RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000530120.5

CSRP1-213, Transcript of cysteine and glycine rich protein 1, human

TSL 4

Gene CSRP1, Length 568 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
CSRP1-213	ENST00000530120	CYP1A2	P05177	515 aa		11.92	□□□□□ -0.5
CSRP1-213	ENST00000530120	MX2	P20592	715 aa		11.92	□□□□□ -0.5
CSRP1-213	ENST00000530120	PBX1	P40424	430 aa		11.92	□□□□□ -0.5
CSRP1-213	ENST00000530120	GARS	P41250	739 aa	Known RBP	11.92	□□□□□ -0.5
CSRP1-213	ENST00000530120	GPR1	P46091	355 aa		11.92	□□□□□ -0.5
CSRP1-213	ENST00000530120	GNPDA1	P46926	289 aa		11.92	□□□□□ -0.5
CSRP1-213	ENST00000530120	GPLD1	P80108	840 aa		11.92	□□□□□ -0.5
CSRP1-213	ENST00000530120	ZBED6	P86452	979 aa		11.92	□□□□□ -0.5
CSRP1-213	ENST00000530120	B4GALNT1	Q00973	533 aa		11.92	□□□□□ -0.5
CSRP1-213	ENST00000530120	GALNT2	Q10471	571 aa		11.92	□□□□□ -0.5
CSRP1-213	ENST00000530120	SQSTM1	Q13501	440 aa		11.92	□□□□□ -0.5
CSRP1-213	ENST00000530120	PDK2	Q15119	407 aa		11.92	□□□□□ -0.5
CSRP1-213	ENST00000530120	HSD11B1L	Q7Z5J1	315 aa		11.92	□□□□□ -0.5
CSRP1-213	ENST00000530120	TECPR1	Q7Z6L1	1165 aa		11.92	□□□□□ -0.5
CSRP1-213	ENST00000530120	NRROS	Q86YC3	692 aa		11.92	□□□□□ -0.5
CSRP1-213	ENST00000530120	CNGA4	Q8IV77	575 aa		11.92	□□□□□ -0.5
CSRP1-213	ENST00000530120	MAP7D3	Q8IWC1	876 aa		11.92	□□□□□ -0.5
CSRP1-213	ENST00000530120	REXO1L1P	Q8IX06	675 aa		11.92	□□□□□ -0.5
CSRP1-213	ENST00000530120	TP53INP2	Q8IXH6	220 aa		11.92	□□□□□ -0.5
CSRP1-213	ENST00000530120	NRSN1	Q8IZ57	195 aa		11.92	□□□□□ -0.5
CSRP1-213	ENST00000530120	AVL9	Q8NBF6	648 aa		11.92	□□□□□ -0.5
CSRP1-213	ENST00000530120	OR4D9	Q8NGE8	314 aa		11.92	□□□□□ -0.5
CSRP1-213	ENST00000530120	MAML1	Q92585	1016 aa		11.92	□□□□□ -0.5
CSRP1-213	ENST00000530120	NSMCE3	Q96MG7	304 aa		11.92	□□□□□ -0.5
CSRP1-213	ENST00000530120	OR2M4	Q96R27	311 aa		11.92	□□□□□ -0.5
CSRP1-213	ENST00000530120	LYSMD1	Q96S90	227 aa		11.92	□□□□□ -0.5
CSRP1-213	ENST00000530120	NUP85	Q9BW27	656 aa		11.92	□□□□□ -0.5
CSRP1-213	ENST00000530120	VPS18	Q9P253	973 aa		11.92	□□□□□ -0.5
CSRP1-213	ENST00000530120	PLEKHB1	Q9UF11	243 aa	Predicted RBP	11.92	□□□□□ -0.5
CSRP1-213	ENST00000530120	PPP2R2C	Q9Y2T4	447 aa		11.92	□□□□□ -0.5
CSRP1-213	ENST00000530120	PCDHGA3	Q9Y5H0	932 aa		11.92	□□□□□ -0.5
CSRP1-213	ENST00000530120	UCHL5	Q9Y5K5	329 aa	Known RBP eCLIP	11.92	□□□□□ -0.5
CSRP1-213	ENST00000530120		A0A0J9YYE9	177 aa		11.91	□□□□□ -0.5
CSRP1-213	ENST00000530120	GOLGA6C	A6NDK9	693 aa		11.91	□□□□□ -0.5
CSRP1-213	ENST00000530120	GOLGA6B	A6NDN3	693 aa		11.91	□□□□□ -0.5
CSRP1-213	ENST00000530120		A8MX80	341 aa		11.91	□□□□□ -0.5
CSRP1-213	ENST00000530120	MATN3	O15232	486 aa		11.91	□□□□□ -0.5
CSRP1-213	ENST00000530120	AGFG2	O95081	481 aa		11.91	□□□□□ -0.5
CSRP1-213	ENST00000530120	TRBC1	P01850	177 aa		11.91	□□□□□ -0.5
CSRP1-213	ENST00000530120	FGF1	P05230	155 aa		11.91	□□□□□ -0.5
CSRP1-213	ENST00000530120	GOLGA6D	P0CG33	693 aa		11.91	□□□□□ -0.5
CSRP1-213	ENST00000530120	SLC2A4	P14672	509 aa		11.91	□□□□□ -0.5
CSRP1-213	ENST00000530120	LIF	P15018	202 aa		11.91	□□□□□ -0.5
CSRP1-213	ENST00000530120	TCF4	P15884	667 aa		11.91	□□□□□ -0.5
CSRP1-213	ENST00000530120	FECH	P22830	423 aa		11.91	□□□□□ -0.5
CSRP1-213	ENST00000530120	FASLG	P48023	281 aa		11.91	□□□□□ -0.5
CSRP1-213	ENST00000530120	EPHB1	P54762	984 aa		11.91	□□□□□ -0.5
CSRP1-213	ENST00000530120	MAX	P61244	160 aa		11.91	□□□□□ -0.5
CSRP1-213	ENST00000530120	PAFAH1B3	Q15102	231 aa	Known RBP	11.91	□□□□□ -0.5
CSRP1-213	ENST00000530120	IFI16	Q16666	785 aa	Known RBP	11.91	□□□□□ -0.5
CSRP1-213	ENST00000530120	CCDC122	Q5T0U0	273 aa		11.91	□□□□□ -0.5
CSRP1-213	ENST00000530120	LRRC66	Q68CR7	880 aa		11.91	□□□□□ -0.5
CSRP1-213	ENST00000530120	DENND2C	Q68D51	928 aa		11.91	□□□□□ -0.5
CSRP1-213	ENST00000530120	SLC30A9	Q6PML9	568 aa		11.91	□□□□□ -0.5
CSRP1-213	ENST00000530120		Q6ZVL8	140 aa		11.91	□□□□□ -0.5
CSRP1-213	ENST00000530120	GALNT13	Q8IUC8	556 aa		11.91	□□□□□ -0.5
CSRP1-213	ENST00000530120	PELI3	Q8N2H9	469 aa		11.91	□□□□□ -0.5
CSRP1-213	ENST00000530120	CCL4L1	Q8NHW4	92 aa		11.91	□□□□□ -0.5
CSRP1-213	ENST00000530120	PIH1D2	Q8WWB5	315 aa		11.91	□□□□□ -0.5
CSRP1-213	ENST00000530120	NKD1	Q969G9	470 aa		11.91	□□□□□ -0.5
CSRP1-213	ENST00000530120	AP2M1	Q96CW1	435 aa		11.91	□□□□□ -0.5
CSRP1-213	ENST00000530120	TSGA13	Q96PP4	275 aa		11.91	□□□□□ -0.5
CSRP1-213	ENST00000530120	TDRD1	Q9BXT4	1180 aa	Known RBP	11.91	□□□□□ -0.5
CSRP1-213	ENST00000530120	THAP2	Q9H0W7	228 aa		11.91	□□□□□ -0.5
CSRP1-213	ENST00000530120	STN1	Q9H668	368 aa	Known RBP	11.91	□□□□□ -0.5
CSRP1-213	ENST00000530120	NT5M	Q9NPB1	228 aa		11.91	□□□□□ -0.5
CSRP1-213	ENST00000530120	SPATS2L	Q9NUQ6	558 aa	Known RBP	11.91	□□□□□ -0.5
CSRP1-213	ENST00000530120	GOLGA6A	Q9NYA3	693 aa		11.91	□□□□□ -0.5
CSRP1-213	ENST00000530120	UVRAG	Q9P2Y5	699 aa		11.91	□□□□□ -0.5
CSRP1-213	ENST00000530120	ARHGEF17	Q96PE2	2063 aa	Predicted RBP	11.91	□□□□□ -0.5
CSRP1-213	ENST00000530120	RGSL1	A5PLK6	1076 aa		11.9	□□□□□ -0.5
CSRP1-213	ENST00000530120	CAPN5	O15484	640 aa	Predicted RBP	11.9	□□□□□ -0.5
CSRP1-213	ENST00000530120	MFSD11	O43934	449 aa		11.9	□□□□□ -0.5
CSRP1-213	ENST00000530120	MFAP3L	O75121	409 aa		11.9	□□□□□ -0.5
CSRP1-213	ENST00000530120	ANKRD17	O75179	2603 aa	Known RBP	11.9	□□□□□ -0.5
CSRP1-213	ENST00000530120	ECEL1	O95672	775 aa		11.9	□□□□□ -0.5
CSRP1-213	ENST00000530120	SOD1	P00441	154 aa		11.9	□□□□□ -0.5
CSRP1-213	ENST00000530120	KRT7	P08729	469 aa		11.9	□□□□□ -0.5
CSRP1-213	ENST00000530120	CCDC175	P0C221	793 aa		11.9	□□□□□ -0.5
CSRP1-213	ENST00000530120	CCNC	P24863	283 aa		11.9	□□□□□ -0.5
CSRP1-213	ENST00000530120	ALDH4A1	P30038	563 aa		11.9	□□□□□ -0.5
CSRP1-213	ENST00000530120	ADCY8	P40145	1251 aa		11.9	□□□□□ -0.5
CSRP1-213	ENST00000530120	ACTR1B	P42025	376 aa		11.9	□□□□□ -0.5
CSRP1-213	ENST00000530120	STC1	P52823	247 aa		11.9	□□□□□ -0.5
CSRP1-213	ENST00000530120	MAZ	P56270	477 aa	Known RBP	11.9	□□□□□ -0.5
CSRP1-213	ENST00000530120	RAB15	P59190	212 aa		11.9	□□□□□ -0.5
CSRP1-213	ENST00000530120	ACTR1A	P61163	376 aa		11.9	□□□□□ -0.5
CSRP1-213	ENST00000530120	CTBS	Q01459	385 aa		11.9	□□□□□ -0.5
CSRP1-213	ENST00000530120	SEPT6	Q14141	434 aa		11.9	□□□□□ -0.5
CSRP1-213	ENST00000530120	DPYSL3	Q14195	570 aa		11.9	□□□□□ -0.5
CSRP1-213	ENST00000530120	C16orf72	Q14CZ0	275 aa		11.9	□□□□□ -0.5
CSRP1-213	ENST00000530120	LACTB2	Q53H82	288 aa	Predicted RBP	11.9	□□□□□ -0.5
CSRP1-213	ENST00000530120	ALKBH5	Q6P6C2	394 aa	Known RBP	11.9	□□□□□ -0.5
CSRP1-213	ENST00000530120	TSPAN33	Q86UF1	283 aa		11.9	□□□□□ -0.5
CSRP1-213	ENST00000530120	VSIG1	Q86XK7	387 aa		11.9	□□□□□ -0.5
CSRP1-213	ENST00000530120	CACNA2D3	Q8IZS8	1091 aa		11.9	□□□□□ -0.5
CSRP1-213	ENST00000530120	NAGS	Q8N159	534 aa		11.9	□□□□□ -0.5
CSRP1-213	ENST00000530120	AGBL5	Q8NDL9	886 aa		11.9	□□□□□ -0.5
CSRP1-213	ENST00000530120	EXD1	Q8NHP7	514 aa		11.9	□□□□□ -0.5
CSRP1-213	ENST00000530120	MIB2	Q96AX9	1013 aa		11.9	□□□□□ -0.5

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