RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000583153.2

PTPRM-214, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type M, humanhuman

TSL 3

Gene PTPRM, Length 713 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRM-214ENST00000583153 WASHC5Q12768 1159 aa8.27□□□□□ -1.09
PTPRM-214ENST00000583153 RTP5Q14D33 572 aa8.27□□□□□ -1.09
PTPRM-214ENST00000583153 PRKD1Q15139 912 aaPredicted RBP8.27□□□□□ -1.09
PTPRM-214ENST00000583153 PPP2R5EQ16537 467 aa8.27□□□□□ -1.09
PTPRM-214ENST00000583153 TAZQ16635 292 aa8.27□□□□□ -1.09
PTPRM-214ENST00000583153 C14orf28Q4W4Y0 310 aa8.27□□□□□ -1.09
PTPRM-214ENST00000583153 C3orf38Q5JPI3 329 aa8.27□□□□□ -1.09
PTPRM-214ENST00000583153 OGFOD3Q6PK18 319 aa8.27□□□□□ -1.09
PTPRM-214ENST00000583153 BBS12Q6ZW61 710 aa8.27□□□□□ -1.09
PTPRM-214ENST00000583153 CHST15Q7LFX5 561 aaPredicted RBP8.27□□□□□ -1.09
PTPRM-214ENST00000583153 PEX26Q7Z412 305 aa8.27□□□□□ -1.09
PTPRM-214ENST00000583153 GALNT13Q8IUC8 556 aa8.27□□□□□ -1.09
PTPRM-214ENST00000583153 RAVER1Q8IY67 606 aaKnown RBP8.27□□□□□ -1.09
PTPRM-214ENST00000583153 SYCE1Q8N0S2 351 aa8.27□□□□□ -1.09
PTPRM-214ENST00000583153 LSMEM2Q8N112 164 aa8.27□□□□□ -1.09
PTPRM-214ENST00000583153 SLC25A41Q8N5S1 370 aa8.27□□□□□ -1.09
PTPRM-214ENST00000583153 UBL4BQ8N7F7 174 aa8.27□□□□□ -1.09
PTPRM-214ENST00000583153 GPR156Q8NFN8 814 aa8.27□□□□□ -1.09
PTPRM-214ENST00000583153 IPMKQ8NFU5 416 aa8.27□□□□□ -1.09
PTPRM-214ENST00000583153 GPBAR1Q8TDU6 330 aa8.27□□□□□ -1.09
PTPRM-214ENST00000583153 ZDHHC1Q8WTX9 485 aa8.27□□□□□ -1.09
PTPRM-214ENST00000583153 ATXN7L3BQ96GX2 97 aa8.27□□□□□ -1.09
PTPRM-214ENST00000583153 OR2M4Q96R27 311 aa8.27□□□□□ -1.09
PTPRM-214ENST00000583153 GFM1Q96RP9 751 aaKnown RBP8.27□□□□□ -1.09
PTPRM-214ENST00000583153 SRPK1Q96SB4 655 aaKnown RBP8.27□□□□□ -1.09
PTPRM-214ENST00000583153 VAT1Q99536 393 aa8.27□□□□□ -1.09
PTPRM-214ENST00000583153 DESI2Q9BSY9 194 aa8.27□□□□□ -1.09
PTPRM-214ENST00000583153 SPATA16Q9BXB7 569 aa8.27□□□□□ -1.09
PTPRM-214ENST00000583153 OSBPL8Q9BZF1 889 aa8.27□□□□□ -1.09
PTPRM-214ENST00000583153 C10orf88Q9H8K7 445 aa8.27□□□□□ -1.09
PTPRM-214ENST00000583153 MAGEE1Q9HCI5 957 aa8.27□□□□□ -1.09
PTPRM-214ENST00000583153 RAD18Q9NS91 495 aa8.27□□□□□ -1.09
PTPRM-214ENST00000583153 SPATS2LQ9NUQ6 558 aaKnown RBP8.27□□□□□ -1.09
PTPRM-214ENST00000583153 WDR70Q9NW82 654 aa8.27□□□□□ -1.09
PTPRM-214ENST00000583153 TAAR2Q9P1P5 351 aa8.27□□□□□ -1.09
PTPRM-214ENST00000583153 DKK4Q9UBT3 224 aa8.27□□□□□ -1.09
PTPRM-214ENST00000583153 RSPH14Q9UHP6 348 aa8.27□□□□□ -1.09
PTPRM-214ENST00000583153 TRHDEQ9UKU6 1024 aa8.27□□□□□ -1.09
PTPRM-214ENST00000583153 AMFRQ9UKV5 643 aa8.27□□□□□ -1.09
PTPRM-214ENST00000583153 PYCARDQ9ULZ3 195 aa8.27□□□□□ -1.09
PTPRM-214ENST00000583153 LHX6Q9UPM6 363 aa8.27□□□□□ -1.09
PTPRM-214ENST00000583153 SLC17A4Q9Y2C5 497 aa8.27□□□□□ -1.09
PTPRM-214ENST00000583153 REXO2Q9Y3B8 237 aaKnown RBP8.27□□□□□ -1.09
PTPRM-214ENST00000583153 SCN8AQ9UQD0 1980 aa8.26□□□□□ -1.09
PTPRM-214ENST00000583153 TRBV23OR9-2A0A075B6M9 112 aa8.26□□□□□ -1.09
PTPRM-214ENST00000583153 GRID2IPA4D2P6 1211 aa8.26□□□□□ -1.09
PTPRM-214ENST00000583153 GOLGA6L9A6NEM1 432 aa8.26□□□□□ -1.09
PTPRM-214ENST00000583153 AGRPO00253 132 aa8.26□□□□□ -1.09
PTPRM-214ENST00000583153 PJA2O43164 708 aa8.26□□□□□ -1.09
PTPRM-214ENST00000583153 NOBOXO60393 691 aa8.26□□□□□ -1.09
PTPRM-214ENST00000583153 BRINP1O60477 761 aa8.26□□□□□ -1.09
PTPRM-214ENST00000583153 STK10O94804 968 aaKnown RBP8.26□□□□□ -1.09
PTPRM-214ENST00000583153 SLC25A14O95258 325 aaPredicted RBP8.26□□□□□ -1.09
PTPRM-214ENST00000583153 ECEL1O95672 775 aa8.26□□□□□ -1.09
PTPRM-214ENST00000583153 SOD1P00441 154 aa8.26□□□□□ -1.09
PTPRM-214ENST00000583153 FGF1P05230 155 aa8.26□□□□□ -1.09
PTPRM-214ENST00000583153 IVLP07476 585 aa8.26□□□□□ -1.09
PTPRM-214ENST00000583153 PYGMP11217 842 aa8.26□□□□□ -1.09
PTPRM-214ENST00000583153 RBL1P28749 1068 aa8.26□□□□□ -1.09
PTPRM-214ENST00000583153 ALDH4A1P30038 563 aa8.26□□□□□ -1.09
PTPRM-214ENST00000583153 CD68P34810 354 aaPredicted RBP8.26□□□□□ -1.09
PTPRM-214ENST00000583153 MAZP56270 477 aaKnown RBP8.26□□□□□ -1.09
PTPRM-214ENST00000583153 WNT3AP56704 352 aa8.26□□□□□ -1.09
PTPRM-214ENST00000583153 EIF3EP60228 445 aaKnown RBP8.26□□□□□ -1.09
PTPRM-214ENST00000583153 LSM11P83369 360 aaKnown RBP eCLIP8.26□□□□□ -1.09
PTPRM-214ENST00000583153 OTUD4Q01804 1114 aaKnown RBP8.26□□□□□ -1.09
PTPRM-214ENST00000583153 XRCC4Q13426 336 aa8.26□□□□□ -1.09
PTPRM-214ENST00000583153 PRPSAP1Q14558 356 aa8.26□□□□□ -1.09
PTPRM-214ENST00000583153 AMZ1Q400G9 498 aa8.26□□□□□ -1.09
PTPRM-214ENST00000583153 PYCR3Q53H96 274 aa8.26□□□□□ -1.09
PTPRM-214ENST00000583153 CERCAMQ5T4B2 595 aa8.26□□□□□ -1.09
PTPRM-214ENST00000583153 DARS2Q6PI48 645 aaKnown RBP8.26□□□□□ -1.09
PTPRM-214ENST00000583153 TMC3Q7Z5M5 1100 aa8.26□□□□□ -1.09
PTPRM-214ENST00000583153 CCNJLQ8IV13 435 aa8.26□□□□□ -1.09
PTPRM-214ENST00000583153 CDKL3Q8IVW4 592 aaPredicted RBP8.26□□□□□ -1.09
PTPRM-214ENST00000583153 SFTPA2Q8IWL1 248 aa8.26□□□□□ -1.09
PTPRM-214ENST00000583153 ZNF567Q8N184 647 aa8.26□□□□□ -1.09
PTPRM-214ENST00000583153 ACTL9Q8TC94 416 aa8.26□□□□□ -1.09
PTPRM-214ENST00000583153 BLOC1S5Q8TDH9 187 aa8.26□□□□□ -1.09
PTPRM-214ENST00000583153 PTCD2Q8WV60 388 aaKnown RBP8.26□□□□□ -1.09
PTPRM-214ENST00000583153 FGF11Q92914 225 aa8.26□□□□□ -1.09
PTPRM-214ENST00000583153 GRAMD1AQ96CP6 724 aa8.26□□□□□ -1.09
PTPRM-214ENST00000583153 NAF1Q96HR8 494 aaKnown RBP8.26□□□□□ -1.09
PTPRM-214ENST00000583153 QKIQ96PU8 341 aaKnown RBP eCLIP8.26□□□□□ -1.09
PTPRM-214ENST00000583153 FCRL5Q96RD9 977 aa8.26□□□□□ -1.09
PTPRM-214ENST00000583153 TRIB3Q96RU7 358 aa8.26□□□□□ -1.09
PTPRM-214ENST00000583153 FAM118BQ9BPY3 351 aa8.26□□□□□ -1.09
PTPRM-214ENST00000583153 FSD1LQ9BXM9 530 aa8.26□□□□□ -1.09
PTPRM-214ENST00000583153 STRADBQ9C0K7 418 aa8.26□□□□□ -1.09
PTPRM-214ENST00000583153 LRRN3Q9H3W5 708 aa8.26□□□□□ -1.09
PTPRM-214ENST00000583153 POLR1BQ9H9Y6 1135 aa8.26□□□□□ -1.09
PTPRM-214ENST00000583153 EPB41L5Q9HCM4 733 aa8.26□□□□□ -1.09
PTPRM-214ENST00000583153 BPIFA1Q9NP55 256 aa8.26□□□□□ -1.09
PTPRM-214ENST00000583153 TRIM10Q9UDY6 481 aa8.26□□□□□ -1.09
PTPRM-214ENST00000583153 RABGEF1Q9UJ41 708 aa8.26□□□□□ -1.09
PTPRM-214ENST00000583153 SATB2Q9UPW6 733 aa8.26□□□□□ -1.09
PTPRM-214ENST00000583153 ZNF711Q9Y462 761 aa8.26□□□□□ -1.09
PTPRM-214ENST00000583153 PRKAB1Q9Y478 270 aa8.26□□□□□ -1.09
PTPRM-214ENST00000583153 PLEKHM1Q9Y4G2 1056 aa8.26□□□□□ -1.09
PTPRM-214ENST00000583153 ENTPD2Q9Y5L3 495 aa8.26□□□□□ -1.09
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 25.3 ms