RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000623316.1

ATRX-210, Transcript of ATRX, chromatin remodeler, humanhuman

TSL 5

Gene ATRX, Length 803 nt, Biotype nonsense mediated decay.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATRX-210ENST00000623316 EXOC3O60645 756 aa6.13□□□□□ -1.43
ATRX-210ENST00000623316 STBD1O95210 358 aa6.13□□□□□ -1.43
ATRX-210ENST00000623316 PGM3O95394 542 aa6.13□□□□□ -1.43
ATRX-210ENST00000623316 CBX6O95503 412 aa6.13□□□□□ -1.43
ATRX-210ENST00000623316 APOA4P06727 396 aa6.13□□□□□ -1.43
ATRX-210ENST00000623316 IQCF3P0C7M6 154 aa6.13□□□□□ -1.43
ATRX-210ENST00000623316 SUPT20HL2P0C7V6 817 aa6.13□□□□□ -1.43
ATRX-210ENST00000623316 INSRRP14616 1297 aa6.13□□□□□ -1.43
ATRX-210ENST00000623316 CDH2P19022 906 aaPredicted RBP6.13□□□□□ -1.43
ATRX-210ENST00000623316 IL11P20809 199 aa6.13□□□□□ -1.43
ATRX-210ENST00000623316 TGM2P21980 687 aa6.13□□□□□ -1.43
ATRX-210ENST00000623316 MARK3P27448 753 aa6.13□□□□□ -1.43
ATRX-210ENST00000623316 FMO4P31512 558 aa6.13□□□□□ -1.43
ATRX-210ENST00000623316 TTKP33981 857 aa6.13□□□□□ -1.43
ATRX-210ENST00000623316 PTGS2P35354 604 aa6.13□□□□□ -1.43
ATRX-210ENST00000623316 KRT2P35908 639 aa6.13□□□□□ -1.43
ATRX-210ENST00000623316 EIF2DP41214 584 aaKnown RBP6.13□□□□□ -1.43
ATRX-210ENST00000623316 PTPN9P43378 593 aa6.13□□□□□ -1.43
ATRX-210ENST00000623316 HMGN5P82970 282 aaKnown RBP6.13□□□□□ -1.43
ATRX-210ENST00000623316 PLCB4Q15147 1175 aa6.13□□□□□ -1.43
ATRX-210ENST00000623316 RASA2Q15283 850 aa6.13□□□□□ -1.43
ATRX-210ENST00000623316 PTGISQ16647 500 aa6.13□□□□□ -1.43
ATRX-210ENST00000623316 GSTA3Q16772 222 aa6.13□□□□□ -1.43
ATRX-210ENST00000623316 FBXO43Q4G163 708 aa6.13□□□□□ -1.43
ATRX-210ENST00000623316 GPR139Q6DWJ6 353 aa6.13□□□□□ -1.43
ATRX-210ENST00000623316 TMEM154Q6P9G4 183 aa6.13□□□□□ -1.43
ATRX-210ENST00000623316 Q6ZNX1 250 aa6.13□□□□□ -1.43
ATRX-210ENST00000623316 PLPPR4Q7Z2D5 763 aa6.13□□□□□ -1.43
ATRX-210ENST00000623316 SLC46A3Q7Z3Q1 461 aa6.13□□□□□ -1.43
ATRX-210ENST00000623316 NEK8Q86SG6 692 aa6.13□□□□□ -1.43
ATRX-210ENST00000623316 PEG10Q86TG7 708 aaKnown RBP6.13□□□□□ -1.43
ATRX-210ENST00000623316 TADA2BQ86TJ2 420 aa6.13□□□□□ -1.43
ATRX-210ENST00000623316 SERINC5Q86VE9 423 aa6.13□□□□□ -1.43
ATRX-210ENST00000623316 PALM2Q8IXS6 379 aa6.13□□□□□ -1.43
ATRX-210ENST00000623316 SLC44A3Q8N4M1 653 aa6.13□□□□□ -1.43
ATRX-210ENST00000623316 TMEM116Q8NCL8 245 aa6.13□□□□□ -1.43
ATRX-210ENST00000623316 C11orf65Q8NCR3 313 aa6.13□□□□□ -1.43
ATRX-210ENST00000623316 DNAAF1Q8NEP3 725 aa6.13□□□□□ -1.43
ATRX-210ENST00000623316 FAM110DQ8TAY7 271 aaPredicted RBP6.13□□□□□ -1.43
ATRX-210ENST00000623316 CMTM3Q96MX0 182 aa6.13□□□□□ -1.43
ATRX-210ENST00000623316 RIT2Q99578 217 aa6.13□□□□□ -1.43
ATRX-210ENST00000623316 ZNF577Q9BSK1 485 aa6.13□□□□□ -1.43
ATRX-210ENST00000623316 KCNMB3Q9NPA1 279 aa6.13□□□□□ -1.43
ATRX-210ENST00000623316 PARD6AQ9NPB6 346 aa6.13□□□□□ -1.43
ATRX-210ENST00000623316 SEMA5BQ9P283 1151 aa6.13□□□□□ -1.43
ATRX-210ENST00000623316 HSPB7Q9UBY9 170 aa6.13□□□□□ -1.43
ATRX-210ENST00000623316 DHDHQ9UQ10 334 aa6.13□□□□□ -1.43
ATRX-210ENST00000623316 SIRT4Q9Y6E7 314 aaPredicted RBP6.13□□□□□ -1.43
ATRX-210ENST00000623316 EMSYQ7Z589 1322 aa6.13□□□□□ -1.43
ATRX-210ENST00000623316 LTBP2Q14767 1821 aa6.13□□□□□ -1.43
ATRX-210ENST00000623316 A0A1W2PQ09 198 aa6.12□□□□□ -1.43
ATRX-210ENST00000623316 C17orf102A2RUQ5 167 aa6.12□□□□□ -1.43
ATRX-210ENST00000623316 MBLAC1A4D2B0 266 aaPredicted RBP6.12□□□□□ -1.43
ATRX-210ENST00000623316 LINC00473A8K010 186 aa6.12□□□□□ -1.43
ATRX-210ENST00000623316 EIF3CLB5ME19 914 aaKnown RBP6.12□□□□□ -1.43
ATRX-210ENST00000623316 MT-CO3P00414 261 aa6.12□□□□□ -1.43
ATRX-210ENST00000623316 RPN1P04843 607 aaKnown RBP6.12□□□□□ -1.43
ATRX-210ENST00000623316 RFPL3SP0C7P2 107 aa6.12□□□□□ -1.43
ATRX-210ENST00000623316 GLULP15104 373 aa6.12□□□□□ -1.43
ATRX-210ENST00000623316 U2AF2P26368 475 aaKnown RBP eCLIP6.12□□□□□ -1.433e-6■■□□□ 11.6
ATRX-210ENST00000623316 GARSP41250 739 aaKnown RBP6.12□□□□□ -1.43
ATRX-210ENST00000623316 PRAMEP78395 509 aa6.12□□□□□ -1.43
ATRX-210ENST00000623316 DMWDQ09019 674 aa6.12□□□□□ -1.43
ATRX-210ENST00000623316 ABHD18Q0P651 414 aa6.12□□□□□ -1.43
ATRX-210ENST00000623316 KCNB1Q14721 858 aa6.12□□□□□ -1.43
ATRX-210ENST00000623316 UGCGQ16739 394 aa6.12□□□□□ -1.43
ATRX-210ENST00000623316 LETM2Q2VYF4 491 aa6.12□□□□□ -1.43
ATRX-210ENST00000623316 LRIT3Q3SXY7 679 aa6.12□□□□□ -1.43
ATRX-210ENST00000623316 ARL13AQ5H913 290 aaPredicted RBP6.12□□□□□ -1.43
ATRX-210ENST00000623316 AARS2Q5JTZ9 985 aaKnown RBP6.12□□□□□ -1.43
ATRX-210ENST00000623316 PLEKHS1Q5SXH7 462 aa6.12□□□□□ -1.43
ATRX-210ENST00000623316 LRCH2Q5VUJ6 765 aa6.12□□□□□ -1.43
ATRX-210ENST00000623316 FAM109BQ6ICB4 259 aaPredicted RBP6.12□□□□□ -1.43
ATRX-210ENST00000623316 AADACL2Q6P093 401 aa6.12□□□□□ -1.43
ATRX-210ENST00000623316 TMEM65Q6PI78 240 aa6.12□□□□□ -1.43
ATRX-210ENST00000623316 NAPRTQ6XQN6 538 aa6.12□□□□□ -1.43
ATRX-210ENST00000623316 DCDC5Q6ZRR9 648 aa6.12□□□□□ -1.43
ATRX-210ENST00000623316 MDGA2Q7Z553 956 aa6.12□□□□□ -1.43
ATRX-210ENST00000623316 PRPF39Q86UA1 669 aaKnown RBP6.12□□□□□ -1.43
ATRX-210ENST00000623316 RPAINQ86UA6 219 aa6.12□□□□□ -1.43
ATRX-210ENST00000623316 ADGRF2Q8IZF7 708 aa6.12□□□□□ -1.43
ATRX-210ENST00000623316 TDHQ8IZJ6 230 aa6.12□□□□□ -1.43
ATRX-210ENST00000623316 C4orf32Q8N8J7 132 aa6.12□□□□□ -1.43
ATRX-210ENST00000623316 SCAIQ8N9R8 606 aa6.12□□□□□ -1.43
ATRX-210ENST00000623316 TERB1Q8NA31 727 aa6.12□□□□□ -1.43
ATRX-210ENST00000623316 PROKR1Q8TCW9 393 aa6.12□□□□□ -1.43
ATRX-210ENST00000623316 AFAP1L1Q8TED9 768 aa6.12□□□□□ -1.43
ATRX-210ENST00000623316 NRCAMQ92823 1304 aa6.12□□□□□ -1.43
ATRX-210ENST00000623316 ATP6V0A1Q93050 837 aa6.12□□□□□ -1.43
ATRX-210ENST00000623316 FAM149B1Q96BN6 582 aa6.12□□□□□ -1.43
ATRX-210ENST00000623316 C8orf76Q96K31 380 aa6.12□□□□□ -1.43
ATRX-210ENST00000623316 ADAD1Q96M93 576 aaKnown RBP6.12□□□□□ -1.43
ATRX-210ENST00000623316 MTMR9Q96QG7 549 aa6.12□□□□□ -1.43
ATRX-210ENST00000623316 C20orf141Q9NUB4 165 aa6.12□□□□□ -1.43
ATRX-210ENST00000623316 MTPAPQ9NVV4 582 aaKnown RBP eCLIP6.12□□□□□ -1.43
ATRX-210ENST00000623316 TMEM248Q9NWD8 314 aa6.12□□□□□ -1.43
ATRX-210ENST00000623316 ERAP1Q9NZ08 941 aa6.12□□□□□ -1.43
ATRX-210ENST00000623316 DDX25Q9UHL0 483 aaKnown RBP6.12□□□□□ -1.43
ATRX-210ENST00000623316 CDH22Q9UJ99 828 aa6.12□□□□□ -1.43
ATRX-210ENST00000623316 MKLN1Q9UL63 735 aa6.12□□□□□ -1.43
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