RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000560957.1

AKAP13-223, Transcript of A-kinase anchoring protein 13, human

TSL 3

Gene AKAP13, Length 751 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
AKAP13-223	ENST00000560957	OLIG2	Q13516	323 aa		2.85	□□□□□ -1.95
AKAP13-223	ENST00000560957	TDG	Q13569	410 aa		2.85	□□□□□ -1.95
AKAP13-223	ENST00000560957	RPS6KA1	Q15418	735 aa		2.85	□□□□□ -1.95
AKAP13-223	ENST00000560957	OASL	Q15646	514 aa	Known RBP	2.85	□□□□□ -1.95
AKAP13-223	ENST00000560957	ASTE1	Q2TB18	679 aa	Predicted RBP	2.85	□□□□□ -1.95
AKAP13-223	ENST00000560957	PCGF3	Q3KNV8	242 aa		2.85	□□□□□ -1.95
AKAP13-223	ENST00000560957	SOWAHC	Q53LP3	525 aa	Predicted RBP	2.85	□□□□□ -1.95
AKAP13-223	ENST00000560957	HSP90AA5P	Q58FG0	334 aa		2.85	□□□□□ -1.95
AKAP13-223	ENST00000560957	ZNF789	Q5FWF6	425 aa		2.85	□□□□□ -1.95
AKAP13-223	ENST00000560957	TMEM196	Q5HYL7	178 aa		2.85	□□□□□ -1.95
AKAP13-223	ENST00000560957	CCDC144NL	Q6NUI1	221 aa		2.85	□□□□□ -1.95
AKAP13-223	ENST00000560957	GJB7	Q6PEY0	223 aa		2.85	□□□□□ -1.95
AKAP13-223	ENST00000560957	SHQ1	Q6PI26	577 aa	Known RBP	2.85	□□□□□ -1.95
AKAP13-223	ENST00000560957	COLCA1	Q6ZS62	124 aa		2.85	□□□□□ -1.95
AKAP13-223	ENST00000560957	C15orf52	Q6ZUT6	534 aa	Known RBP	2.85	□□□□□ -1.95
AKAP13-223	ENST00000560957	OTUD6A	Q7L8S5	288 aa		2.85	□□□□□ -1.95
AKAP13-223	ENST00000560957	MIER3	Q7Z3K6	550 aa		2.85	□□□□□ -1.95
AKAP13-223	ENST00000560957	SLC46A3	Q7Z3Q1	461 aa		2.85	□□□□□ -1.95
AKAP13-223	ENST00000560957	SPATA19	Q7Z5L4	167 aa		2.85	□□□□□ -1.95
AKAP13-223	ENST00000560957	ADCK2	Q7Z695	626 aa		2.85	□□□□□ -1.95
AKAP13-223	ENST00000560957	CNTN4	Q8IWV2	1026 aa		2.85	□□□□□ -1.95
AKAP13-223	ENST00000560957	MCEMP1	Q8IX19	187 aa		2.85	□□□□□ -1.95
AKAP13-223	ENST00000560957	TIGD4	Q8IY51	512 aa		2.85	□□□□□ -1.95
AKAP13-223	ENST00000560957	HACE1	Q8IYU2	909 aa		2.85	□□□□□ -1.95
AKAP13-223	ENST00000560957	PI4KAP1	Q8N8J0	262 aa		2.85	□□□□□ -1.95
AKAP13-223	ENST00000560957	C11orf44	Q8N8P7	122 aa		2.85	□□□□□ -1.95
AKAP13-223	ENST00000560957	PNPLA1	Q8N8W4	532 aa		2.85	□□□□□ -1.95
AKAP13-223	ENST00000560957	TC2N	Q8N9U0	490 aa		2.85	□□□□□ -1.95
AKAP13-223	ENST00000560957	IQUB	Q8NA54	791 aa		2.85	□□□□□ -1.95
AKAP13-223	ENST00000560957	CADM4	Q8NFZ8	388 aa		2.85	□□□□□ -1.95
AKAP13-223	ENST00000560957	TSPAN14	Q8NG11	270 aa		2.85	□□□□□ -1.95
AKAP13-223	ENST00000560957	OR52K2	Q8NGK3	314 aa		2.85	□□□□□ -1.95
AKAP13-223	ENST00000560957	B4GALNT2	Q8NHY0	566 aa		2.85	□□□□□ -1.95
AKAP13-223	ENST00000560957	FAM216A	Q8WUB2	273 aa		2.85	□□□□□ -1.95
AKAP13-223	ENST00000560957	SHC3	Q92529	594 aa		2.85	□□□□□ -1.95
AKAP13-223	ENST00000560957	MRPS27	Q92552	414 aa	Known RBP	2.85	□□□□□ -1.95
AKAP13-223	ENST00000560957	CNOT9	Q92600	299 aa	Known RBP	2.85	□□□□□ -1.95
AKAP13-223	ENST00000560957	NPIPB3	Q92617	1050 aa		2.85	□□□□□ -1.95
AKAP13-223	ENST00000560957	MCRS1	Q96EZ8	462 aa		2.85	□□□□□ -1.95
AKAP13-223	ENST00000560957	EEF2KMT	Q96G04	330 aa		2.85	□□□□□ -1.95
AKAP13-223	ENST00000560957	ZFYVE19	Q96K21	471 aa		2.85	□□□□□ -1.95
AKAP13-223	ENST00000560957	KLHL15	Q96M94	604 aa		2.85	□□□□□ -1.95
AKAP13-223	ENST00000560957	KCNK16	Q96T55	309 aa		2.85	□□□□□ -1.95
AKAP13-223	ENST00000560957	FERMT1	Q9BQL6	677 aa		2.85	□□□□□ -1.95
AKAP13-223	ENST00000560957	MGME1	Q9BQP7	344 aa		2.85	□□□□□ -1.95
AKAP13-223	ENST00000560957	TCHP	Q9BT92	498 aa		2.85	□□□□□ -1.95
AKAP13-223	ENST00000560957	NUP85	Q9BW27	656 aa		2.85	□□□□□ -1.95
AKAP13-223	ENST00000560957	NPL	Q9BXD5	320 aa	Predicted RBP	2.85	□□□□□ -1.95
AKAP13-223	ENST00000560957	HEMGN	Q9BXL5	484 aa		2.85	□□□□□ -1.95
AKAP13-223	ENST00000560957	TTYH1	Q9H313	450 aa	Predicted RBP	2.85	□□□□□ -1.95
AKAP13-223	ENST00000560957	NCOR1P1	Q9H4R4	102 aa		2.85	□□□□□ -1.95
AKAP13-223	ENST00000560957	PDE11A	Q9HCR9	933 aa		2.85	□□□□□ -1.95
AKAP13-223	ENST00000560957	MLXIPL	Q9NP71	852 aa		2.85	□□□□□ -1.95
AKAP13-223	ENST00000560957	FANCF	Q9NPI8	374 aa		2.85	□□□□□ -1.95
AKAP13-223	ENST00000560957	OGFR	Q9NZT2	677 aa		2.85	□□□□□ -1.95
AKAP13-223	ENST00000560957	DLGAP2	Q9P1A6	1054 aa		2.85	□□□□□ -1.95
AKAP13-223	ENST00000560957	TSPYL4	Q9UJ04	414 aa		2.85	□□□□□ -1.95
AKAP13-223	ENST00000560957	NENF	Q9UMX5	172 aa		2.85	□□□□□ -1.95
AKAP13-223	ENST00000560957	SLC27A6	Q9Y2P4	619 aa		2.85	□□□□□ -1.95
AKAP13-223	ENST00000560957	PCDHGA5	Q9Y5G8	931 aa		2.85	□□□□□ -1.95
AKAP13-223	ENST00000560957	PCDHGA1	Q9Y5H4	931 aa		2.85	□□□□□ -1.95
AKAP13-223	ENST00000560957	LIPG	Q9Y5X9	500 aa		2.85	□□□□□ -1.95
AKAP13-223	ENST00000560957	TBC1D3D	A0A087WVF3	549 aa		2.84	□□□□□ -1.95
AKAP13-223	ENST00000560957	TBC1D3I	A0A087WXS9	549 aa		2.84	□□□□□ -1.95
AKAP13-223	ENST00000560957	TBC1D3E	A0A087X179	549 aa		2.84	□□□□□ -1.95
AKAP13-223	ENST00000560957	TBC1D3K	A0A087X1G2	549 aa		2.84	□□□□□ -1.95
AKAP13-223	ENST00000560957	GPR75-ASB3	A0A0A6YYF3	556 aa		2.84	□□□□□ -1.95
AKAP13-223	ENST00000560957	TBC1D3B	A6NDS4	549 aa		2.84	□□□□□ -1.95
AKAP13-223	ENST00000560957	TBC1D3F	A6NER0	549 aa	Predicted RBP	2.84	□□□□□ -1.95
AKAP13-223	ENST00000560957	LRRC53	A6NM62	1247 aa		2.84	□□□□□ -1.95
AKAP13-223	ENST00000560957	BTBD18	B2RXH4	712 aa		2.84	□□□□□ -1.95
AKAP13-223	ENST00000560957	EIF3CL	B5ME19	914 aa	Known RBP	2.84	□□□□□ -1.95
AKAP13-223	ENST00000560957	TBC1D3L	B9A6J9	549 aa		2.84	□□□□□ -1.95
AKAP13-223	ENST00000560957	AP3B1	O00203	1094 aa		2.84	□□□□□ -1.95
AKAP13-223	ENST00000560957	RRH	O14718	337 aa		2.84	□□□□□ -1.95
AKAP13-223	ENST00000560957	TNFRSF13B	O14836	293 aa	Predicted RBP	2.84	□□□□□ -1.95
AKAP13-223	ENST00000560957	PER2	O15055	1255 aa		2.84	□□□□□ -1.95
AKAP13-223	ENST00000560957	TSC22D2	O75157	780 aa		2.84	□□□□□ -1.95
AKAP13-223	ENST00000560957	PEX11A	O75192	247 aa		2.84	□□□□□ -1.95
AKAP13-223	ENST00000560957	NDUFS3	O75489	264 aa		2.84	□□□□□ -1.95
AKAP13-223	ENST00000560957	WDR47	O94967	919 aa		2.84	□□□□□ -1.95
AKAP13-223	ENST00000560957	ZFY	P08048	801 aa	Predicted RBP	2.84	□□□□□ -1.95
AKAP13-223	ENST00000560957	TBC1D3H	P0C7X1	549 aa		2.84	□□□□□ -1.95
AKAP13-223	ENST00000560957	ACTN1	P12814	892 aa		2.84	□□□□□ -1.95
AKAP13-223	ENST00000560957	ARSA	P15289	507 aa		2.84	□□□□□ -1.95
AKAP13-223	ENST00000560957	TMEM11	P17152	192 aa		2.84	□□□□□ -1.95
AKAP13-223	ENST00000560957	ARF4	P18085	180 aa	Predicted RBP	2.84	□□□□□ -1.95
AKAP13-223	ENST00000560957	AGA	P20933	346 aa		2.84	□□□□□ -1.95
AKAP13-223	ENST00000560957	ADRA1D	P25100	572 aa		2.84	□□□□□ -1.95
AKAP13-223	ENST00000560957	AVPR2	P30518	371 aa		2.84	□□□□□ -1.95
AKAP13-223	ENST00000560957	GJC1	P36383	396 aa		2.84	□□□□□ -1.95
AKAP13-223	ENST00000560957	IL15	P40933	162 aa	Predicted RBP	2.84	□□□□□ -1.95
AKAP13-223	ENST00000560957	BLK	P51451	505 aa		2.84	□□□□□ -1.95
AKAP13-223	ENST00000560957	RPS6KA3	P51812	740 aa		2.84	□□□□□ -1.95
AKAP13-223	ENST00000560957	ATXN3	P54252	364 aa	Predicted RBP	2.84	□□□□□ -1.95
AKAP13-223	ENST00000560957	HSF1	Q00613	529 aa		2.84	□□□□□ -1.95
AKAP13-223	ENST00000560957	SEMA3B	Q13214	749 aa		2.84	□□□□□ -1.95
AKAP13-223	ENST00000560957	MTX1	Q13505	466 aa		2.84	□□□□□ -1.95
AKAP13-223	ENST00000560957	CBFB	Q13951	182 aa		2.84	□□□□□ -1.95
AKAP13-223	ENST00000560957	RCN2	Q14257	317 aa		2.84	□□□□□ -1.95

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