RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000516879.1

RNU6-579P-201, Transcript of RNA, U6 small nuclear 579, pseudogene, humanhuman

BASIC

Gene RNU6-579P, Length 102 nt, Biotype snRNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNU6-579P-201ENST00000516879 MRPL19P49406 292 aaKnown RBP3.57□□□□□ -1.84
RNU6-579P-201ENST00000516879 NUMBP49757 651 aa3.57□□□□□ -1.84
RNU6-579P-201ENST00000516879 STK19P49842 368 aaPredicted RBP3.57□□□□□ -1.84
RNU6-579P-201ENST00000516879 ATP1A2P50993 1020 aa3.57□□□□□ -1.84
RNU6-579P-201ENST00000516879 CLCNKAP51800 687 aa3.57□□□□□ -1.84
RNU6-579P-201ENST00000516879 AP1S2P56377 157 aa3.57□□□□□ -1.84
RNU6-579P-201ENST00000516879 IL2P60568 153 aa3.57□□□□□ -1.84
RNU6-579P-201ENST00000516879 TIAL1Q01085 375 aaKnown RBP eCLIP3.57□□□□□ -1.84
RNU6-579P-201ENST00000516879 CTBSQ01459 385 aa3.57□□□□□ -1.84
RNU6-579P-201ENST00000516879 SATB1Q01826 763 aa3.57□□□□□ -1.84
RNU6-579P-201ENST00000516879 COL4A3Q01955 1670 aa3.57□□□□□ -1.84
RNU6-579P-201ENST00000516879 GRIK2Q13002 908 aa3.57□□□□□ -1.84
RNU6-579P-201ENST00000516879 CTBP1Q13363 440 aa3.57□□□□□ -1.84
RNU6-579P-201ENST00000516879 OLIG2Q13516 323 aa3.57□□□□□ -1.84
RNU6-579P-201ENST00000516879 SEPT6Q14141 434 aa3.57□□□□□ -1.84
RNU6-579P-201ENST00000516879 GALNT3Q14435 633 aa3.57□□□□□ -1.84
RNU6-579P-201ENST00000516879 STARD3Q14849 445 aa3.57□□□□□ -1.84
RNU6-579P-201ENST00000516879 EFTUD2Q15029 972 aaKnown RBP eCLIP3.57□□□□□ -1.84
RNU6-579P-201ENST00000516879 SMU1Q2TAY7 513 aa3.57□□□□□ -1.84
RNU6-579P-201ENST00000516879 BCL7AQ4VC05 210 aa3.57□□□□□ -1.84
RNU6-579P-201ENST00000516879 LACTB2Q53H82 288 aaPredicted RBP3.57□□□□□ -1.84
RNU6-579P-201ENST00000516879 TECRLQ5HYJ1 363 aa3.57□□□□□ -1.84
RNU6-579P-201ENST00000516879 HECTD2Q5U5R9 776 aa3.57□□□□□ -1.84
RNU6-579P-201ENST00000516879 PRPF38BQ5VTL8 546 aaKnown RBP3.57□□□□□ -1.84
RNU6-579P-201ENST00000516879 LIPMQ5VYY2 423 aa3.57□□□□□ -1.84
RNU6-579P-201ENST00000516879 LRRC66Q68CR7 880 aa3.57□□□□□ -1.84
RNU6-579P-201ENST00000516879 SDE2Q6IQ49 451 aa3.57□□□□□ -1.84
RNU6-579P-201ENST00000516879 KIAA1161Q6NSJ0 714 aa3.57□□□□□ -1.84
RNU6-579P-201ENST00000516879 ADAMTSL4Q6UY14 1074 aa3.57□□□□□ -1.84
RNU6-579P-201ENST00000516879 LINGO4Q6UY18 593 aa3.57□□□□□ -1.84
RNU6-579P-201ENST00000516879 LIPIQ6XZB0 460 aa3.57□□□□□ -1.84
RNU6-579P-201ENST00000516879 CDHR3Q6ZTQ4 885 aa3.57□□□□□ -1.84
RNU6-579P-201ENST00000516879 Q6ZVU0 165 aa3.57□□□□□ -1.84
RNU6-579P-201ENST00000516879 LPCAT2Q7L5N7 544 aa3.57□□□□□ -1.84
RNU6-579P-201ENST00000516879 EFL1Q7Z2Z2 1120 aaKnown RBP3.57□□□□□ -1.84
RNU6-579P-201ENST00000516879 LYSMD3Q7Z3D4 306 aa3.57□□□□□ -1.84
RNU6-579P-201ENST00000516879 CPLX4Q7Z7G2 160 aa3.57□□□□□ -1.84
RNU6-579P-201ENST00000516879 ISCA2Q86U28 154 aa3.57□□□□□ -1.84
RNU6-579P-201ENST00000516879 SERPINA9Q86WD7 417 aa3.57□□□□□ -1.84
RNU6-579P-201ENST00000516879 NUDCD3Q8IVD9 361 aa3.57□□□□□ -1.84
RNU6-579P-201ENST00000516879 WDR75Q8IWA0 830 aaKnown RBP3.57□□□□□ -1.84
RNU6-579P-201ENST00000516879 DENND6AQ8IWF6 608 aa3.57□□□□□ -1.84
RNU6-579P-201ENST00000516879 PARP9Q8IXQ6 854 aa3.57□□□□□ -1.84
RNU6-579P-201ENST00000516879 UNC5BQ8IZJ1 945 aa3.57□□□□□ -1.84
RNU6-579P-201ENST00000516879 CACNA2D3Q8IZS8 1091 aa3.57□□□□□ -1.84
RNU6-579P-201ENST00000516879 GJD3Q8N144 294 aa3.57□□□□□ -1.84
RNU6-579P-201ENST00000516879 C4orf33Q8N1A6 199 aa3.57□□□□□ -1.84
RNU6-579P-201ENST00000516879 TCAIMQ8N3R3 496 aa3.57□□□□□ -1.84
RNU6-579P-201ENST00000516879 C12orf76Q8N812 135 aaPredicted RBP3.57□□□□□ -1.84
RNU6-579P-201ENST00000516879 NETO2Q8NC67 525 aa3.57□□□□□ -1.84
RNU6-579P-201ENST00000516879 CCDC197Q8NCU1 140 aa3.57□□□□□ -1.84
RNU6-579P-201ENST00000516879 LPCAT1Q8NF37 534 aa3.57□□□□□ -1.84
RNU6-579P-201ENST00000516879 OR13C4Q8NGS5 318 aa3.57□□□□□ -1.84
RNU6-579P-201ENST00000516879 OR2T3Q8NH03 318 aa3.57□□□□□ -1.84
RNU6-579P-201ENST00000516879 UHMK1Q8TAS1 419 aaKnown RBP3.57□□□□□ -1.84
RNU6-579P-201ENST00000516879 STAG3L4Q8TBR4 150 aa3.57□□□□□ -1.84
RNU6-579P-201ENST00000516879 PIP4K2CQ8TBX8 421 aa3.57□□□□□ -1.84
RNU6-579P-201ENST00000516879 MDM1Q8TC05 714 aa3.57□□□□□ -1.84
RNU6-579P-201ENST00000516879 PIWIL2Q8TC59 973 aaKnown RBP3.57□□□□□ -1.84
RNU6-579P-201ENST00000516879 ZNF473Q8WTR7 871 aaKnown RBP3.57□□□□□ -1.84
RNU6-579P-201ENST00000516879 UBTD2Q8WUN7 234 aa3.57□□□□□ -1.84
RNU6-579P-201ENST00000516879 LRRN4Q8WUT4 740 aa3.57□□□□□ -1.84
RNU6-579P-201ENST00000516879 BTN2A2Q8WVV5 523 aa3.57□□□□□ -1.84
RNU6-579P-201ENST00000516879 ING5Q8WYH8 240 aa3.57□□□□□ -1.84
RNU6-579P-201ENST00000516879 INPP5DQ92835 1189 aa3.57□□□□□ -1.84
RNU6-579P-201ENST00000516879 KIAA1191Q96A73 305 aa3.57□□□□□ -1.84
RNU6-579P-201ENST00000516879 PBXIP1Q96AQ6 731 aa3.57□□□□□ -1.84
RNU6-579P-201ENST00000516879 EID2BQ96D98 161 aa3.57□□□□□ -1.84
RNU6-579P-201ENST00000516879 CHFRQ96EP1 664 aa3.57□□□□□ -1.84
RNU6-579P-201ENST00000516879 DTD2Q96FN9 168 aa3.57□□□□□ -1.84
RNU6-579P-201ENST00000516879 SHDQ96IW2 340 aa3.57□□□□□ -1.84
RNU6-579P-201ENST00000516879 CNDP1Q96KN2 507 aa3.57□□□□□ -1.84
RNU6-579P-201ENST00000516879 COQ10AQ96MF6 247 aa3.57□□□□□ -1.84
RNU6-579P-201ENST00000516879 KLHL32Q96NJ5 620 aa3.57□□□□□ -1.84
RNU6-579P-201ENST00000516879 FAM111AQ96PZ2 611 aa3.57□□□□□ -1.84
RNU6-579P-201ENST00000516879 AGAP2Q99490 1192 aa3.57□□□□□ -1.84
RNU6-579P-201ENST00000516879 COPS8Q99627 209 aa3.57□□□□□ -1.84
RNU6-579P-201ENST00000516879 P2RY13Q9BPV8 354 aa3.57□□□□□ -1.84
RNU6-579P-201ENST00000516879 SELENOSQ9BQE4 189 aa3.57□□□□□ -1.84
RNU6-579P-201ENST00000516879 APOL2Q9BQE5 337 aa3.57□□□□□ -1.84
RNU6-579P-201ENST00000516879 TRIM55Q9BYV6 548 aa3.57□□□□□ -1.84
RNU6-579P-201ENST00000516879 TM6SF2Q9BZW4 377 aa3.57□□□□□ -1.84
RNU6-579P-201ENST00000516879 CLPBQ9H078 707 aa3.57□□□□□ -1.84
RNU6-579P-201ENST00000516879 FAM83DQ9H4H8 585 aa3.57□□□□□ -1.84
RNU6-579P-201ENST00000516879 EBF3Q9H4W6 596 aa3.57□□□□□ -1.84
RNU6-579P-201ENST00000516879 ASB8Q9H765 288 aa3.57□□□□□ -1.84
RNU6-579P-201ENST00000516879 UBE2ZQ9H832 354 aaPredicted RBP3.57□□□□□ -1.84
RNU6-579P-201ENST00000516879 RMI1Q9H9A7 625 aa3.57□□□□□ -1.84
RNU6-579P-201ENST00000516879 EML4Q9HC35 981 aaKnown RBP3.57□□□□□ -1.84
RNU6-579P-201ENST00000516879 GPAMQ9HCL2 828 aa3.57□□□□□ -1.84
RNU6-579P-201ENST00000516879 PREBQ9HCU5 417 aa3.57□□□□□ -1.84
RNU6-579P-201ENST00000516879 DYRK4Q9NR20 520 aa3.57□□□□□ -1.84
RNU6-579P-201ENST00000516879 SAR1AQ9NR31 198 aa3.57□□□□□ -1.84
RNU6-579P-201ENST00000516879 SPATS2LQ9NUQ6 558 aaKnown RBP3.57□□□□□ -1.84
RNU6-579P-201ENST00000516879 POLR3BQ9NW08 1133 aaPredicted RBP3.57□□□□□ -1.84
RNU6-579P-201ENST00000516879 CLDND1Q9NY35 253 aa3.57□□□□□ -1.84
RNU6-579P-201ENST00000516879 PLK2Q9NYY3 685 aa3.57□□□□□ -1.84
RNU6-579P-201ENST00000516879 B4GALT6Q9UBX8 382 aa3.57□□□□□ -1.84
RNU6-579P-201ENST00000516879 SLC2A6Q9UGQ3 507 aa3.57□□□□□ -1.84
RNU6-579P-201ENST00000516879 SLCO3A1Q9UIG8 710 aa3.57□□□□□ -1.84
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 43.5 ms