422770 INSCQ1MX18 579 aa9.58□□□□□ -0.88
HERC3-204ENST00000422770 ZDHHC20Q5W0Z9 365 aa9.58□□□□□ -0.88
HERC3-204ENST00000422770 LVRNQ6Q4G3 990 aa9.58□□□□□ -0.88
HERC3-204ENST00000422770 LINC00523Q86TU6 105 aa9.58□□□□□ -0.88
HERC3-204ENST00000422770 TRAPPC5Q8IUR0 188 aa9.58□□□□□ -0.88
HERC3-204ENST00000422770 RAVER1Q8IY67 606 aaKnown RBP9.58□□□□□ -0.88
HERC3-204ENST00000422770 ARL10Q8N8L6 244 aa9.58□□□□□ -0.88
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