RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000309641.10

PDE4D-201, Transcript of phosphodiesterase 4D, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene PDE4D, Length 2,025 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE4D-201ENST00000309641 ASMTLO95671 621 aa9.01□□□□□ -0.97
PDE4D-201ENST00000309641 CSF2P04141 144 aa9.01□□□□□ -0.97
PDE4D-201ENST00000309641 F7P08709 466 aaPredicted RBP9.01□□□□□ -0.97
PDE4D-201ENST00000309641 HOXC4P09017 264 aaPredicted RBP9.01□□□□□ -0.97
PDE4D-201ENST00000309641 MLNP12872 115 aa9.01□□□□□ -0.97
PDE4D-201ENST00000309641 CD59P13987 128 aa9.01□□□□□ -0.97
PDE4D-201ENST00000309641 NME1P15531 152 aaKnown RBP9.01□□□□□ -0.97
PDE4D-201ENST00000309641 JUNDP17535 347 aa9.01□□□□□ -0.97
PDE4D-201ENST00000309641 PSMA3P25788 255 aa9.01□□□□□ -0.97
PDE4D-201ENST00000309641 TEAD1P28347 426 aa9.01□□□□□ -0.97
PDE4D-201ENST00000309641 HK3P52790 923 aa9.01□□□□□ -0.97
PDE4D-201ENST00000309641 PPARDQ03181 441 aa9.01□□□□□ -0.97
PDE4D-201ENST00000309641 ACVR1Q04771 509 aa9.01□□□□□ -0.97
PDE4D-201ENST00000309641 NFATC2Q13469 925 aa9.01□□□□□ -0.97
PDE4D-201ENST00000309641 TUBB2AQ13885 445 aa9.01□□□□□ -0.97
PDE4D-201ENST00000309641 FASTKD3Q14CZ7 662 aaKnown RBP9.01□□□□□ -0.97
PDE4D-201ENST00000309641 MORF4L2Q15014 288 aa9.01□□□□□ -0.97
PDE4D-201ENST00000309641 DNTTIP2Q5QJE6 756 aaKnown RBP9.01□□□□□ -0.97
PDE4D-201ENST00000309641 CASC4Q6P4E1 433 aa9.01□□□□□ -0.97
PDE4D-201ENST00000309641 KANSL1Q7Z3B3 1105 aa9.01□□□□□ -0.97
PDE4D-201ENST00000309641 HOOK3Q86VS8 718 aa9.01□□□□□ -0.97
PDE4D-201ENST00000309641 DCP2Q8IU60 420 aaKnown RBP9.01□□□□□ -0.97
PDE4D-201ENST00000309641 PHACTR4Q8IZ21 702 aa9.01□□□□□ -0.97
PDE4D-201ENST00000309641 PPHLN1Q8NEY8 458 aaKnown RBP9.01□□□□□ -0.97
PDE4D-201ENST00000309641 FAM174AQ8TBP5 190 aa9.01□□□□□ -0.97
PDE4D-201ENST00000309641 CAMK1GQ96NX5 476 aa9.01□□□□□ -0.97
PDE4D-201ENST00000309641 LRRC61Q9BV99 259 aa9.01□□□□□ -0.97
PDE4D-201ENST00000309641 TUBB2BQ9BVA1 445 aa9.01□□□□□ -0.97
PDE4D-201ENST00000309641 KIFC1Q9BW19 673 aa9.01□□□□□ -0.97
PDE4D-201ENST00000309641 CLPBQ9H078 707 aa9.01□□□□□ -0.97
PDE4D-201ENST00000309641 TMEM168Q9H0V1 697 aa9.01□□□□□ -0.97
PDE4D-201ENST00000309641 CDH19Q9H159 772 aa9.01□□□□□ -0.97
PDE4D-201ENST00000309641 PLAC1Q9HBJ0 212 aa9.01□□□□□ -0.97
PDE4D-201ENST00000309641 XAB2Q9HCS7 855 aaKnown RBP9.01□□□□□ -0.97
PDE4D-201ENST00000309641 TREX1Q9NSU2 369 aa9.01□□□□□ -0.97
PDE4D-201ENST00000309641 DNAAF2Q9NVR5 837 aaKnown RBP9.01□□□□□ -0.97
PDE4D-201ENST00000309641 KLQ9UEF7 1012 aa9.01□□□□□ -0.97
PDE4D-201ENST00000309641 SUFUQ9UMX1 484 aa9.01□□□□□ -0.97
PDE4D-201ENST00000309641 SLC17A4Q9Y2C5 497 aa9.01□□□□□ -0.97
PDE4D-201ENST00000309641 MAD1L1Q9Y6D9 718 aa9.01□□□□□ -0.97
PDE4D-201ENST00000309641 GOLGA4Q13439 2230 aaKnown RBP9.01□□□□□ -0.97
PDE4D-201ENST00000309641 SPTBN2O15020 2390 aa9□□□□□ -0.97
PDE4D-201ENST00000309641 SDR42E2A6NKP2 422 aa9□□□□□ -0.97
PDE4D-201ENST00000309641 AGAP14A8MT82 685 aa9□□□□□ -0.97
PDE4D-201ENST00000309641 H7C0S8 307 aa9□□□□□ -0.97
PDE4D-201ENST00000309641 DNAJC6O75061 913 aa9□□□□□ -0.97
PDE4D-201ENST00000309641 PIAS2O75928 621 aa9□□□□□ -0.97
PDE4D-201ENST00000309641 CER1O95813 267 aa9□□□□□ -0.97
PDE4D-201ENST00000309641 GOT2P00505 430 aaKnown RBP9□□□□□ -0.97
PDE4D-201ENST00000309641 GIMD1P0DJR0 217 aa9□□□□□ -0.97
PDE4D-201ENST00000309641 ZNF8P17098 575 aaPredicted RBP9□□□□□ -0.97
PDE4D-201ENST00000309641 DGKAP23743 735 aa9□□□□□ -0.97
PDE4D-201ENST00000309641 HTR1BP28222 390 aa9□□□□□ -0.97
PDE4D-201ENST00000309641 EPHA8P29322 1005 aaPredicted RBP9□□□□□ -0.97
PDE4D-201ENST00000309641 FOXN2P32314 431 aa9□□□□□ -0.97
PDE4D-201ENST00000309641 HADHAP40939 763 aa9□□□□□ -0.97
PDE4D-201ENST00000309641 RXRGP48443 463 aa9□□□□□ -0.97
PDE4D-201ENST00000309641 SARNPP82979 210 aaKnown RBP9□□□□□ -0.97
PDE4D-201ENST00000309641 B4GALNT1Q00973 533 aa9□□□□□ -0.97
PDE4D-201ENST00000309641 PDE1BQ01064 536 aa9□□□□□ -0.97
PDE4D-201ENST00000309641 DHX9Q08211 1270 aaKnown RBP9□□□□□ -0.97
PDE4D-201ENST00000309641 PTK2BQ14289 1009 aa9□□□□□ -0.97
PDE4D-201ENST00000309641 SEMA3AQ14563 771 aa9□□□□□ -0.97
PDE4D-201ENST00000309641 SKIDA1Q1XH10 827 aa9□□□□□ -0.97
PDE4D-201ENST00000309641 BBS9Q3SYG4 887 aa9□□□□□ -0.97
PDE4D-201ENST00000309641 PRRT3Q5FWE3 981 aa9□□□□□ -0.97
PDE4D-201ENST00000309641 ZRANB3Q5FWF4 1079 aa9□□□□□ -0.97
PDE4D-201ENST00000309641 GPRC6AQ5T6X5 926 aa9□□□□□ -0.97
PDE4D-201ENST00000309641 IL27RAQ6UWB1 636 aa9□□□□□ -0.97
PDE4D-201ENST00000309641 ZDHHC24Q6UX98 284 aa9□□□□□ -0.97
PDE4D-201ENST00000309641 ADGRG6Q86SQ4 1221 aa9□□□□□ -0.97
PDE4D-201ENST00000309641 LDB1Q86U70 411 aaPredicted RBP9□□□□□ -0.97
PDE4D-201ENST00000309641 SFTPA2Q8IWL1 248 aa9□□□□□ -0.97
PDE4D-201ENST00000309641 UNC5BQ8IZJ1 945 aa9□□□□□ -0.97
PDE4D-201ENST00000309641 MNS1Q8NEH6 495 aa9□□□□□ -0.97
PDE4D-201ENST00000309641 GDAP1Q8TB36 358 aa9□□□□□ -0.97
PDE4D-201ENST00000309641 SAP25Q8TEE9 199 aa9□□□□□ -0.97
PDE4D-201ENST00000309641 BOCQ9BWV1 1114 aa9□□□□□ -0.97
PDE4D-201ENST00000309641 OR2AG1Q9H205 316 aa9□□□□□ -0.97
PDE4D-201ENST00000309641 CARS2Q9HA77 564 aaKnown RBP9□□□□□ -0.97
PDE4D-201ENST00000309641 RAD18Q9NS91 495 aa9□□□□□ -0.97
PDE4D-201ENST00000309641 MARCH4Q9P2E8 410 aaPredicted RBP9□□□□□ -0.97
PDE4D-201ENST00000309641 APOBEC3BQ9UH17 382 aaKnown RBP9□□□□□ -0.97
PDE4D-201ENST00000309641 APPL1Q9UKG1 709 aa9□□□□□ -0.97
PDE4D-201ENST00000309641 SOX13Q9UN79 622 aa9□□□□□ -0.97
PDE4D-201ENST00000309641 BHMG1C9JSJ3 638 aaPredicted RBP9□□□□□ -0.97
PDE4D-201ENST00000309641 TOR1BO14657 336 aa9□□□□□ -0.97
PDE4D-201ENST00000309641 SH3BP5O60239 455 aa9□□□□□ -0.97
PDE4D-201ENST00000309641 RASGRP1O95267 797 aa9□□□□□ -0.97
PDE4D-201ENST00000309641 VAPBO95292 243 aa9□□□□□ -0.97
PDE4D-201ENST00000309641 GNPDA1P46926 289 aa9□□□□□ -0.97
PDE4D-201ENST00000309641 ARRB1P49407 418 aaPredicted RBP9□□□□□ -0.97
PDE4D-201ENST00000309641 CCT8P50990 548 aa9□□□□□ -0.97
PDE4D-201ENST00000309641 CTSCP53634 463 aa9□□□□□ -0.97
PDE4D-201ENST00000309641 PLTPP55058 493 aa9□□□□□ -0.97
PDE4D-201ENST00000309641 GUCY2DQ02846 1103 aa9□□□□□ -0.97
PDE4D-201ENST00000309641 ZDHHC20Q5W0Z9 365 aa9□□□□□ -0.97
PDE4D-201ENST00000309641 PCGF5Q86SE9 256 aa9□□□□□ -0.97
PDE4D-201ENST00000309641 PHYKPLQ8IUZ5 450 aa9□□□□□ -0.97
PDE4D-201ENST00000309641 ZNF547Q8IVP9 402 aa9□□□□□ -0.97
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 24.6 ms