RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000567271.1

NME3-210, Transcript of NME/NM23 nucleoside diphosphate kinase 3, humanhuman

TSL 2

Gene NME3, Length 752 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NME3-210ENST00000567271 IGF2BP2Q9Y6M1 599 aaKnown RBP eCLIP21.47■■□□□ 1.03
NME3-210ENST00000567271 U3KQA8 63 aa21.47■■□□□ 1.03
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NME3-210ENST00000567271 ERI2A8K979 691 aaKnown RBP21.46■■□□□ 1.03
NME3-210ENST00000567271 CES2O00748 559 aa21.46■■□□□ 1.03
NME3-210ENST00000567271 ASMTLO95671 621 aa21.46■■□□□ 1.03
NME3-210ENST00000567271 TOP3BO95985 862 aaKnown RBP21.46■■□□□ 1.03
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NME3-210ENST00000567271 GNG11P61952 73 aa21.46■■□□□ 1.03
NME3-210ENST00000567271 CCDC157Q569K6 752 aa21.46■■□□□ 1.03
NME3-210ENST00000567271 CHCHD4Q8N4Q1 142 aa21.46■■□□□ 1.03
NME3-210ENST00000567271 CCL4L1Q8NHW4 92 aa21.46■■□□□ 1.03
NME3-210ENST00000567271 ACTRT1Q8TDG2 376 aa21.46■■□□□ 1.03
NME3-210ENST00000567271 GPBAR1Q8TDU6 330 aa21.46■■□□□ 1.03
NME3-210ENST00000567271 GLYATL1Q969I3 302 aa21.46■■□□□ 1.03
NME3-210ENST00000567271 NAP1L3Q99457 506 aaPredicted RBP21.46■■□□□ 1.03
NME3-210ENST00000567271 AP1M1Q9BXS5 423 aa21.46■■□□□ 1.03
NME3-210ENST00000567271 SUDS3Q9H7L9 328 aaPredicted RBP21.46■■□□□ 1.03
NME3-210ENST00000567271 RAB6BQ9NRW1 208 aa21.46■■□□□ 1.03
NME3-210ENST00000567271 IGF2BP1Q9NZI8 577 aaKnown RBP eCLIP21.46■■□□□ 1.03
NME3-210ENST00000567271 NCKIPSDQ9NZQ3 722 aa21.46■■□□□ 1.03
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NME3-210ENST00000567271 SCN8AQ9UQD0 1980 aa21.45■■□□□ 1.02
NME3-210ENST00000567271 PGRMC1O00264 195 aaKnown RBP21.45■■□□□ 1.02
NME3-210ENST00000567271 STX7O15400 261 aaKnown RBP21.45■■□□□ 1.02
NME3-210ENST00000567271 RFPL3O75679 317 aa21.45■■□□□ 1.02
NME3-210ENST00000567271 SUN1O94901 812 aa21.45■■□□□ 1.02
NME3-210ENST00000567271 CRTAMO95727 393 aa21.45■■□□□ 1.02
NME3-210ENST00000567271 ILKQ13418 452 aa21.45■■□□□ 1.02
NME3-210ENST00000567271 SEMA5AQ13591 1074 aa21.45■■□□□ 1.02
NME3-210ENST00000567271 PTPRCAPQ14761 206 aa21.45■■□□□ 1.02
NME3-210ENST00000567271 PYCR3Q53H96 274 aa21.45■■□□□ 1.02
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NME3-210ENST00000567271 TAF8Q7Z7C8 310 aa21.45■■□□□ 1.02
NME3-210ENST00000567271 LINC00523Q86TU6 105 aa21.45■■□□□ 1.02
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NME3-210ENST00000567271 GLMNQ92990 594 aa21.45■■□□□ 1.02
NME3-210ENST00000567271 VPS35Q96QK1 796 aa21.45■■□□□ 1.02
NME3-210ENST00000567271 SMARCAL1Q9NZC9 954 aa21.45■■□□□ 1.02
NME3-210ENST00000567271 KCTD3Q9Y597 815 aa21.45■■□□□ 1.02
NME3-210ENST00000567271 GLYATL1P3A0A0U1RQE8 302 aa21.44■■□□□ 1.02
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NME3-210ENST00000567271 CDK4P11802 303 aa21.44■■□□□ 1.02
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NME3-210ENST00000567271 GPR34Q9UPC5 381 aa21.44■■□□□ 1.02
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NME3-210ENST00000567271 EME2A4GXA9 379 aaPredicted RBP21.42■■□□□ 1.02
NME3-210ENST00000567271 NUAK1O60285 661 aa21.42■■□□□ 1.02
NME3-210ENST00000567271 UGT1A9O60656 530 aa21.42■■□□□ 1.02
NME3-210ENST00000567271 UGT1A6P19224 532 aa21.42■■□□□ 1.02
NME3-210ENST00000567271 SPINK2P20155 84 aa21.42■■□□□ 1.02
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