RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000362897.1

RNU6-78P-201, Transcript of RNA, U6 small nuclear 78, pseudogene, humanhuman

BASIC

Gene RNU6-78P, Length 107 nt, Biotype snRNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNU6-78P-201ENST00000362897 QRFPRQ96P65 431 aa2.68□□□□□ -1.98
RNU6-78P-201ENST00000362897 MTERF1Q99551 399 aaKnown RBP2.68□□□□□ -1.98
RNU6-78P-201ENST00000362897 MEIS3Q99687 375 aa2.68□□□□□ -1.98
RNU6-78P-201ENST00000362897 MXD3Q9BW11 206 aa2.68□□□□□ -1.98
RNU6-78P-201ENST00000362897 TEX12Q9BXU0 123 aa2.68□□□□□ -1.98
RNU6-78P-201ENST00000362897 IL25Q9H293 177 aa2.68□□□□□ -1.98
RNU6-78P-201ENST00000362897 DNAJC18Q9H819 358 aa2.68□□□□□ -1.98
RNU6-78P-201ENST00000362897 CD93Q9NPY3 652 aa2.68□□□□□ -1.98
RNU6-78P-201ENST00000362897 MALT1Q9UDY8 824 aa2.68□□□□□ -1.98
RNU6-78P-201ENST00000362897 RPS6KA6Q9UK32 745 aa2.68□□□□□ -1.98
RNU6-78P-201ENST00000362897 PADI3Q9ULW8 664 aa2.68□□□□□ -1.98
RNU6-78P-201ENST00000362897 VDAC3Q9Y277 283 aa2.68□□□□□ -1.98
RNU6-78P-201ENST00000362897 IGKV2D-30A0A075B6S6 120 aa2.67□□□□□ -1.98
RNU6-78P-201ENST00000362897 PLSCR5A0PG75 271 aa2.67□□□□□ -1.98
RNU6-78P-201ENST00000362897 SRRM3A6NNA2 597 aaPredicted RBP2.67□□□□□ -1.98
RNU6-78P-201ENST00000362897 A8MV72 311 aaPredicted RBP2.67□□□□□ -1.98
RNU6-78P-201ENST00000362897 FAM90A26D6RGX4 464 aa2.67□□□□□ -1.98
RNU6-78P-201ENST00000362897 ANKRD28O15084 1053 aa2.67□□□□□ -1.98
RNU6-78P-201ENST00000362897 MID1O15344 667 aa2.67□□□□□ -1.98
RNU6-78P-201ENST00000362897 KCNN4O15554 427 aa2.67□□□□□ -1.98
RNU6-78P-201ENST00000362897 MITFO75030 526 aaPredicted RBP2.67□□□□□ -1.98
RNU6-78P-201ENST00000362897 TMCC2O75069 709 aa2.67□□□□□ -1.98
RNU6-78P-201ENST00000362897 DDNO94850 711 aaPredicted RBP2.67□□□□□ -1.98
RNU6-78P-201ENST00000362897 PMS2P2O95744 297 aa2.67□□□□□ -1.98
RNU6-78P-201ENST00000362897 AFPP02771 609 aaKnown RBP2.67□□□□□ -1.98
RNU6-78P-201ENST00000362897 TUBBP07437 444 aa2.67□□□□□ -1.98
RNU6-78P-201ENST00000362897 PLA2G2AP14555 144 aa2.67□□□□□ -1.98
RNU6-78P-201ENST00000362897 MMP9P14780 707 aa2.67□□□□□ -1.98
RNU6-78P-201ENST00000362897 S1PR1P21453 382 aa2.67□□□□□ -1.98
RNU6-78P-201ENST00000362897 CORO1AP31146 461 aaKnown RBP2.67□□□□□ -1.98
RNU6-78P-201ENST00000362897 ACSL1P33121 698 aa2.67□□□□□ -1.98
RNU6-78P-201ENST00000362897 GNL1P36915 607 aaPredicted RBP2.67□□□□□ -1.98
RNU6-78P-201ENST00000362897 USP8P40818 1118 aa2.67□□□□□ -1.98
RNU6-78P-201ENST00000362897 APOBEC1P41238 236 aaKnown RBP2.67□□□□□ -1.98
RNU6-78P-201ENST00000362897 PDLIM4P50479 330 aa2.67□□□□□ -1.98
RNU6-78P-201ENST00000362897 MRPS5P82675 430 aaKnown RBP2.67□□□□□ -1.98
RNU6-78P-201ENST00000362897 PDE1BQ01064 536 aa2.67□□□□□ -1.98
RNU6-78P-201ENST00000362897 KIF5AQ12840 1032 aa2.67□□□□□ -1.98
RNU6-78P-201ENST00000362897 DLG1Q12959 904 aa2.67□□□□□ -1.98
RNU6-78P-201ENST00000362897 STK4Q13043 487 aa2.67□□□□□ -1.98
RNU6-78P-201ENST00000362897 KCNC3Q14003 757 aa2.67□□□□□ -1.98
RNU6-78P-201ENST00000362897 KEAP1Q14145 624 aa2.67□□□□□ -1.98
RNU6-78P-201ENST00000362897 SLC39A14Q15043 492 aa2.67□□□□□ -1.98
RNU6-78P-201ENST00000362897 SF3B4Q15427 424 aaKnown RBP eCLIP2.67□□□□□ -1.98
RNU6-78P-201ENST00000362897 NTRK2Q16620 822 aa2.67□□□□□ -1.98
RNU6-78P-201ENST00000362897 IZUMO4Q1ZYL8 232 aa2.67□□□□□ -1.98
RNU6-78P-201ENST00000362897 CFAP58Q5T655 872 aa2.67□□□□□ -1.98
RNU6-78P-201ENST00000362897 NSUN5P2Q63ZY6 315 aa2.67□□□□□ -1.98
RNU6-78P-201ENST00000362897 TMEM198Q66K66 360 aa2.67□□□□□ -1.98
RNU6-78P-201ENST00000362897 C18orf63Q68DL7 685 aa2.67□□□□□ -1.98
RNU6-78P-201ENST00000362897 SFR1Q86XK3 245 aa2.67□□□□□ -1.98
RNU6-78P-201ENST00000362897 NRROSQ86YC3 692 aa2.67□□□□□ -1.98
RNU6-78P-201ENST00000362897 MCEMP1Q8IX19 187 aa2.67□□□□□ -1.98
RNU6-78P-201ENST00000362897 ODF3L1Q8IXM7 274 aa2.67□□□□□ -1.98
RNU6-78P-201ENST00000362897 POC5Q8NA72 575 aa2.67□□□□□ -1.98
RNU6-78P-201ENST00000362897 KCNH5Q8NCM2 988 aa2.67□□□□□ -1.98
RNU6-78P-201ENST00000362897 LILRB1Q8NHL6 650 aaPredicted RBP2.67□□□□□ -1.98
RNU6-78P-201ENST00000362897 SPATA22Q8NHS9 363 aa2.67□□□□□ -1.98
RNU6-78P-201ENST00000362897 GSDMBQ8TAX9 411 aa2.67□□□□□ -1.98
RNU6-78P-201ENST00000362897 THAP6Q8TBB0 222 aa2.67□□□□□ -1.98
RNU6-78P-201ENST00000362897 PPP4R1Q8TF05 950 aa2.67□□□□□ -1.98
RNU6-78P-201ENST00000362897 SLC38A5Q8WUX1 472 aa2.67□□□□□ -1.98
RNU6-78P-201ENST00000362897 BICD1Q96G01 975 aa2.67□□□□□ -1.98
RNU6-78P-201ENST00000362897 CEP295NLQ96MC4 621 aa2.67□□□□□ -1.98
RNU6-78P-201ENST00000362897 SMC6Q96SB8 1091 aa2.67□□□□□ -1.98
RNU6-78P-201ENST00000362897 TMEM39BQ9GZU3 492 aa2.67□□□□□ -1.98
RNU6-78P-201ENST00000362897 C6orf106Q9H6K1 298 aaPredicted RBP2.67□□□□□ -1.98
RNU6-78P-201ENST00000362897 PAG1Q9NWQ8 432 aa2.67□□□□□ -1.98
RNU6-78P-201ENST00000362897 MRPL15Q9P015 296 aaKnown RBP2.67□□□□□ -1.98
RNU6-78P-201ENST00000362897 SEC63Q9UGP8 760 aaKnown RBP2.67□□□□□ -1.98
RNU6-78P-201ENST00000362897 DBNLQ9UJU6 430 aaKnown RBP2.67□□□□□ -1.98
RNU6-78P-201ENST00000362897 EXO1Q9UQ84 846 aaKnown RBP2.67□□□□□ -1.98
RNU6-78P-201ENST00000362897 KLHL20Q9Y2M5 609 aa2.67□□□□□ -1.98
RNU6-78P-201ENST00000362897 SEC23IPQ9Y6Y8 1000 aaKnown RBP2.67□□□□□ -1.98
RNU6-78P-201ENST00000362897 PTPRCP08575 1304 aa2.67□□□□□ -1.98
RNU6-78P-201ENST00000362897 ZNF644Q9H582 1327 aaPredicted RBP2.67□□□□□ -1.98
RNU6-78P-201ENST00000362897 SAA2-SAA4A0A096LPE2 208 aa2.66□□□□□ -1.98
RNU6-78P-201ENST00000362897 A0A0G2JPF8 293 aa2.66□□□□□ -1.98
RNU6-78P-201ENST00000362897 A0A1W2PR77 199 aa2.66□□□□□ -1.98
RNU6-78P-201ENST00000362897 LNP1A1A4G5 178 aa2.66□□□□□ -1.98
RNU6-78P-201ENST00000362897 HNRNPCL3B7ZW38 293 aa2.66□□□□□ -1.98
RNU6-78P-201ENST00000362897 CLGNO14967 610 aa2.66□□□□□ -1.98
RNU6-78P-201ENST00000362897 PAPSS1O43252 624 aaPredicted RBP2.66□□□□□ -1.98
RNU6-78P-201ENST00000362897 ENTPD3O75355 529 aa2.66□□□□□ -1.98
RNU6-78P-201ENST00000362897 BEST1O76090 585 aa2.66□□□□□ -1.98
RNU6-78P-201ENST00000362897 ZBTB11O95625 1053 aaPredicted RBP2.66□□□□□ -1.98
RNU6-78P-201ENST00000362897 HNRNPCL4P0DMR1 293 aa2.66□□□□□ -1.98
RNU6-78P-201ENST00000362897 POLR2CP19387 275 aaPredicted RBP2.66□□□□□ -1.98
RNU6-78P-201ENST00000362897 UGT1A1P22309 533 aa2.66□□□□□ -1.98
RNU6-78P-201ENST00000362897 TNFRSF8P28908 595 aa2.66□□□□□ -1.98
RNU6-78P-201ENST00000362897 CCKBRP32239 447 aa2.66□□□□□ -1.98
RNU6-78P-201ENST00000362897 NNMTP40261 264 aa2.66□□□□□ -1.98
RNU6-78P-201ENST00000362897 PNLIPRP2P54317 469 aa2.66□□□□□ -1.98
RNU6-78P-201ENST00000362897 CLDN20P56880 219 aa2.66□□□□□ -1.98
RNU6-78P-201ENST00000362897 PSMC6P62333 389 aa2.66□□□□□ -1.98
RNU6-78P-201ENST00000362897 MVPQ14764 893 aaKnown RBP2.66□□□□□ -1.98
RNU6-78P-201ENST00000362897 ZNF585BQ52M93 769 aa2.66□□□□□ -1.98
RNU6-78P-201ENST00000362897 LRCH2Q5VUJ6 765 aa2.66□□□□□ -1.98
RNU6-78P-201ENST00000362897 C9orf57Q5W0N0 161 aa2.66□□□□□ -1.98
RNU6-78P-201ENST00000362897 LCN10Q6JVE6 187 aa2.66□□□□□ -1.98
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 28.6 ms