RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000380701.7

CCDC171-201, Transcript of coiled-coil domain containing 171, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene CCDC171, Length 6,512 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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CCDC171-201ENST00000380701 TBC1D21Q8IYX1 336 aa7.12□□□□□ -1.27
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CCDC171-201ENST00000380701 MBOAT7Q96N66 472 aa7.12□□□□□ -1.27
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CCDC171-201ENST00000380701 TOP3BO95985 862 aaKnown RBP7.12□□□□□ -1.27
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CCDC171-201ENST00000380701 KHKP50053 298 aa7.12□□□□□ -1.27
CCDC171-201ENST00000380701 ZNF132P52740 706 aa7.12□□□□□ -1.27
CCDC171-201ENST00000380701 EIF4HQ15056 248 aaKnown RBP7.12□□□□□ -1.27
CCDC171-201ENST00000380701 PDCD4Q53EL6 469 aaKnown RBP7.12□□□□□ -1.27
CCDC171-201ENST00000380701 UBXN11Q5T124 520 aa7.12□□□□□ -1.27
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