RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000516122.1

RNU6-871P-201, Transcript of RNA, U6 small nuclear 871, pseudogene, humanhuman

BASIC

Gene RNU6-871P, Length 100 nt, Biotype snRNA.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNU6-871P-201ENST00000516122 SOGA3Q5TF21 947 aa-0.91□□□□□ -2.56
RNU6-871P-201ENST00000516122 ARMCX5Q6P1M9 558 aa-0.91□□□□□ -2.56
RNU6-871P-201ENST00000516122 FIP1L1Q6UN15 594 aaKnown RBP-0.91□□□□□ -2.56
RNU6-871P-201ENST00000516122 SYVN1Q86TM6 617 aa-0.91□□□□□ -2.56
RNU6-871P-201ENST00000516122 ZNF491Q8N8L2 437 aa-0.91□□□□□ -2.56
RNU6-871P-201ENST00000516122 CCDC71LQ8N9Z2 235 aa-0.91□□□□□ -2.56
RNU6-871P-201ENST00000516122 IL31RAQ8NI17 732 aa-0.91□□□□□ -2.56
RNU6-871P-201ENST00000516122 C2CD4CQ8TF44 421 aa-0.91□□□□□ -2.56
RNU6-871P-201ENST00000516122 AZIN2Q96A70 460 aa-0.91□□□□□ -2.56
RNU6-871P-201ENST00000516122 ARSGQ96EG1 525 aa-0.91□□□□□ -2.56
RNU6-871P-201ENST00000516122 FAR2Q96K12 515 aa-0.91□□□□□ -2.56
RNU6-871P-201ENST00000516122 CEP295NLQ96MC4 621 aa-0.91□□□□□ -2.56
RNU6-871P-201ENST00000516122 AGAP4Q96P64 663 aa-0.91□□□□□ -2.56
RNU6-871P-201ENST00000516122 TEFMQ96QE5 360 aaKnown RBP-0.91□□□□□ -2.56
RNU6-871P-201ENST00000516122 YME1L1Q96TA2 773 aa-0.91□□□□□ -2.56
RNU6-871P-201ENST00000516122 KXD1Q9BQD3 176 aa-0.91□□□□□ -2.56
RNU6-871P-201ENST00000516122 NUDT22Q9BRQ3 303 aa-0.91□□□□□ -2.56
RNU6-871P-201ENST00000516122 FUCA2Q9BTY2 467 aa-0.91□□□□□ -2.56
RNU6-871P-201ENST00000516122 CXorf56Q9H5V9 222 aa-0.91□□□□□ -2.56
RNU6-871P-201ENST00000516122 CNGB3Q9NQW8 809 aa-0.91□□□□□ -2.56
RNU6-871P-201ENST00000516122 POGZQ7Z3K3 1410 aa-0.91□□□□□ -2.56
RNU6-871P-201ENST00000516122 PI4K2BG5E9Z4 385 aa-0.92□□□□□ -2.56
RNU6-871P-201ENST00000516122 PLK4O00444 970 aa-0.92□□□□□ -2.56
RNU6-871P-201ENST00000516122 DTNBO60941 627 aa-0.92□□□□□ -2.56
RNU6-871P-201ENST00000516122 ZNF217O75362 1048 aa-0.92□□□□□ -2.56
RNU6-871P-201ENST00000516122 RGS11O94810 467 aa-0.92□□□□□ -2.56
RNU6-871P-201ENST00000516122 INMTO95050 263 aa-0.92□□□□□ -2.56
RNU6-871P-201ENST00000516122 ITGA5P08648 1049 aa-0.92□□□□□ -2.56
RNU6-871P-201ENST00000516122 POU2F2P09086 479 aa-0.92□□□□□ -2.56
RNU6-871P-201ENST00000516122 THEGLP0DJG4 465 aa-0.92□□□□□ -2.56
RNU6-871P-201ENST00000516122 MYCLP1P12525 358 aaPredicted RBP-0.92□□□□□ -2.56
RNU6-871P-201ENST00000516122 ZNF23P17027 643 aa-0.92□□□□□ -2.56
RNU6-871P-201ENST00000516122 YWHAQP27348 245 aa-0.92□□□□□ -2.56
RNU6-871P-201ENST00000516122 ELF1P32519 619 aa-0.92□□□□□ -2.56
RNU6-871P-201ENST00000516122 CSTF2P33240 577 aaKnown RBP eCLIP-0.92□□□□□ -2.56
RNU6-871P-201ENST00000516122 LMAN1P49257 510 aa-0.92□□□□□ -2.56
RNU6-871P-201ENST00000516122 HNRNPH2P55795 449 aaKnown RBP-0.92□□□□□ -2.56
RNU6-871P-201ENST00000516122 ABCE1P61221 599 aaKnown RBP-0.92□□□□□ -2.56
RNU6-871P-201ENST00000516122 RPS16P62249 146 aaKnown RBP-0.92□□□□□ -2.56
RNU6-871P-201ENST00000516122 PDE1BQ01064 536 aa-0.92□□□□□ -2.56
RNU6-871P-201ENST00000516122 FCHO2Q0JRZ9 810 aa-0.92□□□□□ -2.56
RNU6-871P-201ENST00000516122 SRSF5Q13243 272 aaKnown RBP-0.92□□□□□ -2.56
RNU6-871P-201ENST00000516122 ZNF544Q6NX49 715 aa-0.92□□□□□ -2.56
RNU6-871P-201ENST00000516122 MTFR2Q6P444 385 aa-0.92□□□□□ -2.56
RNU6-871P-201ENST00000516122 KLHL17Q6TDP4 642 aa-0.92□□□□□ -2.56
RNU6-871P-201ENST00000516122 B3GNT9Q6UX72 402 aa-0.92□□□□□ -2.56
RNU6-871P-201ENST00000516122 C16orf86Q6ZW13 317 aa-0.92□□□□□ -2.56
RNU6-871P-201ENST00000516122 CHST15Q7LFX5 561 aaPredicted RBP-0.92□□□□□ -2.56
RNU6-871P-201ENST00000516122 NECAB2Q7Z6G3 386 aa-0.92□□□□□ -2.56
RNU6-871P-201ENST00000516122 CATIPQ7Z7H3 387 aa-0.92□□□□□ -2.56
RNU6-871P-201ENST00000516122 TMEM139Q8IV31 216 aa-0.92□□□□□ -2.56
RNU6-871P-201ENST00000516122 KLHDC1Q8N7A1 406 aa-0.92□□□□□ -2.56
RNU6-871P-201ENST00000516122 ZNF433Q8N7K0 673 aaPredicted RBP-0.92□□□□□ -2.56
RNU6-871P-201ENST00000516122 UBR7Q8N806 425 aa-0.92□□□□□ -2.56
RNU6-871P-201ENST00000516122 OR5R1Q8NH85 324 aa-0.92□□□□□ -2.56
RNU6-871P-201ENST00000516122 HDAC11Q96DB2 347 aa-0.92□□□□□ -2.56
RNU6-871P-201ENST00000516122 CALML4Q96GE6 196 aa-0.92□□□□□ -2.56
RNU6-871P-201ENST00000516122 ZSCAN31Q96LW9 406 aaPredicted RBP-0.92□□□□□ -2.56
RNU6-871P-201ENST00000516122 EIF3CQ99613 913 aaKnown RBP-0.92□□□□□ -2.56
RNU6-871P-201ENST00000516122 DGCR6LQ9BY27 220 aa-0.92□□□□□ -2.56
RNU6-871P-201ENST00000516122 SLC13A1Q9BZW2 595 aa-0.92□□□□□ -2.56
RNU6-871P-201ENST00000516122 XRN2Q9H0D6 950 aaKnown RBP eCLIP-0.92□□□□□ -2.56
RNU6-871P-201ENST00000516122 SPHK2Q9NRA0 654 aa-0.92□□□□□ -2.56
RNU6-871P-201ENST00000516122 CLEC5AQ9NY25 188 aa-0.92□□□□□ -2.56
RNU6-871P-201ENST00000516122 GRHL1Q9NZI5 618 aa-0.92□□□□□ -2.56
RNU6-871P-201ENST00000516122 MARCH4Q9P2E8 410 aaPredicted RBP-0.92□□□□□ -2.56
RNU6-871P-201ENST00000516122 LAS1LQ9Y4W2 734 aaKnown RBP-0.92□□□□□ -2.56
RNU6-871P-201ENST00000516122 USP19O94966 1318 aa-0.92□□□□□ -2.56
RNU6-871P-201ENST00000516122 FAM155BO75949 473 aa-0.93□□□□□ -2.56
RNU6-871P-201ENST00000516122 PSG2P11465 335 aa-0.93□□□□□ -2.56
RNU6-871P-201ENST00000516122 POLR2CP19387 275 aaPredicted RBP-0.93□□□□□ -2.56
RNU6-871P-201ENST00000516122 GIFP27352 417 aa-0.93□□□□□ -2.56
RNU6-871P-201ENST00000516122 CENPAP49450 140 aa-0.93□□□□□ -2.56
RNU6-871P-201ENST00000516122 HDAC4P56524 1084 aa-0.93□□□□□ -2.56
RNU6-871P-201ENST00000516122 PFN3P60673 137 aa-0.93□□□□□ -2.56
RNU6-871P-201ENST00000516122 GALNT2Q10471 571 aa-0.93□□□□□ -2.56
RNU6-871P-201ENST00000516122 ATP1A4Q13733 1029 aa-0.93□□□□□ -2.56
RNU6-871P-201ENST00000516122 ZACNQ401N2 412 aa-0.93□□□□□ -2.56
RNU6-871P-201ENST00000516122 C3orf38Q5JPI3 329 aa-0.93□□□□□ -2.56
RNU6-871P-201ENST00000516122 DCAF10Q5QP82 559 aa-0.93□□□□□ -2.56
RNU6-871P-201ENST00000516122 CYP4A22Q5TCH4 519 aa-0.93□□□□□ -2.56
RNU6-871P-201ENST00000516122 TMEM268Q5VZI3 342 aa-0.93□□□□□ -2.56
RNU6-871P-201ENST00000516122 TTC19Q6DKK2 380 aaPredicted RBP-0.93□□□□□ -2.56
RNU6-871P-201ENST00000516122 ANKRD54Q6NXT1 300 aa-0.93□□□□□ -2.56
RNU6-871P-201ENST00000516122 FBXO38Q6PIJ6 1188 aa-0.93□□□□□ -2.56
RNU6-871P-201ENST00000516122 UNC13DQ70J99 1090 aa-0.93□□□□□ -2.56
RNU6-871P-201ENST00000516122 SPATS2Q86XZ4 545 aaKnown RBP-0.93□□□□□ -2.56
RNU6-871P-201ENST00000516122 RNF182Q8N6D2 247 aa-0.93□□□□□ -2.56
RNU6-871P-201ENST00000516122 OR5AP2Q8NGF4 316 aa-0.93□□□□□ -2.56
RNU6-871P-201ENST00000516122 ZNF564Q8TBZ8 553 aaPredicted RBP-0.93□□□□□ -2.56
RNU6-871P-201ENST00000516122 SNRNP27Q8WVK2 155 aaKnown RBP-0.93□□□□□ -2.56
RNU6-871P-201ENST00000516122 ELSPBP1Q96BH3 223 aa-0.93□□□□□ -2.56
RNU6-871P-201ENST00000516122 MTERF1Q99551 399 aaKnown RBP-0.93□□□□□ -2.56
RNU6-871P-201ENST00000516122 CMKLR1Q99788 373 aa-0.93□□□□□ -2.56
RNU6-871P-201ENST00000516122 SEMA3CQ99985 751 aa-0.93□□□□□ -2.56
RNU6-871P-201ENST00000516122 RHNO1Q9BSD3 238 aa-0.93□□□□□ -2.56
RNU6-871P-201ENST00000516122 IFT27Q9BW83 186 aa-0.93□□□□□ -2.56
RNU6-871P-201ENST00000516122 SLC25A39Q9BZJ4 359 aaPredicted RBP-0.93□□□□□ -2.56
RNU6-871P-201ENST00000516122 ESRP2Q9H6T0 727 aaKnown RBP-0.93□□□□□ -2.56
RNU6-871P-201ENST00000516122 NMRK2Q9NPI5 230 aa-0.93□□□□□ -2.56
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 20.7 ms