RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000547298.5

CS-208, Transcript of citrate synthase, human

TSL 3

Gene CS, Length 656 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
CS-208	ENST00000547298	CDH5	P33151	784 aa	Predicted RBP	11.13	□□□□□ -0.63
CS-208	ENST00000547298	CLCN1	P35523	988 aa		11.13	□□□□□ -0.63
CS-208	ENST00000547298	USP8	P40818	1118 aa		11.13	□□□□□ -0.63
CS-208	ENST00000547298	GLRB	P48167	497 aa		11.13	□□□□□ -0.63
CS-208	ENST00000547298	HDAC4	P56524	1084 aa		11.13	□□□□□ -0.63
CS-208	ENST00000547298	SNX16	P57768	344 aa		11.13	□□□□□ -0.63
CS-208	ENST00000547298	YBEY	P58557	167 aa	Predicted RBP	11.13	□□□□□ -0.63
CS-208	ENST00000547298	DPT	Q07507	201 aa		11.13	□□□□□ -0.63
CS-208	ENST00000547298	GPS2	Q13227	327 aa		11.13	□□□□□ -0.63
CS-208	ENST00000547298	TMCO4	Q5TGY1	634 aa		11.13	□□□□□ -0.63
CS-208	ENST00000547298	DENND2C	Q68D51	928 aa		11.13	□□□□□ -0.63
CS-208	ENST00000547298	MED25	Q71SY5	747 aa		11.13	□□□□□ -0.63
CS-208	ENST00000547298	ENOSF1	Q7L5Y1	443 aa		11.13	□□□□□ -0.63
CS-208	ENST00000547298	FJX1	Q86VR8	437 aa		11.13	□□□□□ -0.63
CS-208	ENST00000547298	TRIM59	Q8IWR1	403 aa		11.13	□□□□□ -0.63
CS-208	ENST00000547298	PYROXD2	Q8N2H3	581 aa		11.13	□□□□□ -0.63
CS-208	ENST00000547298	ARFGAP1	Q8N6T3	406 aa		11.13	□□□□□ -0.63
CS-208	ENST00000547298	EMC1	Q8N766	993 aa		11.13	□□□□□ -0.63
CS-208	ENST00000547298	TMEM102	Q8N9M5	508 aa	Predicted RBP	11.13	□□□□□ -0.63
CS-208	ENST00000547298	SLC38A9	Q8NBW4	561 aa		11.13	□□□□□ -0.63
CS-208	ENST00000547298	C18orf8	Q96DM3	657 aa		11.13	□□□□□ -0.63
CS-208	ENST00000547298	COX14	Q96I36	57 aa		11.13	□□□□□ -0.63
CS-208	ENST00000547298	CEP63	Q96MT8	703 aa		11.13	□□□□□ -0.63
CS-208	ENST00000547298	FCRL4	Q96PJ5	515 aa		11.13	□□□□□ -0.63
CS-208	ENST00000547298	AGAP2	Q99490	1192 aa		11.13	□□□□□ -0.63
CS-208	ENST00000547298	LRRC19	Q9H756	370 aa		11.13	□□□□□ -0.63
CS-208	ENST00000547298	UCK1	Q9HA47	277 aa		11.13	□□□□□ -0.63
CS-208	ENST00000547298	ZBTB20	Q9HC78	741 aa	Predicted RBP	11.13	□□□□□ -0.63
CS-208	ENST00000547298	LATS2	Q9NRM7	1088 aa		11.13	□□□□□ -0.63
CS-208	ENST00000547298	SCHIP1	Q9P0W5	487 aa	Predicted RBP	11.13	□□□□□ -0.63
CS-208	ENST00000547298	SEMA5B	Q9P283	1151 aa		11.13	□□□□□ -0.63
CS-208	ENST00000547298	KIR2DS5	A0A0G2JLQ3	304 aa		11.12	□□□□□ -0.63
CS-208	ENST00000547298		A0A0G2JNG1	304 aa		11.12	□□□□□ -0.63
CS-208	ENST00000547298	KIR2DS3	K7RE56	304 aa		11.12	□□□□□ -0.63
CS-208	ENST00000547298	PRAMEF11	O60813	436 aa		11.12	□□□□□ -0.63
CS-208	ENST00000547298	UBXN7	O94888	489 aa		11.12	□□□□□ -0.63
CS-208	ENST00000547298	F13A1	P00488	732 aa		11.12	□□□□□ -0.63
CS-208	ENST00000547298	CAPN1	P07384	714 aa		11.12	□□□□□ -0.63
CS-208	ENST00000547298	F3	P13726	295 aa		11.12	□□□□□ -0.63
CS-208	ENST00000547298	VIPR1	P32241	457 aa		11.12	□□□□□ -0.63
CS-208	ENST00000547298	VAV2	P52735	878 aa		11.12	□□□□□ -0.63
CS-208	ENST00000547298	MARS	P56192	900 aa	Known RBP	11.12	□□□□□ -0.63
CS-208	ENST00000547298	POLR2L	P62875	67 aa	Known RBP	11.12	□□□□□ -0.63
CS-208	ENST00000547298	BCL2L1	Q07817	233 aa		11.12	□□□□□ -0.63
CS-208	ENST00000547298	ZNF235	Q14590	738 aa		11.12	□□□□□ -0.63
CS-208	ENST00000547298	KCNAB1	Q14722	419 aa		11.12	□□□□□ -0.63
CS-208	ENST00000547298	KIR2DS5	Q14953	304 aa		11.12	□□□□□ -0.63
CS-208	ENST00000547298	ZNF630	Q2M218	657 aa	Predicted RBP	11.12	□□□□□ -0.63
CS-208	ENST00000547298	PARP15	Q460N3	678 aa		11.12	□□□□□ -0.63
CS-208	ENST00000547298	CCDC14	Q49A88	953 aa		11.12	□□□□□ -0.63
CS-208	ENST00000547298	CCDC40	Q4G0X9	1142 aa		11.12	□□□□□ -0.63
CS-208	ENST00000547298	ZNF658	Q5TYW1	1059 aa	Predicted RBP	11.12	□□□□□ -0.63
CS-208	ENST00000547298	ADAMTSL4	Q6UY14	1074 aa		11.12	□□□□□ -0.63
CS-208	ENST00000547298	TMEM26	Q6ZUK4	368 aa		11.12	□□□□□ -0.63
CS-208	ENST00000547298	ARC	Q7LC44	396 aa		11.12	□□□□□ -0.63
CS-208	ENST00000547298	GALNT13	Q8IUC8	556 aa		11.12	□□□□□ -0.63
CS-208	ENST00000547298	UMODL1-AS1	Q8N2C9	162 aa		11.12	□□□□□ -0.63
CS-208	ENST00000547298	RELT	Q969Z4	430 aa		11.12	□□□□□ -0.63
CS-208	ENST00000547298	PLEKHG4B	Q96PX9	1271 aa		11.12	□□□□□ -0.63
CS-208	ENST00000547298	HERPUD2	Q9BSE4	406 aa		11.12	□□□□□ -0.63
CS-208	ENST00000547298	ILKAP	Q9H0C8	392 aa	Predicted RBP	11.12	□□□□□ -0.63
CS-208	ENST00000547298	ABCG8	Q9H221	673 aa		11.12	□□□□□ -0.63
CS-208	ENST00000547298	CHST8	Q9H2A9	424 aa		11.12	□□□□□ -0.63
CS-208	ENST00000547298	GOLPH3L	Q9H4A5	285 aa		11.12	□□□□□ -0.63
CS-208	ENST00000547298	STN1	Q9H668	368 aa	Known RBP	11.12	□□□□□ -0.63
CS-208	ENST00000547298	ZNF552	Q9H707	407 aa	Predicted RBP	11.12	□□□□□ -0.63
CS-208	ENST00000547298	KCTD5	Q9NXV2	234 aa		11.12	□□□□□ -0.63
CS-208	ENST00000547298	TMEM63C	Q9P1W3	806 aa		11.12	□□□□□ -0.63
CS-208	ENST00000547298	CNOT8	Q9UFF9	292 aa	Known RBP	11.12	□□□□□ -0.63
CS-208	ENST00000547298	KCNK6	Q9Y257	313 aa		11.12	□□□□□ -0.63
CS-208	ENST00000547298	CSAG2	Q9Y5P2	127 aa		11.12	□□□□□ -0.63
CS-208	ENST00000547298	PKDREJ	Q9NTG1	2253 aa		11.12	□□□□□ -0.63
CS-208	ENST00000547298	IGHV5-51	A0A0C4DH38	117 aa		11.11	□□□□□ -0.63
CS-208	ENST00000547298	TTC24	A2A3L6	582 aa	Predicted RBP	11.11	□□□□□ -0.63
CS-208	ENST00000547298	GOLGA6C	A6NDK9	693 aa		11.11	□□□□□ -0.63
CS-208	ENST00000547298	GOLGA6B	A6NDN3	693 aa		11.11	□□□□□ -0.63
CS-208	ENST00000547298	NPIPB15	A6NHN6	443 aa	Predicted RBP	11.11	□□□□□ -0.63
CS-208	ENST00000547298	GOLGA8S	H3BPF8	625 aa		11.11	□□□□□ -0.63
CS-208	ENST00000547298	HTRA2	O43464	458 aa	Predicted RBP	11.11	□□□□□ -0.63
CS-208	ENST00000547298	GOLGA6D	P0CG33	693 aa		11.11	□□□□□ -0.63
CS-208	ENST00000547298	PNMA6A	P0CW24	399 aa	Predicted RBP	11.11	□□□□□ -0.63
CS-208	ENST00000547298	COX6B1	P14854	86 aa		11.11	□□□□□ -0.63
CS-208	ENST00000547298	SLC9A1	P19634	815 aa		11.11	□□□□□ -0.63
CS-208	ENST00000547298	HTR1E	P28566	365 aa		11.11	□□□□□ -0.63
CS-208	ENST00000547298	KRT9	P35527	623 aa		11.11	□□□□□ -0.63
CS-208	ENST00000547298	GPR1	P46091	355 aa		11.11	□□□□□ -0.63
CS-208	ENST00000547298	PPP1CA	P62136	330 aa		11.11	□□□□□ -0.63
CS-208	ENST00000547298	TUBB3	Q13509	450 aa		11.11	□□□□□ -0.63
CS-208	ENST00000547298	PNOC	Q13519	176 aa		11.11	□□□□□ -0.63
CS-208	ENST00000547298	ATP1A4	Q13733	1029 aa		11.11	□□□□□ -0.63
CS-208	ENST00000547298	LLGL1	Q15334	1064 aa		11.11	□□□□□ -0.63
CS-208	ENST00000547298	CDO1	Q16878	200 aa		11.11	□□□□□ -0.63
CS-208	ENST00000547298	CACHD1	Q5VU97	1274 aa		11.11	□□□□□ -0.63
CS-208	ENST00000547298	ATL3	Q6DD88	541 aa		11.11	□□□□□ -0.63
CS-208	ENST00000547298	DUS1L	Q6P1R4	473 aa	Known RBP	11.11	□□□□□ -0.63
CS-208	ENST00000547298	TRIM65	Q6PJ69	517 aa		11.11	□□□□□ -0.63
CS-208	ENST00000547298	CERS6	Q6ZMG9	384 aa		11.11	□□□□□ -0.63
CS-208	ENST00000547298	BNC2	Q6ZN30	1099 aa	Predicted RBP	11.11	□□□□□ -0.63
CS-208	ENST00000547298	CHST15	Q7LFX5	561 aa	Predicted RBP	11.11	□□□□□ -0.63
CS-208	ENST00000547298	TSPAN33	Q86UF1	283 aa		11.11	□□□□□ -0.63

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