RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000546248.5

TRDN-205, Transcript of triadin, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene TRDN, Length 1,179 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRDN-205ENST00000546248 CPEB1Q9BZB8 566 aaKnown RBP5.56□□□□□ -1.52
TRDN-205ENST00000546248 ULBP1Q9BZM6 244 aa5.56□□□□□ -1.52
TRDN-205ENST00000546248 TSPYL1Q9H0U9 437 aa5.56□□□□□ -1.52
TRDN-205ENST00000546248 UBN1Q9NPG3 1134 aa5.56□□□□□ -1.52
TRDN-205ENST00000546248 STAU2Q9NUL3 570 aaKnown RBP eCLIP5.56□□□□□ -1.52
TRDN-205ENST00000546248 SLC23A1Q9UHI7 598 aa5.56□□□□□ -1.52
TRDN-205ENST00000546248 SLC12A6Q9UHW9 1150 aa5.56□□□□□ -1.52
TRDN-205ENST00000546248 POLHQ9Y253 713 aa5.56□□□□□ -1.52
TRDN-205ENST00000546248 MYH10P35580 1976 aa5.56□□□□□ -1.52
TRDN-205ENST00000546248 COL4A3Q01955 1670 aa5.56□□□□□ -1.52
TRDN-205ENST00000546248 BCLAF3A2AJT9 711 aaKnown RBP5.55□□□□□ -1.52
TRDN-205ENST00000546248 ERICH4A6NGS2 130 aa5.55□□□□□ -1.52
TRDN-205ENST00000546248 GOLGA6L10A6NI86 522 aa5.55□□□□□ -1.52
TRDN-205ENST00000546248 YJEFN3A6XGL0 299 aa5.55□□□□□ -1.52
TRDN-205ENST00000546248 AHRRA9YTQ3 701 aa5.55□□□□□ -1.52
TRDN-205ENST00000546248 E7ENQ6 273 aa5.55□□□□□ -1.52
TRDN-205ENST00000546248 E7ESA3 106 aa5.55□□□□□ -1.52
TRDN-205ENST00000546248 F8W810 466 aa5.55□□□□□ -1.52
TRDN-205ENST00000546248 H3BML4 177 aa5.55□□□□□ -1.52
TRDN-205ENST00000546248 I3L4J1 428 aa5.55□□□□□ -1.52
TRDN-205ENST00000546248 SGK1O00141 431 aa5.55□□□□□ -1.52
TRDN-205ENST00000546248 APOL1O14791 398 aa5.55□□□□□ -1.52
TRDN-205ENST00000546248 RASGRF2O14827 1237 aa5.55□□□□□ -1.52
TRDN-205ENST00000546248 EIF3HO15372 352 aaKnown RBP eCLIP5.55□□□□□ -1.52
TRDN-205ENST00000546248 B3GAT3O94766 335 aa5.55□□□□□ -1.52
TRDN-205ENST00000546248 UBXN7O94888 489 aa5.55□□□□□ -1.52
TRDN-205ENST00000546248 SCAF4O95104 1147 aaKnown RBP5.55□□□□□ -1.52
TRDN-205ENST00000546248 AGTP01019 485 aa5.55□□□□□ -1.52
TRDN-205ENST00000546248 IFNB1P01574 187 aa5.55□□□□□ -1.52
TRDN-205ENST00000546248 FAM200BP0CF97 657 aa5.55□□□□□ -1.52
TRDN-205ENST00000546248 TYMPP19971 482 aa5.55□□□□□ -1.52
TRDN-205ENST00000546248 MALP21145 153 aa5.55□□□□□ -1.52
TRDN-205ENST00000546248 TGM2P21980 687 aa5.55□□□□□ -1.52
TRDN-205ENST00000546248 PAX3P23760 479 aa5.55□□□□□ -1.52
TRDN-205ENST00000546248 CYP2F1P24903 491 aa5.55□□□□□ -1.52
TRDN-205ENST00000546248 HTR1BP28222 390 aa5.55□□□□□ -1.52
TRDN-205ENST00000546248 GCAP28676 217 aa5.55□□□□□ -1.52
TRDN-205ENST00000546248 RBL1P28749 1068 aa5.55□□□□□ -1.52
TRDN-205ENST00000546248 MAP2K2P36507 400 aa5.55□□□□□ -1.52
TRDN-205ENST00000546248 MMP13P45452 471 aa5.55□□□□□ -1.52
TRDN-205ENST00000546248 SULT1E1P49888 294 aa5.55□□□□□ -1.52
TRDN-205ENST00000546248 HK3P52790 923 aa5.55□□□□□ -1.52
TRDN-205ENST00000546248 GPX6P59796 221 aa5.55□□□□□ -1.52
TRDN-205ENST00000546248 CTXN1P60606 82 aa5.55□□□□□ -1.52
TRDN-205ENST00000546248 RAP2BP61225 183 aa5.55□□□□□ -1.52
TRDN-205ENST00000546248 YWHAZP63104 245 aaKnown RBP5.55□□□□□ -1.52
TRDN-205ENST00000546248 CREMQ03060 361 aa5.55□□□□□ -1.52
TRDN-205ENST00000546248 TLE1Q04724 770 aa5.55□□□□□ -1.52
TRDN-205ENST00000546248 ADIGQ0VDE8 80 aa5.55□□□□□ -1.52
TRDN-205ENST00000546248 GRIK3Q13003 919 aa5.55□□□□□ -1.52
TRDN-205ENST00000546248 KRT81Q14533 505 aa5.55□□□□□ -1.52
TRDN-205ENST00000546248 RAB39AQ14964 217 aa5.55□□□□□ -1.52
TRDN-205ENST00000546248 MORF4L2Q15014 288 aa5.55□□□□□ -1.52
TRDN-205ENST00000546248 TCTN1Q2MV58 587 aa5.55□□□□□ -1.52
TRDN-205ENST00000546248 DARS2Q6PI48 645 aaKnown RBP5.55□□□□□ -1.52
TRDN-205ENST00000546248 OVCH2Q7RTZ1 564 aa5.55□□□□□ -1.52
TRDN-205ENST00000546248 CTU1Q7Z7A3 348 aaKnown RBP5.55□□□□□ -1.52
TRDN-205ENST00000546248 PCGF5Q86SE9 256 aa5.55□□□□□ -1.52
TRDN-205ENST00000546248 CROCCP2Q86T23 111 aa5.55□□□□□ -1.52
TRDN-205ENST00000546248 EXOC3L1Q86VI1 746 aa5.55□□□□□ -1.52
TRDN-205ENST00000546248 MAP7D3Q8IWC1 876 aa5.55□□□□□ -1.52
TRDN-205ENST00000546248 CCDC13Q8IYE1 715 aa5.55□□□□□ -1.52
TRDN-205ENST00000546248 COLGALT2Q8IYK4 626 aa5.55□□□□□ -1.52
TRDN-205ENST00000546248 SCML4Q8N228 414 aa5.55□□□□□ -1.52
TRDN-205ENST00000546248 ARFGAP2Q8N6H7 521 aa5.55□□□□□ -1.52
TRDN-205ENST00000546248 DCBLD1Q8N8Z6 715 aa5.55□□□□□ -1.52
TRDN-205ENST00000546248 FAM71DQ8N9W8 422 aa5.55□□□□□ -1.52
TRDN-205ENST00000546248 OR10T2Q8NGX3 314 aa5.55□□□□□ -1.52
TRDN-205ENST00000546248 MYCBPAPQ8TBZ2 947 aa5.55□□□□□ -1.52
TRDN-205ENST00000546248 NTN5Q8WTR8 489 aaPredicted RBP5.55□□□□□ -1.52
TRDN-205ENST00000546248 RSPH1Q8WYR4 309 aa5.55□□□□□ -1.52
TRDN-205ENST00000546248 P3H4Q92791 437 aa5.55□□□□□ -1.52
TRDN-205ENST00000546248 TIFAQ96CG3 184 aa5.55□□□□□ -1.52
TRDN-205ENST00000546248 RTP4Q96DX8 246 aa5.55□□□□□ -1.52
TRDN-205ENST00000546248 C9orf72Q96LT7 481 aa5.55□□□□□ -1.52
TRDN-205ENST00000546248 GLT1D1Q96MS3 346 aa5.55□□□□□ -1.52
TRDN-205ENST00000546248 UROC1Q96N76 676 aa5.55□□□□□ -1.52
TRDN-205ENST00000546248 SERPINB12Q96P63 405 aa5.55□□□□□ -1.52
TRDN-205ENST00000546248 FAM193BQ96PV7 902 aaPredicted RBP5.55□□□□□ -1.52
TRDN-205ENST00000546248 ACBD6Q9BR61 282 aa5.55□□□□□ -1.52
TRDN-205ENST00000546248 WDR83Q9BRX9 315 aaKnown RBP5.55□□□□□ -1.52
TRDN-205ENST00000546248 ZNF670Q9BS34 389 aa5.55□□□□□ -1.52
TRDN-205ENST00000546248 CALN1Q9BXU9 219 aa5.55□□□□□ -1.52
TRDN-205ENST00000546248 DNAI2Q9GZS0 605 aa5.55□□□□□ -1.52
TRDN-205ENST00000546248 CENPHQ9H3R5 247 aa5.55□□□□□ -1.52
TRDN-205ENST00000546248 LRRC4Q9HBW1 653 aa5.55□□□□□ -1.52
TRDN-205ENST00000546248 CSNK1G1Q9HCP0 422 aa5.55□□□□□ -1.52
TRDN-205ENST00000546248 WDR6Q9NNW5 1121 aaKnown RBP5.55□□□□□ -1.52
TRDN-205ENST00000546248 SAYSD1Q9NPB0 183 aa5.55□□□□□ -1.52
TRDN-205ENST00000546248 ETNK2Q9NVF9 386 aa5.55□□□□□ -1.52
TRDN-205ENST00000546248 GEMIN8Q9NWZ8 242 aaKnown RBP5.55□□□□□ -1.52
TRDN-205ENST00000546248 EURLQ9NYK6 297 aa5.55□□□□□ -1.52
TRDN-205ENST00000546248 CWC15Q9P013 229 aaKnown RBP5.55□□□□□ -1.52
TRDN-205ENST00000546248 NAALADL1Q9UQQ1 740 aa5.55□□□□□ -1.52
TRDN-205ENST00000546248 MFHAS1Q9Y4C4 1052 aa5.55□□□□□ -1.52
TRDN-205ENST00000546248 NR2E3Q9Y5X4 410 aa5.55□□□□□ -1.52
TRDN-205ENST00000546248 PLXNA1Q9UIW2 1896 aa5.55□□□□□ -1.52
TRDN-205ENST00000546248 CENPVL1A0A0U1RR11 272 aa5.54□□□□□ -1.52
TRDN-205ENST00000546248 SRRM3A6NNA2 597 aaPredicted RBP5.54□□□□□ -1.52
TRDN-205ENST00000546248 TBKBP1A7MCY6 615 aa5.54□□□□□ -1.52
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