RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000277657.12

CCDC7-201, Transcript of coiled-coil domain containing 7, humanhuman

APPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC

Gene CCDC7, Length 1,899 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC7-201ENST00000277657 CES5AQ6NT32 575 aa21.9■■□□□ 1.1
CCDC7-201ENST00000277657 NXPE1Q8N323 547 aa21.9■■□□□ 1.1
CCDC7-201ENST00000277657 ZNF366Q8N895 744 aa21.9■■□□□ 1.1
CCDC7-201ENST00000277657 TERB1Q8NA31 727 aa21.9■■□□□ 1.1
CCDC7-201ENST00000277657 GIMAP7Q8NHV1 300 aa21.9■■□□□ 1.1
CCDC7-201ENST00000277657 KIAA1191Q96A73 305 aa21.9■■□□□ 1.1
CCDC7-201ENST00000277657 CCDC97Q96F63 343 aaPredicted RBP21.9■■□□□ 1.1
CCDC7-201ENST00000277657 ACSS2Q9NR19 701 aa21.9■■□□□ 1.1
CCDC7-201ENST00000277657 DNAJC28Q9NX36 388 aa21.9■■□□□ 1.1
CCDC7-201ENST00000277657 TRMT6Q9UJA5 497 aaKnown RBP21.9■■□□□ 1.1
CCDC7-201ENST00000277657 SZT2Q5T011 3432 aa21.89■■□□□ 1.1
CCDC7-201ENST00000277657 TSPAN12O95859 305 aa21.89■■□□□ 1.09
CCDC7-201ENST00000277657 VIPR1P32241 457 aa21.89■■□□□ 1.09
CCDC7-201ENST00000277657 LIG3P49916 1009 aa21.89■■□□□ 1.09
CCDC7-201ENST00000277657 CLCN7P51798 805 aa21.89■■□□□ 1.09
CCDC7-201ENST00000277657 OR4D1Q15615 310 aa21.89■■□□□ 1.09
CCDC7-201ENST00000277657 CTC1Q2NKJ3 1217 aa21.89■■□□□ 1.09
CCDC7-201ENST00000277657 SIDT2Q8NBJ9 832 aaKnown RBP21.89■■□□□ 1.09
CCDC7-201ENST00000277657 ELSPBP1Q96BH3 223 aa21.89■■□□□ 1.09
CCDC7-201ENST00000277657 TMEM237Q96Q45 408 aa21.89■■□□□ 1.09
CCDC7-201ENST00000277657 ATOH8Q96SQ7 321 aa21.89■■□□□ 1.09
CCDC7-201ENST00000277657 EBF4Q9BQW3 602 aa21.89■■□□□ 1.09
CCDC7-201ENST00000277657 BOCQ9BWV1 1114 aa21.89■■□□□ 1.09
CCDC7-201ENST00000277657 CLPBQ9H078 707 aa21.89■■□□□ 1.09
CCDC7-201ENST00000277657 CRLS1Q9UJA2 301 aa21.89■■□□□ 1.09
CCDC7-201ENST00000277657 DNAJC8O75937 253 aaPredicted RBP21.88■■□□□ 1.09
CCDC7-201ENST00000277657 LAMP2P13473 410 aa21.88■■□□□ 1.09
CCDC7-201ENST00000277657 PSMC3P17980 439 aa21.88■■□□□ 1.09
CCDC7-201ENST00000277657 GJA4P35212 333 aa21.88■■□□□ 1.09
CCDC7-201ENST00000277657 CCR10P46092 362 aa21.88■■□□□ 1.09
CCDC7-201ENST00000277657 NCALDP61601 193 aa21.88■■□□□ 1.09
CCDC7-201ENST00000277657 ZBTB16Q05516 673 aa21.88■■□□□ 1.09
CCDC7-201ENST00000277657 PRKAA1Q13131 559 aa21.88■■□□□ 1.09
CCDC7-201ENST00000277657 GRM2Q14416 872 aa21.88■■□□□ 1.09
CCDC7-201ENST00000277657 HNRNPA1L2Q32P51 320 aaKnown RBP21.88■■□□□ 1.09
CCDC7-201ENST00000277657 FAM91A1Q658Y4 838 aa21.88■■□□□ 1.09
CCDC7-201ENST00000277657 UGT3A1Q6NUS8 523 aa21.88■■□□□ 1.09
CCDC7-201ENST00000277657 RFLNAQ6ZTI6 216 aa21.88■■□□□ 1.09
CCDC7-201ENST00000277657 ALYREFQ86V81 257 aaKnown RBP21.88■■□□□ 1.09
CCDC7-201ENST00000277657 CCNYL1Q8N7R7 359 aa21.88■■□□□ 1.09
CCDC7-201ENST00000277657 CNDP1Q96KN2 507 aa21.88■■□□□ 1.09
CCDC7-201ENST00000277657 PCDH12Q9NPG4 1184 aa21.88■■□□□ 1.09
CCDC7-201ENST00000277657 DHRS7Q9Y394 339 aa21.88■■□□□ 1.09
CCDC7-201ENST00000277657 E5RI56 91 aa21.88■■□□□ 1.09
CCDC7-201ENST00000277657 CHRM3P20309 590 aa21.88■■□□□ 1.09
CCDC7-201ENST00000277657 NFKBIAP25963 317 aa21.88■■□□□ 1.09
CCDC7-201ENST00000277657 HK2P52789 917 aa21.88■■□□□ 1.09
CCDC7-201ENST00000277657 DLX2Q07687 328 aaPredicted RBP21.88■■□□□ 1.09
CCDC7-201ENST00000277657 TUBB3Q13509 450 aa21.88■■□□□ 1.09
CCDC7-201ENST00000277657 ARHGEF7Q14155 803 aa21.88■■□□□ 1.09
CCDC7-201ENST00000277657 FNDC3BQ53EP0 1204 aaKnown RBP21.88■■□□□ 1.09
CCDC7-201ENST00000277657 NAIF1Q69YI7 327 aaPredicted RBP21.88■■□□□ 1.09
CCDC7-201ENST00000277657 SFTPA1Q8IWL2 248 aa21.88■■□□□ 1.09
CCDC7-201ENST00000277657 YAF2Q8IY57 180 aa21.88■■□□□ 1.09
CCDC7-201ENST00000277657 CYP4F12Q9HCS2 524 aa21.88■■□□□ 1.09
CCDC7-201ENST00000277657 SAR1AQ9NR31 198 aa21.88■■□□□ 1.09
CCDC7-201ENST00000277657 GTSE1Q9NYZ3 720 aa21.88■■□□□ 1.09
CCDC7-201ENST00000277657 GNPTGQ9UJJ9 305 aa21.88■■□□□ 1.09
CCDC7-201ENST00000277657 EPB41L3Q9Y2J2 1087 aaPredicted RBP21.88■■□□□ 1.09
CCDC7-201ENST00000277657 PLXNB3Q9ULL4 1909 aa21.88■■□□□ 1.09
CCDC7-201ENST00000277657 EDDM13A0A1B0GTR0 161 aa21.87■■□□□ 1.09
CCDC7-201ENST00000277657 CCDC189A1A4V9 331 aa21.87■■□□□ 1.09
CCDC7-201ENST00000277657 GOLGA8CPA6NN73 597 aa21.87■■□□□ 1.09
CCDC7-201ENST00000277657 C16orf96A6NNT2 1141 aa21.87■■□□□ 1.09
CCDC7-201ENST00000277657 IQCF5A8MTL0 148 aa21.87■■□□□ 1.09
CCDC7-201ENST00000277657 KERAO60938 352 aa21.87■■□□□ 1.09
CCDC7-201ENST00000277657 TBX10O75333 385 aa21.87■■□□□ 1.09
CCDC7-201ENST00000277657 UNC5CO95185 931 aa21.87■■□□□ 1.09
CCDC7-201ENST00000277657 TPBGLP0DKB5 382 aa21.87■■□□□ 1.09
CCDC7-201ENST00000277657 MTHFD2P13995 350 aa21.87■■□□□ 1.09
CCDC7-201ENST00000277657 IMPDH1P20839 514 aa21.87■■□□□ 1.09
CCDC7-201ENST00000277657 MPSTP25325 297 aa21.87■■□□□ 1.09
CCDC7-201ENST00000277657 IDH3AP50213 366 aa21.87■■□□□ 1.09
CCDC7-201ENST00000277657 C9orf64Q5T6V5 341 aa21.87■■□□□ 1.09
CCDC7-201ENST00000277657 STAG3L4Q8TBR4 150 aa21.87■■□□□ 1.09
CCDC7-201ENST00000277657 L3HYPDHQ96EM0 354 aa21.87■■□□□ 1.09
CCDC7-201ENST00000277657 CHFRQ96EP1 664 aa21.87■■□□□ 1.09
CCDC7-201ENST00000277657 KXD1Q9BQD3 176 aa21.87■■□□□ 1.09
CCDC7-201ENST00000277657 TMEM245Q9H330 911 aa21.87■■□□□ 1.09
CCDC7-201ENST00000277657 PKD2L2Q9NZM6 624 aa21.87■■□□□ 1.09
CCDC7-201ENST00000277657 IKZF3Q9UKT9 509 aa21.87■■□□□ 1.09
CCDC7-201ENST00000277657 DENND4AQ7Z401 1863 aa21.86■■□□□ 1.09
CCDC7-201ENST00000277657 FCHO1O14526 889 aa21.86■■□□□ 1.09
CCDC7-201ENST00000277657 SMIM24O75264 130 aa21.86■■□□□ 1.09
CCDC7-201ENST00000277657 T-ENOLP0DO92 83 aa21.86■■□□□ 1.09
CCDC7-201ENST00000277657 EIF2DP41214 584 aaKnown RBP21.86■■□□□ 1.09
CCDC7-201ENST00000277657 RPL14P50914 215 aaKnown RBP21.86■■□□□ 1.09
CCDC7-201ENST00000277657 IL2P60568 153 aa21.86■■□□□ 1.09
CCDC7-201ENST00000277657 ZNF234Q14588 700 aa21.86■■□□□ 1.09
CCDC7-201ENST00000277657 ATP13A5Q4VNC0 1218 aa21.86■■□□□ 1.09
CCDC7-201ENST00000277657 CFAP157Q5JU67 520 aa21.86■■□□□ 1.09
CCDC7-201ENST00000277657 PTRHD1Q6GMV3 140 aaKnown RBP21.86■■□□□ 1.09
CCDC7-201ENST00000277657 PARM1Q6UWI2 310 aa21.86■■□□□ 1.09
CCDC7-201ENST00000277657 MACC1Q6ZN28 852 aa21.86■■□□□ 1.09
CCDC7-201ENST00000277657 DPPA4Q7L190 304 aa21.86■■□□□ 1.09
CCDC7-201ENST00000277657 FGF14Q92915 247 aa21.86■■□□□ 1.09
CCDC7-201ENST00000277657 PDLIM5Q96HC4 596 aaKnown RBP21.86■■□□□ 1.09
CCDC7-201ENST00000277657 NMUR2Q9GZQ4 415 aa21.86■■□□□ 1.09
CCDC7-201ENST00000277657 TXLNGQ9NUQ3 528 aa21.86■■□□□ 1.09
CCDC7-201ENST00000277657 LMCD1Q9NZU5 365 aa21.86■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 38.1 ms