RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000375175.1

TMOD1-202, Transcript of tropomodulin 1, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene TMOD1, Length 2,516 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMOD1-202ENST00000375175 UBA6A0AVT1 1052 aaPredicted RBP13.11□□□□□ -0.31
TMOD1-202ENST00000375175 C9JVG2 144 aa13.11□□□□□ -0.31
TMOD1-202ENST00000375175 PIP5K1BO14986 540 aa13.11□□□□□ -0.31
TMOD1-202ENST00000375175 AKAP10O43572 662 aa13.11□□□□□ -0.31
TMOD1-202ENST00000375175 TIPRLO75663 272 aa13.11□□□□□ -0.31
TMOD1-202ENST00000375175 CDK14O94921 469 aa13.11□□□□□ -0.31
TMOD1-202ENST00000375175 WISP3O95389 354 aaPredicted RBP13.11□□□□□ -0.31
TMOD1-202ENST00000375175 ASGR1P07306 291 aa13.11□□□□□ -0.31
TMOD1-202ENST00000375175 DCKP27707 260 aa13.11□□□□□ -0.31
TMOD1-202ENST00000375175 ZNF157P51786 506 aaPredicted RBP13.11□□□□□ -0.31
TMOD1-202ENST00000375175 RPS3AP61247 264 aaKnown RBP13.11□□□□□ -0.31
TMOD1-202ENST00000375175 SEMA3AQ14563 771 aa13.11□□□□□ -0.31
TMOD1-202ENST00000375175 RPS6KA2Q15349 733 aa13.11□□□□□ -0.31
TMOD1-202ENST00000375175 OR4D1Q15615 310 aa13.11□□□□□ -0.31
TMOD1-202ENST00000375175 NFE2Q16621 373 aaPredicted RBP13.11□□□□□ -0.31
TMOD1-202ENST00000375175 UGT3A2Q3SY77 523 aa13.11□□□□□ -0.31
TMOD1-202ENST00000375175 VPS26BQ4G0F5 336 aa13.11□□□□□ -0.31
TMOD1-202ENST00000375175 C6orf10Q5SRN2 563 aa13.11□□□□□ -0.31
TMOD1-202ENST00000375175 ATAD1Q8NBU5 361 aa13.11□□□□□ -0.31
TMOD1-202ENST00000375175 TFAP2CQ92754 450 aa13.11□□□□□ -0.31
TMOD1-202ENST00000375175 FATE1Q969F0 183 aa13.11□□□□□ -0.31
TMOD1-202ENST00000375175 FBXO32Q969P5 355 aa13.11□□□□□ -0.31
TMOD1-202ENST00000375175 LRCH3Q96II8 777 aa13.11□□□□□ -0.31
TMOD1-202ENST00000375175 NSUN5Q96P11 429 aaKnown RBP13.11□□□□□ -0.31
TMOD1-202ENST00000375175 KCNA7Q96RP8 456 aa13.11□□□□□ -0.31
TMOD1-202ENST00000375175 DOK1Q99704 481 aa13.11□□□□□ -0.31
TMOD1-202ENST00000375175 POLR1EQ9GZS1 481 aaKnown RBP13.11□□□□□ -0.31
TMOD1-202ENST00000375175 CATSPERZQ9NTU4 200 aa13.11□□□□□ -0.31
TMOD1-202ENST00000375175 SMOXQ9NWM0 555 aa13.11□□□□□ -0.31
TMOD1-202ENST00000375175 GID8Q9NWU2 228 aa13.11□□□□□ -0.31
TMOD1-202ENST00000375175 MARCH2Q9P0N8 246 aa13.11□□□□□ -0.31
TMOD1-202ENST00000375175 RBMX2Q9Y388 322 aaKnown RBP13.11□□□□□ -0.31
TMOD1-202ENST00000375175 PATJQ8NI35 1801 aa13.11□□□□□ -0.31
TMOD1-202ENST00000375175 TCRBV3S1A0A5B6 114 aa13.11□□□□□ -0.31
TMOD1-202ENST00000375175 AZIN1O14977 448 aa13.11□□□□□ -0.31
TMOD1-202ENST00000375175 PRSS56P0CW18 603 aa13.11□□□□□ -0.31
TMOD1-202ENST00000375175 ZNF182P17025 639 aaPredicted RBP13.11□□□□□ -0.31
TMOD1-202ENST00000375175 PBX3P40426 434 aa13.11□□□□□ -0.31
TMOD1-202ENST00000375175 ATP4BP51164 291 aa13.11□□□□□ -0.31
TMOD1-202ENST00000375175 FOXA1P55317 472 aa13.11□□□□□ -0.31
TMOD1-202ENST00000375175 ITGADQ13349 1161 aa13.11□□□□□ -0.31
TMOD1-202ENST00000375175 SERINC3Q13530 473 aa13.11□□□□□ -0.31
TMOD1-202ENST00000375175 GRB7Q14451 532 aa13.11□□□□□ -0.31
TMOD1-202ENST00000375175 MOGQ16653 247 aa13.11□□□□□ -0.31
TMOD1-202ENST00000375175 TMEM214Q6NUQ4 689 aaKnown RBP13.11□□□□□ -0.31
TMOD1-202ENST00000375175 GLB1LQ6UWU2 654 aa13.11□□□□□ -0.31
TMOD1-202ENST00000375175 RETREG3Q86VR2 466 aa13.11□□□□□ -0.31
TMOD1-202ENST00000375175 TTC9BQ8N6N2 239 aa13.11□□□□□ -0.31
TMOD1-202ENST00000375175 OR4L1Q8NH43 312 aa13.11□□□□□ -0.31
TMOD1-202ENST00000375175 TWIST2Q8WVJ9 160 aa13.11□□□□□ -0.31
TMOD1-202ENST00000375175 TUBGCP3Q96CW5 907 aa13.11□□□□□ -0.31
TMOD1-202ENST00000375175 C8orf48Q96LL4 319 aa13.11□□□□□ -0.31
TMOD1-202ENST00000375175 POLR3BQ9NW08 1133 aaPredicted RBP13.11□□□□□ -0.31
TMOD1-202ENST00000375175 PCDHB5Q9Y5E4 795 aa13.11□□□□□ -0.31
TMOD1-202ENST00000375175 SUPT3HB4E1H0 165 aa13.1□□□□□ -0.31
TMOD1-202ENST00000375175 CFAP99D6REC4 459 aa13.1□□□□□ -0.31
TMOD1-202ENST00000375175 ANGPT2O15123 496 aa13.1□□□□□ -0.31
TMOD1-202ENST00000375175 CNOT3O75175 753 aaKnown RBP13.1□□□□□ -0.31
TMOD1-202ENST00000375175 CRCPO75575 148 aa13.1□□□□□ -0.31
TMOD1-202ENST00000375175 RPP40O75818 363 aaKnown RBP13.1□□□□□ -0.31
TMOD1-202ENST00000375175 RPLP2P05387 115 aaKnown RBP13.1□□□□□ -0.31
TMOD1-202ENST00000375175 LINC00032P0C843 101 aa13.1□□□□□ -0.31
TMOD1-202ENST00000375175 NFKB2Q00653 900 aa13.1□□□□□ -0.31
TMOD1-202ENST00000375175 TRIP4Q15650 581 aaPredicted RBP13.1□□□□□ -0.31
TMOD1-202ENST00000375175 FBXO48Q5FWF7 155 aa13.1□□□□□ -0.31
TMOD1-202ENST00000375175 C6orf183Q5T699 404 aa13.1□□□□□ -0.31
TMOD1-202ENST00000375175 HACD2Q6Y1H2 254 aa13.1□□□□□ -0.31
TMOD1-202ENST00000375175 MIER2Q8N344 545 aa13.1□□□□□ -0.31
TMOD1-202ENST00000375175 CANT1Q8WVQ1 401 aa13.1□□□□□ -0.31
TMOD1-202ENST00000375175 TAMM41Q96BW9 452 aa13.1□□□□□ -0.31
TMOD1-202ENST00000375175 ROPN1LQ96C74 230 aa13.1□□□□□ -0.31
TMOD1-202ENST00000375175 AURKCQ9UQB9 309 aa13.1□□□□□ -0.31
TMOD1-202ENST00000375175 ERGIC3Q9Y282 383 aa13.1□□□□□ -0.31
TMOD1-202ENST00000375175 BTRCQ9Y297 605 aa13.1□□□□□ -0.31
TMOD1-202ENST00000375175 SLC27A5Q9Y2P5 690 aa13.1□□□□□ -0.31
TMOD1-202ENST00000375175 DOCK4Q8N1I0 1966 aa13.1□□□□□ -0.31
TMOD1-202ENST00000375175 IGLV3-10A0A075B6K4 115 aa13.1□□□□□ -0.31
TMOD1-202ENST00000375175 SAC3D1A6NKF1 404 aa13.1□□□□□ -0.31
TMOD1-202ENST00000375175 H3BMM5 538 aa13.1□□□□□ -0.31
TMOD1-202ENST00000375175 MUSKO15146 869 aa13.1□□□□□ -0.31
TMOD1-202ENST00000375175 RHOBTB1O94844 696 aa13.1□□□□□ -0.31
TMOD1-202ENST00000375175 CLIC3O95833 236 aa13.1□□□□□ -0.31
TMOD1-202ENST00000375175 FGF1P05230 155 aa13.1□□□□□ -0.31
TMOD1-202ENST00000375175 ZNF37AP17032 561 aaPredicted RBP13.1□□□□□ -0.31
TMOD1-202ENST00000375175 HLA-DPA1P20036 260 aa13.1□□□□□ -0.31
TMOD1-202ENST00000375175 TIAL1Q01085 375 aaKnown RBP eCLIP13.1□□□□□ -0.31
TMOD1-202ENST00000375175 TRAF2Q12933 501 aa13.1□□□□□ -0.31
TMOD1-202ENST00000375175 KCNA10Q16322 511 aa13.1□□□□□ -0.31
TMOD1-202ENST00000375175 PARP15Q460N3 678 aa13.1□□□□□ -0.31
TMOD1-202ENST00000375175 MFSD14CQ5VZR4 134 aa13.1□□□□□ -0.31
TMOD1-202ENST00000375175 THOC7Q6I9Y2 204 aaKnown RBP13.1□□□□□ -0.31
TMOD1-202ENST00000375175 GALNT18Q6P9A2 607 aa13.1□□□□□ -0.31
TMOD1-202ENST00000375175 ZNF598Q86UK7 904 aaKnown RBP13.1□□□□□ -0.31
TMOD1-202ENST00000375175 ZC3H7AQ8IWR0 971 aaKnown RBP13.1□□□□□ -0.31
TMOD1-202ENST00000375175 CFAP52Q8N1V2 620 aa13.1□□□□□ -0.31
TMOD1-202ENST00000375175 OR2T34Q8NGX1 318 aa13.1□□□□□ -0.31
TMOD1-202ENST00000375175 OR2T3Q8NH03 318 aa13.1□□□□□ -0.31
TMOD1-202ENST00000375175 ZNF420Q8TAQ5 688 aaPredicted RBP13.1□□□□□ -0.31
TMOD1-202ENST00000375175 BRSK1Q8TDC3 778 aa13.1□□□□□ -0.31
TMOD1-202ENST00000375175 STARD8Q92502 1023 aa13.1□□□□□ -0.31
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 28.2 ms