RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000623495.1

LETMD1-238, Transcript of LETM1 domain containing 1, human

Gene LETMD1, Length 2,948 nt, Biotype TEC.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
LETMD1-238	ENST00000623495	ASTE1	Q2TB18	679 aa	Predicted RBP	7.23	□□□□□ -1.25
LETMD1-238	ENST00000623495	NUDT18	Q6ZVK8	323 aa		7.23	□□□□□ -1.25
LETMD1-238	ENST00000623495	USP43	Q70EL4	1123 aa		7.23	□□□□□ -1.25
LETMD1-238	ENST00000623495	FRA10AC1	Q70Z53	315 aa		7.23	□□□□□ -1.25
LETMD1-238	ENST00000623495	ANKS1B	Q7Z6G8	1248 aa		7.23	□□□□□ -1.25
LETMD1-238	ENST00000623495	CLNK	Q7Z7G1	428 aa		7.23	□□□□□ -1.25
LETMD1-238	ENST00000623495	RGL4	Q8IZJ4	473 aa		7.23	□□□□□ -1.25
LETMD1-238	ENST00000623495	RASGEF1C	Q8N431	466 aa		7.23	□□□□□ -1.25
LETMD1-238	ENST00000623495	FBXL6	Q8N531	539 aa		7.23	□□□□□ -1.25
LETMD1-238	ENST00000623495	TSTD1	Q8NFU3	115 aa		7.23	□□□□□ -1.25
LETMD1-238	ENST00000623495	PJA1	Q8NG27	643 aa		7.23	□□□□□ -1.25
LETMD1-238	ENST00000623495	PPP4R1	Q8TF05	950 aa		7.23	□□□□□ -1.25
LETMD1-238	ENST00000623495	NSL1	Q96IY1	281 aa		7.23	□□□□□ -1.25
LETMD1-238	ENST00000623495	SP110	Q9HB58	689 aa		7.23	□□□□□ -1.25
LETMD1-238	ENST00000623495	PIH1D1	Q9NWS0	290 aa	Known RBP	7.23	□□□□□ -1.25
LETMD1-238	ENST00000623495	FREM2	Q5SZK8	3169 aa		7.23	□□□□□ -1.25
LETMD1-238	ENST00000623495		A0A1B0GVM2	712 aa		7.23	□□□□□ -1.25
LETMD1-238	ENST00000623495	CCDC78	A2IDD5	438 aa		7.23	□□□□□ -1.25
LETMD1-238	ENST00000623495	TCAF2	A6NFQ2	919 aa		7.23	□□□□□ -1.25
LETMD1-238	ENST00000623495	CHURC1-FNTB	B4DL54	471 aa		7.23	□□□□□ -1.25
LETMD1-238	ENST00000623495		H3BNX3	289 aa		7.23	□□□□□ -1.25
LETMD1-238	ENST00000623495		J3KR12	359 aa		7.23	□□□□□ -1.25
LETMD1-238	ENST00000623495	ZNF701	M0R085	212 aa	Predicted RBP	7.23	□□□□□ -1.25
LETMD1-238	ENST00000623495	NCAM2	O15394	837 aa		7.23	□□□□□ -1.25
LETMD1-238	ENST00000623495	FOXD2	O60548	495 aa	Predicted RBP	7.23	□□□□□ -1.25
LETMD1-238	ENST00000623495	GREM1	O60565	184 aa		7.23	□□□□□ -1.25
LETMD1-238	ENST00000623495	KCNJ13	O60928	360 aa		7.23	□□□□□ -1.25
LETMD1-238	ENST00000623495	AVPR2	P30518	371 aa		7.23	□□□□□ -1.25
LETMD1-238	ENST00000623495	RECQL	P46063	649 aa	Predicted RBP	7.23	□□□□□ -1.25
LETMD1-238	ENST00000623495	FNTB	P49356	437 aa		7.23	□□□□□ -1.25
LETMD1-238	ENST00000623495	GBE1	Q04446	702 aa		7.23	□□□□□ -1.25
LETMD1-238	ENST00000623495	CDK18	Q07002	472 aa		7.23	□□□□□ -1.25
LETMD1-238	ENST00000623495	GALNT1	Q10472	559 aa	Predicted RBP	7.23	□□□□□ -1.25
LETMD1-238	ENST00000623495	PIGH	Q14442	188 aa	Predicted RBP	7.23	□□□□□ -1.25
LETMD1-238	ENST00000623495	DMC1	Q14565	340 aa		7.23	□□□□□ -1.25
LETMD1-238	ENST00000623495	ZNF234	Q14588	700 aa		7.23	□□□□□ -1.25
LETMD1-238	ENST00000623495	STARD3	Q14849	445 aa		7.23	□□□□□ -1.25
LETMD1-238	ENST00000623495	SF3B4	Q15427	424 aa	Known RBP eCLIP	7.23	□□□□□ -1.25
LETMD1-238	ENST00000623495	FUT11	Q495W5	492 aa		7.23	□□□□□ -1.25
LETMD1-238	ENST00000623495	CCDC157	Q569K6	752 aa		7.23	□□□□□ -1.25
LETMD1-238	ENST00000623495	DUPD1	Q68J44	220 aa		7.23	□□□□□ -1.25
LETMD1-238	ENST00000623495	LAYN	Q6UX15	382 aa		7.23	□□□□□ -1.25
LETMD1-238	ENST00000623495	MFSD7	Q6UXD7	560 aa		7.23	□□□□□ -1.25
LETMD1-238	ENST00000623495	PRR23C	Q6ZRP0	262 aa		7.23	□□□□□ -1.25
LETMD1-238	ENST00000623495	CEP68	Q76N32	757 aa		7.23	□□□□□ -1.25
LETMD1-238	ENST00000623495	CLVS1	Q8IUQ0	354 aa	Predicted RBP	7.23	□□□□□ -1.25
LETMD1-238	ENST00000623495	ANKRD42	Q8N9B4	389 aa		7.23	□□□□□ -1.25
LETMD1-238	ENST00000623495	MINDY2	Q8NBR6	621 aa		7.23	□□□□□ -1.25
LETMD1-238	ENST00000623495	CDKL2	Q92772	493 aa		7.23	□□□□□ -1.25
LETMD1-238	ENST00000623495	E2F7	Q96AV8	911 aa		7.23	□□□□□ -1.25
LETMD1-238	ENST00000623495	HMCES	Q96FZ2	354 aa		7.23	□□□□□ -1.25
LETMD1-238	ENST00000623495	SLC39A13	Q96H72	371 aa		7.23	□□□□□ -1.25
LETMD1-238	ENST00000623495	LGMN	Q99538	433 aa		7.23	□□□□□ -1.25
LETMD1-238	ENST00000623495	ZDHHC6	Q9H6R6	413 aa		7.23	□□□□□ -1.25
LETMD1-238	ENST00000623495	KCNK9	Q9NPC2	374 aa		7.23	□□□□□ -1.25
LETMD1-238	ENST00000623495	C11orf16	Q9NQ32	467 aa		7.23	□□□□□ -1.25
LETMD1-238	ENST00000623495	WNT16	Q9UBV4	365 aa		7.23	□□□□□ -1.25
LETMD1-238	ENST00000623495	AMACR	Q9UHK6	382 aa		7.23	□□□□□ -1.25
LETMD1-238	ENST00000623495	MOSPD1	Q9UJG1	213 aa		7.23	□□□□□ -1.25
LETMD1-238	ENST00000623495	INTS6	Q9UL03	887 aa	Known RBP	7.23	□□□□□ -1.25
LETMD1-238	ENST00000623495	PHTF1	Q9UMS5	762 aa		7.23	□□□□□ -1.25
LETMD1-238	ENST00000623495	CYP8B1	Q9UNU6	501 aa		7.23	□□□□□ -1.25
LETMD1-238	ENST00000623495	APOBEC2	Q9Y235	224 aa	Known RBP	7.23	□□□□□ -1.25
LETMD1-238	ENST00000623495	COMMD10	Q9Y6G5	202 aa		7.23	□□□□□ -1.25
LETMD1-238	ENST00000623495	NUMA1	Q14980	2115 aa		7.23	□□□□□ -1.25
LETMD1-238	ENST00000623495	ABCA7	Q8IZY2	2146 aa		7.22	□□□□□ -1.25
LETMD1-238	ENST00000623495	RALGAPA2	Q2PPJ7	1873 aa		7.22	□□□□□ -1.25
LETMD1-238	ENST00000623495	MSANTD3-TMEFF1	A0A0A6YYJ0	341 aa		7.22	□□□□□ -1.25
LETMD1-238	ENST00000623495	FADS2P1	A8MWK0	482 aa		7.22	□□□□□ -1.25
LETMD1-238	ENST00000623495	ARHGAP33	O14559	1287 aa		7.22	□□□□□ -1.25
LETMD1-238	ENST00000623495	CST8	O60676	142 aa		7.22	□□□□□ -1.25
LETMD1-238	ENST00000623495	RNASEH2A	O75792	299 aa	Known RBP	7.22	□□□□□ -1.25
LETMD1-238	ENST00000623495	PROSC	O94903	275 aa		7.22	□□□□□ -1.25
LETMD1-238	ENST00000623495	ATP5B	P06576	529 aa	Known RBP	7.22	□□□□□ -1.25
LETMD1-238	ENST00000623495	ADSL	P30566	484 aa	Predicted RBP	7.22	□□□□□ -1.25
LETMD1-238	ENST00000623495	STT3A	P46977	705 aa		7.22	□□□□□ -1.25
LETMD1-238	ENST00000623495	CXCL12	P48061	93 aa		7.22	□□□□□ -1.25
LETMD1-238	ENST00000623495	PSMD8	P48556	350 aa		7.22	□□□□□ -1.25
LETMD1-238	ENST00000623495	ACTR3	P61158	418 aa		7.22	□□□□□ -1.25
LETMD1-238	ENST00000623495	COX10	Q12887	443 aa		7.22	□□□□□ -1.25
LETMD1-238	ENST00000623495	PTK2B	Q14289	1009 aa		7.22	□□□□□ -1.25
LETMD1-238	ENST00000623495	DLG2	Q15700	870 aa		7.22	□□□□□ -1.25
LETMD1-238	ENST00000623495	PLEKHG6	Q3KR16	790 aa		7.22	□□□□□ -1.25
LETMD1-238	ENST00000623495	PITRM1	Q5JRX3	1037 aa		7.22	□□□□□ -1.25
LETMD1-238	ENST00000623495	RFX8	Q6ZV50	586 aa		7.22	□□□□□ -1.25
LETMD1-238	ENST00000623495	DHDDS	Q86SQ9	333 aa		7.22	□□□□□ -1.25
LETMD1-238	ENST00000623495	PRUNE1	Q86TP1	453 aa		7.22	□□□□□ -1.25
LETMD1-238	ENST00000623495	RALGPS2	Q86X27	583 aa	Predicted RBP	7.22	□□□□□ -1.25
LETMD1-238	ENST00000623495	TMEFF1	Q8IYR6	380 aa		7.22	□□□□□ -1.25
LETMD1-238	ENST00000623495	SAMD14	Q8IZD0	417 aa	Predicted RBP	7.22	□□□□□ -1.25
LETMD1-238	ENST00000623495	NPW	Q8N729	165 aa		7.22	□□□□□ -1.25
LETMD1-238	ENST00000623495	BRSK1	Q8TDC3	778 aa		7.22	□□□□□ -1.25
LETMD1-238	ENST00000623495	ATG4A	Q8WYN0	398 aa		7.22	□□□□□ -1.25
LETMD1-238	ENST00000623495	ATOH1	Q92858	354 aa	Predicted RBP	7.22	□□□□□ -1.25
LETMD1-238	ENST00000623495	MKRN2	Q9H000	416 aa	Known RBP	7.22	□□□□□ -1.25
LETMD1-238	ENST00000623495	FAM124B	Q9H5Z6	455 aa	Predicted RBP	7.22	□□□□□ -1.25
LETMD1-238	ENST00000623495	MARCH7	Q9H992	704 aa		7.22	□□□□□ -1.25
LETMD1-238	ENST00000623495	TPR	P12270	2363 aa	Known RBP	7.22	□□□□□ -1.25
LETMD1-238	ENST00000623495	GOLGA8Q	A0A0J9YX86	632 aa		7.22	□□□□□ -1.25
LETMD1-238	ENST00000623495	GOLGA8O	A6NCC3	632 aa		7.22	□□□□□ -1.25

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