RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000569341.1

CFDP1-208, Transcript of craniofacial development protein 1, human

TSL 3

Gene CFDP1, Length 454 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

Download Table

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
CFDP1-208	ENST00000569341	DDX55	Q8NHQ9	600 aa	Known RBP eCLIP	4.27	□□□□□ -1.73
CFDP1-208	ENST00000569341	GABPB2	Q8TAK5	448 aa	Predicted RBP	4.27	□□□□□ -1.73
CFDP1-208	ENST00000569341	DEPTOR	Q8TB45	409 aa		4.27	□□□□□ -1.73
CFDP1-208	ENST00000569341	CCDC110	Q8TBZ0	833 aa		4.27	□□□□□ -1.73
CFDP1-208	ENST00000569341	TBC1D15	Q8TC07	691 aa		4.27	□□□□□ -1.73
CFDP1-208	ENST00000569341	ACER1	Q8TDN7	264 aa		4.27	□□□□□ -1.73
CFDP1-208	ENST00000569341	ACMSD	Q8TDX5	336 aa		4.27	□□□□□ -1.73
CFDP1-208	ENST00000569341	DCAKD	Q8WVC6	231 aa		4.27	□□□□□ -1.73
CFDP1-208	ENST00000569341	SLC44A1	Q8WWI5	657 aa		4.27	□□□□□ -1.73
CFDP1-208	ENST00000569341	JADE3	Q92613	823 aa		4.27	□□□□□ -1.73
CFDP1-208	ENST00000569341	USP6NL	Q92738	828 aa		4.27	□□□□□ -1.73
CFDP1-208	ENST00000569341	SKA1	Q96BD8	255 aa		4.27	□□□□□ -1.73
CFDP1-208	ENST00000569341	FAM136A	Q96C01	138 aa		4.27	□□□□□ -1.73
CFDP1-208	ENST00000569341	HAUS1	Q96CS2	278 aa		4.27	□□□□□ -1.73
CFDP1-208	ENST00000569341	RTP4	Q96DX8	246 aa		4.27	□□□□□ -1.73
CFDP1-208	ENST00000569341	PRMT6	Q96LA8	375 aa	Predicted RBP	4.27	□□□□□ -1.73
CFDP1-208	ENST00000569341	C8orf48	Q96LL4	319 aa		4.27	□□□□□ -1.73
CFDP1-208	ENST00000569341	RMDN3	Q96TC7	470 aa		4.27	□□□□□ -1.73
CFDP1-208	ENST00000569341	PAFAH2	Q99487	392 aa		4.27	□□□□□ -1.73
CFDP1-208	ENST00000569341	TSC22D3	Q99576	134 aa		4.27	□□□□□ -1.73
CFDP1-208	ENST00000569341	C11orf70	Q9BRQ4	267 aa		4.27	□□□□□ -1.73
CFDP1-208	ENST00000569341	TSSK1B	Q9BXA7	367 aa		4.27	□□□□□ -1.73
CFDP1-208	ENST00000569341	GCOM2	Q9BZD3	368 aa	Predicted RBP	4.27	□□□□□ -1.73
CFDP1-208	ENST00000569341	PORCN	Q9H237	461 aa		4.27	□□□□□ -1.73
CFDP1-208	ENST00000569341	DENND2D	Q9H6A0	471 aa	Predicted RBP	4.27	□□□□□ -1.73
CFDP1-208	ENST00000569341	PXMP2	Q9NR77	195 aa		4.27	□□□□□ -1.73
CFDP1-208	ENST00000569341	NRBP2	Q9NSY0	501 aa		4.27	□□□□□ -1.73
CFDP1-208	ENST00000569341	MRGBP	Q9NV56	204 aa		4.27	□□□□□ -1.73
CFDP1-208	ENST00000569341	C14orf119	Q9NWQ9	140 aa		4.27	□□□□□ -1.73
CFDP1-208	ENST00000569341	RBAK	Q9NYW8	714 aa	Predicted RBP	4.27	□□□□□ -1.73
CFDP1-208	ENST00000569341	SEPT10	Q9P0V9	454 aa		4.27	□□□□□ -1.73
CFDP1-208	ENST00000569341	PAK5	Q9P286	719 aa		4.27	□□□□□ -1.73
CFDP1-208	ENST00000569341	FRMD4A	Q9P2Q2	1039 aa	Predicted RBP	4.27	□□□□□ -1.73
CFDP1-208	ENST00000569341	HSFX1	Q9UBD0	423 aa		4.27	□□□□□ -1.73
CFDP1-208	ENST00000569341	TBK1	Q9UHD2	729 aa		4.27	□□□□□ -1.73
CFDP1-208	ENST00000569341	HAO1	Q9UJM8	370 aa		4.27	□□□□□ -1.73
CFDP1-208	ENST00000569341	ITGB1BP2	Q9UKP3	347 aa		4.27	□□□□□ -1.73
CFDP1-208	ENST00000569341	DNPEP	Q9ULA0	475 aa		4.27	□□□□□ -1.73
CFDP1-208	ENST00000569341	KIAA1257	Q9ULG3	409 aa		4.27	□□□□□ -1.73
CFDP1-208	ENST00000569341	G3BP2	Q9UN86	482 aa	Known RBP	4.27	□□□□□ -1.73
CFDP1-208	ENST00000569341	AGTPBP1	Q9UPW5	1226 aa		4.27	□□□□□ -1.73
CFDP1-208	ENST00000569341	ASB3	Q9Y575	518 aa		4.27	□□□□□ -1.73
CFDP1-208	ENST00000569341	PCDHGA2	Q9Y5H1	932 aa		4.27	□□□□□ -1.73
CFDP1-208	ENST00000569341	KIF13B	Q9NQT8	1826 aa		4.27	□□□□□ -1.73
CFDP1-208	ENST00000569341	CEP350	Q5VT06	3117 aa		4.27	□□□□□ -1.73
CFDP1-208	ENST00000569341	ADGRA2	Q96PE1	1338 aa		4.26	□□□□□ -1.73
CFDP1-208	ENST00000569341	CNTNAP2	Q9UHC6	1331 aa		4.26	□□□□□ -1.73
CFDP1-208	ENST00000569341	C3orf70	A6NLC5	250 aa	Predicted RBP	4.26	□□□□□ -1.73
CFDP1-208	ENST00000569341	DDX39A	O00148	427 aa	Known RBP	4.26	□□□□□ -1.73
CFDP1-208	ENST00000569341	MCF2L	O15068	1137 aa		4.26	□□□□□ -1.73
CFDP1-208	ENST00000569341	SMIM24	O75264	130 aa		4.26	□□□□□ -1.73
CFDP1-208	ENST00000569341	TOM1L1	O75674	476 aa		4.26	□□□□□ -1.73
CFDP1-208	ENST00000569341	RNASEH2A	O75792	299 aa	Known RBP	4.26	□□□□□ -1.73
CFDP1-208	ENST00000569341	TM7SF2	O76062	418 aa		4.26	□□□□□ -1.73
CFDP1-208	ENST00000569341	KLHL2	O95198	593 aa		4.26	□□□□□ -1.73
CFDP1-208	ENST00000569341	IL18RAP	O95256	599 aa		4.26	□□□□□ -1.73
CFDP1-208	ENST00000569341	PSMG1	O95456	288 aa		4.26	□□□□□ -1.73
CFDP1-208	ENST00000569341	VNN1	O95497	513 aa		4.26	□□□□□ -1.73
CFDP1-208	ENST00000569341	SNRPA	P09012	282 aa	Known RBP	4.26	□□□□□ -1.73
CFDP1-208	ENST00000569341	DLD	P09622	509 aa	Known RBP	4.26	□□□□□ -1.73
CFDP1-208	ENST00000569341	SUPT20HL2	P0C7V6	817 aa		4.26	□□□□□ -1.73
CFDP1-208	ENST00000569341	PIM1	P11309	404 aa	Predicted RBP	4.26	□□□□□ -1.73
CFDP1-208	ENST00000569341	KRT3	P12035	628 aa		4.26	□□□□□ -1.73
CFDP1-208	ENST00000569341	CCDC130	P13994	396 aa		4.26	□□□□□ -1.73
CFDP1-208	ENST00000569341	ZFX	P17010	805 aa	Predicted RBP	4.26	□□□□□ -1.73
CFDP1-208	ENST00000569341	ZNF24	P17028	368 aa		4.26	□□□□□ -1.73
CFDP1-208	ENST00000569341	ATF7	P17544	494 aa	Predicted RBP	4.26	□□□□□ -1.73
CFDP1-208	ENST00000569341	CD58	P19256	250 aa		4.26	□□□□□ -1.73
CFDP1-208	ENST00000569341	AOC1	P19801	751 aa		4.26	□□□□□ -1.73
CFDP1-208	ENST00000569341	TGM2	P21980	687 aa		4.26	□□□□□ -1.73
CFDP1-208	ENST00000569341	GLRA2	P23416	452 aa		4.26	□□□□□ -1.73
CFDP1-208	ENST00000569341	PRKCH	P24723	683 aa		4.26	□□□□□ -1.73
CFDP1-208	ENST00000569341	EPHB2	P29323	1055 aa		4.26	□□□□□ -1.73
CFDP1-208	ENST00000569341	PRDX6	P30041	224 aa		4.26	□□□□□ -1.73
CFDP1-208	ENST00000569341	ICAM3	P32942	547 aa		4.26	□□□□□ -1.73
CFDP1-208	ENST00000569341	ARL2	P36404	184 aa		4.26	□□□□□ -1.73
CFDP1-208	ENST00000569341	TSPAN7	P41732	249 aa		4.26	□□□□□ -1.73
CFDP1-208	ENST00000569341	GABRB2	P47870	512 aa		4.26	□□□□□ -1.73
CFDP1-208	ENST00000569341	SLC6A9	P48067	706 aa		4.26	□□□□□ -1.73
CFDP1-208	ENST00000569341	PAPOLA	P51003	745 aa	Known RBP	4.26	□□□□□ -1.73
CFDP1-208	ENST00000569341	RPS6KA3	P51812	740 aa		4.26	□□□□□ -1.73
CFDP1-208	ENST00000569341	GPX6	P59796	221 aa		4.26	□□□□□ -1.73
CFDP1-208	ENST00000569341	ZNF280A	P59817	542 aa	Predicted RBP	4.26	□□□□□ -1.73
CFDP1-208	ENST00000569341	KRTAP10-6	P60371	365 aa	Predicted RBP	4.26	□□□□□ -1.73
CFDP1-208	ENST00000569341	MYL6	P60660	151 aa		4.26	□□□□□ -1.73
CFDP1-208	ENST00000569341	RPS6	P62753	249 aa	Known RBP	4.26	□□□□□ -1.73
CFDP1-208	ENST00000569341	AP2B1	P63010	937 aa		4.26	□□□□□ -1.73
CFDP1-208	ENST00000569341	UBXN2A	P68543	259 aa		4.26	□□□□□ -1.73
CFDP1-208	ENST00000569341	NOP14	P78316	857 aa	Known RBP	4.26	□□□□□ -1.73
CFDP1-208	ENST00000569341	CREM	Q03060	361 aa		4.26	□□□□□ -1.73
CFDP1-208	ENST00000569341	ZBTB16	Q05516	673 aa		4.26	□□□□□ -1.73
CFDP1-208	ENST00000569341	MGAT2	Q10469	447 aa		4.26	□□□□□ -1.73
CFDP1-208	ENST00000569341	SPP2	Q13103	211 aa		4.26	□□□□□ -1.73
CFDP1-208	ENST00000569341	ZBTB17	Q13105	803 aa		4.26	□□□□□ -1.73
CFDP1-208	ENST00000569341	EMC2	Q15006	297 aa		4.26	□□□□□ -1.73
CFDP1-208	ENST00000569341	SLC1A5	Q15758	541 aa		4.26	□□□□□ -1.73
CFDP1-208	ENST00000569341	UGCG	Q16739	394 aa		4.26	□□□□□ -1.73
CFDP1-208	ENST00000569341	ANO4	Q32M45	955 aa		4.26	□□□□□ -1.73
CFDP1-208	ENST00000569341	SUPT20HL1	Q3ZLR7	823 aa		4.26	□□□□□ -1.73
CFDP1-208	ENST00000569341	BOLA3	Q53S33	107 aa		4.26	□□□□□ -1.73

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 65.2 ms