RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000272602.6

CNGA3-201, Transcript of cyclic nucleotide gated channel alpha 3, humanhuman

APPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC

Gene CNGA3, Length 3,470 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNGA3-201ENST00000272602 ATP5F1P24539 256 aaPredicted RBP10.78□□□□□ -0.68
CNGA3-201ENST00000272602 KPNA2P52292 529 aaKnown RBP10.78□□□□□ -0.68
CNGA3-201ENST00000272602 YWHAHQ04917 246 aaPredicted RBP10.78□□□□□ -0.68
CNGA3-201ENST00000272602 PCSK7Q16549 785 aa10.78□□□□□ -0.68
CNGA3-201ENST00000272602 DGUOKQ16854 277 aa10.78□□□□□ -0.68
CNGA3-201ENST00000272602 ATAD3BQ5T9A4 648 aa10.78□□□□□ -0.68
CNGA3-201ENST00000272602 ZPBP2Q6X784 338 aa10.78□□□□□ -0.68
CNGA3-201ENST00000272602 CEP97Q8IW35 865 aa10.78□□□□□ -0.68
CNGA3-201ENST00000272602 FBXO30Q8TB52 745 aa10.78□□□□□ -0.68
CNGA3-201ENST00000272602 STYXQ8WUJ0 223 aa10.78□□□□□ -0.68
CNGA3-201ENST00000272602 RORBQ92753 470 aa10.78□□□□□ -0.68
CNGA3-201ENST00000272602 MAGED4Q96JG8 741 aa10.78□□□□□ -0.68
CNGA3-201ENST00000272602 MROQ9BYG7 248 aa10.78□□□□□ -0.68
CNGA3-201ENST00000272602 ALG9Q9H6U8 611 aa10.78□□□□□ -0.68
CNGA3-201ENST00000272602 PRDM16Q9HAZ2 1276 aa10.78□□□□□ -0.68
CNGA3-201ENST00000272602 SIX4Q9UIU6 781 aa10.78□□□□□ -0.68
CNGA3-201ENST00000272602 CPSF3Q9UKF6 684 aaKnown RBP10.78□□□□□ -0.68
CNGA3-201ENST00000272602 TRIP11Q15643 1979 aa10.77□□□□□ -0.68
CNGA3-201ENST00000272602 MDM4O15151 490 aa10.77□□□□□ -0.68
CNGA3-201ENST00000272602 HS6ST1O60243 411 aa10.77□□□□□ -0.68
CNGA3-201ENST00000272602 CCNKO75909 580 aa10.77□□□□□ -0.68
CNGA3-201ENST00000272602 GSNP06396 782 aa10.77□□□□□ -0.68
CNGA3-201ENST00000272602 INHBBP09529 407 aa10.77□□□□□ -0.68
CNGA3-201ENST00000272602 SNX16P57768 344 aa10.77□□□□□ -0.68
CNGA3-201ENST00000272602 FOXD4Q12950 439 aaPredicted RBP10.77□□□□□ -0.68
CNGA3-201ENST00000272602 SELENBP1Q13228 472 aa10.77□□□□□ -0.68
CNGA3-201ENST00000272602 CYBRD1Q53TN4 286 aa10.77□□□□□ -0.68
CNGA3-201ENST00000272602 FBXO47Q5MNV8 452 aa10.77□□□□□ -0.68
CNGA3-201ENST00000272602 PPP2R2DQ66LE6 453 aa10.77□□□□□ -0.68
CNGA3-201ENST00000272602 SPESP1Q6UW49 350 aa10.77□□□□□ -0.68
CNGA3-201ENST00000272602 THAP5Q7Z6K1 395 aa10.77□□□□□ -0.68
CNGA3-201ENST00000272602 ZC3HC1Q86WB0 502 aaKnown RBP10.77□□□□□ -0.68
CNGA3-201ENST00000272602 DEFB106AQ8N104 65 aa10.77□□□□□ -0.68
CNGA3-201ENST00000272602 MFSD2AQ8NA29 543 aa10.77□□□□□ -0.68
CNGA3-201ENST00000272602 SMG8Q8ND04 991 aaKnown RBP10.77□□□□□ -0.68
CNGA3-201ENST00000272602 OR13F1Q8NGS4 319 aa10.77□□□□□ -0.68
CNGA3-201ENST00000272602 PXYLP1Q8TE99 480 aa10.77□□□□□ -0.68
CNGA3-201ENST00000272602 TOP1MTQ969P6 601 aa10.77□□□□□ -0.68
CNGA3-201ENST00000272602 CLIP3Q96DZ5 547 aa10.77□□□□□ -0.68
CNGA3-201ENST00000272602 SENP8Q96LD8 212 aa10.77□□□□□ -0.68
CNGA3-201ENST00000272602 DMRTB1Q96MA1 342 aa10.77□□□□□ -0.68
CNGA3-201ENST00000272602 NSMCE2Q96MF7 247 aa10.77□□□□□ -0.68
CNGA3-201ENST00000272602 REXO4Q9GZR2 422 aaKnown RBP10.77□□□□□ -0.68
CNGA3-201ENST00000272602 IL22Q9GZX6 179 aa10.77□□□□□ -0.68
CNGA3-201ENST00000272602 ADAMTS10Q9H324 1103 aa10.77□□□□□ -0.68
CNGA3-201ENST00000272602 HPS4Q9NQG7 708 aa10.77□□□□□ -0.68
CNGA3-201ENST00000272602 TBC1D14Q9P2M4 693 aa10.77□□□□□ -0.68
CNGA3-201ENST00000272602 MOSPD1Q9UJG1 213 aa10.77□□□□□ -0.68
CNGA3-201ENST00000272602 USP22Q9UPT9 525 aa10.77□□□□□ -0.68
CNGA3-201ENST00000272602 ARL5CA6NH57 179 aa10.77□□□□□ -0.69
CNGA3-201ENST00000272602 A8MV72 311 aaPredicted RBP10.77□□□□□ -0.69
CNGA3-201ENST00000272602 GSTA4O15217 222 aa10.77□□□□□ -0.69
CNGA3-201ENST00000272602 UGT2B4P06133 528 aa10.77□□□□□ -0.69
CNGA3-201ENST00000272602 KCNA5P22460 613 aa10.77□□□□□ -0.69
CNGA3-201ENST00000272602 SHMT2P34897 504 aa10.77□□□□□ -0.69
CNGA3-201ENST00000272602 DAB2P98082 770 aa10.77□□□□□ -0.69
CNGA3-201ENST00000272602 SOX4Q06945 474 aaPredicted RBP10.77□□□□□ -0.69
CNGA3-201ENST00000272602 INTS11Q5TA45 600 aaKnown RBP10.77□□□□□ -0.69
CNGA3-201ENST00000272602 UGT3A1Q6NUS8 523 aa10.77□□□□□ -0.69
CNGA3-201ENST00000272602 CYS1Q717R9 158 aa10.77□□□□□ -0.69
CNGA3-201ENST00000272602 CACUL1Q86Y37 369 aa10.77□□□□□ -0.69
CNGA3-201ENST00000272602 LGI2Q8N0V4 545 aa10.77□□□□□ -0.69
CNGA3-201ENST00000272602 PACRGLQ8N7B6 248 aa10.77□□□□□ -0.69
CNGA3-201ENST00000272602 PDPRQ8NCN5 879 aa10.77□□□□□ -0.69
CNGA3-201ENST00000272602 TMEM169Q96HH4 297 aa10.77□□□□□ -0.69
CNGA3-201ENST00000272602 FAR2Q96K12 515 aa10.77□□□□□ -0.69
CNGA3-201ENST00000272602 CSF3RQ99062 836 aa10.77□□□□□ -0.69
CNGA3-201ENST00000272602 MCOLN1Q9GZU1 580 aa10.77□□□□□ -0.69
CNGA3-201ENST00000272602 SMURF2Q9HAU4 748 aa10.77□□□□□ -0.69
CNGA3-201ENST00000272602 MID1IP1Q9NPA3 183 aa10.77□□□□□ -0.69
CNGA3-201ENST00000272602 ATG2BQ96BY7 2078 aa10.77□□□□□ -0.69
CNGA3-201ENST00000272602 H0Y626 953 aa10.77□□□□□ -0.69
CNGA3-201ENST00000272602 DLGAP1O14490 977 aa10.77□□□□□ -0.69
CNGA3-201ENST00000272602 PRRG1O14668 218 aa10.77□□□□□ -0.69
CNGA3-201ENST00000272602 XPNPEP2O43895 674 aa10.77□□□□□ -0.69
CNGA3-201ENST00000272602 ABCB7O75027 752 aa10.77□□□□□ -0.69
CNGA3-201ENST00000272602 RASAL1O95294 804 aa10.77□□□□□ -0.69
CNGA3-201ENST00000272602 TRIM16O95361 564 aa10.77□□□□□ -0.69
CNGA3-201ENST00000272602 LINC00032P0C843 101 aa10.77□□□□□ -0.69
CNGA3-201ENST00000272602 HGFP14210 728 aa10.77□□□□□ -0.69
CNGA3-201ENST00000272602 GJA1P17302 382 aa10.77□□□□□ -0.69
CNGA3-201ENST00000272602 PROZP22891 400 aa10.77□□□□□ -0.69
CNGA3-201ENST00000272602 KCNK10P57789 538 aa10.77□□□□□ -0.69
CNGA3-201ENST00000272602 TPI1P60174 286 aa10.77□□□□□ -0.69
CNGA3-201ENST00000272602 PHC1P78364 1004 aa10.77□□□□□ -0.69
CNGA3-201ENST00000272602 LIPEQ05469 1076 aa10.77□□□□□ -0.69
CNGA3-201ENST00000272602 NSUN2Q08J23 767 aaKnown RBP eCLIP10.77□□□□□ -0.69
CNGA3-201ENST00000272602 AQP6Q13520 282 aa10.77□□□□□ -0.69
CNGA3-201ENST00000272602 TARBP2Q15633 366 aaKnown RBP10.77□□□□□ -0.69
CNGA3-201ENST00000272602 CCDC85BQ15834 202 aaPredicted RBP10.77□□□□□ -0.69
CNGA3-201ENST00000272602 NDUFA5Q16718 116 aa10.77□□□□□ -0.69
CNGA3-201ENST00000272602 UGP2Q16851 508 aa10.77□□□□□ -0.69
CNGA3-201ENST00000272602 SOWAHAQ2M3V2 549 aa10.77□□□□□ -0.69
CNGA3-201ENST00000272602 TBPL2Q6SJ96 375 aa10.77□□□□□ -0.69
CNGA3-201ENST00000272602 PDZD4Q76G19 769 aaPredicted RBP10.77□□□□□ -0.69
CNGA3-201ENST00000272602 ITIH5Q86UX2 942 aa10.77□□□□□ -0.69
CNGA3-201ENST00000272602 ZDHHC13Q8IUH4 622 aa10.77□□□□□ -0.69
CNGA3-201ENST00000272602 CENPLQ8N0S6 344 aaPredicted RBP10.77□□□□□ -0.69
CNGA3-201ENST00000272602 MIER2Q8N344 545 aa10.77□□□□□ -0.69
CNGA3-201ENST00000272602 RDH11Q8TC12 318 aa10.77□□□□□ -0.69
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 22.1 ms