RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000540606.5

ATE1-208, Transcript of arginyltransferase 1, human

TSL 2 BASIC

Gene ATE1, Length 5,165 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
ATE1-208	ENST00000540606	CDH3	P22223	829 aa		13.21	□□□□□ -0.29
ATE1-208	ENST00000540606	DGKG	P49619	791 aa		13.21	□□□□□ -0.29
ATE1-208	ENST00000540606	TRAF3	Q13114	568 aa		13.21	□□□□□ -0.29
ATE1-208	ENST00000540606	CCNYL2	Q5T2Q4	361 aa		13.21	□□□□□ -0.29
ATE1-208	ENST00000540606	RP9	Q8TA86	221 aa	Known RBP	13.21	□□□□□ -0.29
ATE1-208	ENST00000540606	ADAMTS15	Q8TE58	950 aa		13.21	□□□□□ -0.29
ATE1-208	ENST00000540606	FNIP1	Q8TF40	1166 aa		13.21	□□□□□ -0.29
ATE1-208	ENST00000540606	SH3GL2	Q99962	352 aa		13.21	□□□□□ -0.29
ATE1-208	ENST00000540606	DNAJC11	Q9NVH1	559 aa		13.21	□□□□□ -0.29
ATE1-208	ENST00000540606	ZNF446	Q9NWS9	450 aa		13.21	□□□□□ -0.29
ATE1-208	ENST00000540606	C2orf71	A6NGG8	1288 aa		13.21	□□□□□ -0.3
ATE1-208	ENST00000540606	AOC2	O75106	756 aa		13.21	□□□□□ -0.3
ATE1-208	ENST00000540606	FGF19	O95750	216 aa		13.21	□□□□□ -0.3
ATE1-208	ENST00000540606	IDO1	P14902	403 aa		13.21	□□□□□ -0.3
ATE1-208	ENST00000540606	RYK	P34925	604 aa		13.21	□□□□□ -0.3
ATE1-208	ENST00000540606	KRR1	Q13601	381 aa	Known RBP	13.21	□□□□□ -0.3
ATE1-208	ENST00000540606	SH3PXD2A	Q5TCZ1	1133 aa		13.21	□□□□□ -0.3
ATE1-208	ENST00000540606	FAM171B	Q6P995	826 aa		13.21	□□□□□ -0.3
ATE1-208	ENST00000540606	NRSN1	Q8IZ57	195 aa		13.21	□□□□□ -0.3
ATE1-208	ENST00000540606	VANGL1	Q8TAA9	524 aa	Predicted RBP	13.21	□□□□□ -0.3
ATE1-208	ENST00000540606	SLC39A8	Q9C0K1	460 aa		13.21	□□□□□ -0.3
ATE1-208	ENST00000540606	RNF39	Q9H2S5	420 aa		13.21	□□□□□ -0.3
ATE1-208	ENST00000540606	MRPL39	Q9NYK5	338 aa	Known RBP	13.21	□□□□□ -0.3
ATE1-208	ENST00000540606	RCOR3	Q9P2K3	495 aa	Predicted RBP	13.21	□□□□□ -0.3
ATE1-208	ENST00000540606	ABHD14A-ACY1	A0A1B0GW23	586 aa		13.21	□□□□□ -0.3
ATE1-208	ENST00000540606	PER2	O15055	1255 aa		13.21	□□□□□ -0.3
ATE1-208	ENST00000540606	POP4	O95707	220 aa	Known RBP	13.21	□□□□□ -0.3
ATE1-208	ENST00000540606	GNPDA1	P46926	289 aa		13.21	□□□□□ -0.3
ATE1-208	ENST00000540606	CAP1	Q01518	475 aa		13.21	□□□□□ -0.3
ATE1-208	ENST00000540606	LPIN1	Q14693	890 aa		13.21	□□□□□ -0.3
ATE1-208	ENST00000540606	ANKRD22	Q5VYY1	191 aa		13.21	□□□□□ -0.3
ATE1-208	ENST00000540606	VIT	Q6UXI7	678 aa		13.21	□□□□□ -0.3
ATE1-208	ENST00000540606	DHDDS	Q86SQ9	333 aa		13.21	□□□□□ -0.3
ATE1-208	ENST00000540606	HID1	Q8IV36	788 aa		13.21	□□□□□ -0.3
ATE1-208	ENST00000540606	IPPK	Q9H8X2	491 aa		13.21	□□□□□ -0.3
ATE1-208	ENST00000540606	RPRD1B	Q9NQG5	326 aa	Known RBP	13.21	□□□□□ -0.3
ATE1-208	ENST00000540606	ABCB8	Q9NUT2	735 aa		13.21	□□□□□ -0.3
ATE1-208	ENST00000540606	PTPRZ1	P23471	2315 aa	Predicted RBP	13.2	□□□□□ -0.3
ATE1-208	ENST00000540606	DDX3Y	O15523	660 aa	Known RBP	13.2	□□□□□ -0.3
ATE1-208	ENST00000540606	BPGM	P07738	259 aa		13.2	□□□□□ -0.3
ATE1-208	ENST00000540606	CYP4B1	P13584	511 aa		13.2	□□□□□ -0.3
ATE1-208	ENST00000540606	ADSS	P30520	456 aa		13.2	□□□□□ -0.3
ATE1-208	ENST00000540606	CDH4	P55283	916 aa		13.2	□□□□□ -0.3
ATE1-208	ENST00000540606	ZNF280A	P59817	542 aa	Predicted RBP	13.2	□□□□□ -0.3
ATE1-208	ENST00000540606	PPP2R2D	Q66LE6	453 aa		13.2	□□□□□ -0.3
ATE1-208	ENST00000540606	OR4A15	Q8NGL6	344 aa		13.2	□□□□□ -0.3
ATE1-208	ENST00000540606	SLC9A6	Q92581	669 aa		13.2	□□□□□ -0.3
ATE1-208	ENST00000540606	TBC1D30	Q9Y2I9	924 aa		13.2	□□□□□ -0.3
ATE1-208	ENST00000540606	TRIM38	O00635	465 aa		13.2	□□□□□ -0.3
ATE1-208	ENST00000540606	ERN1	O75460	977 aa	Known RBP	13.2	□□□□□ -0.3
ATE1-208	ENST00000540606	IPO13	O94829	963 aa	Known RBP	13.2	□□□□□ -0.3
ATE1-208	ENST00000540606	CYP3A5	P20815	502 aa		13.2	□□□□□ -0.3
ATE1-208	ENST00000540606	SRP54	P61011	504 aa	Known RBP	13.2	□□□□□ -0.3
ATE1-208	ENST00000540606	ITCH	Q96J02	903 aa		13.2	□□□□□ -0.3
ATE1-208	ENST00000540606	IL12RB2	Q99665	862 aa		13.2	□□□□□ -0.3
ATE1-208	ENST00000540606	SLC25A51	Q9H1U9	297 aa		13.2	□□□□□ -0.3
ATE1-208	ENST00000540606	ST6GALNAC4	Q9H4F1	302 aa		13.2	□□□□□ -0.3
ATE1-208	ENST00000540606	RNPEPL1	Q9HAU8	725 aa		13.2	□□□□□ -0.3
ATE1-208	ENST00000540606	C3orf14	Q9HBI5	128 aa		13.2	□□□□□ -0.3
ATE1-208	ENST00000540606	INTS7	Q9NVH2	962 aa	Known RBP	13.2	□□□□□ -0.3
ATE1-208	ENST00000540606	PTGFRN	Q9P2B2	879 aa		13.2	□□□□□ -0.3
ATE1-208	ENST00000540606	FKBPL	Q9UIM3	349 aa		13.2	□□□□□ -0.3
ATE1-208	ENST00000540606	SH3GLB1	Q9Y371	365 aa		13.2	□□□□□ -0.3
ATE1-208	ENST00000540606	IQGAP1	P46940	1657 aa		13.2	□□□□□ -0.3
ATE1-208	ENST00000540606	IQCM	A0A1B0GVH7	501 aa		13.2	□□□□□ -0.3
ATE1-208	ENST00000540606	BIRC5	O15392	142 aa		13.2	□□□□□ -0.3
ATE1-208	ENST00000540606	INSIG1	O15503	277 aa		13.2	□□□□□ -0.3
ATE1-208	ENST00000540606	NELFE	P18615	380 aa	Known RBP	13.2	□□□□□ -0.3
ATE1-208	ENST00000540606	TNK2	Q07912	1038 aa		13.2	□□□□□ -0.3
ATE1-208	ENST00000540606	CLEC6A	Q6EIG7	209 aa		13.2	□□□□□ -0.3
ATE1-208	ENST00000540606	FOXR2	Q6PJQ5	311 aa		13.2	□□□□□ -0.3
ATE1-208	ENST00000540606	ZBTB2	Q8N680	514 aa		13.2	□□□□□ -0.3
ATE1-208	ENST00000540606	MTMR14	Q8NCE2	650 aa		13.2	□□□□□ -0.3
ATE1-208	ENST00000540606	ZNF540	Q8NDQ6	660 aa		13.2	□□□□□ -0.3
ATE1-208	ENST00000540606	ZNF563	Q8TA94	476 aa		13.2	□□□□□ -0.3
ATE1-208	ENST00000540606	RDH11	Q8TC12	318 aa		13.2	□□□□□ -0.3
ATE1-208	ENST00000540606	UBASH3B	Q8TF42	649 aa		13.2	□□□□□ -0.3
ATE1-208	ENST00000540606	HEXDC	Q8WVB3	486 aa		13.2	□□□□□ -0.3
ATE1-208	ENST00000540606	EXOSC8	Q96B26	276 aa	Known RBP	13.2	□□□□□ -0.3
ATE1-208	ENST00000540606	HEPH	Q9BQS7	1158 aa		13.2	□□□□□ -0.3
ATE1-208	ENST00000540606	MAGEH1	Q9H213	219 aa		13.2	□□□□□ -0.3
ATE1-208	ENST00000540606	NOL11	Q9H8H0	719 aa	Known RBP	13.2	□□□□□ -0.3
ATE1-208	ENST00000540606	SALL4	Q9UJQ4	1053 aa		13.2	□□□□□ -0.3
ATE1-208	ENST00000540606		A0A0J9YYE9	177 aa		13.2	□□□□□ -0.3
ATE1-208	ENST00000540606	SLC38A8	A6NNN8	435 aa		13.2	□□□□□ -0.3
ATE1-208	ENST00000540606	MCIDAS	D6RGH6	385 aa		13.2	□□□□□ -0.3
ATE1-208	ENST00000540606		H3BNH8	94 aa		13.2	□□□□□ -0.3
ATE1-208	ENST00000540606	SUV39H1	O43463	412 aa		13.2	□□□□□ -0.3
ATE1-208	ENST00000540606	SIN3B	O75182	1162 aa		13.2	□□□□□ -0.3
ATE1-208	ENST00000540606	AP2A1	O95782	977 aa		13.2	□□□□□ -0.3
ATE1-208	ENST00000540606	TCEA1	P23193	301 aa	Known RBP	13.2	□□□□□ -0.3
ATE1-208	ENST00000540606	CCNC	P24863	283 aa		13.2	□□□□□ -0.3
ATE1-208	ENST00000540606	ADSL	P30566	484 aa	Predicted RBP	13.2	□□□□□ -0.3
ATE1-208	ENST00000540606	ELF3	P78545	371 aa	Predicted RBP	13.2	□□□□□ -0.3
ATE1-208	ENST00000540606	RALGDS	Q12967	914 aa		13.2	□□□□□ -0.3
ATE1-208	ENST00000540606	ALG11	Q2TAA5	492 aa		13.2	□□□□□ -0.3
ATE1-208	ENST00000540606	PLEKHG4	Q58EX7	1191 aa		13.2	□□□□□ -0.3
ATE1-208	ENST00000540606	CERS6	Q6ZMG9	384 aa		13.2	□□□□□ -0.3
ATE1-208	ENST00000540606	IFNL1	Q8IU54	200 aa		13.2	□□□□□ -0.3
ATE1-208	ENST00000540606	MREG	Q8N565	214 aa		13.2	□□□□□ -0.3

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