RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000581080.1

RARA-AS1-201, RARA antisense RNA 1, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene RARA-AS1, Length 1,790 nt, Biotype antisense RNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RARA-AS1-201ENST00000581080 HENMT1Q5T8I9 393 aaKnown RBP23.24■■□□□ 1.31
RARA-AS1-201ENST00000581080 CYP2U1Q7Z449 544 aa23.24■■□□□ 1.31
RARA-AS1-201ENST00000581080 CMC1Q7Z7K0 106 aa23.24■■□□□ 1.31
RARA-AS1-201ENST00000581080 CXorf40AQ8TE69 158 aa23.24■■□□□ 1.31
RARA-AS1-201ENST00000581080 NDNQ99608 321 aa23.24■■□□□ 1.31
RARA-AS1-201ENST00000581080 TTC1Q99614 292 aa23.24■■□□□ 1.31
RARA-AS1-201ENST00000581080 SMG5Q9UPR3 1016 aaKnown RBP23.24■■□□□ 1.31
RARA-AS1-201ENST00000581080 PRPF4O43172 522 aaKnown RBP eCLIP23.24■■□□□ 1.31
RARA-AS1-201ENST00000581080 MMP20O60882 483 aa23.24■■□□□ 1.31
RARA-AS1-201ENST00000581080 C6P13671 934 aa23.24■■□□□ 1.31
RARA-AS1-201ENST00000581080 CA5AP35218 305 aa23.24■■□□□ 1.31
RARA-AS1-201ENST00000581080 CCNFP41002 786 aa23.24■■□□□ 1.31
RARA-AS1-201ENST00000581080 ATP1A2P50993 1020 aa23.24■■□□□ 1.31
RARA-AS1-201ENST00000581080 POU4F1Q01851 419 aa23.24■■□□□ 1.31
RARA-AS1-201ENST00000581080 ATP13A5Q4VNC0 1218 aa23.24■■□□□ 1.31
RARA-AS1-201ENST00000581080 LYPLAL1Q5VWZ2 237 aa23.24■■□□□ 1.31
RARA-AS1-201ENST00000581080 SERPINA9Q86WD7 417 aa23.24■■□□□ 1.31
RARA-AS1-201ENST00000581080 DTD2Q96FN9 168 aa23.24■■□□□ 1.31
RARA-AS1-201ENST00000581080 ELMO2Q96JJ3 720 aa23.24■■□□□ 1.31
RARA-AS1-201ENST00000581080 ASB2Q96Q27 587 aa23.24■■□□□ 1.31
RARA-AS1-201ENST00000581080 CNOT10Q9H9A5 744 aaKnown RBP23.24■■□□□ 1.31
RARA-AS1-201ENST00000581080 CRLS1Q9UJA2 301 aa23.24■■□□□ 1.31
RARA-AS1-201ENST00000581080 VWA7Q9Y334 891 aa23.24■■□□□ 1.31
RARA-AS1-201ENST00000581080 TRIOO75962 3097 aa23.23■■□□□ 1.31
RARA-AS1-201ENST00000581080 FAM170BA6NMN3 283 aa23.23■■□□□ 1.31
RARA-AS1-201ENST00000581080 SAT1P21673 171 aa23.23■■□□□ 1.31
RARA-AS1-201ENST00000581080 ACRV1P26436 265 aa23.23■■□□□ 1.31
RARA-AS1-201ENST00000581080 PTGER3P43115 390 aa23.23■■□□□ 1.31
RARA-AS1-201ENST00000581080 CSRP3P50461 194 aa23.23■■□□□ 1.31
RARA-AS1-201ENST00000581080 SLC18A1P54219 525 aa23.23■■□□□ 1.31
RARA-AS1-201ENST00000581080 ADARP55265 1226 aaKnown RBP23.23■■□□□ 1.31
RARA-AS1-201ENST00000581080 MPP2Q14168 576 aa23.23■■□□□ 1.31
RARA-AS1-201ENST00000581080 DBN1Q16643 649 aa23.23■■□□□ 1.31
RARA-AS1-201ENST00000581080 TTC31Q49AM3 519 aaPredicted RBP23.23■■□□□ 1.31
RARA-AS1-201ENST00000581080 ZNF549Q6P9A3 640 aa23.23■■□□□ 1.31
RARA-AS1-201ENST00000581080 SYT13Q7L8C5 426 aa23.23■■□□□ 1.31
RARA-AS1-201ENST00000581080 SLC41A1Q8IVJ1 513 aa23.23■■□□□ 1.31
RARA-AS1-201ENST00000581080 GANCQ8TET4 914 aa23.23■■□□□ 1.31
RARA-AS1-201ENST00000581080 RIOK2Q9BVS4 552 aaKnown RBP23.23■■□□□ 1.31
RARA-AS1-201ENST00000581080 SPATA16Q9BXB7 569 aa23.23■■□□□ 1.31
RARA-AS1-201ENST00000581080 TCRBV21S2A2A0A5A6 115 aa23.22■■□□□ 1.31
RARA-AS1-201ENST00000581080 UBA6A0AVT1 1052 aaPredicted RBP23.22■■□□□ 1.31
RARA-AS1-201ENST00000581080 FAM47DPA6NHR8 397 aa23.22■■□□□ 1.31
RARA-AS1-201ENST00000581080 OR1I1O60431 355 aa23.22■■□□□ 1.31
RARA-AS1-201ENST00000581080 RECQL5O94762 991 aaPredicted RBP23.22■■□□□ 1.31
RARA-AS1-201ENST00000581080 NDUFV2P19404 249 aa23.22■■□□□ 1.31
RARA-AS1-201ENST00000581080 PPARDQ03181 441 aa23.22■■□□□ 1.31
RARA-AS1-201ENST00000581080 PDE1CQ14123 709 aaPredicted RBP23.22■■□□□ 1.31
RARA-AS1-201ENST00000581080 ZNF284Q2VY69 593 aa23.22■■□□□ 1.31
RARA-AS1-201ENST00000581080 HECTD2Q5U5R9 776 aa23.22■■□□□ 1.31
RARA-AS1-201ENST00000581080 USP30Q70CQ3 517 aa23.22■■□□□ 1.31
RARA-AS1-201ENST00000581080 NXPE1Q8N323 547 aa23.22■■□□□ 1.31
RARA-AS1-201ENST00000581080 TRAM1L1Q8N609 369 aa23.22■■□□□ 1.31
RARA-AS1-201ENST00000581080 AP2M1Q96CW1 435 aa23.22■■□□□ 1.31
RARA-AS1-201ENST00000581080 APOPT1Q96IL0 206 aa23.22■■□□□ 1.31
RARA-AS1-201ENST00000581080 BIRC8Q96P09 236 aa23.22■■□□□ 1.31
RARA-AS1-201ENST00000581080 ZSCAN5AQ9BUG6 496 aa23.22■■□□□ 1.31
RARA-AS1-201ENST00000581080 FOXQ1Q9C009 403 aa23.22■■□□□ 1.31
RARA-AS1-201ENST00000581080 ABCG8Q9H221 673 aa23.22■■□□□ 1.31
RARA-AS1-201ENST00000581080 PCMTD2Q9NV79 361 aa23.22■■□□□ 1.31
RARA-AS1-201ENST00000581080 COQ6Q9Y2Z9 468 aa23.22■■□□□ 1.31
RARA-AS1-201ENST00000581080 LZTS3O60299 673 aaPredicted RBP23.22■■□□□ 1.31
RARA-AS1-201ENST00000581080 MPOP05164 745 aa23.22■■□□□ 1.31
RARA-AS1-201ENST00000581080 STMN1P16949 149 aa23.22■■□□□ 1.31
RARA-AS1-201ENST00000581080 DGKEP52429 567 aa23.22■■□□□ 1.31
RARA-AS1-201ENST00000581080 TAS2R39P59534 338 aa23.22■■□□□ 1.31
RARA-AS1-201ENST00000581080 ZKSCAN8Q15776 578 aaPredicted RBP23.22■■□□□ 1.31
RARA-AS1-201ENST00000581080 PPM1JQ5JR12 505 aa23.22■■□□□ 1.31
RARA-AS1-201ENST00000581080 KBTBD6Q86V97 674 aa23.22■■□□□ 1.31
RARA-AS1-201ENST00000581080 CEP97Q8IW35 865 aa23.22■■□□□ 1.31
RARA-AS1-201ENST00000581080 MDM1Q8TC05 714 aa23.22■■□□□ 1.31
RARA-AS1-201ENST00000581080 ULK4Q96C45 1275 aa23.22■■□□□ 1.31
RARA-AS1-201ENST00000581080 CABS1Q96KC9 395 aa23.22■■□□□ 1.31
RARA-AS1-201ENST00000581080 SLC13A1Q9BZW2 595 aa23.22■■□□□ 1.31
RARA-AS1-201ENST00000581080 SMOXQ9NWM0 555 aa23.22■■□□□ 1.31
RARA-AS1-201ENST00000581080 FZD4Q9ULV1 537 aa23.22■■□□□ 1.31
RARA-AS1-201ENST00000581080 LRRK1Q38SD2 2015 aa23.22■■□□□ 1.31
RARA-AS1-201ENST00000581080 A0A096LPK6 155 aa23.21■■□□□ 1.31
RARA-AS1-201ENST00000581080 COPEO14579 308 aa23.21■■□□□ 1.31
RARA-AS1-201ENST00000581080 PLRG1O43660 514 aaKnown RBP23.21■■□□□ 1.31
RARA-AS1-201ENST00000581080 ATG13O75143 517 aa23.21■■□□□ 1.31
RARA-AS1-201ENST00000581080 PCDH8O95206 1070 aa23.21■■□□□ 1.31
RARA-AS1-201ENST00000581080 C2P06681 752 aa23.21■■□□□ 1.31
RARA-AS1-201ENST00000581080 ACADMP11310 421 aa23.21■■□□□ 1.31
RARA-AS1-201ENST00000581080 GABRG2P18507 467 aa23.21■■□□□ 1.31
RARA-AS1-201ENST00000581080 FMO4P31512 558 aa23.21■■□□□ 1.31
RARA-AS1-201ENST00000581080 RPA3P35244 121 aaPredicted RBP23.21■■□□□ 1.31
RARA-AS1-201ENST00000581080 CCT5P48643 541 aa23.21■■□□□ 1.31
RARA-AS1-201ENST00000581080 RAB10P61026 200 aa23.21■■□□□ 1.31
RARA-AS1-201ENST00000581080 SFSWAPQ12872 951 aaKnown RBP23.21■■□□□ 1.31
RARA-AS1-201ENST00000581080 GAS6Q14393 721 aa23.21■■□□□ 1.31
RARA-AS1-201ENST00000581080 FAM45BPQ6NSW5 357 aa23.21■■□□□ 1.31
RARA-AS1-201ENST00000581080 GJD3Q8N144 294 aa23.21■■□□□ 1.31
RARA-AS1-201ENST00000581080 FAM45AQ8TCE6 357 aa23.21■■□□□ 1.31
RARA-AS1-201ENST00000581080 OLFM1Q99784 485 aa23.21■■□□□ 1.31
RARA-AS1-201ENST00000581080 AARSD1Q9BTE6 412 aaKnown RBP23.21■■□□□ 1.31
RARA-AS1-201ENST00000581080 POLMQ9NP87 494 aaPredicted RBP23.21■■□□□ 1.31
RARA-AS1-201ENST00000581080 MKS1Q9NXB0 559 aa23.21■■□□□ 1.31
RARA-AS1-201ENST00000581080 MUTYHQ9UIF7 546 aa23.21■■□□□ 1.31
RARA-AS1-201ENST00000581080 PLXNA2O75051 1894 aa23.21■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 51.1 ms