RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000362817.1

RNU1-38P-201, Transcript of RNA, U1 small nuclear 38, pseudogene, humanhuman

BASIC

Gene RNU1-38P, Length 144 nt, Biotype snRNA.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNU1-38P-201ENST00000362817 GALNT2Q10471 571 aa7.52□□□□□ -1.21
RNU1-38P-201ENST00000362817 SLC10A2Q12908 348 aaPredicted RBP7.52□□□□□ -1.21
RNU1-38P-201ENST00000362817 PAFAH1B3Q15102 231 aaKnown RBP7.52□□□□□ -1.21
RNU1-38P-201ENST00000362817 ZNF805Q5CZA5 627 aa7.52□□□□□ -1.21
RNU1-38P-201ENST00000362817 STPG1Q5TH74 334 aa7.52□□□□□ -1.21
RNU1-38P-201ENST00000362817 LRRC38Q5VT99 294 aa7.52□□□□□ -1.21
RNU1-38P-201ENST00000362817 USP53Q70EK8 1073 aa7.52□□□□□ -1.21
RNU1-38P-201ENST00000362817 ERN2Q76MJ5 926 aaKnown RBP7.52□□□□□ -1.21
RNU1-38P-201ENST00000362817 VSIG1Q86XK7 387 aa7.52□□□□□ -1.21
RNU1-38P-201ENST00000362817 MAP7D3Q8IWC1 876 aa7.52□□□□□ -1.21
RNU1-38P-201ENST00000362817 RYBPQ8N488 228 aaPredicted RBP7.52□□□□□ -1.21
RNU1-38P-201ENST00000362817 ZCCHC9Q8N567 271 aaKnown RBP7.52□□□□□ -1.21
RNU1-38P-201ENST00000362817 PPP1R16AQ96I34 528 aa7.52□□□□□ -1.21
RNU1-38P-201ENST00000362817 LRIG1Q96JA1 1093 aa7.52□□□□□ -1.21
RNU1-38P-201ENST00000362817 NSMCE3Q96MG7 304 aa7.52□□□□□ -1.21
RNU1-38P-201ENST00000362817 GDAP1L1Q96MZ0 367 aa7.52□□□□□ -1.21
RNU1-38P-201ENST00000362817 RNF157Q96PX1 679 aa7.52□□□□□ -1.21
RNU1-38P-201ENST00000362817 EDEM2Q9BV94 578 aa7.52□□□□□ -1.21
RNU1-38P-201ENST00000362817 SPATA9Q9BWV2 254 aa7.52□□□□□ -1.21
RNU1-38P-201ENST00000362817 NUSAP1Q9BXS6 441 aaKnown RBP7.52□□□□□ -1.21
RNU1-38P-201ENST00000362817 CALN1Q9BXU9 219 aa7.52□□□□□ -1.21
RNU1-38P-201ENST00000362817 ZCCHC4Q9H5U6 513 aa7.52□□□□□ -1.21
RNU1-38P-201ENST00000362817 PREBQ9HCU5 417 aa7.52□□□□□ -1.21
RNU1-38P-201ENST00000362817 DYRK4Q9NR20 520 aa7.52□□□□□ -1.21
RNU1-38P-201ENST00000362817 DLL3Q9NYJ7 618 aa7.52□□□□□ -1.21
RNU1-38P-201ENST00000362817 ZFR2Q9UPR6 939 aaKnown RBP7.52□□□□□ -1.21
RNU1-38P-201ENST00000362817 ADAMTS9Q9P2N4 1935 aa7.52□□□□□ -1.21
RNU1-38P-201ENST00000362817 GVINP1Q7Z2Y8 2422 aa7.51□□□□□ -1.21
RNU1-38P-201ENST00000362817 SDK1Q7Z5N4 2213 aa7.51□□□□□ -1.21
RNU1-38P-201ENST00000362817 RIF1Q5UIP0 2472 aaKnown RBP7.51□□□□□ -1.21
RNU1-38P-201ENST00000362817 TBC1D3DA0A087WVF3 549 aa7.51□□□□□ -1.21
RNU1-38P-201ENST00000362817 TBC1D3IA0A087WXS9 549 aa7.51□□□□□ -1.21
RNU1-38P-201ENST00000362817 TBC1D3EA0A087X179 549 aa7.51□□□□□ -1.21
RNU1-38P-201ENST00000362817 TBC1D3KA0A087X1G2 549 aa7.51□□□□□ -1.21
RNU1-38P-201ENST00000362817 LRRD1A4D1F6 860 aa7.51□□□□□ -1.21
RNU1-38P-201ENST00000362817 TBC1D3FA6NER0 549 aaPredicted RBP7.51□□□□□ -1.21
RNU1-38P-201ENST00000362817 C16orf96A6NNT2 1141 aa7.51□□□□□ -1.21
RNU1-38P-201ENST00000362817 TBC1D3LB9A6J9 549 aa7.51□□□□□ -1.21
RNU1-38P-201ENST00000362817 WNT9AO14904 365 aa7.51□□□□□ -1.21
RNU1-38P-201ENST00000362817 HGSO14964 777 aaPredicted RBP7.51□□□□□ -1.21
RNU1-38P-201ENST00000362817 PJA2O43164 708 aa7.51□□□□□ -1.21
RNU1-38P-201ENST00000362817 LATO43561 262 aa7.51□□□□□ -1.21
RNU1-38P-201ENST00000362817 PSTPIP1O43586 416 aa7.51□□□□□ -1.21
RNU1-38P-201ENST00000362817 SPOPO43791 374 aa7.51□□□□□ -1.21
RNU1-38P-201ENST00000362817 PALMO75781 387 aa7.51□□□□□ -1.21
RNU1-38P-201ENST00000362817 PIGNO95427 931 aa7.51□□□□□ -1.21
RNU1-38P-201ENST00000362817 TBC1D3HP0C7X1 549 aa7.51□□□□□ -1.21
RNU1-38P-201ENST00000362817 TNNT1P13805 278 aa7.51□□□□□ -1.21
RNU1-38P-201ENST00000362817 GNSP15586 552 aa7.51□□□□□ -1.21
RNU1-38P-201ENST00000362817 BMP7P18075 431 aa7.51□□□□□ -1.21
RNU1-38P-201ENST00000362817 GARSP41250 739 aaKnown RBP7.51□□□□□ -1.21
RNU1-38P-201ENST00000362817 ID4P47928 161 aa7.51□□□□□ -1.21
RNU1-38P-201ENST00000362817 CSNK1DP48730 415 aa7.51□□□□□ -1.21
RNU1-38P-201ENST00000362817 NEK3P51956 506 aa7.51□□□□□ -1.21
RNU1-38P-201ENST00000362817 VAV2P52735 878 aa7.51□□□□□ -1.21
RNU1-38P-201ENST00000362817 GBE1Q04446 702 aa7.51□□□□□ -1.21
RNU1-38P-201ENST00000362817 SLC10A7Q0GE19 358 aa7.51□□□□□ -1.21
RNU1-38P-201ENST00000362817 RFTN1Q14699 578 aaPredicted RBP7.51□□□□□ -1.21
RNU1-38P-201ENST00000362817 TAZQ16635 292 aa7.51□□□□□ -1.21
RNU1-38P-201ENST00000362817 ZFYVE27Q5T4F4 411 aa7.51□□□□□ -1.21
RNU1-38P-201ENST00000362817 TBC1D3GQ6DHY5 549 aa7.51□□□□□ -1.21
RNU1-38P-201ENST00000362817 TBC1D3CQ6IPX1 549 aa7.51□□□□□ -1.21
RNU1-38P-201ENST00000362817 C11orf63Q6NUN7 778 aa7.51□□□□□ -1.21
RNU1-38P-201ENST00000362817 LAYNQ6UX15 382 aa7.51□□□□□ -1.21
RNU1-38P-201ENST00000362817 MFSD7Q6UXD7 560 aa7.51□□□□□ -1.21
RNU1-38P-201ENST00000362817 GDPD4Q6W3E5 623 aa7.51□□□□□ -1.21
RNU1-38P-201ENST00000362817 TTLL10Q6ZVT0 673 aa7.51□□□□□ -1.21
RNU1-38P-201ENST00000362817 RABEPKQ7Z6M1 372 aa7.51□□□□□ -1.21
RNU1-38P-201ENST00000362817 MILR1Q7Z6M3 343 aa7.51□□□□□ -1.21
RNU1-38P-201ENST00000362817 TRIM69Q86WT6 500 aa7.51□□□□□ -1.21
RNU1-38P-201ENST00000362817 RHOT1Q8IXI2 618 aa7.51□□□□□ -1.21
RNU1-38P-201ENST00000362817 TBC1D3Q8IZP1 549 aaPredicted RBP7.51□□□□□ -1.21
RNU1-38P-201ENST00000362817 PGBD5Q8N414 524 aa7.51□□□□□ -1.21
RNU1-38P-201ENST00000362817 ATPAF2Q8N5M1 289 aa7.51□□□□□ -1.21
RNU1-38P-201ENST00000362817 PLD5Q8N7P1 536 aa7.51□□□□□ -1.21
RNU1-38P-201ENST00000362817 KLHL32Q96NJ5 620 aa7.51□□□□□ -1.21
RNU1-38P-201ENST00000362817 ZNF599Q96NL3 588 aa7.51□□□□□ -1.21
RNU1-38P-201ENST00000362817 DESI2Q9BSY9 194 aa7.51□□□□□ -1.21
RNU1-38P-201ENST00000362817 CINPQ9BW66 212 aaPredicted RBP7.51□□□□□ -1.21
RNU1-38P-201ENST00000362817 CPEB1Q9BZB8 566 aaKnown RBP7.51□□□□□ -1.21
RNU1-38P-201ENST00000362817 TM9SF3Q9HD45 589 aa7.51□□□□□ -1.21
RNU1-38P-201ENST00000362817 LUC7LQ9NQ29 371 aaKnown RBP7.51□□□□□ -1.21
RNU1-38P-201ENST00000362817 DTLQ9NZJ0 730 aa7.51□□□□□ -1.21
RNU1-38P-201ENST00000362817 FADS3Q9Y5Q0 445 aa7.51□□□□□ -1.21
RNU1-38P-201ENST00000362817 EP300Q09472 2414 aaPredicted RBP7.51□□□□□ -1.21
RNU1-38P-201ENST00000362817 A0A1B0GVT2 93 aa7.5□□□□□ -1.21
RNU1-38P-201ENST00000362817 A0A1W2PR77 199 aa7.5□□□□□ -1.21
RNU1-38P-201ENST00000362817 TSPAN11A1L157 253 aa7.5□□□□□ -1.21
RNU1-38P-201ENST00000362817 C4orf47A7E2U8 309 aa7.5□□□□□ -1.21
RNU1-38P-201ENST00000362817 SLC30A4O14863 429 aa7.5□□□□□ -1.21
RNU1-38P-201ENST00000362817 AP1G1O43747 822 aa7.5□□□□□ -1.21
RNU1-38P-201ENST00000362817 IPO7O95373 1038 aaKnown RBP7.5□□□□□ -1.21
RNU1-38P-201ENST00000362817 WNT1P04628 370 aa7.5□□□□□ -1.21
RNU1-38P-201ENST00000362817 CR2P20023 1033 aa7.5□□□□□ -1.21
RNU1-38P-201ENST00000362817 MAT2AP31153 395 aaKnown RBP7.5□□□□□ -1.21
RNU1-38P-201ENST00000362817 CDKN2BP42772 138 aa7.5□□□□□ -1.21
RNU1-38P-201ENST00000362817 MARCKSL1P49006 195 aa7.5□□□□□ -1.21
RNU1-38P-201ENST00000362817 CSNK1EP49674 416 aaKnown RBP7.5□□□□□ -1.21
RNU1-38P-201ENST00000362817 GSDMDP57764 484 aa7.5□□□□□ -1.21
RNU1-38P-201ENST00000362817 RAD51Q06609 339 aa7.5□□□□□ -1.21
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 36.2 ms