RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000516127.1

RNA5SP249-201, Transcript of RNA, 5S ribosomal pseudogene 249, humanhuman

BASIC

Gene RNA5SP249, Length 99 nt, Biotype rRNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNA5SP249-201ENST00000516127 ZNF37AP17032 561 aaPredicted RBP4.87□□□□□ -1.63
RNA5SP249-201ENST00000516127 ZNF7P17097 686 aaPredicted RBP4.87□□□□□ -1.63
RNA5SP249-201ENST00000516127 HOXB6P17509 224 aaKnown RBP4.87□□□□□ -1.63
RNA5SP249-201ENST00000516127 KCNA5P22460 613 aa4.87□□□□□ -1.63
RNA5SP249-201ENST00000516127 DGKAP23743 735 aa4.87□□□□□ -1.63
RNA5SP249-201ENST00000516127 CCND3P30281 292 aaPredicted RBP4.87□□□□□ -1.63
RNA5SP249-201ENST00000516127 HMOX2P30519 316 aa4.87□□□□□ -1.63
RNA5SP249-201ENST00000516127 ARL1P40616 181 aaPredicted RBP4.87□□□□□ -1.63
RNA5SP249-201ENST00000516127 GRIA3P42263 894 aa4.87□□□□□ -1.63
RNA5SP249-201ENST00000516127 MAPK8P45983 427 aa4.87□□□□□ -1.63
RNA5SP249-201ENST00000516127 KCNC1P48547 511 aa4.87□□□□□ -1.63
RNA5SP249-201ENST00000516127 MRPL19P49406 292 aaKnown RBP4.87□□□□□ -1.63
RNA5SP249-201ENST00000516127 ALDH7A1P49419 539 aaKnown RBP4.87□□□□□ -1.63
RNA5SP249-201ENST00000516127 PGFP49763 221 aa4.87□□□□□ -1.63
RNA5SP249-201ENST00000516127 POLR2JP52435 117 aaKnown RBP4.87□□□□□ -1.63
RNA5SP249-201ENST00000516127 SLC7A2P52569 658 aa4.87□□□□□ -1.63
RNA5SP249-201ENST00000516127 PGGT1BP53609 377 aa4.87□□□□□ -1.63
RNA5SP249-201ENST00000516127 PTPN5P54829 565 aa4.87□□□□□ -1.63
RNA5SP249-201ENST00000516127 NME5P56597 212 aa4.87□□□□□ -1.63
RNA5SP249-201ENST00000516127 C1QTNF8P60827 252 aa4.87□□□□□ -1.63
RNA5SP249-201ENST00000516127 TUBA4AP68366 448 aa4.87□□□□□ -1.63
RNA5SP249-201ENST00000516127 TXNL4AP83876 142 aaKnown RBP4.87□□□□□ -1.63
RNA5SP249-201ENST00000516127 SP3Q02447 781 aa4.87□□□□□ -1.63
RNA5SP249-201ENST00000516127 PLOD1Q02809 727 aaPredicted RBP4.87□□□□□ -1.63
RNA5SP249-201ENST00000516127 CACNG1Q06432 222 aa4.87□□□□□ -1.63
RNA5SP249-201ENST00000516127 LSAMPQ13449 338 aa4.87□□□□□ -1.63
RNA5SP249-201ENST00000516127 IKBKEQ14164 716 aa4.87□□□□□ -1.63
RNA5SP249-201ENST00000516127 GALNT3Q14435 633 aa4.87□□□□□ -1.63
RNA5SP249-201ENST00000516127 VEPH1Q14D04 833 aa4.87□□□□□ -1.63
RNA5SP249-201ENST00000516127 CYTH1Q15438 398 aa4.87□□□□□ -1.63
RNA5SP249-201ENST00000516127 PPP1R3AQ16821 1122 aa4.87□□□□□ -1.63
RNA5SP249-201ENST00000516127 TYSND1Q2T9J0 566 aa4.87□□□□□ -1.63
RNA5SP249-201ENST00000516127 USP41Q3LFD5 358 aa4.87□□□□□ -1.63
RNA5SP249-201ENST00000516127 UGT3A2Q3SY77 523 aa4.87□□□□□ -1.63
RNA5SP249-201ENST00000516127 VPS26BQ4G0F5 336 aa4.87□□□□□ -1.63
RNA5SP249-201ENST00000516127 ATP6AP1LQ52LC2 224 aa4.87□□□□□ -1.63
RNA5SP249-201ENST00000516127 PDCD4Q53EL6 469 aaKnown RBP4.87□□□□□ -1.63
RNA5SP249-201ENST00000516127 INO80DQ53TQ3 878 aaPredicted RBP4.87□□□□□ -1.63
RNA5SP249-201ENST00000516127 CLLU1OSQ5K130 101 aa4.87□□□□□ -1.63
RNA5SP249-201ENST00000516127 TMTC4Q5T4D3 741 aa4.87□□□□□ -1.63
RNA5SP249-201ENST00000516127 C6orf52Q5T4I8 152 aa4.87□□□□□ -1.63
RNA5SP249-201ENST00000516127 ADGRF1Q5T601 910 aa4.87□□□□□ -1.63
RNA5SP249-201ENST00000516127 RNF219Q5W0B1 726 aaPredicted RBP4.87□□□□□ -1.63
RNA5SP249-201ENST00000516127 KANK2Q63ZY3 851 aa4.87□□□□□ -1.63
RNA5SP249-201ENST00000516127 ALG1LQ6GMV1 187 aa4.87□□□□□ -1.63
RNA5SP249-201ENST00000516127 PTRHD1Q6GMV3 140 aaKnown RBP4.87□□□□□ -1.63
RNA5SP249-201ENST00000516127 CCSAPQ6IQ19 270 aaPredicted RBP4.87□□□□□ -1.63
RNA5SP249-201ENST00000516127 OGFOD2Q6N063 350 aa4.87□□□□□ -1.63
RNA5SP249-201ENST00000516127 FUT10Q6P4F1 479 aa4.87□□□□□ -1.63
RNA5SP249-201ENST00000516127 ZNF549Q6P9A3 640 aa4.87□□□□□ -1.63
RNA5SP249-201ENST00000516127 TTC23LQ6PF05 361 aa4.87□□□□□ -1.63
RNA5SP249-201ENST00000516127 BORAQ6PGQ7 559 aa4.87□□□□□ -1.63
RNA5SP249-201ENST00000516127 BLOC1S3Q6QNY0 202 aa4.87□□□□□ -1.63
RNA5SP249-201ENST00000516127 TMEM207Q6UWW9 146 aa4.87□□□□□ -1.63
RNA5SP249-201ENST00000516127 CYP2R1Q6VVX0 501 aa4.87□□□□□ -1.63
RNA5SP249-201ENST00000516127 GPRIN3Q6ZVF9 776 aa4.87□□□□□ -1.63
RNA5SP249-201ENST00000516127 FRA10AC1Q70Z53 315 aa4.87□□□□□ -1.63
RNA5SP249-201ENST00000516127 ERMP1Q7Z2K6 904 aa4.87□□□□□ -1.63
RNA5SP249-201ENST00000516127 MILR1Q7Z6M3 343 aa4.87□□□□□ -1.63
RNA5SP249-201ENST00000516127 AMIGO2Q86SJ2 522 aa4.87□□□□□ -1.63
RNA5SP249-201ENST00000516127 METTL3Q86U44 580 aaKnown RBP4.87□□□□□ -1.63
RNA5SP249-201ENST00000516127 SAPCD2Q86UD0 394 aa4.87□□□□□ -1.63
RNA5SP249-201ENST00000516127 TICAM1Q8IUC6 712 aa4.87□□□□□ -1.63
RNA5SP249-201ENST00000516127 GALNT13Q8IUC8 556 aa4.87□□□□□ -1.63
RNA5SP249-201ENST00000516127 DENND1CQ8IV53 801 aa4.87□□□□□ -1.63
RNA5SP249-201ENST00000516127 TBC1D21Q8IYX1 336 aa4.87□□□□□ -1.63
RNA5SP249-201ENST00000516127 FAM9CQ8IZT9 166 aa4.87□□□□□ -1.63
RNA5SP249-201ENST00000516127 CFAP52Q8N1V2 620 aa4.87□□□□□ -1.63
RNA5SP249-201ENST00000516127 PGBD5Q8N414 524 aa4.87□□□□□ -1.63
RNA5SP249-201ENST00000516127 TMEM102Q8N9M5 508 aaPredicted RBP4.87□□□□□ -1.63
RNA5SP249-201ENST00000516127 TERB1Q8NA31 727 aa4.87□□□□□ -1.63
RNA5SP249-201ENST00000516127 TRPV3Q8NET8 790 aa4.87□□□□□ -1.63
RNA5SP249-201ENST00000516127 LPCAT1Q8NF37 534 aa4.87□□□□□ -1.63
RNA5SP249-201ENST00000516127 TSPAN14Q8NG11 270 aa4.87□□□□□ -1.63
RNA5SP249-201ENST00000516127 OR7D4Q8NG98 312 aa4.87□□□□□ -1.63
RNA5SP249-201ENST00000516127 OR13C4Q8NGS5 318 aa4.87□□□□□ -1.63
RNA5SP249-201ENST00000516127 METTL6Q8TCB7 284 aa4.87□□□□□ -1.63
RNA5SP249-201ENST00000516127 HM13Q8TCT9 377 aa4.87□□□□□ -1.63
RNA5SP249-201ENST00000516127 RAET1EQ8TD07 263 aa4.87□□□□□ -1.63
RNA5SP249-201ENST00000516127 GPR152Q8TDT2 470 aa4.87□□□□□ -1.63
RNA5SP249-201ENST00000516127 LRTOMTQ8WZ04 291 aa4.87□□□□□ -1.63
RNA5SP249-201ENST00000516127 NCSTNQ92542 709 aa4.87□□□□□ -1.63
RNA5SP249-201ENST00000516127 PTERQ96BW5 349 aa4.87□□□□□ -1.63
RNA5SP249-201ENST00000516127 RMND5BQ96G75 393 aaPredicted RBP4.87□□□□□ -1.63
RNA5SP249-201ENST00000516127 CENPNQ96H22 339 aaPredicted RBP4.87□□□□□ -1.63
RNA5SP249-201ENST00000516127 PDLIM5Q96HC4 596 aaKnown RBP4.87□□□□□ -1.63
RNA5SP249-201ENST00000516127 HIC2Q96JB3 615 aa4.87□□□□□ -1.63
RNA5SP249-201ENST00000516127 SLC45A3Q96JT2 553 aa4.87□□□□□ -1.63
RNA5SP249-201ENST00000516127 ZNF597Q96LX8 424 aa4.87□□□□□ -1.63
RNA5SP249-201ENST00000516127 TRIB3Q96RU7 358 aa4.87□□□□□ -1.63
RNA5SP249-201ENST00000516127 ATOH8Q96SQ7 321 aa4.87□□□□□ -1.63
RNA5SP249-201ENST00000516127 UHRF1Q96T88 793 aaPredicted RBP4.87□□□□□ -1.63
RNA5SP249-201ENST00000516127 PRPF18Q99633 342 aaKnown RBP4.87□□□□□ -1.63
RNA5SP249-201ENST00000516127 GPR21Q99679 349 aa4.87□□□□□ -1.63
RNA5SP249-201ENST00000516127 KCTD14Q9BQ13 255 aaPredicted RBP4.87□□□□□ -1.63
RNA5SP249-201ENST00000516127 BDH2Q9BUT1 245 aa4.87□□□□□ -1.63
RNA5SP249-201ENST00000516127 TTLL2Q9BWV7 592 aa4.87□□□□□ -1.63
RNA5SP249-201ENST00000516127 C1QTNF3Q9BXJ4 246 aa4.87□□□□□ -1.63
RNA5SP249-201ENST00000516127 TRIM54Q9BYV2 358 aa4.87□□□□□ -1.63
RNA5SP249-201ENST00000516127 SEMA6AQ9H2E6 1030 aa4.87□□□□□ -1.63
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 23.7 ms