RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000334268.8

TRDN-201, Transcript of triadin, humanhuman

APPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC

Gene TRDN, Length 4,770 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRDN-201ENST00000334268 ADH1AP07327 375 aa3.12□□□□□ -1.91
TRDN-201ENST00000334268 CSH1P0DML2 217 aa3.12□□□□□ -1.91
TRDN-201ENST00000334268 CSH2P0DML3 217 aa3.12□□□□□ -1.91
TRDN-201ENST00000334268 CHRNA3P32297 505 aa3.12□□□□□ -1.91
TRDN-201ENST00000334268 TTKP33981 857 aa3.12□□□□□ -1.91
TRDN-201ENST00000334268 GRIK1P39086 918 aa3.12□□□□□ -1.91
TRDN-201ENST00000334268 MAPKAPK2P49137 400 aa3.12□□□□□ -1.91
TRDN-201ENST00000334268 MXRA7P84157 204 aa3.12□□□□□ -1.91
TRDN-201ENST00000334268 ZNF252P-AS1Q0IIN9 211 aa3.12□□□□□ -1.91
TRDN-201ENST00000334268 BST2Q10589 180 aaKnown RBP3.12□□□□□ -1.91
TRDN-201ENST00000334268 HYAL1Q12794 435 aa3.12□□□□□ -1.91
TRDN-201ENST00000334268 OVGP1Q12889 678 aa3.12□□□□□ -1.91
TRDN-201ENST00000334268 TAF10Q12962 218 aa3.12□□□□□ -1.91
TRDN-201ENST00000334268 SLC14A2Q15849 920 aa3.12□□□□□ -1.91
TRDN-201ENST00000334268 LINC01559Q495D7 138 aa3.12□□□□□ -1.91
TRDN-201ENST00000334268 PM20D1Q6GTS8 502 aa3.12□□□□□ -1.91
TRDN-201ENST00000334268 TMEM214Q6NUQ4 689 aaKnown RBP3.12□□□□□ -1.91
TRDN-201ENST00000334268 WDR93Q6P2C0 686 aa3.12□□□□□ -1.91
TRDN-201ENST00000334268 KLHL35Q6PF15 583 aa3.12□□□□□ -1.91
TRDN-201ENST00000334268 PAPD4Q6PIY7 484 aaKnown RBP3.12□□□□□ -1.91
TRDN-201ENST00000334268 ABRAXAS1Q6UWZ7 409 aa3.12□□□□□ -1.91
TRDN-201ENST00000334268 DENND5BQ6ZUT9 1274 aa3.12□□□□□ -1.91
TRDN-201ENST00000334268 NUDT18Q6ZVK8 323 aa3.12□□□□□ -1.91
TRDN-201ENST00000334268 ZNF677Q86XU0 584 aa3.12□□□□□ -1.91
TRDN-201ENST00000334268 PHF13Q86YI8 300 aaPredicted RBP3.12□□□□□ -1.91
TRDN-201ENST00000334268 SPATA2LQ8IUW3 424 aaPredicted RBP3.12□□□□□ -1.91
TRDN-201ENST00000334268 CROCCP3Q8IVE0 287 aa3.12□□□□□ -1.91
TRDN-201ENST00000334268 DCP1BQ8IZD4 617 aaKnown RBP3.12□□□□□ -1.91
TRDN-201ENST00000334268 GADD45GIP1Q8TAE8 222 aaPredicted RBP3.12□□□□□ -1.91
TRDN-201ENST00000334268 ZNF707Q96C28 371 aaPredicted RBP3.12□□□□□ -1.91
TRDN-201ENST00000334268 C18orf8Q96DM3 657 aa3.12□□□□□ -1.91
TRDN-201ENST00000334268 BTBD6Q96KE9 485 aa3.12□□□□□ -1.91
TRDN-201ENST00000334268 HSFY1Q96LI6 401 aa3.12□□□□□ -1.91
TRDN-201ENST00000334268 SAMD11Q96NU1 681 aa3.12□□□□□ -1.91
TRDN-201ENST00000334268 TRNT1Q96Q11 434 aaKnown RBP3.12□□□□□ -1.91
TRDN-201ENST00000334268 TXN2Q99757 166 aa3.12□□□□□ -1.91
TRDN-201ENST00000334268 SLX1AQ9BQ83 275 aa3.12□□□□□ -1.91
TRDN-201ENST00000334268 LRRC1Q9BTT6 524 aa3.12□□□□□ -1.91
TRDN-201ENST00000334268 ZNF416Q9BWM5 594 aa3.12□□□□□ -1.91
TRDN-201ENST00000334268 MAGEB5Q9BZ81 275 aa3.12□□□□□ -1.91
TRDN-201ENST00000334268 ULBP1Q9BZM6 244 aa3.12□□□□□ -1.91
TRDN-201ENST00000334268 TRIM31Q9BZY9 425 aa3.12□□□□□ -1.91
TRDN-201ENST00000334268 L2HGDHQ9H9P8 463 aa3.12□□□□□ -1.91
TRDN-201ENST00000334268 LIN28AQ9H9Z2 209 aaKnown RBP3.12□□□□□ -1.91
TRDN-201ENST00000334268 APOBEC3CQ9NRW3 190 aaKnown RBP eCLIP3.12□□□□□ -1.91
TRDN-201ENST00000334268 PSD3Q9NYI0 1048 aa3.12□□□□□ -1.91
TRDN-201ENST00000334268 IL37Q9NZH6 218 aa3.12□□□□□ -1.91
TRDN-201ENST00000334268 CLEC1BQ9P126 229 aa3.12□□□□□ -1.91
TRDN-201ENST00000334268 ZNF225Q9UK10 706 aa3.12□□□□□ -1.91
TRDN-201ENST00000334268 TMEM59LQ9UK28 342 aa3.12□□□□□ -1.91
TRDN-201ENST00000334268 PLA2G4CQ9UP65 541 aa3.12□□□□□ -1.91
TRDN-201ENST00000334268 YIPF1Q9Y548 306 aa3.12□□□□□ -1.91
TRDN-201ENST00000334268 TECTAO75443 2155 aa3.12□□□□□ -1.91
TRDN-201ENST00000334268 A0A0A6YYH2 397 aa3.12□□□□□ -1.91
TRDN-201ENST00000334268 C1orf232A0A0U1RR37 186 aa3.12□□□□□ -1.91
TRDN-201ENST00000334268 C5orf51A6NDU8 294 aa3.12□□□□□ -1.91
TRDN-201ENST00000334268 A6NJ64 397 aa3.12□□□□□ -1.91
TRDN-201ENST00000334268 H0Y8G0 127 aa3.12□□□□□ -1.91
TRDN-201ENST00000334268 H7C4K7 107 aa3.12□□□□□ -1.91
TRDN-201ENST00000334268 KRIT1O00522 736 aa3.12□□□□□ -1.91
TRDN-201ENST00000334268 CLPTM1O96005 669 aa3.12□□□□□ -1.91
TRDN-201ENST00000334268 GLUD1P00367 558 aa3.12□□□□□ -1.91
TRDN-201ENST00000334268 SNRNP70P08621 437 aaKnown RBP3.12□□□□□ -1.91
TRDN-201ENST00000334268 H2AFZP0C0S5 128 aa3.12□□□□□ -1.91
TRDN-201ENST00000334268 TMIGD3P0DMS9 266 aaPredicted RBP3.12□□□□□ -1.91
TRDN-201ENST00000334268 IGFBP4P22692 258 aa3.12□□□□□ -1.91
TRDN-201ENST00000334268 MAGEA11P43364 429 aa3.12□□□□□ -1.91
TRDN-201ENST00000334268 GBX2P52951 348 aaPredicted RBP3.12□□□□□ -1.91
TRDN-201ENST00000334268 PSMD4P55036 377 aaKnown RBP3.12□□□□□ -1.91
TRDN-201ENST00000334268 HDAC4P56524 1084 aa3.12□□□□□ -1.91
TRDN-201ENST00000334268 CORO7P57737 925 aa3.12□□□□□ -1.91
TRDN-201ENST00000334268 ACTR1AP61163 376 aa3.12□□□□□ -1.91
TRDN-201ENST00000334268 TWF1Q12792 350 aa3.12□□□□□ -1.91
TRDN-201ENST00000334268 TRAP1Q12931 704 aaKnown RBP3.12□□□□□ -1.91
TRDN-201ENST00000334268 PPP1R8Q12972 351 aaKnown RBP3.12□□□□□ -1.91
TRDN-201ENST00000334268 ABRQ12979 859 aa3.12□□□□□ -1.91
TRDN-201ENST00000334268 SLC5A9Q2M3M2 681 aa3.12□□□□□ -1.91
TRDN-201ENST00000334268 CCDC58Q4VC31 144 aa3.12□□□□□ -1.91
TRDN-201ENST00000334268 TM4SF20Q53R12 229 aa3.12□□□□□ -1.91
TRDN-201ENST00000334268 FAM76BQ5HYJ3 339 aa3.12□□□□□ -1.91
TRDN-201ENST00000334268 TPGS2Q68CL5 300 aa3.12□□□□□ -1.91
TRDN-201ENST00000334268 PLEKHA7Q6IQ23 1121 aa3.12□□□□□ -1.91
TRDN-201ENST00000334268 H2AFVQ71UI9 128 aa3.12□□□□□ -1.91
TRDN-201ENST00000334268 SMIM15Q7Z3B0 74 aa3.12□□□□□ -1.91
TRDN-201ENST00000334268 ERICH1Q86X53 443 aa3.12□□□□□ -1.91
TRDN-201ENST00000334268 XYLT1Q86Y38 959 aa3.12□□□□□ -1.91
TRDN-201ENST00000334268 SPNS2Q8IVW8 549 aa3.12□□□□□ -1.91
TRDN-201ENST00000334268 MARVELD2Q8N4S9 558 aa3.12□□□□□ -1.91
TRDN-201ENST00000334268 ARFGAP1Q8N6T3 406 aa3.12□□□□□ -1.91
TRDN-201ENST00000334268 RASGEF1AQ8N9B8 481 aa3.12□□□□□ -1.91
TRDN-201ENST00000334268 HLA-CQ95604 372 aa3.12□□□□□ -1.91
TRDN-201ENST00000334268 MIEF2Q96C03 454 aa3.12□□□□□ -1.91
TRDN-201ENST00000334268 SDCCAG3Q96C92 435 aa3.12□□□□□ -1.91
TRDN-201ENST00000334268 RNF125Q96EQ8 232 aa3.12□□□□□ -1.91
TRDN-201ENST00000334268 MCRS1Q96EZ8 462 aa3.12□□□□□ -1.91
TRDN-201ENST00000334268 AGAP3Q96P47 875 aa3.12□□□□□ -1.91
TRDN-201ENST00000334268 FAM111AQ96PZ2 611 aa3.12□□□□□ -1.91
TRDN-201ENST00000334268 CYP2S1Q96SQ9 504 aa3.12□□□□□ -1.91
TRDN-201ENST00000334268 GORASP1Q9BQQ3 440 aa3.12□□□□□ -1.91
TRDN-201ENST00000334268 MED10Q9BTT4 135 aa3.12□□□□□ -1.91
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 35.1 ms