RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000587718.5

CAPNS1-204, Transcript of calpain small subunit 1, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC

Gene CAPNS1, Length 1,558 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPNS1-204ENST00000587718 LPAL2Q16609 132 aa25.38■■□□□ 1.65
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CAPNS1-204ENST00000587718 SH2D4BQ5SQS7 431 aa25.38■■□□□ 1.65
CAPNS1-204ENST00000587718 HECTD3Q5T447 861 aa25.38■■□□□ 1.65
CAPNS1-204ENST00000587718 KLC3Q6P597 504 aa25.38■■□□□ 1.65
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CAPNS1-204ENST00000587718 ZNF781Q8N8C0 355 aa25.38■■□□□ 1.65
CAPNS1-204ENST00000587718 OR13J1Q8NGT2 312 aa25.38■■□□□ 1.65
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CAPNS1-204ENST00000587718 LGI2Q8N0V4 545 aa25.36■■□□□ 1.65
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CAPNS1-204ENST00000587718 BRSK1Q8TDC3 778 aa25.36■■□□□ 1.65
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CAPNS1-204ENST00000587718 RAB23Q9ULC3 237 aa25.36■■□□□ 1.65
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CAPNS1-204ENST00000587718 ZC3H8Q8N5P1 291 aaKnown RBP eCLIP25.35■■□□□ 1.65
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CAPNS1-204ENST00000587718 CPSF2Q9P2I0 782 aaKnown RBP25.35■■□□□ 1.65
CAPNS1-204ENST00000587718 HELZP42694 1942 aaKnown RBP25.34■■□□□ 1.65
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CAPNS1-204ENST00000587718 HMBSP08397 361 aa25.34■■□□□ 1.65
CAPNS1-204ENST00000587718 MAXP61244 160 aa25.34■■□□□ 1.65
CAPNS1-204ENST00000587718 KDSRQ06136 332 aa25.34■■□□□ 1.65
CAPNS1-204ENST00000587718 BTKQ06187 659 aa25.34■■□□□ 1.65
CAPNS1-204ENST00000587718 HERC3Q15034 1050 aa25.34■■□□□ 1.65
CAPNS1-204ENST00000587718 MRNIPQ6NTE8 343 aa25.34■■□□□ 1.65
CAPNS1-204ENST00000587718 RFWD3Q6PCD5 774 aa25.34■■□□□ 1.65
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