RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000280780.6

FAM53B-201, Transcript of family with sequence similarity 53 member B, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene FAM53B, Length 1,568 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM53B-201ENST00000280780 TRIM61Q5EBN2 209 aa22.19■■□□□ 1.14
FAM53B-201ENST00000280780 WDR45BQ5MNZ6 344 aa22.19■■□□□ 1.14
FAM53B-201ENST00000280780 AGBL2Q5U5Z8 902 aa22.19■■□□□ 1.14
FAM53B-201ENST00000280780 PTAR1Q7Z6K3 402 aaPredicted RBP22.19■■□□□ 1.14
FAM53B-201ENST00000280780 KCNMB4Q86W47 210 aa22.19■■□□□ 1.14
FAM53B-201ENST00000280780 TRIM69Q86WT6 500 aa22.19■■□□□ 1.14
FAM53B-201ENST00000280780 RAVER1Q8IY67 606 aaKnown RBP22.19■■□□□ 1.14
FAM53B-201ENST00000280780 NRSN1Q8IZ57 195 aa22.19■■□□□ 1.14
FAM53B-201ENST00000280780 NUS1Q96E22 293 aa22.19■■□□□ 1.14
FAM53B-201ENST00000280780 PGM2Q96G03 612 aa22.19■■□□□ 1.14
FAM53B-201ENST00000280780 RIOK2Q9BVS4 552 aaKnown RBP22.19■■□□□ 1.14
FAM53B-201ENST00000280780 FAM83DQ9H4H8 585 aa22.19■■□□□ 1.14
FAM53B-201ENST00000280780 PPCSQ9HAB8 311 aa22.19■■□□□ 1.14
FAM53B-201ENST00000280780 SPEGQ15772 3267 aa22.18■■□□□ 1.14
FAM53B-201ENST00000280780 LNP1A1A4G5 178 aa22.18■■□□□ 1.14
FAM53B-201ENST00000280780 FAM159BA6NKW6 160 aa22.18■■□□□ 1.14
FAM53B-201ENST00000280780 K7ESM1 405 aa22.18■■□□□ 1.14
FAM53B-201ENST00000280780 RAD51BO15315 384 aa22.18■■□□□ 1.14
FAM53B-201ENST00000280780 PRAMEF1O95521 474 aa22.18■■□□□ 1.14
FAM53B-201ENST00000280780 SOD1P00441 154 aa22.18■■□□□ 1.14
FAM53B-201ENST00000280780 PAMP19021 973 aa22.18■■□□□ 1.14
FAM53B-201ENST00000280780 PHBP35232 272 aa22.18■■□□□ 1.14
FAM53B-201ENST00000280780 AGERQ15109 404 aa22.18■■□□□ 1.14
FAM53B-201ENST00000280780 KRT71Q3SY84 523 aa22.18■■□□□ 1.14
FAM53B-201ENST00000280780 PDPK2PQ6A1A2 396 aa22.18■■□□□ 1.14
FAM53B-201ENST00000280780 SLC23A3Q6PIS1 610 aa22.18■■□□□ 1.14
FAM53B-201ENST00000280780 AFTPHQ6ULP2 937 aa22.18■■□□□ 1.14
FAM53B-201ENST00000280780 LAYNQ6UX15 382 aa22.18■■□□□ 1.14
FAM53B-201ENST00000280780 KDM7AQ6ZMT4 941 aa22.18■■□□□ 1.14
FAM53B-201ENST00000280780 CYS1Q717R9 158 aa22.18■■□□□ 1.14
FAM53B-201ENST00000280780 PIANPQ8IYJ0 282 aa22.18■■□□□ 1.14
FAM53B-201ENST00000280780 SLC17A9Q9BYT1 436 aa22.18■■□□□ 1.14
FAM53B-201ENST00000280780 FAM96AQ9H5X1 160 aa22.18■■□□□ 1.14
FAM53B-201ENST00000280780 ACSS3Q9H6R3 686 aa22.18■■□□□ 1.14
FAM53B-201ENST00000280780 CAPN10Q9HC96 672 aa22.18■■□□□ 1.14
FAM53B-201ENST00000280780 TMPRSS11EQ9UL52 423 aa22.18■■□□□ 1.14
FAM53B-201ENST00000280780 CEP250Q9BV73 2442 aa22.18■■□□□ 1.14
FAM53B-201ENST00000280780 A0A1W2PPC4 97 aa22.17■■□□□ 1.14
FAM53B-201ENST00000280780 FADS2P1A8MWK0 482 aa22.17■■□□□ 1.14
FAM53B-201ENST00000280780 LATO43561 262 aa22.17■■□□□ 1.14
FAM53B-201ENST00000280780 SRP72O76094 671 aaKnown RBP22.17■■□□□ 1.14
FAM53B-201ENST00000280780 PAK4O96013 591 aaPredicted RBP22.17■■□□□ 1.14
FAM53B-201ENST00000280780 IVLP07476 585 aa22.17■■□□□ 1.14
FAM53B-201ENST00000280780 STX2P32856 288 aa22.17■■□□□ 1.14
FAM53B-201ENST00000280780 CCR5P51681 352 aa22.17■■□□□ 1.14
FAM53B-201ENST00000280780 BNC1Q01954 994 aa22.17■■□□□ 1.14
FAM53B-201ENST00000280780 RASA2Q15283 850 aa22.17■■□□□ 1.14
FAM53B-201ENST00000280780 DUOXA1Q1HG43 343 aa22.17■■□□□ 1.14
FAM53B-201ENST00000280780 WSCD2Q2TBF2 565 aa22.17■■□□□ 1.14
FAM53B-201ENST00000280780 KBTBD12Q3ZCT8 623 aa22.17■■□□□ 1.14
FAM53B-201ENST00000280780 PSAPL1Q6NUJ1 521 aa22.17■■□□□ 1.14
FAM53B-201ENST00000280780 ZNF765Q7L2R6 523 aa22.17■■□□□ 1.14
FAM53B-201ENST00000280780 OR4L1Q8NH43 312 aa22.17■■□□□ 1.14
FAM53B-201ENST00000280780 AP2M1Q96CW1 435 aa22.17■■□□□ 1.14
FAM53B-201ENST00000280780 SGSM3Q96HU1 749 aa22.17■■□□□ 1.14
FAM53B-201ENST00000280780 ATP6V1G3Q96LB4 118 aa22.17■■□□□ 1.14
FAM53B-201ENST00000280780 KLF6Q99612 283 aaPredicted RBP22.17■■□□□ 1.14
FAM53B-201ENST00000280780 CCDC77Q9BR77 488 aa22.17■■□□□ 1.14
FAM53B-201ENST00000280780 PCDH15Q96QU1 1955 aa22.17■■□□□ 1.14
FAM53B-201ENST00000280780 CACNA1EQ15878 2313 aa22.17■■□□□ 1.14
FAM53B-201ENST00000280780 HMGB1P1B2RPK0 211 aaPredicted RBP22.16■■□□□ 1.14
FAM53B-201ENST00000280780 KHNYNO15037 678 aaKnown RBP22.16■■□□□ 1.14
FAM53B-201ENST00000280780 UGT1A9O60656 530 aa22.16■■□□□ 1.14
FAM53B-201ENST00000280780 UGT1A6P19224 532 aa22.16■■□□□ 1.14
FAM53B-201ENST00000280780 UGT1A1P22309 533 aa22.16■■□□□ 1.14
FAM53B-201ENST00000280780 UGT1A4P22310 534 aa22.16■■□□□ 1.14
FAM53B-201ENST00000280780 CD27P26842 260 aa22.16■■□□□ 1.14
FAM53B-201ENST00000280780 UGT1A3P35503 534 aa22.16■■□□□ 1.14
FAM53B-201ENST00000280780 UGT1A5P35504 534 aa22.16■■□□□ 1.14
FAM53B-201ENST00000280780 MGAT5Q09328 741 aa22.16■■□□□ 1.14
FAM53B-201ENST00000280780 ATP13A5Q4VNC0 1218 aa22.16■■□□□ 1.14
FAM53B-201ENST00000280780 TNFAIP8L3Q5GJ75 292 aa22.16■■□□□ 1.14
FAM53B-201ENST00000280780 TEDDM1Q5T9Z0 273 aa22.16■■□□□ 1.14
FAM53B-201ENST00000280780 ZDHHC20Q5W0Z9 365 aa22.16■■□□□ 1.14
FAM53B-201ENST00000280780 NEPROQ6NW34 567 aa22.16■■□□□ 1.14
FAM53B-201ENST00000280780 LDB1Q86U70 411 aaPredicted RBP22.16■■□□□ 1.14
FAM53B-201ENST00000280780 TDRPQ86YL5 185 aa22.16■■□□□ 1.14
FAM53B-201ENST00000280780 DENND6AQ8IWF6 608 aa22.16■■□□□ 1.14
FAM53B-201ENST00000280780 CNTN4Q8IWV2 1026 aa22.16■■□□□ 1.14
FAM53B-201ENST00000280780 TP53I13Q8NBR0 393 aaPredicted RBP22.16■■□□□ 1.14
FAM53B-201ENST00000280780 PLA2G15Q8NCC3 412 aa22.16■■□□□ 1.14
FAM53B-201ENST00000280780 UGT1A7Q9HAW7 530 aa22.16■■□□□ 1.14
FAM53B-201ENST00000280780 UGT1A10Q9HAW8 530 aa22.16■■□□□ 1.14
FAM53B-201ENST00000280780 UGT1A8Q9HAW9 530 aa22.16■■□□□ 1.14
FAM53B-201ENST00000280780 TM9SF3Q9HD45 589 aa22.16■■□□□ 1.14
FAM53B-201ENST00000280780 FZD3Q9NPG1 666 aa22.16■■□□□ 1.14
FAM53B-201ENST00000280780 PPANQ9NQ55 473 aaKnown RBP22.16■■□□□ 1.14
FAM53B-201ENST00000280780 MBNL1Q9NR56 388 aaKnown RBP22.16■■□□□ 1.14
FAM53B-201ENST00000280780 IARS2Q9NSE4 1012 aaKnown RBP22.16■■□□□ 1.14
FAM53B-201ENST00000280780 APPL1Q9UKG1 709 aa22.16■■□□□ 1.14
FAM53B-201ENST00000280780 SPTBN4Q9H254 2564 aa22.16■■□□□ 1.14
FAM53B-201ENST00000280780 RASGRF2O14827 1237 aa22.16■■□□□ 1.14
FAM53B-201ENST00000280780 BCAT2O15382 392 aaPredicted RBP22.16■■□□□ 1.14
FAM53B-201ENST00000280780 CFIP05156 583 aa22.16■■□□□ 1.14
FAM53B-201ENST00000280780 CSNK1EP49674 416 aaKnown RBP22.16■■□□□ 1.14
FAM53B-201ENST00000280780 DPTQ07507 201 aa22.16■■□□□ 1.14
FAM53B-201ENST00000280780 NFATC2Q13469 925 aa22.16■■□□□ 1.14
FAM53B-201ENST00000280780 RIBC1Q8N443 379 aaPredicted RBP22.16■■□□□ 1.14
FAM53B-201ENST00000280780 OR2I1PQ8NGU4 316 aa22.16■■□□□ 1.14
FAM53B-201ENST00000280780 CENPTQ96BT3 561 aa22.16■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 38 ms