RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000377027.1

C9orf85-202, Transcript of chromosome 9 open reading frame 85, humanhuman

TSL 3

Gene C9orf85, Length 539 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C9orf85-202ENST00000377027 PPM1DO15297 605 aa9.5□□□□□ -0.89
C9orf85-202ENST00000377027 NVLO15381 856 aaKnown RBP9.5□□□□□ -0.89
C9orf85-202ENST00000377027 DAPK3O43293 454 aa9.5□□□□□ -0.89
C9orf85-202ENST00000377027 NUDT21O43809 227 aaKnown RBP9.5□□□□□ -0.89
C9orf85-202ENST00000377027 MFSD11O43934 449 aa9.5□□□□□ -0.89
C9orf85-202ENST00000377027 SOCS5O75159 536 aa9.5□□□□□ -0.89
C9orf85-202ENST00000377027 PGLSO95336 258 aa9.5□□□□□ -0.89
C9orf85-202ENST00000377027 ECEL1O95672 775 aa9.5□□□□□ -0.89
C9orf85-202ENST00000377027 EML2O95834 649 aa9.5□□□□□ -0.89
C9orf85-202ENST00000377027 CPP00450 1065 aa9.5□□□□□ -0.89
C9orf85-202ENST00000377027 LIPCP11150 499 aa9.5□□□□□ -0.89
C9orf85-202ENST00000377027 CTPS1P17812 591 aa9.5□□□□□ -0.89
C9orf85-202ENST00000377027 ITGB6P18564 788 aa9.5□□□□□ -0.89
C9orf85-202ENST00000377027 CD1CP29017 333 aa9.5□□□□□ -0.89
C9orf85-202ENST00000377027 PBX1P40424 430 aa9.5□□□□□ -0.89
C9orf85-202ENST00000377027 SETDB1Q15047 1291 aa9.5□□□□□ -0.89
C9orf85-202ENST00000377027 IQCB1Q15051 598 aa9.5□□□□□ -0.89
C9orf85-202ENST00000377027 CCDC183Q5T5S1 534 aa9.5□□□□□ -0.89
C9orf85-202ENST00000377027 CFAP58Q5T655 872 aa9.5□□□□□ -0.89
C9orf85-202ENST00000377027 TRIM74Q86UV6 250 aa9.5□□□□□ -0.89
C9orf85-202ENST00000377027 JAMLQ86YT9 394 aa9.5□□□□□ -0.89
C9orf85-202ENST00000377027 TEX26Q8N6G2 289 aa9.5□□□□□ -0.89
C9orf85-202ENST00000377027 RCBTB1Q8NDN9 531 aa9.5□□□□□ -0.89
C9orf85-202ENST00000377027 ANKRD20A12PQ8NF67 263 aa9.5□□□□□ -0.89
C9orf85-202ENST00000377027 OR6C4Q8NGE1 309 aa9.5□□□□□ -0.89
C9orf85-202ENST00000377027 FAM71BQ8TC56 605 aa9.5□□□□□ -0.89
C9orf85-202ENST00000377027 HSPH1Q92598 858 aa9.5□□□□□ -0.89
C9orf85-202ENST00000377027 USP7Q93009 1102 aa9.5□□□□□ -0.89
C9orf85-202ENST00000377027 MED8Q96G25 268 aa9.5□□□□□ -0.89
C9orf85-202ENST00000377027 TMEM74Q96NL1 305 aa9.5□□□□□ -0.89
C9orf85-202ENST00000377027 WDR24Q96S15 920 aa9.5□□□□□ -0.89
C9orf85-202ENST00000377027 BPIFA3Q9BQP9 254 aa9.5□□□□□ -0.89
C9orf85-202ENST00000377027 DPEP2Q9H4A9 486 aa9.5□□□□□ -0.89
C9orf85-202ENST00000377027 ZWILCHQ9H900 591 aa9.5□□□□□ -0.89
C9orf85-202ENST00000377027 STAU2Q9NUL3 570 aaKnown RBP eCLIP9.5□□□□□ -0.89
C9orf85-202ENST00000377027 TAAR2Q9P1P5 351 aa9.5□□□□□ -0.89
C9orf85-202ENST00000377027 CD84Q9UIB8 345 aa9.5□□□□□ -0.89
C9orf85-202ENST00000377027 NENFQ9UMX5 172 aa9.5□□□□□ -0.89
C9orf85-202ENST00000377027 SLC17A4Q9Y2C5 497 aa9.5□□□□□ -0.89
C9orf85-202ENST00000377027 PPIL1Q9Y3C6 166 aa9.5□□□□□ -0.89
C9orf85-202ENST00000377027 MAST4O15021 2626 aa9.5□□□□□ -0.89
C9orf85-202ENST00000377027 IGHV5-10-1A0A0J9YXX1 117 aa9.49□□□□□ -0.89
C9orf85-202ENST00000377027 A0A1W2PQC6 194 aa9.49□□□□□ -0.89
C9orf85-202ENST00000377027 J3QKU1 62 aa9.49□□□□□ -0.89
C9orf85-202ENST00000377027 RNF8O76064 485 aa9.49□□□□□ -0.89
C9orf85-202ENST00000377027 PRLP01236 227 aa9.49□□□□□ -0.89
C9orf85-202ENST00000377027 IGHA1P01876 353 aa9.49□□□□□ -0.89
C9orf85-202ENST00000377027 FGF3P11487 239 aaPredicted RBP9.49□□□□□ -0.89
C9orf85-202ENST00000377027 EPHA1P21709 976 aa9.49□□□□□ -0.89
C9orf85-202ENST00000377027 ADCY8P40145 1251 aa9.49□□□□□ -0.89
C9orf85-202ENST00000377027 GNPDA1P46926 289 aa9.49□□□□□ -0.89
C9orf85-202ENST00000377027 CYP4F2P78329 520 aa9.49□□□□□ -0.89
C9orf85-202ENST00000377027 NFKB2Q00653 900 aa9.49□□□□□ -0.89
C9orf85-202ENST00000377027 ZNF235Q14590 738 aa9.49□□□□□ -0.89
C9orf85-202ENST00000377027 NR1I3Q14994 352 aa9.49□□□□□ -0.89
C9orf85-202ENST00000377027 ATP13A4Q4VNC1 1196 aa9.49□□□□□ -0.89
C9orf85-202ENST00000377027 DENND2CQ68D51 928 aa9.49□□□□□ -0.89
C9orf85-202ENST00000377027 NCBP2-AS2Q69YL0 99 aa9.49□□□□□ -0.89
C9orf85-202ENST00000377027 ALG1LQ6GMV1 187 aa9.49□□□□□ -0.89
C9orf85-202ENST00000377027 SLC30A9Q6PML9 568 aa9.49□□□□□ -0.89
C9orf85-202ENST00000377027 SHISA2Q6UWI4 295 aa9.49□□□□□ -0.89
C9orf85-202ENST00000377027 LZTR1Q8N653 840 aa9.49□□□□□ -0.89
C9orf85-202ENST00000377027 NIPA2Q8N8Q9 360 aa9.49□□□□□ -0.89
C9orf85-202ENST00000377027 ATL2Q8NHH9 583 aa9.49□□□□□ -0.89
C9orf85-202ENST00000377027 PDCD6IPQ8WUM4 868 aaKnown RBP9.49□□□□□ -0.89
C9orf85-202ENST00000377027 EXTL1Q92935 676 aa9.49□□□□□ -0.89
C9orf85-202ENST00000377027 SCAMP4Q969E2 229 aa9.49□□□□□ -0.89
C9orf85-202ENST00000377027 SCRN2Q96FV2 425 aa9.49□□□□□ -0.89
C9orf85-202ENST00000377027 BHLHE41Q9C0J9 482 aaPredicted RBP9.49□□□□□ -0.89
C9orf85-202ENST00000377027 THAP2Q9H0W7 228 aa9.49□□□□□ -0.89
C9orf85-202ENST00000377027 ABCG8Q9H221 673 aa9.49□□□□□ -0.89
C9orf85-202ENST00000377027 SRA1Q9HD15 236 aaKnown RBP9.49□□□□□ -0.89
C9orf85-202ENST00000377027 MOSPD1Q9UJG1 213 aa9.49□□□□□ -0.89
C9orf85-202ENST00000377027 LOC107983988A0A1B0GUW6 1196 aaPredicted RBP9.48□□□□□ -0.89
C9orf85-202ENST00000377027 H3BRJ5 948 aa9.48□□□□□ -0.89
C9orf85-202ENST00000377027 PROCP04070 461 aa9.48□□□□□ -0.89
C9orf85-202ENST00000377027 IVLP07476 585 aa9.48□□□□□ -0.89
C9orf85-202ENST00000377027 CCDC172P0C7W6 258 aa9.48□□□□□ -0.89
C9orf85-202ENST00000377027 JMJD7P0C870 316 aa9.48□□□□□ -0.89
C9orf85-202ENST00000377027 TEAD1P28347 426 aa9.48□□□□□ -0.89
C9orf85-202ENST00000377027 MMP13P45452 471 aa9.48□□□□□ -0.89
C9orf85-202ENST00000377027 RENBPP51606 427 aa9.48□□□□□ -0.89
C9orf85-202ENST00000377027 MAPK10P53779 464 aa9.48□□□□□ -0.89
C9orf85-202ENST00000377027 POLR2LP62875 67 aaKnown RBP9.48□□□□□ -0.89
C9orf85-202ENST00000377027 DSC2Q02487 901 aa9.48□□□□□ -0.89
C9orf85-202ENST00000377027 DPTQ07507 201 aa9.48□□□□□ -0.89
C9orf85-202ENST00000377027 NIPAL4Q0D2K0 466 aa9.48□□□□□ -0.89
C9orf85-202ENST00000377027 KLHL30Q0D2K2 578 aa9.48□□□□□ -0.89
C9orf85-202ENST00000377027 AMZ1Q400G9 498 aa9.48□□□□□ -0.89
C9orf85-202ENST00000377027 PHF19Q5T6S3 580 aa9.48□□□□□ -0.89
C9orf85-202ENST00000377027 NKAIN2Q5VXU1 208 aa9.48□□□□□ -0.89
C9orf85-202ENST00000377027 LRRC66Q68CR7 880 aa9.48□□□□□ -0.89
C9orf85-202ENST00000377027 PPP1R2P3Q6NXS1 205 aa9.48□□□□□ -0.89
C9orf85-202ENST00000377027 TMCO3Q6UWJ1 677 aa9.48□□□□□ -0.89
C9orf85-202ENST00000377027 USP53Q70EK8 1073 aa9.48□□□□□ -0.89
C9orf85-202ENST00000377027 ZNF761Q86XN6 746 aaPredicted RBP9.48□□□□□ -0.89
C9orf85-202ENST00000377027 ARRDC2Q8TBH0 407 aa9.48□□□□□ -0.89
C9orf85-202ENST00000377027 MAML1Q92585 1016 aa9.48□□□□□ -0.89
C9orf85-202ENST00000377027 COX14Q96I36 57 aa9.48□□□□□ -0.89
C9orf85-202ENST00000377027 CCDC74BQ96LY2 380 aa9.48□□□□□ -0.89
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 24.5 ms