RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000588374.1

EFTUD2-211, Transcript of elongation factor Tu GTP binding domain containing 2, humanhuman

TSL 3

Gene EFTUD2, Length 524 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EFTUD2-211ENST00000588374 OAS3Q9Y6K5 1087 aaKnown RBP6.76□□□□□ -1.33
EFTUD2-211ENST00000588374 CSNK1G3Q9Y6M4 447 aa6.76□□□□□ -1.33
EFTUD2-211ENST00000588374 KNL1Q8NG31 2342 aa6.76□□□□□ -1.33
EFTUD2-211ENST00000588374 PLXNB3Q9ULL4 1909 aa6.76□□□□□ -1.33
EFTUD2-211ENST00000588374 COL5A1P20908 1838 aaPredicted RBP6.76□□□□□ -1.33
EFTUD2-211ENST00000588374 ZFC3H1O60293 1989 aaKnown RBP6.75□□□□□ -1.33
EFTUD2-211ENST00000588374 PTPRBP23467 1997 aa6.75□□□□□ -1.33
EFTUD2-211ENST00000588374 TRBV23OR9-2A0A075B6M9 112 aa6.75□□□□□ -1.33
EFTUD2-211ENST00000588374 CCDC78A2IDD5 438 aa6.75□□□□□ -1.33
EFTUD2-211ENST00000588374 CPED1A4D0V7 1026 aa6.75□□□□□ -1.33
EFTUD2-211ENST00000588374 LMO7DNF2Z398 122 aa6.75□□□□□ -1.33
EFTUD2-211ENST00000588374 PGRMC1O00264 195 aaKnown RBP6.75□□□□□ -1.33
EFTUD2-211ENST00000588374 CRTAMO95727 393 aa6.75□□□□□ -1.33
EFTUD2-211ENST00000588374 AP2A1O95782 977 aa6.75□□□□□ -1.33
EFTUD2-211ENST00000588374 KRT14P02533 472 aa6.75□□□□□ -1.33
EFTUD2-211ENST00000588374 PYGLP06737 847 aa6.75□□□□□ -1.33
EFTUD2-211ENST00000588374 CKMT2P17540 419 aa6.75□□□□□ -1.33
EFTUD2-211ENST00000588374 SPINK2P20155 84 aa6.75□□□□□ -1.33
EFTUD2-211ENST00000588374 AK4P27144 223 aaPredicted RBP6.75□□□□□ -1.33
EFTUD2-211ENST00000588374 TEAD1P28347 426 aa6.75□□□□□ -1.33
EFTUD2-211ENST00000588374 COILP38432 576 aaPredicted RBP6.75□□□□□ -1.33
EFTUD2-211ENST00000588374 GRIA1P42261 906 aa6.75□□□□□ -1.33
EFTUD2-211ENST00000588374 VPS41P49754 854 aa6.75□□□□□ -1.33
EFTUD2-211ENST00000588374 DAB2P98082 770 aa6.75□□□□□ -1.33
EFTUD2-211ENST00000588374 MSLNQ13421 630 aaPredicted RBP6.75□□□□□ -1.33
EFTUD2-211ENST00000588374 SEPT6Q14141 434 aa6.75□□□□□ -1.33
EFTUD2-211ENST00000588374 TAF1AQ15573 450 aaPredicted RBP6.75□□□□□ -1.33
EFTUD2-211ENST00000588374 CHRNA6Q15825 494 aa6.75□□□□□ -1.33
EFTUD2-211ENST00000588374 ATP13A5Q4VNC0 1218 aa6.75□□□□□ -1.33
EFTUD2-211ENST00000588374 TTC27Q6P3X3 843 aa6.75□□□□□ -1.33
EFTUD2-211ENST00000588374 DRICH1Q6PGQ1 229 aaPredicted RBP6.75□□□□□ -1.33
EFTUD2-211ENST00000588374 CCDC137Q6PK04 289 aaKnown RBP6.75□□□□□ -1.33
EFTUD2-211ENST00000588374 FAM151BQ6UXP7 276 aa6.75□□□□□ -1.33
EFTUD2-211ENST00000588374 C4orf22Q6V702 233 aa6.75□□□□□ -1.33
EFTUD2-211ENST00000588374 PPP1R21Q6ZMI0 780 aa6.75□□□□□ -1.33
EFTUD2-211ENST00000588374 CHST15Q7LFX5 561 aaPredicted RBP6.75□□□□□ -1.33
EFTUD2-211ENST00000588374 GLRX5Q86SX6 157 aa6.75□□□□□ -1.33
EFTUD2-211ENST00000588374 LINC00523Q86TU6 105 aa6.75□□□□□ -1.33
EFTUD2-211ENST00000588374 GKN2Q86XP6 184 aa6.75□□□□□ -1.33
EFTUD2-211ENST00000588374 FSTL5Q8N475 847 aaPredicted RBP6.75□□□□□ -1.33
EFTUD2-211ENST00000588374 CHCHD4Q8N4Q1 142 aa6.75□□□□□ -1.33
EFTUD2-211ENST00000588374 TRAM1L1Q8N609 369 aa6.75□□□□□ -1.33
EFTUD2-211ENST00000588374 DNAAF3Q8N9W5 541 aa6.75□□□□□ -1.33
EFTUD2-211ENST00000588374 OR52K1Q8NGK4 314 aa6.75□□□□□ -1.33
EFTUD2-211ENST00000588374 OR13C4Q8NGS5 318 aa6.75□□□□□ -1.33
EFTUD2-211ENST00000588374 OR4C6Q8NH72 309 aa6.75□□□□□ -1.33
EFTUD2-211ENST00000588374 GDAP1Q8TB36 358 aa6.75□□□□□ -1.33
EFTUD2-211ENST00000588374 ZNF398Q8TD17 642 aa6.75□□□□□ -1.33
EFTUD2-211ENST00000588374 ACTRT1Q8TDG2 376 aa6.75□□□□□ -1.33
EFTUD2-211ENST00000588374 SCG3Q8WXD2 468 aaKnown RBP6.75□□□□□ -1.33
EFTUD2-211ENST00000588374 PDXPQ96GD0 296 aa6.75□□□□□ -1.33
EFTUD2-211ENST00000588374 COX14Q96I36 57 aa6.75□□□□□ -1.33
EFTUD2-211ENST00000588374 CAPZA3Q96KX2 299 aa6.75□□□□□ -1.33
EFTUD2-211ENST00000588374 NAP1L3Q99457 506 aaPredicted RBP6.75□□□□□ -1.33
EFTUD2-211ENST00000588374 DUSP23Q9BVJ7 150 aa6.75□□□□□ -1.33
EFTUD2-211ENST00000588374 FAM96AQ9H5X1 160 aa6.75□□□□□ -1.33
EFTUD2-211ENST00000588374 ARNT2Q9HBZ2 717 aa6.75□□□□□ -1.33
EFTUD2-211ENST00000588374 TRIM39Q9HCM9 518 aa6.75□□□□□ -1.33
EFTUD2-211ENST00000588374 IL26Q9NPH9 171 aa6.75□□□□□ -1.33
EFTUD2-211ENST00000588374 IGF2BP1Q9NZI8 577 aaKnown RBP eCLIP6.75□□□□□ -1.33
EFTUD2-211ENST00000588374 SIRPGQ9P1W8 387 aa6.75□□□□□ -1.33
EFTUD2-211ENST00000588374 PAK5Q9P286 719 aa6.75□□□□□ -1.33
EFTUD2-211ENST00000588374 TMPRSS11EQ9UL52 423 aa6.75□□□□□ -1.33
EFTUD2-211ENST00000588374 TTC7AQ9ULT0 858 aaPredicted RBP6.75□□□□□ -1.33
EFTUD2-211ENST00000588374 SUFUQ9UMX1 484 aa6.75□□□□□ -1.33
EFTUD2-211ENST00000588374 GPR34Q9UPC5 381 aa6.75□□□□□ -1.33
EFTUD2-211ENST00000588374 DGKBQ9Y6T7 804 aa6.75□□□□□ -1.33
EFTUD2-211ENST00000588374 GLYATL1P3A0A0U1RQE8 302 aa6.74□□□□□ -1.33
EFTUD2-211ENST00000588374 CTAGE9A4FU28 777 aa6.74□□□□□ -1.33
EFTUD2-211ENST00000588374 CCL22O00626 93 aa6.74□□□□□ -1.33
EFTUD2-211ENST00000588374 CES2O00748 559 aa6.74□□□□□ -1.33
EFTUD2-211ENST00000588374 TPP1O14773 563 aa6.74□□□□□ -1.33
EFTUD2-211ENST00000588374 HYAL3O43820 417 aaPredicted RBP6.74□□□□□ -1.33
EFTUD2-211ENST00000588374 DNAJC6O75061 913 aa6.74□□□□□ -1.33
EFTUD2-211ENST00000588374 MTX2O75431 263 aa6.74□□□□□ -1.33
EFTUD2-211ENST00000588374 GAS8O95995 478 aa6.74□□□□□ -1.33
EFTUD2-211ENST00000588374 IVLP07476 585 aa6.74□□□□□ -1.33
EFTUD2-211ENST00000588374 APRTP07741 180 aa6.74□□□□□ -1.33
EFTUD2-211ENST00000588374 ADRB1P08588 477 aa6.74□□□□□ -1.33
EFTUD2-211ENST00000588374 TCP1P17987 556 aaKnown RBP6.74□□□□□ -1.33
EFTUD2-211ENST00000588374 CASQ1P31415 396 aa6.74□□□□□ -1.33
EFTUD2-211ENST00000588374 CA5AP35218 305 aa6.74□□□□□ -1.33
EFTUD2-211ENST00000588374 SPAM1P38567 509 aa6.74□□□□□ -1.33
EFTUD2-211ENST00000588374 ADCY8P40145 1251 aa6.74□□□□□ -1.33
EFTUD2-211ENST00000588374 DUSP3P51452 185 aaPredicted RBP6.74□□□□□ -1.33
EFTUD2-211ENST00000588374 DCDC1P59894 354 aa6.74□□□□□ -1.33
EFTUD2-211ENST00000588374 BASP1P80723 227 aaKnown RBP6.74□□□□□ -1.33
EFTUD2-211ENST00000588374 CTBSQ01459 385 aa6.74□□□□□ -1.33
EFTUD2-211ENST00000588374 TMEM115Q12893 351 aaPredicted RBP6.74□□□□□ -1.33
EFTUD2-211ENST00000588374 GPS1Q13098 491 aa6.74□□□□□ -1.33
EFTUD2-211ENST00000588374 SEMA5AQ13591 1074 aa6.74□□□□□ -1.33
EFTUD2-211ENST00000588374 POU6F1Q14863 301 aa6.74□□□□□ -1.33
EFTUD2-211ENST00000588374 PROX2Q3B8N5 592 aa6.74□□□□□ -1.33
EFTUD2-211ENST00000588374 CCDC38Q502W7 563 aa6.74□□□□□ -1.33
EFTUD2-211ENST00000588374 PYCR3Q53H96 274 aa6.74□□□□□ -1.33
EFTUD2-211ENST00000588374 CERCAMQ5T4B2 595 aa6.74□□□□□ -1.33
EFTUD2-211ENST00000588374 PAPD7Q5XG87 772 aaKnown RBP6.74□□□□□ -1.33
EFTUD2-211ENST00000588374 ZCCHC8Q6NZY4 707 aaKnown RBP6.74□□□□□ -1.33
EFTUD2-211ENST00000588374 SLC30A9Q6PML9 568 aa6.74□□□□□ -1.33
EFTUD2-211ENST00000588374 LVRNQ6Q4G3 990 aa6.74□□□□□ -1.33
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 22.4 ms