RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000362869.1

RNU6-552P-201, Transcript of RNA, U6 small nuclear 552, pseudogene, humanhuman

BASIC

Gene RNU6-552P, Length 119 nt, Biotype snRNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNU6-552P-201ENST00000362869 ANKRD28O15084 1053 aa2.99□□□□□ -1.93
RNU6-552P-201ENST00000362869 KCNN4O15554 427 aa2.99□□□□□ -1.93
RNU6-552P-201ENST00000362869 TBX18O95935 607 aa2.99□□□□□ -1.93
RNU6-552P-201ENST00000362869 PIK3CAP42336 1068 aa2.99□□□□□ -1.93
RNU6-552P-201ENST00000362869 PRCPP42785 496 aa2.99□□□□□ -1.93
RNU6-552P-201ENST00000362869 MRPS34P82930 218 aaKnown RBP2.99□□□□□ -1.93
RNU6-552P-201ENST00000362869 COG7P83436 770 aa2.99□□□□□ -1.93
RNU6-552P-201ENST00000362869 CDC16Q13042 620 aa2.99□□□□□ -1.93
RNU6-552P-201ENST00000362869 FAM72AQ5TYM5 149 aa2.99□□□□□ -1.93
RNU6-552P-201ENST00000362869 PMS2CLQ68D20 193 aa2.99□□□□□ -1.93
RNU6-552P-201ENST00000362869 OR7E24Q6IFN5 339 aa2.99□□□□□ -1.93
RNU6-552P-201ENST00000362869 FAM72DQ6L9T8 149 aa2.99□□□□□ -1.93
RNU6-552P-201ENST00000362869 FAM171BQ6P995 826 aa2.99□□□□□ -1.93
RNU6-552P-201ENST00000362869 PAPD4Q6PIY7 484 aaKnown RBP2.99□□□□□ -1.93
RNU6-552P-201ENST00000362869 RAD9BQ6WBX8 426 aa2.99□□□□□ -1.93
RNU6-552P-201ENST00000362869 ZNF852Q6ZMS4 543 aa2.99□□□□□ -1.93
RNU6-552P-201ENST00000362869 SEPT14Q6ZU15 432 aa2.99□□□□□ -1.93
RNU6-552P-201ENST00000362869 FAM72BQ86X60 149 aa2.99□□□□□ -1.93
RNU6-552P-201ENST00000362869 MAP7D3Q8IWC1 876 aa2.99□□□□□ -1.93
RNU6-552P-201ENST00000362869 ARHGAP12Q8IWW6 846 aa2.99□□□□□ -1.93
RNU6-552P-201ENST00000362869 TDRD7Q8NHU6 1098 aaKnown RBP2.99□□□□□ -1.93
RNU6-552P-201ENST00000362869 TMEM255BQ8WV15 326 aa2.99□□□□□ -1.93
RNU6-552P-201ENST00000362869 SLC44A1Q8WWI5 657 aa2.99□□□□□ -1.93
RNU6-552P-201ENST00000362869 SGCDQ92629 289 aa2.99□□□□□ -1.93
RNU6-552P-201ENST00000362869 C7orf26Q96N11 449 aa2.99□□□□□ -1.93
RNU6-552P-201ENST00000362869 WDFY2Q96P53 400 aa2.99□□□□□ -1.93
RNU6-552P-201ENST00000362869 TRMT61BQ9BVS5 477 aaKnown RBP2.99□□□□□ -1.93
RNU6-552P-201ENST00000362869 SIL1Q9H173 461 aa2.99□□□□□ -1.93
RNU6-552P-201ENST00000362869 PIGMQ9H3S5 423 aa2.99□□□□□ -1.93
RNU6-552P-201ENST00000362869 POLR1BQ9H9Y6 1135 aa2.99□□□□□ -1.93
RNU6-552P-201ENST00000362869 RRP7BPQ9NSQ0 103 aa2.99□□□□□ -1.93
RNU6-552P-201ENST00000362869 HCFC1R1Q9NWW0 138 aa2.99□□□□□ -1.93
RNU6-552P-201ENST00000362869 COPG2Q9UBF2 871 aa2.99□□□□□ -1.93
RNU6-552P-201ENST00000362869 UBA2Q9UBT2 640 aaPredicted RBP2.99□□□□□ -1.93
RNU6-552P-201ENST00000362869 FBXW11Q9UKB1 542 aa2.99□□□□□ -1.93
RNU6-552P-201ENST00000362869 KIF26BQ2KJY2 2108 aa2.98□□□□□ -1.93
RNU6-552P-201ENST00000362869 ZCWPW2A0A1B0GU75 182 aa2.98□□□□□ -1.93
RNU6-552P-201ENST00000362869 PRSS47A8MTI9 375 aa2.98□□□□□ -1.93
RNU6-552P-201ENST00000362869 H3BQ06 376 aaPredicted RBP2.98□□□□□ -1.93
RNU6-552P-201ENST00000362869 J3KRW8 73 aa2.98□□□□□ -1.93
RNU6-552P-201ENST00000362869 EIF3DO15371 548 aaKnown RBP eCLIP2.98□□□□□ -1.93
RNU6-552P-201ENST00000362869 HCRTR2O43614 444 aa2.98□□□□□ -1.93
RNU6-552P-201ENST00000362869 UGT1A1P22309 533 aa2.98□□□□□ -1.93
RNU6-552P-201ENST00000362869 PSMA4P25789 261 aaKnown RBP2.98□□□□□ -1.93
RNU6-552P-201ENST00000362869 AHRP35869 848 aa2.98□□□□□ -1.93
RNU6-552P-201ENST00000362869 MMP14P50281 582 aa2.98□□□□□ -1.93
RNU6-552P-201ENST00000362869 TFAP4Q01664 338 aa2.98□□□□□ -1.93
RNU6-552P-201ENST00000362869 NIPAL4Q0D2K0 466 aa2.98□□□□□ -1.93
RNU6-552P-201ENST00000362869 LRMPQ12912 555 aa2.98□□□□□ -1.93
RNU6-552P-201ENST00000362869 GAGE5Q13069 117 aa2.98□□□□□ -1.93
RNU6-552P-201ENST00000362869 GAGE6Q13070 117 aa2.98□□□□□ -1.93
RNU6-552P-201ENST00000362869 MED22Q15528 200 aa2.98□□□□□ -1.93
RNU6-552P-201ENST00000362869 NAB2Q15742 525 aa2.98□□□□□ -1.93
RNU6-552P-201ENST00000362869 ADIPOQQ15848 244 aa2.98□□□□□ -1.93
RNU6-552P-201ENST00000362869 KRTCAP3Q53RY4 240 aa2.98□□□□□ -1.93
RNU6-552P-201ENST00000362869 ZNF805Q5CZA5 627 aa2.98□□□□□ -1.93
RNU6-552P-201ENST00000362869 CCDC70Q6NSX1 233 aa2.98□□□□□ -1.93
RNU6-552P-201ENST00000362869 NCEH1Q6PIU2 408 aa2.98□□□□□ -1.93
RNU6-552P-201ENST00000362869 PLEKHM3Q6ZWE6 761 aa2.98□□□□□ -1.93
RNU6-552P-201ENST00000362869 TMTC3Q6ZXV5 915 aa2.98□□□□□ -1.93
RNU6-552P-201ENST00000362869 SDCCAG8Q86SQ7 713 aaPredicted RBP2.98□□□□□ -1.93
RNU6-552P-201ENST00000362869 FOXP4Q8IVH2 680 aaPredicted RBP2.98□□□□□ -1.93
RNU6-552P-201ENST00000362869 RNF168Q8IYW5 571 aaPredicted RBP2.98□□□□□ -1.93
RNU6-552P-201ENST00000362869 ZBTB8BQ8NAP8 495 aaPredicted RBP2.98□□□□□ -1.93
RNU6-552P-201ENST00000362869 OR52I2Q8NH67 350 aa2.98□□□□□ -1.93
RNU6-552P-201ENST00000362869 UCMAQ8WVF2 138 aa2.98□□□□□ -1.93
RNU6-552P-201ENST00000362869 ALG14Q96F25 216 aa2.98□□□□□ -1.93
RNU6-552P-201ENST00000362869 LINGO1Q96FE5 620 aa2.98□□□□□ -1.93
RNU6-552P-201ENST00000362869 PGLYRP2Q96PD5 576 aa2.98□□□□□ -1.93
RNU6-552P-201ENST00000362869 SEPT5Q99719 369 aaPredicted RBP2.98□□□□□ -1.93
RNU6-552P-201ENST00000362869 LRMDAQ9H2I8 198 aa2.98□□□□□ -1.93
RNU6-552P-201ENST00000362869 PDZD7Q9H5P4 517 aa2.98□□□□□ -1.93
RNU6-552P-201ENST00000362869 MAP3K20Q9NYL2 800 aaKnown RBP2.98□□□□□ -1.93
RNU6-552P-201ENST00000362869 EHD2Q9NZN4 543 aa2.98□□□□□ -1.93
RNU6-552P-201ENST00000362869 MARCH4Q9P2E8 410 aaPredicted RBP2.98□□□□□ -1.93
RNU6-552P-201ENST00000362869 POLG2Q9UHN1 485 aa2.98□□□□□ -1.93
RNU6-552P-201ENST00000362869 ERRFI1Q9UJM3 462 aaPredicted RBP2.98□□□□□ -1.93
RNU6-552P-201ENST00000362869 TCF19Q9Y242 345 aa2.98□□□□□ -1.93
RNU6-552P-201ENST00000362869 A0A1W2PP11 408 aa2.97□□□□□ -1.93
RNU6-552P-201ENST00000362869 OR5K3A6NET4 321 aa2.97□□□□□ -1.93
RNU6-552P-201ENST00000362869 B4E171 279 aa2.97□□□□□ -1.93
RNU6-552P-201ENST00000362869 TMEM178BH3BS89 294 aa2.97□□□□□ -1.93
RNU6-552P-201ENST00000362869 MAP2K7O14733 419 aa2.97□□□□□ -1.93
RNU6-552P-201ENST00000362869 DAB1O75553 588 aa2.97□□□□□ -1.93
RNU6-552P-201ENST00000362869 KCNK5O95279 499 aa2.97□□□□□ -1.93
RNU6-552P-201ENST00000362869 IGHV4-39P01824 125 aa2.97□□□□□ -1.93
RNU6-552P-201ENST00000362869 EIF2S1P05198 315 aaKnown RBP2.97□□□□□ -1.93
RNU6-552P-201ENST00000362869 CHMP24386 653 aa2.97□□□□□ -1.93
RNU6-552P-201ENST00000362869 NR2F2P24468 414 aa2.97□□□□□ -1.93
RNU6-552P-201ENST00000362869 NFKBIAP25963 317 aa2.97□□□□□ -1.93
RNU6-552P-201ENST00000362869 TSPAN7P41732 249 aa2.97□□□□□ -1.93
RNU6-552P-201ENST00000362869 TAS2R40P59535 323 aa2.97□□□□□ -1.93
RNU6-552P-201ENST00000362869 MPP1Q00013 466 aa2.97□□□□□ -1.93
RNU6-552P-201ENST00000362869 SREBF2Q12772 1141 aa2.97□□□□□ -1.93
RNU6-552P-201ENST00000362869 RBM39Q14498 530 aaKnown RBP2.97□□□□□ -1.93
RNU6-552P-201ENST00000362869 PLA2G4FQ68DD2 849 aa2.97□□□□□ -1.93
RNU6-552P-201ENST00000362869 GLDNQ6ZMI3 551 aaPredicted RBP2.97□□□□□ -1.93
RNU6-552P-201ENST00000362869 PXKQ7Z7A4 578 aa2.97□□□□□ -1.93
RNU6-552P-201ENST00000362869 PDILTQ8N807 584 aa2.97□□□□□ -1.93
RNU6-552P-201ENST00000362869 HM13Q8TCT9 377 aa2.97□□□□□ -1.93
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 26.9 ms