RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000411092.1

RNU6-55P-201, Transcript of RNA, U6 small nuclear 55, pseudogene, humanhuman

BASIC

Gene RNU6-55P, Length 107 nt, Biotype snRNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNU6-55P-201ENST00000411092 CYP3A43Q9HB55 503 aa3.58□□□□□ -1.84
RNU6-55P-201ENST00000411092 POPDC2Q9HBU9 364 aa3.58□□□□□ -1.84
RNU6-55P-201ENST00000411092 APOBEC3GQ9HC16 384 aaKnown RBP3.58□□□□□ -1.84
RNU6-55P-201ENST00000411092 XPNPEP1Q9NQW7 623 aa3.58□□□□□ -1.84
RNU6-55P-201ENST00000411092 PXMP2Q9NR77 195 aa3.58□□□□□ -1.84
RNU6-55P-201ENST00000411092 CISHQ9NSE2 258 aa3.58□□□□□ -1.84
RNU6-55P-201ENST00000411092 TBCCD1Q9NVR7 557 aa3.58□□□□□ -1.84
RNU6-55P-201ENST00000411092 CHCHD3Q9NX63 227 aaKnown RBP3.58□□□□□ -1.84
RNU6-55P-201ENST00000411092 RNF181Q9P0P0 153 aa3.58□□□□□ -1.84
RNU6-55P-201ENST00000411092 COL20A1Q9P218 1284 aa3.58□□□□□ -1.84
RNU6-55P-201ENST00000411092 DCDC2Q9UHG0 476 aa3.58□□□□□ -1.84
RNU6-55P-201ENST00000411092 ADAM28Q9UKQ2 775 aa3.58□□□□□ -1.84
RNU6-55P-201ENST00000411092 ARHGAP26Q9UNA1 814 aa3.58□□□□□ -1.84
RNU6-55P-201ENST00000411092 CHMP2BQ9UQN3 213 aa3.58□□□□□ -1.84
RNU6-55P-201ENST00000411092 DMTF1Q9Y222 760 aa3.58□□□□□ -1.84
RNU6-55P-201ENST00000411092 TTLL3Q9Y4R7 772 aa3.58□□□□□ -1.84
RNU6-55P-201ENST00000411092 MAD1L1Q9Y6D9 718 aa3.58□□□□□ -1.84
RNU6-55P-201ENST00000411092 SF3B1O75533 1304 aaKnown RBP eCLIP3.58□□□□□ -1.84
RNU6-55P-201ENST00000411092 CNTNAP2Q9UHC6 1331 aa3.58□□□□□ -1.84
RNU6-55P-201ENST00000411092 PHIPQ8WWQ0 1821 aa3.58□□□□□ -1.84
RNU6-55P-201ENST00000411092 A0A088AWK7 358 aa3.57□□□□□ -1.84
RNU6-55P-201ENST00000411092 C15orf38-AP3S2A0A0A6YYH1 394 aa3.57□□□□□ -1.84
RNU6-55P-201ENST00000411092 WDR91A4D1P6 747 aa3.57□□□□□ -1.84
RNU6-55P-201ENST00000411092 ARHGAP42A6NI28 874 aa3.57□□□□□ -1.84
RNU6-55P-201ENST00000411092 SLC15A5A6NIM6 579 aa3.57□□□□□ -1.84
RNU6-55P-201ENST00000411092 MARCH11A6NNE9 402 aa3.57□□□□□ -1.84
RNU6-55P-201ENST00000411092 KPNA7A9QM74 516 aa3.57□□□□□ -1.84
RNU6-55P-201ENST00000411092 HACD1B0YJ81 288 aa3.57□□□□□ -1.84
RNU6-55P-201ENST00000411092 SLCO1B7G3V0H7 640 aa3.57□□□□□ -1.84
RNU6-55P-201ENST00000411092 GOLGA8SH3BPF8 625 aa3.57□□□□□ -1.84
RNU6-55P-201ENST00000411092 GOLGA8MH3BSY2 632 aa3.57□□□□□ -1.84
RNU6-55P-201ENST00000411092 GOLGA8RI6L899 631 aa3.57□□□□□ -1.84
RNU6-55P-201ENST00000411092 ZNF701M0R085 212 aaPredicted RBP3.57□□□□□ -1.84
RNU6-55P-201ENST00000411092 AP3B1O00203 1094 aa3.57□□□□□ -1.84
RNU6-55P-201ENST00000411092 APOL1O14791 398 aa3.57□□□□□ -1.84
RNU6-55P-201ENST00000411092 MDM4O15151 490 aa3.57□□□□□ -1.84
RNU6-55P-201ENST00000411092 OGTO15294 1046 aa3.57□□□□□ -1.84
RNU6-55P-201ENST00000411092 PRPSAP2O60256 369 aa3.57□□□□□ -1.84
RNU6-55P-201ENST00000411092 RNASEH1O60930 286 aaKnown RBP3.57□□□□□ -1.84
RNU6-55P-201ENST00000411092 GCATO75600 419 aa3.57□□□□□ -1.84
RNU6-55P-201ENST00000411092 RFPL1O75677 317 aa3.57□□□□□ -1.84
RNU6-55P-201ENST00000411092 TRUB2O95900 331 aaKnown RBP3.57□□□□□ -1.84
RNU6-55P-201ENST00000411092 CLPTM1O96005 669 aa3.57□□□□□ -1.84
RNU6-55P-201ENST00000411092 C1QAP02745 245 aa3.57□□□□□ -1.84
RNU6-55P-201ENST00000411092 CFIP05156 583 aa3.57□□□□□ -1.84
RNU6-55P-201ENST00000411092 ELANEP08246 267 aa3.57□□□□□ -1.84
RNU6-55P-201ENST00000411092 UBTFL6P0CB48 400 aaPredicted RBP3.57□□□□□ -1.84
RNU6-55P-201ENST00000411092 THRAP10827 490 aa3.57□□□□□ -1.84
RNU6-55P-201ENST00000411092 EGR2P11161 476 aaPredicted RBP3.57□□□□□ -1.84
RNU6-55P-201ENST00000411092 ETS1P14921 441 aa3.57□□□□□ -1.84
RNU6-55P-201ENST00000411092 TYRP1P17643 537 aa3.57□□□□□ -1.84
RNU6-55P-201ENST00000411092 ATICP31939 592 aa3.57□□□□□ -1.84
RNU6-55P-201ENST00000411092 ICAM3P32942 547 aa3.57□□□□□ -1.84
RNU6-55P-201ENST00000411092 ARL2P36404 184 aa3.57□□□□□ -1.84
RNU6-55P-201ENST00000411092 FDFT1P37268 417 aa3.57□□□□□ -1.84
RNU6-55P-201ENST00000411092 PLA2G5P39877 138 aa3.57□□□□□ -1.84
RNU6-55P-201ENST00000411092 HARS2P49590 506 aaKnown RBP3.57□□□□□ -1.84
RNU6-55P-201ENST00000411092 ACADVLP49748 655 aa3.57□□□□□ -1.84
RNU6-55P-201ENST00000411092 NUMBP49757 651 aa3.57□□□□□ -1.84
RNU6-55P-201ENST00000411092 CACNB3P54284 484 aa3.57□□□□□ -1.84
RNU6-55P-201ENST00000411092 ALDH18A1P54886 795 aaKnown RBP3.57□□□□□ -1.84
RNU6-55P-201ENST00000411092 NR1H2P55055 460 aa3.57□□□□□ -1.84
RNU6-55P-201ENST00000411092 MTTPP55157 894 aa3.57□□□□□ -1.84
RNU6-55P-201ENST00000411092 RAP2BP61225 183 aa3.57□□□□□ -1.84
RNU6-55P-201ENST00000411092 PSMC1P62191 440 aaKnown RBP3.57□□□□□ -1.84
RNU6-55P-201ENST00000411092 RPS6P62753 249 aaKnown RBP3.57□□□□□ -1.84
RNU6-55P-201ENST00000411092 CNTNAP1P78357 1384 aa3.57□□□□□ -1.84
RNU6-55P-201ENST00000411092 MRPS5P82675 430 aaKnown RBP3.57□□□□□ -1.84
RNU6-55P-201ENST00000411092 ARHGAP8P85298 464 aa3.57□□□□□ -1.84
RNU6-55P-201ENST00000411092 OGDHQ02218 1023 aa3.57□□□□□ -1.84
RNU6-55P-201ENST00000411092 KDSRQ06136 332 aa3.57□□□□□ -1.84
RNU6-55P-201ENST00000411092 SULT2A1Q06520 285 aa3.57□□□□□ -1.84
RNU6-55P-201ENST00000411092 ILF2Q12905 390 aaKnown RBP3.57□□□□□ -1.84
RNU6-55P-201ENST00000411092 SEMA5AQ13591 1074 aa3.57□□□□□ -1.84
RNU6-55P-201ENST00000411092 TNFAIP1Q13829 316 aa3.57□□□□□ -1.84
RNU6-55P-201ENST00000411092 CYLC2Q14093 348 aaPredicted RBP3.57□□□□□ -1.84
RNU6-55P-201ENST00000411092 DPYSQ14117 519 aa3.57□□□□□ -1.84
RNU6-55P-201ENST00000411092 KRT81Q14533 505 aa3.57□□□□□ -1.84
RNU6-55P-201ENST00000411092 MXD4Q14582 209 aaPredicted RBP3.57□□□□□ -1.84
RNU6-55P-201ENST00000411092 PDK3Q15120 406 aa3.57□□□□□ -1.84
RNU6-55P-201ENST00000411092 LLGL1Q15334 1064 aa3.57□□□□□ -1.84
RNU6-55P-201ENST00000411092 SHROOM1Q2M3G4 852 aaPredicted RBP3.57□□□□□ -1.84
RNU6-55P-201ENST00000411092 RALGAPA2Q2PPJ7 1873 aa3.57□□□□□ -1.84
RNU6-55P-201ENST00000411092 ZNF699Q32M78 642 aa3.57□□□□□ -1.84
RNU6-55P-201ENST00000411092 CCDC14Q49A88 953 aa3.57□□□□□ -1.84
RNU6-55P-201ENST00000411092 CFAP157Q5JU67 520 aa3.57□□□□□ -1.84
RNU6-55P-201ENST00000411092 ABHD17BQ5VST6 288 aa3.57□□□□□ -1.84
RNU6-55P-201ENST00000411092 SLC9A4Q6AI14 798 aa3.57□□□□□ -1.84
RNU6-55P-201ENST00000411092 MED25Q71SY5 747 aa3.57□□□□□ -1.84
RNU6-55P-201ENST00000411092 ARPINQ7Z6K5 226 aa3.57□□□□□ -1.84
RNU6-55P-201ENST00000411092 TTC7BQ86TV6 843 aa3.57□□□□□ -1.84
RNU6-55P-201ENST00000411092 KBTBD6Q86V97 674 aa3.57□□□□□ -1.84
RNU6-55P-201ENST00000411092 SPATA24Q86W54 205 aa3.57□□□□□ -1.84
RNU6-55P-201ENST00000411092 ZDHHC17Q8IUH5 632 aa3.57□□□□□ -1.84
RNU6-55P-201ENST00000411092 PSTKQ8IV42 348 aaKnown RBP3.57□□□□□ -1.84
RNU6-55P-201ENST00000411092 CROCCP3Q8IVE0 287 aa3.57□□□□□ -1.84
RNU6-55P-201ENST00000411092 UNC45BQ8IWX7 931 aa3.57□□□□□ -1.84
RNU6-55P-201ENST00000411092 CTAGE3PQ8IX95 158 aa3.57□□□□□ -1.84
RNU6-55P-201ENST00000411092 NDUFAF2Q8N183 169 aa3.57□□□□□ -1.84
RNU6-55P-201ENST00000411092 FBXW8Q8N3Y1 598 aa3.57□□□□□ -1.84
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 20.5 ms