RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000550446.5

LETMD1-224, Transcript of LETM1 domain containing 1, human

TSL 3

Gene LETMD1, Length 562 nt, Biotype processed transcript.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
LETMD1-224	ENST00000550446	CA4	P22748	312 aa		18.8	■□□□□ 0.6
LETMD1-224	ENST00000550446	UGT1A3	P35503	534 aa		18.8	■□□□□ 0.6
LETMD1-224	ENST00000550446	TPM4	P67936	248 aa		18.8	■□□□□ 0.6
LETMD1-224	ENST00000550446	GBE1	Q04446	702 aa		18.8	■□□□□ 0.6
LETMD1-224	ENST00000550446	NFATC2	Q13469	925 aa		18.8	■□□□□ 0.6
LETMD1-224	ENST00000550446	PDK2	Q15119	407 aa		18.8	■□□□□ 0.6
LETMD1-224	ENST00000550446	DCAF12	Q5T6F0	453 aa		18.8	■□□□□ 0.6
LETMD1-224	ENST00000550446	ALG1L	Q6GMV1	187 aa		18.8	■□□□□ 0.6
LETMD1-224	ENST00000550446	LUZP1	Q86V48	1076 aa		18.8	■□□□□ 0.6
LETMD1-224	ENST00000550446	MAP7D3	Q8IWC1	876 aa		18.8	■□□□□ 0.6
LETMD1-224	ENST00000550446	ZNF564	Q8TBZ8	553 aa	Predicted RBP	18.8	■□□□□ 0.6
LETMD1-224	ENST00000550446	NCSTN	Q92542	709 aa		18.8	■□□□□ 0.6
LETMD1-224	ENST00000550446	ASPSCR1	Q9BZE9	553 aa		18.8	■□□□□ 0.6
LETMD1-224	ENST00000550446	FAM83D	Q9H4H8	585 aa		18.8	■□□□□ 0.6
LETMD1-224	ENST00000550446	CBX8	Q9HC52	389 aa		18.8	■□□□□ 0.6
LETMD1-224	ENST00000550446	CTTNBP2NL	Q9P2B4	639 aa		18.8	■□□□□ 0.6
LETMD1-224	ENST00000550446	TBC1D29	Q9UFV1	150 aa		18.8	■□□□□ 0.6
LETMD1-224	ENST00000550446	AMACR	Q9UHK6	382 aa		18.8	■□□□□ 0.6
LETMD1-224	ENST00000550446	LUC7L2	Q9Y383	392 aa	Known RBP	18.8	■□□□□ 0.6
LETMD1-224	ENST00000550446	OAS3	Q9Y6K5	1087 aa	Known RBP	18.8	■□□□□ 0.6
LETMD1-224	ENST00000550446	C1orf232	A0A0U1RR37	186 aa		18.79	■□□□□ 0.6
LETMD1-224	ENST00000550446	SNX2	O60749	519 aa		18.79	■□□□□ 0.6
LETMD1-224	ENST00000550446	DNAJC6	O75061	913 aa		18.79	■□□□□ 0.6
LETMD1-224	ENST00000550446	JCHAIN	P01591	159 aa		18.79	■□□□□ 0.6
LETMD1-224	ENST00000550446	HLA-DQB2	P05538	268 aa		18.79	■□□□□ 0.6
LETMD1-224	ENST00000550446	PBX1	P40424	430 aa		18.79	■□□□□ 0.6
LETMD1-224	ENST00000550446	FASLG	P48023	281 aa		18.79	■□□□□ 0.6
LETMD1-224	ENST00000550446	TAS2R40	P59535	323 aa		18.79	■□□□□ 0.6
LETMD1-224	ENST00000550446	SLC10A2	Q12908	348 aa	Predicted RBP	18.79	■□□□□ 0.6
LETMD1-224	ENST00000550446	CLCA4	Q14CN2	919 aa		18.79	■□□□□ 0.6
LETMD1-224	ENST00000550446	ZFYVE27	Q5T4F4	411 aa		18.79	■□□□□ 0.6
LETMD1-224	ENST00000550446	ANKS6	Q68DC2	871 aa		18.79	■□□□□ 0.6
LETMD1-224	ENST00000550446	IYD	Q6PHW0	289 aa		18.79	■□□□□ 0.6
LETMD1-224	ENST00000550446	CACNA2D3	Q8IZS8	1091 aa		18.79	■□□□□ 0.6
LETMD1-224	ENST00000550446	FATE1	Q969F0	183 aa		18.79	■□□□□ 0.6
LETMD1-224	ENST00000550446	WDR24	Q96S15	920 aa		18.79	■□□□□ 0.6
LETMD1-224	ENST00000550446	DDA1	Q9BW61	102 aa		18.79	■□□□□ 0.6
LETMD1-224	ENST00000550446	SLC12A9	Q9BXP2	914 aa		18.79	■□□□□ 0.6
LETMD1-224	ENST00000550446	KCNK6	Q9Y257	313 aa		18.79	■□□□□ 0.6
LETMD1-224	ENST00000550446		B4E171	279 aa		18.78	■□□□□ 0.6
LETMD1-224	ENST00000550446	DUX1	O43812	170 aa		18.78	■□□□□ 0.6
LETMD1-224	ENST00000550446	PROSC	O94903	275 aa		18.78	■□□□□ 0.6
LETMD1-224	ENST00000550446	ACP5	P13686	325 aa		18.78	■□□□□ 0.6
LETMD1-224	ENST00000550446	LIF	P15018	202 aa		18.78	■□□□□ 0.6
LETMD1-224	ENST00000550446	MX2	P20592	715 aa		18.78	■□□□□ 0.6
LETMD1-224	ENST00000550446	TSPAN7	P41732	249 aa		18.78	■□□□□ 0.6
LETMD1-224	ENST00000550446	CD86	P42081	329 aa		18.78	■□□□□ 0.6
LETMD1-224	ENST00000550446	MAPK9	P45984	424 aa		18.78	■□□□□ 0.6
LETMD1-224	ENST00000550446	SPINT3	P49223	89 aa		18.78	■□□□□ 0.6
LETMD1-224	ENST00000550446	RPL26	P61254	145 aa	Known RBP	18.78	■□□□□ 0.6
LETMD1-224	ENST00000550446	HHEX	Q03014	270 aa		18.78	■□□□□ 0.6
LETMD1-224	ENST00000550446	QPCT	Q16769	361 aa		18.78	■□□□□ 0.6
LETMD1-224	ENST00000550446	CHCHD2P9	Q5T1J5	151 aa	Predicted RBP	18.78	■□□□□ 0.6
LETMD1-224	ENST00000550446	PQLC3	Q8N755	202 aa		18.78	■□□□□ 0.6
LETMD1-224	ENST00000550446	CCHCR1	Q8TD31	782 aa		18.78	■□□□□ 0.6
LETMD1-224	ENST00000550446	CTRC	Q99895	268 aa		18.78	■□□□□ 0.6
LETMD1-224	ENST00000550446	ZNF670	Q9BS34	389 aa		18.78	■□□□□ 0.6
LETMD1-224	ENST00000550446	FUCA2	Q9BTY2	467 aa		18.78	■□□□□ 0.6
LETMD1-224	ENST00000550446	MLPH	Q9BV36	600 aa	Predicted RBP	18.78	■□□□□ 0.6
LETMD1-224	ENST00000550446	VPS18	Q9P253	973 aa		18.78	■□□□□ 0.6
LETMD1-224	ENST00000550446	PDP2	Q9P2J9	529 aa		18.78	■□□□□ 0.6
LETMD1-224	ENST00000550446	IL17B	Q9UHF5	180 aa		18.78	■□□□□ 0.6
LETMD1-224	ENST00000550446	RPL26L1	Q9UNX3	145 aa	Known RBP	18.78	■□□□□ 0.6
LETMD1-224	ENST00000550446	FADS2P1	A8MWK0	482 aa		18.77	■□□□□ 0.6
LETMD1-224	ENST00000550446	ANKRD66	B4E2M5	251 aa		18.77	■□□□□ 0.6
LETMD1-224	ENST00000550446	KRT7	P08729	469 aa		18.77	■□□□□ 0.6
LETMD1-224	ENST00000550446	FAM182A	Q5T1J6	154 aa		18.77	■□□□□ 0.6
LETMD1-224	ENST00000550446	ATG14	Q6ZNE5	492 aa		18.77	■□□□□ 0.6
LETMD1-224	ENST00000550446	KDELC2	Q7Z4H8	507 aa		18.77	■□□□□ 0.6
LETMD1-224	ENST00000550446	SLC9B2	Q86UD5	537 aa		18.77	■□□□□ 0.6
LETMD1-224	ENST00000550446	RAVER1	Q8IY67	606 aa	Known RBP	18.77	■□□□□ 0.6
LETMD1-224	ENST00000550446	CCDC13	Q8IYE1	715 aa		18.77	■□□□□ 0.6
LETMD1-224	ENST00000550446	SH3KBP1	Q96B97	665 aa		18.77	■□□□□ 0.6
LETMD1-224	ENST00000550446	LYSMD1	Q96S90	227 aa		18.77	■□□□□ 0.6
LETMD1-224	ENST00000550446	STN1	Q9H668	368 aa	Known RBP	18.77	■□□□□ 0.6
LETMD1-224	ENST00000550446	ARFGAP3	Q9NP61	516 aa		18.77	■□□□□ 0.6
LETMD1-224	ENST00000550446	PKD2L2	Q9NZM6	624 aa		18.77	■□□□□ 0.6
LETMD1-224	ENST00000550446	MYO18B	Q8IUG5	2567 aa		18.77	■□□□□ 0.59
LETMD1-224	ENST00000550446	KCNK1	O00180	336 aa		18.76	■□□□□ 0.59
LETMD1-224	ENST00000550446	SUV39H1	O43463	412 aa		18.76	■□□□□ 0.59
LETMD1-224	ENST00000550446	RAD1	O60671	282 aa		18.76	■□□□□ 0.59
LETMD1-224	ENST00000550446	MMP2	P08253	660 aa		18.76	■□□□□ 0.59
LETMD1-224	ENST00000550446	CSRP3	P50461	194 aa		18.76	■□□□□ 0.59
LETMD1-224	ENST00000550446	RAB15	P59190	212 aa		18.76	■□□□□ 0.59
LETMD1-224	ENST00000550446	ZNF648	Q5T619	568 aa	Predicted RBP	18.76	■□□□□ 0.59
LETMD1-224	ENST00000550446	HENMT1	Q5T8I9	393 aa	Known RBP	18.76	■□□□□ 0.59
LETMD1-224	ENST00000550446	BORA	Q6PGQ7	559 aa		18.76	■□□□□ 0.59
LETMD1-224	ENST00000550446	WDR74	Q6RFH5	385 aa	Predicted RBP	18.76	■□□□□ 0.59
LETMD1-224	ENST00000550446	LYSMD3	Q7Z3D4	306 aa		18.76	■□□□□ 0.59
LETMD1-224	ENST00000550446	RAPGEF5	Q92565	580 aa		18.76	■□□□□ 0.59
LETMD1-224	ENST00000550446	ADGRE3	Q9BY15	652 aa		18.76	■□□□□ 0.59
LETMD1-224	ENST00000550446	SLC25A18	Q9H1K4	315 aa		18.76	■□□□□ 0.59
LETMD1-224	ENST00000550446	RMI1	Q9H9A7	625 aa		18.76	■□□□□ 0.59
LETMD1-224	ENST00000550446	SARS2	Q9NP81	518 aa	Known RBP	18.76	■□□□□ 0.59
LETMD1-224	ENST00000550446	GEMIN8	Q9NWZ8	242 aa	Known RBP	18.76	■□□□□ 0.59
LETMD1-224	ENST00000550446	DTL	Q9NZJ0	730 aa		18.76	■□□□□ 0.59
LETMD1-224	ENST00000550446	KLHL3	Q9UH77	587 aa		18.76	■□□□□ 0.59
LETMD1-224	ENST00000550446	SPTA1	P02549	2419 aa		18.75	■□□□□ 0.59
LETMD1-224	ENST00000550446	SYCE3	A1L190	88 aa		18.75	■□□□□ 0.59
LETMD1-224	ENST00000550446	RGSL1	A5PLK6	1076 aa		18.75	■□□□□ 0.59

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