RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000586792.5

ZNF540-204, Transcript of zinc finger protein 540, human

TSL 3 BASIC

Gene ZNF540, Length 564 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
ZNF540-204	ENST00000586792	MYO7A	Q13402	2215 aa		4.84	□□□□□ -1.64
ZNF540-204	ENST00000586792		A0A087WV62	115 aa		4.83	□□□□□ -1.64
ZNF540-204	ENST00000586792	TRAV19	A0A0A6YYK7	116 aa		4.83	□□□□□ -1.64
ZNF540-204	ENST00000586792	MYBPHL	A2RUH7	354 aa		4.83	□□□□□ -1.64
ZNF540-204	ENST00000586792	SLC38A8	A6NNN8	435 aa		4.83	□□□□□ -1.64
ZNF540-204	ENST00000586792	ANHX	E9PGG2	379 aa		4.83	□□□□□ -1.64
ZNF540-204	ENST00000586792	CBX4	O00257	560 aa		4.83	□□□□□ -1.64
ZNF540-204	ENST00000586792	FRS3	O43559	492 aa		4.83	□□□□□ -1.64
ZNF540-204	ENST00000586792	SKAP2	O75563	359 aa	Predicted RBP	4.83	□□□□□ -1.64
ZNF540-204	ENST00000586792	RTN3	O95197	1032 aa	Predicted RBP	4.83	□□□□□ -1.64
ZNF540-204	ENST00000586792	TBX18	O95935	607 aa		4.83	□□□□□ -1.64
ZNF540-204	ENST00000586792	ASS1	P00966	412 aa	Known RBP	4.83	□□□□□ -1.64
ZNF540-204	ENST00000586792	HLA-DRA	P01903	254 aa		4.83	□□□□□ -1.64
ZNF540-204	ENST00000586792	CSTB	P04080	98 aa	Known RBP	4.83	□□□□□ -1.64
ZNF540-204	ENST00000586792	CCDC175	P0C221	793 aa		4.83	□□□□□ -1.64
ZNF540-204	ENST00000586792	PRR35	P0CG20	571 aa		4.83	□□□□□ -1.64
ZNF540-204	ENST00000586792	TRIM49	P0CI25	452 aa		4.83	□□□□□ -1.64
ZNF540-204	ENST00000586792	TRIM49C	P0CI26	452 aa		4.83	□□□□□ -1.64
ZNF540-204	ENST00000586792	CCDC192	P0DO97	292 aa		4.83	□□□□□ -1.64
ZNF540-204	ENST00000586792	KRT10	P13645	584 aa		4.83	□□□□□ -1.64
ZNF540-204	ENST00000586792	CD58	P19256	250 aa		4.83	□□□□□ -1.64
ZNF540-204	ENST00000586792	AOC1	P19801	751 aa		4.83	□□□□□ -1.64
ZNF540-204	ENST00000586792	ABCB4	P21439	1286 aa		4.83	□□□□□ -1.64
ZNF540-204	ENST00000586792	KEL	P23276	732 aa		4.83	□□□□□ -1.64
ZNF540-204	ENST00000586792	CCNE1	P24864	410 aa		4.83	□□□□□ -1.64
ZNF540-204	ENST00000586792	CYP2F1	P24903	491 aa		4.83	□□□□□ -1.64
ZNF540-204	ENST00000586792	LMO2	P25791	158 aa		4.83	□□□□□ -1.64
ZNF540-204	ENST00000586792	AVPR2	P30518	371 aa		4.83	□□□□□ -1.64
ZNF540-204	ENST00000586792	GDI1	P31150	447 aa		4.83	□□□□□ -1.64
ZNF540-204	ENST00000586792	MAGEA11	P43364	429 aa		4.83	□□□□□ -1.64
ZNF540-204	ENST00000586792	TNNT3	P45378	269 aa	Predicted RBP	4.83	□□□□□ -1.64
ZNF540-204	ENST00000586792	CLCN5	P51795	746 aa		4.83	□□□□□ -1.64
ZNF540-204	ENST00000586792	KPNA1	P52294	538 aa	Predicted RBP	4.83	□□□□□ -1.64
ZNF540-204	ENST00000586792	VAV2	P52735	878 aa		4.83	□□□□□ -1.64
ZNF540-204	ENST00000586792	ARL4C	P56559	192 aa		4.83	□□□□□ -1.64
ZNF540-204	ENST00000586792	UBASH3A	P57075	661 aa		4.83	□□□□□ -1.64
ZNF540-204	ENST00000586792	SESN3	P58005	492 aa		4.83	□□□□□ -1.64
ZNF540-204	ENST00000586792	SEMA5A	Q13591	1074 aa		4.83	□□□□□ -1.64
ZNF540-204	ENST00000586792	UBXN2B	Q14CS0	331 aa		4.83	□□□□□ -1.64
ZNF540-204	ENST00000586792	ACAP2	Q15057	778 aa		4.83	□□□□□ -1.64
ZNF540-204	ENST00000586792	MLF2	Q15773	248 aa	Predicted RBP	4.83	□□□□□ -1.64
ZNF540-204	ENST00000586792	CAMK4	Q16566	473 aa		4.83	□□□□□ -1.64
ZNF540-204	ENST00000586792	CYP2A13	Q16696	494 aa		4.83	□□□□□ -1.64
ZNF540-204	ENST00000586792	ZACN	Q401N2	412 aa		4.83	□□□□□ -1.64
ZNF540-204	ENST00000586792	FAM78A	Q5JUQ0	283 aa		4.83	□□□□□ -1.64
ZNF540-204	ENST00000586792	PLBD1	Q6P4A8	553 aa		4.83	□□□□□ -1.64
ZNF540-204	ENST00000586792	TPRG1	Q6ZUI0	275 aa		4.83	□□□□□ -1.64
ZNF540-204	ENST00000586792	CCDC91	Q7Z6B0	441 aa		4.83	□□□□□ -1.64
ZNF540-204	ENST00000586792	TMC8	Q8IU68	726 aa		4.83	□□□□□ -1.64
ZNF540-204	ENST00000586792	NRSN1	Q8IZ57	195 aa		4.83	□□□□□ -1.64
ZNF540-204	ENST00000586792	ADSSL1	Q8N142	457 aa		4.83	□□□□□ -1.64
ZNF540-204	ENST00000586792	CAMKK1	Q8N5S9	505 aa		4.83	□□□□□ -1.64
ZNF540-204	ENST00000586792	ESX1	Q8N693	406 aa		4.83	□□□□□ -1.64
ZNF540-204	ENST00000586792	CELF5	Q8N6W0	485 aa	Known RBP	4.83	□□□□□ -1.64
ZNF540-204	ENST00000586792	STKLD1	Q8NE28	680 aa		4.83	□□□□□ -1.64
ZNF540-204	ENST00000586792	FBXL13	Q8NEE6	735 aa		4.83	□□□□□ -1.64
ZNF540-204	ENST00000586792	GSDMB	Q8TAX9	411 aa		4.83	□□□□□ -1.64
ZNF540-204	ENST00000586792	KBTBD7	Q8WVZ9	684 aa		4.83	□□□□□ -1.64
ZNF540-204	ENST00000586792	NELFB	Q8WX92	580 aa		4.83	□□□□□ -1.64
ZNF540-204	ENST00000586792	DNASE1L2	Q92874	299 aa		4.83	□□□□□ -1.64
ZNF540-204	ENST00000586792	TCEAL4	Q96EI5	215 aa		4.83	□□□□□ -1.64
ZNF540-204	ENST00000586792	EEF2KMT	Q96G04	330 aa		4.83	□□□□□ -1.64
ZNF540-204	ENST00000586792	SMARCD1	Q96GM5	515 aa		4.83	□□□□□ -1.64
ZNF540-204	ENST00000586792	MSANTD3	Q96H12	275 aa		4.83	□□□□□ -1.64
ZNF540-204	ENST00000586792	PCED1B	Q96HM7	432 aa		4.83	□□□□□ -1.64
ZNF540-204	ENST00000586792	CEP295NL	Q96MC4	621 aa		4.83	□□□□□ -1.64
ZNF540-204	ENST00000586792	SEMA4C	Q9C0C4	833 aa		4.83	□□□□□ -1.64
ZNF540-204	ENST00000586792	TASP1	Q9H6P5	420 aa		4.83	□□□□□ -1.64
ZNF540-204	ENST00000586792	SMYD3	Q9H7B4	428 aa		4.83	□□□□□ -1.64
ZNF540-204	ENST00000586792	UNKL	Q9H9P5	680 aa	Known RBP	4.83	□□□□□ -1.64
ZNF540-204	ENST00000586792	TBC1D17	Q9HA65	648 aa		4.83	□□□□□ -1.64
ZNF540-204	ENST00000586792	KIF9	Q9HAQ2	790 aa		4.83	□□□□□ -1.64
ZNF540-204	ENST00000586792	CYP3A43	Q9HB55	503 aa		4.83	□□□□□ -1.64
ZNF540-204	ENST00000586792	DMAP1	Q9NPF5	467 aa	Predicted RBP	4.83	□□□□□ -1.64
ZNF540-204	ENST00000586792	NRIP3	Q9NQ35	241 aa		4.83	□□□□□ -1.64
ZNF540-204	ENST00000586792	WASH6P	Q9NQA3	447 aa		4.83	□□□□□ -1.64
ZNF540-204	ENST00000586792	DMAC2	Q9NW81	257 aa		4.83	□□□□□ -1.64
ZNF540-204	ENST00000586792	MAN1B1	Q9UKM7	699 aa		4.83	□□□□□ -1.64
ZNF540-204	ENST00000586792	TBC1D30	Q9Y2I9	924 aa		4.83	□□□□□ -1.64
ZNF540-204	ENST00000586792	ZKSCAN5	Q9Y2L8	839 aa		4.83	□□□□□ -1.64
ZNF540-204	ENST00000586792	SCN1A	P35498	2009 aa		4.83	□□□□□ -1.64
ZNF540-204	ENST00000586792	NUP210	Q8TEM1	1887 aa	Predicted RBP	4.83	□□□□□ -1.64
ZNF540-204	ENST00000586792	KMT2E	Q8IZD2	1858 aa		4.82	□□□□□ -1.64
ZNF540-204	ENST00000586792	BRWD1	Q9NSI6	2320 aa		4.82	□□□□□ -1.64
ZNF540-204	ENST00000586792	KANSL1L	A0AUZ9	987 aa		4.82	□□□□□ -1.64
ZNF540-204	ENST00000586792	TRIM49B	A6NDI0	452 aa		4.82	□□□□□ -1.64
ZNF540-204	ENST00000586792		A6NLC8	198 aa		4.82	□□□□□ -1.64
ZNF540-204	ENST00000586792		A6NNZ2	444 aa		4.82	□□□□□ -1.64
ZNF540-204	ENST00000586792	HEPACAM2	A8MVW5	462 aa		4.82	□□□□□ -1.64
ZNF540-204	ENST00000586792		F5H0A9	414 aa	Predicted RBP	4.82	□□□□□ -1.64
ZNF540-204	ENST00000586792		F8VP50	259 aa		4.82	□□□□□ -1.64
ZNF540-204	ENST00000586792	HCRT	O43612	131 aa		4.82	□□□□□ -1.64
ZNF540-204	ENST00000586792	ATP2C2	O75185	946 aa		4.82	□□□□□ -1.64
ZNF540-204	ENST00000586792	MOSPD3	O75425	235 aa		4.82	□□□□□ -1.64
ZNF540-204	ENST00000586792	ERN1	O75460	977 aa	Known RBP	4.82	□□□□□ -1.64
ZNF540-204	ENST00000586792	NOL4	O94818	638 aa		4.82	□□□□□ -1.64
ZNF540-204	ENST00000586792	VNN1	O95497	513 aa		4.82	□□□□□ -1.64
ZNF540-204	ENST00000586792	VNN2	O95498	520 aa		4.82	□□□□□ -1.64
ZNF540-204	ENST00000586792	PDGFB	P01127	241 aa	Predicted RBP	4.82	□□□□□ -1.64
ZNF540-204	ENST00000586792	CCDC130	P13994	396 aa		4.82	□□□□□ -1.64

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