RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000419445.5

PGGT1B-203, Transcript of protein geranylgeranyltransferase type I subunit beta, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene PGGT1B, Length 9,545 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PGGT1B-203ENST00000419445 BBIP1A8MTZ0 92 aa3.61□□□□□ -1.83
PGGT1B-203ENST00000419445 H7C0S8 307 aa3.61□□□□□ -1.83
PGGT1B-203ENST00000419445 J3KR12 359 aa3.61□□□□□ -1.83
PGGT1B-203ENST00000419445 MSI1O43347 362 aaKnown RBP3.61□□□□□ -1.83
PGGT1B-203ENST00000419445 WBP4O75554 376 aaKnown RBP3.61□□□□□ -1.83
PGGT1B-203ENST00000419445 HTR1BP28222 390 aa3.61□□□□□ -1.83
PGGT1B-203ENST00000419445 CTGFP29279 349 aa3.61□□□□□ -1.83
PGGT1B-203ENST00000419445 SULT1E1P49888 294 aa3.61□□□□□ -1.83
PGGT1B-203ENST00000419445 ADARP55265 1226 aaKnown RBP3.61□□□□□ -1.83
PGGT1B-203ENST00000419445 EEFSECP57772 596 aaKnown RBP3.61□□□□□ -1.83
PGGT1B-203ENST00000419445 LCP2Q13094 533 aa3.61□□□□□ -1.83
PGGT1B-203ENST00000419445 SLC14A1Q13336 389 aa3.61□□□□□ -1.83
PGGT1B-203ENST00000419445 CDKN3Q16667 212 aa3.61□□□□□ -1.83
PGGT1B-203ENST00000419445 NOTUMQ6P988 496 aa3.61□□□□□ -1.83
PGGT1B-203ENST00000419445 TRPV1Q8NER1 839 aa3.61□□□□□ -1.83
PGGT1B-203ENST00000419445 TRPC4APQ8TEL6 797 aa3.61□□□□□ -1.83
PGGT1B-203ENST00000419445 IGSF8Q969P0 613 aa3.61□□□□□ -1.83
PGGT1B-203ENST00000419445 LRRC58Q96CX6 371 aa3.61□□□□□ -1.83
PGGT1B-203ENST00000419445 TMEM74Q96NL1 305 aa3.61□□□□□ -1.83
PGGT1B-203ENST00000419445 TINF2Q9BSI4 451 aa3.61□□□□□ -1.83
PGGT1B-203ENST00000419445 OSBPL6Q9BZF3 934 aa3.61□□□□□ -1.83
PGGT1B-203ENST00000419445 CHST8Q9H2A9 424 aa3.61□□□□□ -1.83
PGGT1B-203ENST00000419445 ATP13A3Q9H7F0 1226 aa3.61□□□□□ -1.83
PGGT1B-203ENST00000419445 IFT80Q9P2H3 777 aaPredicted RBP3.61□□□□□ -1.83
PGGT1B-203ENST00000419445 PPP1R1BQ9UD71 204 aaPredicted RBP3.61□□□□□ -1.83
PGGT1B-203ENST00000419445 TCEAL9Q9UHQ7 104 aa3.61□□□□□ -1.83
PGGT1B-203ENST00000419445 ERGIC3Q9Y282 383 aa3.61□□□□□ -1.83
PGGT1B-203ENST00000419445 PCDHB3Q9Y5E6 796 aa3.61□□□□□ -1.83
PGGT1B-203ENST00000419445 SCN8AQ9UQD0 1980 aa3.61□□□□□ -1.83
PGGT1B-203ENST00000419445 PIP5K1BO14986 540 aa3.6□□□□□ -1.83
PGGT1B-203ENST00000419445 MT-CO1P00395 513 aa3.6□□□□□ -1.83
PGGT1B-203ENST00000419445 CLCN5P51795 746 aa3.6□□□□□ -1.83
PGGT1B-203ENST00000419445 MOGQ16653 247 aa3.6□□□□□ -1.83
PGGT1B-203ENST00000419445 AGKQ53H12 422 aa3.6□□□□□ -1.83
PGGT1B-203ENST00000419445 HECTD2Q5U5R9 776 aa3.6□□□□□ -1.83
PGGT1B-203ENST00000419445 LDB1Q86U70 411 aaPredicted RBP3.6□□□□□ -1.83
PGGT1B-203ENST00000419445 CADM3Q8N126 398 aa3.6□□□□□ -1.83
PGGT1B-203ENST00000419445 GALNT4Q8N4A0 578 aa3.6□□□□□ -1.83
PGGT1B-203ENST00000419445 SLC15A4Q8N697 577 aa3.6□□□□□ -1.83
PGGT1B-203ENST00000419445 EME1Q96AY2 570 aa3.6□□□□□ -1.83
PGGT1B-203ENST00000419445 BIRC7Q96CA5 298 aa3.6□□□□□ -1.83
PGGT1B-203ENST00000419445 C19orf60Q96EN9 201 aa3.6□□□□□ -1.83
PGGT1B-203ENST00000419445 CDCA5Q96FF9 252 aa3.6□□□□□ -1.83
PGGT1B-203ENST00000419445 OTUD5Q96G74 571 aa3.6□□□□□ -1.83
PGGT1B-203ENST00000419445 TNIP3Q96KP6 325 aa3.6□□□□□ -1.83
PGGT1B-203ENST00000419445 ZNF560Q96MR9 790 aa3.6□□□□□ -1.83
PGGT1B-203ENST00000419445 ACOX2Q99424 681 aa3.6□□□□□ -1.83
PGGT1B-203ENST00000419445 ARMC7Q9H6L4 198 aa3.6□□□□□ -1.83
PGGT1B-203ENST00000419445 CCDC167Q9P0B6 97 aa3.6□□□□□ -1.83
PGGT1B-203ENST00000419445 KLK14Q9P0G3 267 aa3.6□□□□□ -1.83
PGGT1B-203ENST00000419445 MAN2B2Q9Y2E5 1009 aa3.6□□□□□ -1.83
PGGT1B-203ENST00000419445 FADS3Q9Y5Q0 445 aa3.6□□□□□ -1.83
PGGT1B-203ENST00000419445 DHRS12A0PJE2 317 aa3.6□□□□□ -1.83
PGGT1B-203ENST00000419445 LCHNA4D1U4 455 aa3.6□□□□□ -1.83
PGGT1B-203ENST00000419445 PABPN1LA6NDY0 278 aaKnown RBP3.6□□□□□ -1.83
PGGT1B-203ENST00000419445 TRPC5OSA6NMA1 111 aa3.6□□□□□ -1.83
PGGT1B-203ENST00000419445 UGT2B11O75310 529 aa3.6□□□□□ -1.83
PGGT1B-203ENST00000419445 PAGE1O75459 146 aa3.6□□□□□ -1.83
PGGT1B-203ENST00000419445 GPIP06744 558 aa3.6□□□□□ -1.83
PGGT1B-203ENST00000419445 PSMC3P17980 439 aa3.6□□□□□ -1.83
PGGT1B-203ENST00000419445 CES1P23141 567 aa3.6□□□□□ -1.83
PGGT1B-203ENST00000419445 HTR1EP28566 365 aa3.6□□□□□ -1.83
PGGT1B-203ENST00000419445 CLCNKBP51801 687 aa3.6□□□□□ -1.83
PGGT1B-203ENST00000419445 TMBIM6P55061 237 aa3.6□□□□□ -1.83
PGGT1B-203ENST00000419445 RAB15P59190 212 aa3.6□□□□□ -1.83
PGGT1B-203ENST00000419445 SPCS2Q15005 226 aa3.6□□□□□ -1.83
PGGT1B-203ENST00000419445 ADPRMQ3LIE5 342 aa3.6□□□□□ -1.83
PGGT1B-203ENST00000419445 LRIF1Q5T3J3 769 aa3.6□□□□□ -1.83
PGGT1B-203ENST00000419445 NADSYN1Q6IA69 706 aa3.6□□□□□ -1.83
PGGT1B-203ENST00000419445 ZBTB49Q6ZSB9 765 aa3.6□□□□□ -1.83
PGGT1B-203ENST00000419445 LRRC49Q8IUZ0 686 aa3.6□□□□□ -1.83
PGGT1B-203ENST00000419445 OR52B6Q8NGF0 335 aa3.6□□□□□ -1.83
PGGT1B-203ENST00000419445 DYNC2LI1Q8TCX1 351 aa3.6□□□□□ -1.83
PGGT1B-203ENST00000419445 CD200R1Q8TD46 325 aa3.6□□□□□ -1.83
PGGT1B-203ENST00000419445 RSPH1Q8WYR4 309 aa3.6□□□□□ -1.83
PGGT1B-203ENST00000419445 ACBD6Q9BR61 282 aa3.6□□□□□ -1.83
PGGT1B-203ENST00000419445 POMKQ9H5K3 350 aa3.6□□□□□ -1.83
PGGT1B-203ENST00000419445 TMEM184CQ9NVA4 438 aa3.6□□□□□ -1.83
PGGT1B-203ENST00000419445 TBC1D13Q9NVG8 400 aa3.6□□□□□ -1.83
PGGT1B-203ENST00000419445 ASIC5Q9NY37 505 aa3.6□□□□□ -1.83
PGGT1B-203ENST00000419445 SMPD3Q9NY59 655 aaPredicted RBP3.6□□□□□ -1.83
PGGT1B-203ENST00000419445 SCHIP1Q9P0W5 487 aaPredicted RBP3.6□□□□□ -1.83
PGGT1B-203ENST00000419445 KLHL8Q9P2G9 620 aaPredicted RBP3.6□□□□□ -1.83
PGGT1B-203ENST00000419445 REV3LO60673 3130 aa3.6□□□□□ -1.83
PGGT1B-203ENST00000419445 A0A087WXM4 84 aa3.6□□□□□ -1.83
PGGT1B-203ENST00000419445 GPR39O43194 453 aa3.6□□□□□ -1.83
PGGT1B-203ENST00000419445 CLASP2O75122 1294 aaKnown RBP3.6□□□□□ -1.83
PGGT1B-203ENST00000419445 ZNF189O75820 626 aaPredicted RBP3.6□□□□□ -1.83
PGGT1B-203ENST00000419445 OAZ2O95190 189 aa3.6□□□□□ -1.83
PGGT1B-203ENST00000419445 ESRRBO95718 433 aa3.6□□□□□ -1.83
PGGT1B-203ENST00000419445 PLA2G16P53816 162 aa3.6□□□□□ -1.83
PGGT1B-203ENST00000419445 TUBA3CQ13748 450 aa3.6□□□□□ -1.83
PGGT1B-203ENST00000419445 FASTKQ14296 549 aaKnown RBP3.6□□□□□ -1.83
PGGT1B-203ENST00000419445 BRMS1LQ5PSV4 323 aa3.6□□□□□ -1.83
PGGT1B-203ENST00000419445 OFCC1Q8IZS5 231 aa3.6□□□□□ -1.83
PGGT1B-203ENST00000419445 HS3ST5Q8IZT8 346 aa3.6□□□□□ -1.83
PGGT1B-203ENST00000419445 TTC30BQ8N4P2 665 aa3.6□□□□□ -1.83
PGGT1B-203ENST00000419445 TRUB1Q8WWH5 349 aaKnown RBP3.6□□□□□ -1.83
PGGT1B-203ENST00000419445 FGF11Q92914 225 aa3.6□□□□□ -1.83
PGGT1B-203ENST00000419445 PITX2Q99697 317 aa3.6□□□□□ -1.83
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 28.1 ms