RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000556170.5

NEK9-209, Transcript of NIMA related kinase 9, humanhuman

TSL 5

Gene NEK9, Length 3,975 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEK9-209ENST00000556170 DDX53Q86TM3 631 aaKnown RBP14.78□□□□□ -0.04
NEK9-209ENST00000556170 ZBTB46Q86UZ6 589 aa14.78□□□□□ -0.04
NEK9-209ENST00000556170 GFM2Q969S9 779 aaKnown RBP14.78□□□□□ -0.04
NEK9-209ENST00000556170 ZBTB26Q9HCK0 441 aa14.78□□□□□ -0.04
NEK9-209ENST00000556170 C6orf203Q9P0P8 240 aaPredicted RBP14.78□□□□□ -0.04
NEK9-209ENST00000556170 HSPA1AP0DMV8 641 aaKnown RBP14.78□□□□□ -0.04
NEK9-209ENST00000556170 HSPA1BP0DMV9 641 aaKnown RBP14.78□□□□□ -0.04
NEK9-209ENST00000556170 ATP6V1B2P21281 511 aa14.78□□□□□ -0.04
NEK9-209ENST00000556170 NOGQ13253 232 aa14.78□□□□□ -0.04
NEK9-209ENST00000556170 DEFB115Q30KQ5 88 aa14.78□□□□□ -0.04
NEK9-209ENST00000556170 GPRIN3Q6ZVF9 776 aa14.78□□□□□ -0.04
NEK9-209ENST00000556170 MAGEE2Q8TD90 523 aaPredicted RBP14.78□□□□□ -0.04
NEK9-209ENST00000556170 FAM162AQ96A26 154 aa14.78□□□□□ -0.04
NEK9-209ENST00000556170 OR1I1O60431 355 aa14.78□□□□□ -0.04
NEK9-209ENST00000556170 HTR7P34969 479 aa14.78□□□□□ -0.04
NEK9-209ENST00000556170 MTTPP55157 894 aa14.78□□□□□ -0.04
NEK9-209ENST00000556170 SERINC3Q13530 473 aa14.78□□□□□ -0.04
NEK9-209ENST00000556170 PTPRRQ15256 657 aa14.78□□□□□ -0.04
NEK9-209ENST00000556170 HSF5Q4G112 596 aaPredicted RBP14.78□□□□□ -0.04
NEK9-209ENST00000556170 SLC45A3Q96JT2 553 aa14.78□□□□□ -0.04
NEK9-209ENST00000556170 NR1H4Q96RI1 486 aaPredicted RBP14.78□□□□□ -0.04
NEK9-209ENST00000556170 TRMOQ9BU70 441 aa14.78□□□□□ -0.04
NEK9-209ENST00000556170 LZTS1Q9Y250 596 aa14.78□□□□□ -0.04
NEK9-209ENST00000556170 M0QZQ0 153 aa14.77□□□□□ -0.04
NEK9-209ENST00000556170 ATP6V1G1O75348 118 aa14.77□□□□□ -0.04
NEK9-209ENST00000556170 IMPDH1P20839 514 aa14.77□□□□□ -0.04
NEK9-209ENST00000556170 GABRR2P28476 465 aa14.77□□□□□ -0.04
NEK9-209ENST00000556170 PBLDP30039 288 aaPredicted RBP14.77□□□□□ -0.04
NEK9-209ENST00000556170 AGTR2P50052 363 aa14.77□□□□□ -0.04
NEK9-209ENST00000556170 TRIM25Q14258 630 aaKnown RBP14.77□□□□□ -0.04
NEK9-209ENST00000556170 MRPL10Q7Z7H8 261 aaKnown RBP14.77□□□□□ -0.04
NEK9-209ENST00000556170 UMODL1-AS1Q8N2C9 162 aa14.77□□□□□ -0.04
NEK9-209ENST00000556170 C8orf48Q96LL4 319 aa14.77□□□□□ -0.04
NEK9-209ENST00000556170 PKP2Q99959 881 aa14.77□□□□□ -0.04
NEK9-209ENST00000556170 MFSD1Q9H3U5 465 aa14.77□□□□□ -0.04
NEK9-209ENST00000556170 PIDD1Q9HB75 910 aa14.77□□□□□ -0.04
NEK9-209ENST00000556170 MYO1GB0I1T2 1018 aa14.77□□□□□ -0.04
NEK9-209ENST00000556170 GPR39O43194 453 aa14.77□□□□□ -0.04
NEK9-209ENST00000556170 C1QTNF8P60827 252 aa14.77□□□□□ -0.04
NEK9-209ENST00000556170 RPL38P63173 70 aaKnown RBP14.77□□□□□ -0.04
NEK9-209ENST00000556170 GTF2H3Q13889 308 aa14.77□□□□□ -0.04
NEK9-209ENST00000556170 GSTA3Q16772 222 aa14.77□□□□□ -0.04
NEK9-209ENST00000556170 PGS1Q32NB8 556 aa14.77□□□□□ -0.04
NEK9-209ENST00000556170 TXNDC8Q6A555 127 aa14.77□□□□□ -0.04
NEK9-209ENST00000556170 KDM1BQ8NB78 822 aa14.77□□□□□ -0.04
NEK9-209ENST00000556170 MAGEH1Q9H213 219 aa14.77□□□□□ -0.04
NEK9-209ENST00000556170 POLR3BQ9NW08 1133 aaPredicted RBP14.77□□□□□ -0.04
NEK9-209ENST00000556170 IL1BP01584 269 aa14.77□□□□□ -0.05
NEK9-209ENST00000556170 C1QAP02745 245 aa14.77□□□□□ -0.05
NEK9-209ENST00000556170 HSPA7P48741 367 aa14.77□□□□□ -0.05
NEK9-209ENST00000556170 CDKN1CP49918 316 aaPredicted RBP14.77□□□□□ -0.05
NEK9-209ENST00000556170 CACUL1Q86Y37 369 aa14.77□□□□□ -0.05
NEK9-209ENST00000556170 FBXO30Q8TB52 745 aa14.77□□□□□ -0.05
NEK9-209ENST00000556170 DLG3Q92796 817 aa14.77□□□□□ -0.05
NEK9-209ENST00000556170 CDK5RAP1Q96SZ6 601 aaKnown RBP14.77□□□□□ -0.05
NEK9-209ENST00000556170 TMEM248Q9NWD8 314 aa14.77□□□□□ -0.05
NEK9-209ENST00000556170 TRIP12Q14669 1992 aaPredicted RBP14.77□□□□□ -0.05
NEK9-209ENST00000556170 KIF13BQ9NQT8 1826 aa14.77□□□□□ -0.05
NEK9-209ENST00000556170 RAD51BO15315 384 aa14.76□□□□□ -0.05
NEK9-209ENST00000556170 S1PR4O95977 384 aa14.76□□□□□ -0.05
NEK9-209ENST00000556170 GPR17Q13304 367 aa14.76□□□□□ -0.05
NEK9-209ENST00000556170 EFL1Q7Z2Z2 1120 aaKnown RBP14.76□□□□□ -0.05
NEK9-209ENST00000556170 NSMCE2Q96MF7 247 aa14.76□□□□□ -0.05
NEK9-209ENST00000556170 C2orf49Q9BVC5 232 aaPredicted RBP14.76□□□□□ -0.05
NEK9-209ENST00000556170 UNC93B1Q9H1C4 597 aa14.76□□□□□ -0.05
NEK9-209ENST00000556170 ZDHHC6Q9H6R6 413 aa14.76□□□□□ -0.05
NEK9-209ENST00000556170 ARL15Q9NXU5 204 aa14.76□□□□□ -0.05
NEK9-209ENST00000556170 PCDH10Q9P2E7 1040 aa14.76□□□□□ -0.05
NEK9-209ENST00000556170 ORC6Q9Y5N6 252 aa14.76□□□□□ -0.05
NEK9-209ENST00000556170 RNASEH1O60930 286 aaKnown RBP14.76□□□□□ -0.05
NEK9-209ENST00000556170 HALP42357 657 aa14.76□□□□□ -0.05
NEK9-209ENST00000556170 DIO3P55073 304 aa14.76□□□□□ -0.05
NEK9-209ENST00000556170 MS4A2Q01362 244 aa14.76□□□□□ -0.05
NEK9-209ENST00000556170 TTLL9Q3SXZ7 439 aa14.76□□□□□ -0.05
NEK9-209ENST00000556170 AASDHQ4L235 1098 aaPredicted RBP14.76□□□□□ -0.05
NEK9-209ENST00000556170 TECRLQ5HYJ1 363 aa14.76□□□□□ -0.05
NEK9-209ENST00000556170 STK32CQ86UX6 486 aa14.76□□□□□ -0.05
NEK9-209ENST00000556170 DCUN1D5Q9BTE7 237 aa14.76□□□□□ -0.05
NEK9-209ENST00000556170 DPY30Q9C005 99 aa14.76□□□□□ -0.05
NEK9-209ENST00000556170 TMEM39AQ9NV64 488 aa14.76□□□□□ -0.05
NEK9-209ENST00000556170 SLC8A2Q9UPR5 921 aa14.76□□□□□ -0.05
NEK9-209ENST00000556170 EIF3LQ9Y262 564 aaKnown RBP14.76□□□□□ -0.05
NEK9-209ENST00000556170 A0A1B0GVM2 712 aa14.76□□□□□ -0.05
NEK9-209ENST00000556170 TCAF2A6NFQ2 919 aa14.76□□□□□ -0.05
NEK9-209ENST00000556170 FKBP9O95302 570 aa14.76□□□□□ -0.05
NEK9-209ENST00000556170 TNFAIP8O95379 198 aa14.76□□□□□ -0.05
NEK9-209ENST00000556170 CYP11A1P05108 521 aa14.76□□□□□ -0.05
NEK9-209ENST00000556170 LCP2Q13094 533 aa14.76□□□□□ -0.05
NEK9-209ENST00000556170 FKBP9P1Q75LS8 142 aa14.76□□□□□ -0.05
NEK9-209ENST00000556170 MPP4Q96JB8 637 aa14.76□□□□□ -0.05
NEK9-209ENST00000556170 CORO1BQ9BR76 489 aa14.76□□□□□ -0.05
NEK9-209ENST00000556170 COQ10BQ9H8M1 238 aa14.76□□□□□ -0.05
NEK9-209ENST00000556170 PARVBQ9HBI1 364 aa14.76□□□□□ -0.05
NEK9-209ENST00000556170 OPTCQ9UBM4 332 aa14.76□□□□□ -0.05
NEK9-209ENST00000556170 DHRS12A0PJE2 317 aa14.75□□□□□ -0.05
NEK9-209ENST00000556170 PRMT5O14744 637 aaPredicted RBP14.75□□□□□ -0.05
NEK9-209ENST00000556170 TMCC1O94876 653 aa14.75□□□□□ -0.05
NEK9-209ENST00000556170 SLC25A14O95258 325 aaPredicted RBP14.75□□□□□ -0.05
NEK9-209ENST00000556170 ALBP02768 609 aa14.75□□□□□ -0.05
NEK9-209ENST00000556170 HOXB8P17481 243 aaPredicted RBP14.75□□□□□ -0.05
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 43.9 ms