RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000246533.7

CAPNS1-201, Transcript of calpain small subunit 1, humanhuman

APPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC

Gene CAPNS1, Length 1,918 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPNS1-201ENST00000246533 E9PAM4 449 aa26.22■■□□□ 1.79
CAPNS1-201ENST00000246533 BCAS2O75934 225 aaPredicted RBP26.22■■□□□ 1.79
CAPNS1-201ENST00000246533 TIE1P35590 1138 aa26.22■■□□□ 1.79
CAPNS1-201ENST00000246533 ZNF669Q96BR6 464 aaPredicted RBP26.22■■□□□ 1.79
CAPNS1-201ENST00000246533 ERLEC1Q96DZ1 483 aa26.22■■□□□ 1.79
CAPNS1-201ENST00000246533 LMLNQ96KR4 655 aa26.22■■□□□ 1.79
CAPNS1-201ENST00000246533 C1orf74Q96LT6 269 aa26.22■■□□□ 1.79
CAPNS1-201ENST00000246533 FCRL3Q96P31 734 aaPredicted RBP26.22■■□□□ 1.79
CAPNS1-201ENST00000246533 OR52B2Q96RD2 323 aa26.22■■□□□ 1.79
CAPNS1-201ENST00000246533 ACOX2Q99424 681 aa26.22■■□□□ 1.79
CAPNS1-201ENST00000246533 CHRDQ9H2X0 955 aa26.22■■□□□ 1.79
CAPNS1-201ENST00000246533 TIMMDC1Q9NPL8 285 aa26.22■■□□□ 1.79
CAPNS1-201ENST00000246533 RAPGEFL1Q9UHV5 662 aa26.22■■□□□ 1.79
CAPNS1-201ENST00000246533 C2P06681 752 aa26.21■■□□□ 1.79
CAPNS1-201ENST00000246533 SERPINB5P36952 375 aa26.21■■□□□ 1.79
CAPNS1-201ENST00000246533 KIR2DL1P43626 348 aaPredicted RBP26.21■■□□□ 1.79
CAPNS1-201ENST00000246533 RPS9P46781 194 aaKnown RBP26.21■■□□□ 1.79
CAPNS1-201ENST00000246533 MPP7Q5T2T1 576 aa26.21■■□□□ 1.79
CAPNS1-201ENST00000246533 PLD6Q8N2A8 252 aaKnown RBP26.21■■□□□ 1.79
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CAPNS1-201ENST00000246533 MAPK15Q8TD08 544 aa26.21■■□□□ 1.79
CAPNS1-201ENST00000246533 PDCD6IPQ8WUM4 868 aaKnown RBP26.21■■□□□ 1.79
CAPNS1-201ENST00000246533 MPP4Q96JB8 637 aa26.21■■□□□ 1.79
CAPNS1-201ENST00000246533 CDRT15Q96T59 188 aa26.21■■□□□ 1.79
CAPNS1-201ENST00000246533 MCMBPQ9BTE3 642 aa26.21■■□□□ 1.79
CAPNS1-201ENST00000246533 INTS6Q9UL03 887 aaKnown RBP26.21■■□□□ 1.79
CAPNS1-201ENST00000246533 CDYLQ9Y232 598 aa26.21■■□□□ 1.79
CAPNS1-201ENST00000246533 SLC27A6Q9Y2P4 619 aa26.21■■□□□ 1.79
CAPNS1-201ENST00000246533 AP4B1Q9Y6B7 739 aa26.21■■□□□ 1.79
CAPNS1-201ENST00000246533 PALM2-AKAP2B1ALY0 433 aaPredicted RBP26.2■■□□□ 1.79
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CAPNS1-201ENST00000246533 ZMPSTE24O75844 475 aa26.2■■□□□ 1.79
CAPNS1-201ENST00000246533 FAM58BPP0C7Q3 252 aa26.2■■□□□ 1.79
CAPNS1-201ENST00000246533 CSRP3P50461 194 aa26.2■■□□□ 1.79
CAPNS1-201ENST00000246533 LMAN2Q12907 356 aa26.2■■□□□ 1.79
CAPNS1-201ENST00000246533 MPP3Q13368 585 aa26.2■■□□□ 1.79
CAPNS1-201ENST00000246533 DGKKQ5KSL6 1271 aa26.2■■□□□ 1.79
CAPNS1-201ENST00000246533 PID1Q7Z2X4 250 aa26.2■■□□□ 1.79
CAPNS1-201ENST00000246533 TFAP2DQ7Z6R9 452 aa26.2■■□□□ 1.79
CAPNS1-201ENST00000246533 CCNYQ8ND76 341 aa26.2■■□□□ 1.79
CAPNS1-201ENST00000246533 NTAN1Q96AB6 310 aa26.2■■□□□ 1.79
CAPNS1-201ENST00000246533 ZNF358Q9NW07 568 aa26.2■■□□□ 1.79
CAPNS1-201ENST00000246533 UTP6Q9NYH9 597 aaKnown RBP26.2■■□□□ 1.79
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CAPNS1-201ENST00000246533 NEU3Q9UQ49 428 aa26.2■■□□□ 1.79
CAPNS1-201ENST00000246533 ZCWPW2A0A1B0GU75 182 aa26.2■■□□□ 1.78
CAPNS1-201ENST00000246533 A0A1B0GVG6 124 aa26.2■■□□□ 1.78
CAPNS1-201ENST00000246533 PRSS51A0A1B0GVH4 220 aa26.2■■□□□ 1.78
CAPNS1-201ENST00000246533 ETS2P15036 469 aa26.2■■□□□ 1.78
CAPNS1-201ENST00000246533 NR1H2P55055 460 aa26.2■■□□□ 1.78
CAPNS1-201ENST00000246533 LRRC32Q14392 662 aa26.2■■□□□ 1.78
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CAPNS1-201ENST00000246533 C5orf22Q49AR2 442 aa26.2■■□□□ 1.78
CAPNS1-201ENST00000246533 EGFLAMQ63HQ2 1017 aa26.2■■□□□ 1.78
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CAPNS1-201ENST00000246533 DPYSQ14117 519 aa26.19■■□□□ 1.78
CAPNS1-201ENST00000246533 CXorf57Q6NSI4 855 aaKnown RBP26.19■■□□□ 1.78
CAPNS1-201ENST00000246533 TSSK4Q6SA08 328 aa26.19■■□□□ 1.78
CAPNS1-201ENST00000246533 RBM44Q6ZP01 1051 aaKnown RBP26.19■■□□□ 1.78
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CAPNS1-201ENST00000246533 USP33Q8TEY7 942 aa26.19■■□□□ 1.78
CAPNS1-201ENST00000246533 AGAP3Q96P47 875 aa26.19■■□□□ 1.78
CAPNS1-201ENST00000246533 NDFIP2Q9NV92 336 aa26.19■■□□□ 1.78
CAPNS1-201ENST00000246533 SPATA6Q9NWH7 488 aaPredicted RBP26.19■■□□□ 1.78
CAPNS1-201ENST00000246533 KLHL8Q9P2G9 620 aaPredicted RBP26.19■■□□□ 1.78
CAPNS1-201ENST00000246533 MFHAS1Q9Y4C4 1052 aa26.19■■□□□ 1.78
CAPNS1-201ENST00000246533 DRGXA6NNA5 263 aa26.18■■□□□ 1.78
CAPNS1-201ENST00000246533 WASP42768 502 aa26.18■■□□□ 1.78
CAPNS1-201ENST00000246533 SCAPQ12770 1279 aa26.18■■□□□ 1.78
CAPNS1-201ENST00000246533 ART3Q13508 389 aa26.18■■□□□ 1.78
CAPNS1-201ENST00000246533 PEX6Q13608 980 aa26.18■■□□□ 1.78
CAPNS1-201ENST00000246533 CDH18Q13634 790 aa26.18■■□□□ 1.78
CAPNS1-201ENST00000246533 MANEALQ5VSG8 457 aa26.18■■□□□ 1.78
CAPNS1-201ENST00000246533 ITPRIPL1Q6GPH6 555 aa26.18■■□□□ 1.78
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CAPNS1-201ENST00000246533 OR52K1Q8NGK4 314 aa26.18■■□□□ 1.78
CAPNS1-201ENST00000246533 VAT1Q99536 393 aa26.18■■□□□ 1.78
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CAPNS1-201ENST00000246533 RBM38Q9H0Z9 239 aaKnown RBP26.18■■□□□ 1.78
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CAPNS1-201ENST00000246533 IGLV3-10A0A075B6K4 115 aa26.18■■□□□ 1.78
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CAPNS1-201ENST00000246533 MZF1P28698 734 aaPredicted RBP26.18■■□□□ 1.78
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CAPNS1-201ENST00000246533 HCAR3P49019 387 aa26.18■■□□□ 1.78
CAPNS1-201ENST00000246533 APOFQ13790 326 aa26.18■■□□□ 1.78
CAPNS1-201ENST00000246533 FUT11Q495W5 492 aa26.18■■□□□ 1.78
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