RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000384139.1

RNU6-187P-201, Transcript of RNA, U6 small nuclear 187, pseudogene, humanhuman

BASIC

Gene RNU6-187P, Length 106 nt, Biotype snRNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNU6-187P-201ENST00000384139 A0A1W2PQ67 120 aa0.73□□□□□ -2.29
RNU6-187P-201ENST00000384139 HSPB2A8KAH6 182 aa0.73□□□□□ -2.29
RNU6-187P-201ENST00000384139 SKAP2O75563 359 aaPredicted RBP0.73□□□□□ -2.29
RNU6-187P-201ENST00000384139 IPO7O95373 1038 aaKnown RBP0.73□□□□□ -2.29
RNU6-187P-201ENST00000384139 METTL18O95568 372 aa0.73□□□□□ -2.29
RNU6-187P-201ENST00000384139 IGHV4-59P01825 116 aa0.73□□□□□ -2.29
RNU6-187P-201ENST00000384139 HRGP04196 525 aa0.73□□□□□ -2.29
RNU6-187P-201ENST00000384139 PTPN2P17706 415 aa0.73□□□□□ -2.29
RNU6-187P-201ENST00000384139 HSPB2Q16082 182 aa0.73□□□□□ -2.29
RNU6-187P-201ENST00000384139 MAP3K21Q5TCX8 1036 aa0.73□□□□□ -2.29
RNU6-187P-201ENST00000384139 BRAT1Q6PJG6 821 aa0.73□□□□□ -2.29
RNU6-187P-201ENST00000384139 IL20RBQ6UXL0 311 aa0.73□□□□□ -2.29
RNU6-187P-201ENST00000384139 ZNF841Q6ZN19 808 aa0.73□□□□□ -2.29
RNU6-187P-201ENST00000384139 TBC1D26Q86UD7 250 aa0.73□□□□□ -2.29
RNU6-187P-201ENST00000384139 GPR180Q86V85 440 aa0.73□□□□□ -2.29
RNU6-187P-201ENST00000384139 ABHD12Q8N2K0 398 aa0.73□□□□□ -2.29
RNU6-187P-201ENST00000384139 TXLNBQ8N3L3 684 aa0.73□□□□□ -2.29
RNU6-187P-201ENST00000384139 PTGR2Q8N8N7 351 aaPredicted RBP0.73□□□□□ -2.29
RNU6-187P-201ENST00000384139 ZNF519Q8TB69 540 aa0.73□□□□□ -2.29
RNU6-187P-201ENST00000384139 KCNG4Q8TDN1 519 aa0.73□□□□□ -2.29
RNU6-187P-201ENST00000384139 GDPD5Q8WTR4 605 aa0.73□□□□□ -2.29
RNU6-187P-201ENST00000384139 COLEC11Q9BWP8 271 aa0.73□□□□□ -2.29
RNU6-187P-201ENST00000384139 STK33Q9BYT3 514 aa0.73□□□□□ -2.29
RNU6-187P-201ENST00000384139 LRMDAQ9H2I8 198 aa0.73□□□□□ -2.29
RNU6-187P-201ENST00000384139 ESRP2Q9H6T0 727 aaKnown RBP0.73□□□□□ -2.29
RNU6-187P-201ENST00000384139 MKKSQ9NPJ1 570 aaPredicted RBP0.73□□□□□ -2.29
RNU6-187P-201ENST00000384139 SLC38A7Q9NVC3 462 aa0.73□□□□□ -2.29
RNU6-187P-201ENST00000384139 HDAC6Q9UBN7 1215 aa0.73□□□□□ -2.29
RNU6-187P-201ENST00000384139 PLCL2Q9UPR0 1127 aa0.73□□□□□ -2.29
RNU6-187P-201ENST00000384139 STON1Q9Y6Q2 735 aa0.73□□□□□ -2.29
RNU6-187P-201ENST00000384139 WI2-2373I1.2A0A1W2PRP0 233 aa0.72□□□□□ -2.29
RNU6-187P-201ENST00000384139 POM121BA6NF01 834 aa0.72□□□□□ -2.29
RNU6-187P-201ENST00000384139 APOL1O14791 398 aa0.72□□□□□ -2.29
RNU6-187P-201ENST00000384139 BUD23O43709 281 aaKnown RBP0.72□□□□□ -2.29
RNU6-187P-201ENST00000384139 NPPBP16860 134 aa0.72□□□□□ -2.29
RNU6-187P-201ENST00000384139 MAOAP21397 527 aa0.72□□□□□ -2.29
RNU6-187P-201ENST00000384139 TMEM50BP56557 158 aa0.72□□□□□ -2.29
RNU6-187P-201ENST00000384139 RIPK4P57078 832 aa0.72□□□□□ -2.29
RNU6-187P-201ENST00000384139 FOXM1Q08050 763 aa0.72□□□□□ -2.29
RNU6-187P-201ENST00000384139 ZNF776Q68DI1 518 aaPredicted RBP0.72□□□□□ -2.29
RNU6-187P-201ENST00000384139 KRTAP5-10Q6L8G5 202 aa0.72□□□□□ -2.29
RNU6-187P-201ENST00000384139 PACS1Q6VY07 963 aa0.72□□□□□ -2.29
RNU6-187P-201ENST00000384139 SLC16A9Q7RTY1 509 aa0.72□□□□□ -2.29
RNU6-187P-201ENST00000384139 MAP7D3Q8IWC1 876 aa0.72□□□□□ -2.29
RNU6-187P-201ENST00000384139 NGEFQ8N5V2 710 aa0.72□□□□□ -2.29
RNU6-187P-201ENST00000384139 OR5R1Q8NH85 324 aa0.72□□□□□ -2.29
RNU6-187P-201ENST00000384139 LRRC15Q8TF66 581 aa0.72□□□□□ -2.29
RNU6-187P-201ENST00000384139 ST6GALNAC6Q969X2 333 aa0.72□□□□□ -2.29
RNU6-187P-201ENST00000384139 PHF21AQ96BD5 680 aa0.72□□□□□ -2.29
RNU6-187P-201ENST00000384139 ZSCAN31Q96LW9 406 aaPredicted RBP0.72□□□□□ -2.29
RNU6-187P-201ENST00000384139 FUCA2Q9BTY2 467 aa0.72□□□□□ -2.29
RNU6-187P-201ENST00000384139 SLC39A8Q9C0K1 460 aa0.72□□□□□ -2.29
RNU6-187P-201ENST00000384139 TKTL2Q9H0I9 626 aa0.72□□□□□ -2.29
RNU6-187P-201ENST00000384139 DIAPH3Q9NSV4 1193 aa0.72□□□□□ -2.29
RNU6-187P-201ENST00000384139 TMLHEQ9NVH6 421 aa0.72□□□□□ -2.29
RNU6-187P-201ENST00000384139 TEX10Q9NXF1 929 aaPredicted RBP0.72□□□□□ -2.29
RNU6-187P-201ENST00000384139 COQ3Q9NZJ6 369 aa0.72□□□□□ -2.29
RNU6-187P-201ENST00000384139 DNAJC16Q9Y2G8 782 aa0.72□□□□□ -2.29
RNU6-187P-201ENST00000384139 KLHL20Q9Y2M5 609 aa0.72□□□□□ -2.29
RNU6-187P-201ENST00000384139 NACAE9PAV3 2078 aa0.72□□□□□ -2.29
RNU6-187P-201ENST00000384139 A0A0G2JNG1 304 aa0.71□□□□□ -2.3
RNU6-187P-201ENST00000384139 ZNF840PA6NDX5 716 aa0.71□□□□□ -2.3
RNU6-187P-201ENST00000384139 PLK4O00444 970 aa0.71□□□□□ -2.3
RNU6-187P-201ENST00000384139 HNRNPDLO14979 420 aaKnown RBP0.71□□□□□ -2.3
RNU6-187P-201ENST00000384139 CSPG5O95196 566 aa0.71□□□□□ -2.3
RNU6-187P-201ENST00000384139 ZBED1O96006 694 aa0.71□□□□□ -2.3
RNU6-187P-201ENST00000384139 CHN1P15882 459 aa0.71□□□□□ -2.3
RNU6-187P-201ENST00000384139 MMP12P39900 470 aa0.71□□□□□ -2.3
RNU6-187P-201ENST00000384139 MVDP53602 400 aa0.71□□□□□ -2.3
RNU6-187P-201ENST00000384139 PIN1Q13526 163 aaPredicted RBP0.71□□□□□ -2.3
RNU6-187P-201ENST00000384139 KIR2DS5Q14953 304 aa0.71□□□□□ -2.3
RNU6-187P-201ENST00000384139 BTBD16Q32M84 506 aa0.71□□□□□ -2.3
RNU6-187P-201ENST00000384139 MOGAT2Q3SYC2 334 aa0.71□□□□□ -2.3
RNU6-187P-201ENST00000384139 TRIM60Q495X7 471 aa0.71□□□□□ -2.3
RNU6-187P-201ENST00000384139 ANKRD54Q6NXT1 300 aa0.71□□□□□ -2.3
RNU6-187P-201ENST00000384139 METTL2BQ6P1Q9 378 aaKnown RBP0.71□□□□□ -2.3
RNU6-187P-201ENST00000384139 DUS1LQ6P1R4 473 aaKnown RBP0.71□□□□□ -2.3
RNU6-187P-201ENST00000384139 GJB7Q6PEY0 223 aa0.71□□□□□ -2.3
RNU6-187P-201ENST00000384139 SLC46A3Q7Z3Q1 461 aa0.71□□□□□ -2.3
RNU6-187P-201ENST00000384139 ZNF561Q8N587 486 aa0.71□□□□□ -2.3
RNU6-187P-201ENST00000384139 PCDH20Q8N6Y1 951 aaKnown RBP0.71□□□□□ -2.3
RNU6-187P-201ENST00000384139 RBM15BQ8NDT2 890 aaKnown RBP0.71□□□□□ -2.3
RNU6-187P-201ENST00000384139 FBXL8Q96CD0 374 aa0.71□□□□□ -2.3
RNU6-187P-201ENST00000384139 METTL2AQ96IZ6 378 aaKnown RBP0.71□□□□□ -2.3
RNU6-187P-201ENST00000384139 PITPNM3Q9BZ71 974 aa0.71□□□□□ -2.3
RNU6-187P-201ENST00000384139 HEXA-AS1Q9H8Q6 139 aa0.71□□□□□ -2.3
RNU6-187P-201ENST00000384139 DNAJB4Q9UDY4 337 aa0.71□□□□□ -2.3
RNU6-187P-201ENST00000384139 TNNQ9UQP3 1299 aa0.71□□□□□ -2.3
RNU6-187P-201ENST00000384139 OR5K3A6NET4 321 aa0.7□□□□□ -2.3
RNU6-187P-201ENST00000384139 ANKRD66B4E2M5 251 aa0.7□□□□□ -2.3
RNU6-187P-201ENST00000384139 ZNF197O14709 1029 aa0.7□□□□□ -2.3
RNU6-187P-201ENST00000384139 MAGEB4O15481 346 aaPredicted RBP0.7□□□□□ -2.3
RNU6-187P-201ENST00000384139 DNPH1O43598 174 aa0.7□□□□□ -2.3
RNU6-187P-201ENST00000384139 KHDRBS3O75525 346 aaKnown RBP0.7□□□□□ -2.3
RNU6-187P-201ENST00000384139 SOX3P41225 446 aa0.7□□□□□ -2.3
RNU6-187P-201ENST00000384139 FASLGP48023 281 aa0.7□□□□□ -2.3
RNU6-187P-201ENST00000384139 ZNF543Q08ER8 600 aa0.7□□□□□ -2.3
RNU6-187P-201ENST00000384139 EDRF1Q3B7T1 1238 aa0.7□□□□□ -2.3
RNU6-187P-201ENST00000384139 RNLSQ5VYX0 342 aa0.7□□□□□ -2.3
RNU6-187P-201ENST00000384139 IGFL2Q6UWQ7 119 aa0.7□□□□□ -2.3
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 25.3 ms