RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000590874.5

CAPNS1-211, Transcript of calpain small subunit 1, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene CAPNS1, Length 926 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPNS1-211ENST00000590874 NCSTNQ92542 709 aa25.42■■□□□ 1.66
CAPNS1-211ENST00000590874 WDR24Q96S15 920 aa25.42■■□□□ 1.66
CAPNS1-211ENST00000590874 TDRD1Q9BXT4 1180 aaKnown RBP25.42■■□□□ 1.66
CAPNS1-211ENST00000590874 VPS18Q9P253 973 aa25.42■■□□□ 1.66
CAPNS1-211ENST00000590874 A6NCN8 305 aa25.41■■□□□ 1.66
CAPNS1-211ENST00000590874 CLDN7O95471 211 aa25.41■■□□□ 1.66
CAPNS1-211ENST00000590874 PRLP01236 227 aa25.41■■□□□ 1.66
CAPNS1-211ENST00000590874 CD48P09326 243 aa25.41■■□□□ 1.66
CAPNS1-211ENST00000590874 MAP4P27816 1152 aaKnown RBP25.41■■□□□ 1.66
CAPNS1-211ENST00000590874 GARSP41250 739 aaKnown RBP25.41■■□□□ 1.66
CAPNS1-211ENST00000590874 MAPK9P45984 424 aa25.41■■□□□ 1.66
CAPNS1-211ENST00000590874 PIGHQ14442 188 aaPredicted RBP25.41■■□□□ 1.66
CAPNS1-211ENST00000590874 IYDQ6PHW0 289 aa25.41■■□□□ 1.66
CAPNS1-211ENST00000590874 CEACAM20Q6UY09 585 aa25.41■■□□□ 1.66
CAPNS1-211ENST00000590874 MAML1Q92585 1016 aa25.41■■□□□ 1.66
CAPNS1-211ENST00000590874 KIAA1143Q96AT1 154 aaPredicted RBP25.41■■□□□ 1.66
CAPNS1-211ENST00000590874 ZNF71Q9NQZ8 489 aaPredicted RBP25.41■■□□□ 1.66
CAPNS1-211ENST00000590874 FADS2P1A8MWK0 482 aa25.4■■□□□ 1.66
CAPNS1-211ENST00000590874 STK17BO94768 372 aa25.4■■□□□ 1.66
CAPNS1-211ENST00000590874 ACP5P13686 325 aa25.4■■□□□ 1.66
CAPNS1-211ENST00000590874 OAS2P29728 719 aaKnown RBP25.4■■□□□ 1.66
CAPNS1-211ENST00000590874 CASRP41180 1078 aa25.4■■□□□ 1.66
CAPNS1-211ENST00000590874 GALNT2Q10471 571 aa25.4■■□□□ 1.66
CAPNS1-211ENST00000590874 KRT81Q14533 505 aa25.4■■□□□ 1.66
CAPNS1-211ENST00000590874 LRRC49Q8IUZ0 686 aa25.4■■□□□ 1.66
CAPNS1-211ENST00000590874 NIPA2Q8N8Q9 360 aa25.4■■□□□ 1.66
CAPNS1-211ENST00000590874 C9orf43Q8TAL5 461 aaPredicted RBP25.4■■□□□ 1.66
CAPNS1-211ENST00000590874 FBXO8Q9NRD0 319 aa25.4■■□□□ 1.66
CAPNS1-211ENST00000590874 KLHL3Q9UH77 587 aa25.4■■□□□ 1.66
CAPNS1-211ENST00000590874 TTLL3Q9Y4R7 772 aa25.4■■□□□ 1.66
CAPNS1-211ENST00000590874 TMEM184BQ9Y519 407 aaPredicted RBP25.4■■□□□ 1.66
CAPNS1-211ENST00000590874 NAV2Q8IVL1 2488 aa25.4■■□□□ 1.66
CAPNS1-211ENST00000590874 PTPN13Q12923 2485 aa25.39■■□□□ 1.66
CAPNS1-211ENST00000590874 FOXK1P85037 733 aa25.39■■□□□ 1.66
CAPNS1-211ENST00000590874 IGFBP7Q16270 282 aa25.39■■□□□ 1.66
CAPNS1-211ENST00000590874 NCBP2-AS2Q69YL0 99 aa25.39■■□□□ 1.66
CAPNS1-211ENST00000590874 LPCAT1Q8NF37 534 aa25.39■■□□□ 1.66
CAPNS1-211ENST00000590874 ARRDC2Q8TBH0 407 aa25.39■■□□□ 1.66
CAPNS1-211ENST00000590874 ZPBPQ9BS86 351 aa25.39■■□□□ 1.66
CAPNS1-211ENST00000590874 THAP2Q9H0W7 228 aa25.39■■□□□ 1.66
CAPNS1-211ENST00000590874 STN1Q9H668 368 aaKnown RBP25.39■■□□□ 1.66
CAPNS1-211ENST00000590874 RCOR3Q9P2K3 495 aaPredicted RBP25.39■■□□□ 1.66
CAPNS1-211ENST00000590874 ANKMY1Q9P2S6 941 aa25.39■■□□□ 1.66
CAPNS1-211ENST00000590874 ANAPC2Q9UJX6 822 aa25.39■■□□□ 1.66
CAPNS1-211ENST00000590874 DNPEPQ9ULA0 475 aa25.39■■□□□ 1.66
CAPNS1-211ENST00000590874 SNX2O60749 519 aa25.38■■□□□ 1.65
CAPNS1-211ENST00000590874 MAN1A1P33908 653 aa25.38■■□□□ 1.65
CAPNS1-211ENST00000590874 EPHA4P54764 986 aa25.38■■□□□ 1.65
CAPNS1-211ENST00000590874 TYRO3Q06418 890 aa25.38■■□□□ 1.65
CAPNS1-211ENST00000590874 NIPAL4Q0D2K0 466 aa25.38■■□□□ 1.65
CAPNS1-211ENST00000590874 ABHD18Q0P651 414 aa25.38■■□□□ 1.65
CAPNS1-211ENST00000590874 HENMT1Q5T8I9 393 aaKnown RBP25.38■■□□□ 1.65
CAPNS1-211ENST00000590874 ATP1A1-AS1Q5TC04 95 aa25.38■■□□□ 1.65
CAPNS1-211ENST00000590874 SLC9B2Q86UD5 537 aa25.38■■□□□ 1.65
CAPNS1-211ENST00000590874 FAM71BQ8TC56 605 aa25.38■■□□□ 1.65
CAPNS1-211ENST00000590874 LRRN4Q8WUT4 740 aa25.38■■□□□ 1.65
CAPNS1-211ENST00000590874 STARD8Q92502 1023 aa25.38■■□□□ 1.65
CAPNS1-211ENST00000590874 SH3KBP1Q96B97 665 aa25.38■■□□□ 1.65
CAPNS1-211ENST00000590874 LYSMD1Q96S90 227 aa25.38■■□□□ 1.65
CAPNS1-211ENST00000590874 HERPUD2Q9BSE4 406 aa25.38■■□□□ 1.65
CAPNS1-211ENST00000590874 TBC1D10AQ9BXI6 508 aa25.38■■□□□ 1.65
CAPNS1-211ENST00000590874 RBM22Q9NW64 420 aaKnown RBP eCLIP25.38■■□□□ 1.65
CAPNS1-211ENST00000590874 ANAPC7Q9UJX3 599 aa25.38■■□□□ 1.65
CAPNS1-211ENST00000590874 COL12A1Q99715 3063 aa25.38■■□□□ 1.65
CAPNS1-211ENST00000590874 MATN3O15232 486 aa25.37■■□□□ 1.65
CAPNS1-211ENST00000590874 DLGAP3O95886 979 aa25.37■■□□□ 1.65
CAPNS1-211ENST00000590874 F3P13726 295 aa25.37■■□□□ 1.65
CAPNS1-211ENST00000590874 SPINT3P49223 89 aa25.37■■□□□ 1.65
CAPNS1-211ENST00000590874 ZNF165P49910 485 aa25.37■■□□□ 1.65
CAPNS1-211ENST00000590874 ARSEP51690 589 aa25.37■■□□□ 1.65
CAPNS1-211ENST00000590874 PAFAH1B3Q15102 231 aaKnown RBP25.37■■□□□ 1.65
CAPNS1-211ENST00000590874 DEFB109BQ30KR1 87 aa25.37■■□□□ 1.65
CAPNS1-211ENST00000590874 LYSMD3Q7Z3D4 306 aa25.37■■□□□ 1.65
CAPNS1-211ENST00000590874 KDELC2Q7Z4H8 507 aa25.37■■□□□ 1.65
CAPNS1-211ENST00000590874 RAVER1Q8IY67 606 aaKnown RBP25.37■■□□□ 1.65
CAPNS1-211ENST00000590874 EFHD1Q9BUP0 239 aa25.37■■□□□ 1.65
CAPNS1-211ENST00000590874 PCDH9Q9HC56 1237 aa25.37■■□□□ 1.65
CAPNS1-211ENST00000590874 SIDT1Q9NXL6 827 aaKnown RBP25.37■■□□□ 1.65
CAPNS1-211ENST00000590874 IP6K2Q9UHH9 426 aa25.37■■□□□ 1.65
CAPNS1-211ENST00000590874 C1orf232A0A0U1RR37 186 aa25.36■■□□□ 1.65
CAPNS1-211ENST00000590874 HLA-DQB2P05538 268 aa25.36■■□□□ 1.65
CAPNS1-211ENST00000590874 UBAP2LQ14157 1087 aaKnown RBP25.36■■□□□ 1.65
CAPNS1-211ENST00000590874 CCDC122Q5T0U0 273 aa25.36■■□□□ 1.65
CAPNS1-211ENST00000590874 TIGD7Q6NT04 549 aaPredicted RBP25.36■■□□□ 1.65
CAPNS1-211ENST00000590874 RNF31Q96EP0 1072 aa25.36■■□□□ 1.65
CAPNS1-211ENST00000590874 ABHD17AQ96GS6 310 aa25.36■■□□□ 1.65
CAPNS1-211ENST00000590874 RMI1Q9H9A7 625 aa25.36■■□□□ 1.65
CAPNS1-211ENST00000590874 CPNE7Q9UBL6 633 aa25.36■■□□□ 1.65
CAPNS1-211ENST00000590874 MRPS18BQ9Y676 258 aaKnown RBP25.36■■□□□ 1.65
CAPNS1-211ENST00000590874 MN1Q10571 1320 aaPredicted RBP25.36■■□□□ 1.65
CAPNS1-211ENST00000590874 KIR2DS5A0A0G2JLQ3 304 aa25.35■■□□□ 1.65
CAPNS1-211ENST00000590874 A0A0G2JNG1 304 aa25.35■■□□□ 1.65
CAPNS1-211ENST00000590874 KIR2DS3K7RE56 304 aa25.35■■□□□ 1.65
CAPNS1-211ENST00000590874 POLR1CO15160 346 aaPredicted RBP25.35■■□□□ 1.65
CAPNS1-211ENST00000590874 CES1P23141 567 aa25.35■■□□□ 1.65
CAPNS1-211ENST00000590874 STAT5AP42229 794 aa25.35■■□□□ 1.65
CAPNS1-211ENST00000590874 RPL26P61254 145 aaKnown RBP25.35■■□□□ 1.65
CAPNS1-211ENST00000590874 DPYSL3Q14195 570 aa25.35■■□□□ 1.65
CAPNS1-211ENST00000590874 KIR2DS5Q14953 304 aa25.35■■□□□ 1.65
CAPNS1-211ENST00000590874 ANO6Q4KMQ2 910 aa25.35■■□□□ 1.65
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