RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000514552.5

PDE4D-222, Transcript of phosphodiesterase 4D, humanhuman

TSL 3

Gene PDE4D, Length 494 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE4D-222ENST00000514552 DNAI2Q9GZS0 605 aa7.07□□□□□ -1.28
PDE4D-222ENST00000514552 DPEP3Q9H4B8 488 aa7.07□□□□□ -1.28
PDE4D-222ENST00000514552 SLC32A1Q9H598 525 aa7.07□□□□□ -1.28
PDE4D-222ENST00000514552 SMYD3Q9H7B4 428 aa7.07□□□□□ -1.28
PDE4D-222ENST00000514552 UNKLQ9H9P5 680 aaKnown RBP7.07□□□□□ -1.28
PDE4D-222ENST00000514552 TLR8Q9NR97 1041 aaKnown RBP7.07□□□□□ -1.28
PDE4D-222ENST00000514552 SPHK2Q9NRA0 654 aa7.07□□□□□ -1.28
PDE4D-222ENST00000514552 DMAC2Q9NW81 257 aa7.07□□□□□ -1.28
PDE4D-222ENST00000514552 DEC1Q9P2X7 70 aa7.07□□□□□ -1.28
PDE4D-222ENST00000514552 PILRBQ9UKJ0 227 aa7.07□□□□□ -1.28
PDE4D-222ENST00000514552 NFE2L3Q9Y4A8 694 aa7.07□□□□□ -1.28
PDE4D-222ENST00000514552 PLEKHM1Q9Y4G2 1056 aa7.07□□□□□ -1.28
PDE4D-222ENST00000514552 HS3ST3A1Q9Y663 406 aa7.07□□□□□ -1.28
PDE4D-222ENST00000514552 IGF2BP2Q9Y6M1 599 aaKnown RBP eCLIP7.07□□□□□ -1.28
PDE4D-222ENST00000514552 CACNA1EQ15878 2313 aa7.06□□□□□ -1.28
PDE4D-222ENST00000514552 TCRBV21S2A2A0A5A6 115 aa7.06□□□□□ -1.28
PDE4D-222ENST00000514552 PIPSLA2A3N6 862 aa7.06□□□□□ -1.28
PDE4D-222ENST00000514552 H0Y626 953 aa7.06□□□□□ -1.28
PDE4D-222ENST00000514552 M0QYG6 137 aa7.06□□□□□ -1.28
PDE4D-222ENST00000514552 TLR5O60602 858 aa7.06□□□□□ -1.28
PDE4D-222ENST00000514552 TULP3O75386 442 aa7.06□□□□□ -1.28
PDE4D-222ENST00000514552 DNAJB5O75953 348 aa7.06□□□□□ -1.28
PDE4D-222ENST00000514552 KIF20AO95235 890 aa7.06□□□□□ -1.28
PDE4D-222ENST00000514552 TRIM16O95361 564 aa7.06□□□□□ -1.28
PDE4D-222ENST00000514552 ASS1P00966 412 aaKnown RBP7.06□□□□□ -1.28
PDE4D-222ENST00000514552 SERPINF2P08697 491 aa7.06□□□□□ -1.28
PDE4D-222ENST00000514552 FDXRP22570 491 aa7.06□□□□□ -1.28
PDE4D-222ENST00000514552 NTSR1P30989 418 aa7.06□□□□□ -1.28
PDE4D-222ENST00000514552 ACVRL1P37023 503 aa7.06□□□□□ -1.28
PDE4D-222ENST00000514552 GDF5P43026 501 aa7.06□□□□□ -1.28
PDE4D-222ENST00000514552 DHPSP49366 369 aaPredicted RBP7.06□□□□□ -1.28
PDE4D-222ENST00000514552 SCAPQ12770 1279 aa7.06□□□□□ -1.28
PDE4D-222ENST00000514552 BIRC3Q13489 604 aa7.06□□□□□ -1.28
PDE4D-222ENST00000514552 DYRK1AQ13627 763 aa7.06□□□□□ -1.28
PDE4D-222ENST00000514552 NFIL3Q16649 462 aa7.06□□□□□ -1.28
PDE4D-222ENST00000514552 GEN1Q17RS7 908 aa7.06□□□□□ -1.28
PDE4D-222ENST00000514552 SGSM1Q2NKQ1 1148 aa7.06□□□□□ -1.28
PDE4D-222ENST00000514552 C10orf76Q5T2E6 689 aa7.06□□□□□ -1.28
PDE4D-222ENST00000514552 PAQR9Q6ZVX9 377 aa7.06□□□□□ -1.28
PDE4D-222ENST00000514552 PIP4P1Q86T03 277 aa7.06□□□□□ -1.28
PDE4D-222ENST00000514552 TADA2BQ86TJ2 420 aa7.06□□□□□ -1.28
PDE4D-222ENST00000514552 ULK2Q8IYT8 1036 aa7.06□□□□□ -1.28
PDE4D-222ENST00000514552 TTC39CQ8N584 583 aa7.06□□□□□ -1.28
PDE4D-222ENST00000514552 LRTOMTQ8WZ04 291 aa7.06□□□□□ -1.28
PDE4D-222ENST00000514552 XPO6Q96QU8 1125 aaKnown RBP7.06□□□□□ -1.28
PDE4D-222ENST00000514552 KCNK16Q96T55 309 aa7.06□□□□□ -1.28
PDE4D-222ENST00000514552 NACA2Q9H009 215 aa7.06□□□□□ -1.28
PDE4D-222ENST00000514552 CAMSAP3Q9P1Y5 1249 aaPredicted RBP7.06□□□□□ -1.28
PDE4D-222ENST00000514552 BCCIPQ9P287 314 aaKnown RBP eCLIP7.06□□□□□ -1.28
PDE4D-222ENST00000514552 WDR35Q9P2L0 1181 aa7.06□□□□□ -1.28
PDE4D-222ENST00000514552 SCML2Q9UQR0 700 aa7.06□□□□□ -1.28
PDE4D-222ENST00000514552 NEUROG3Q9Y4Z2 214 aa7.06□□□□□ -1.28
PDE4D-222ENST00000514552 TBC1D3BA6NDS4 549 aa7.05□□□□□ -1.28
PDE4D-222ENST00000514552 TOR1BO14657 336 aa7.05□□□□□ -1.28
PDE4D-222ENST00000514552 CLIC2O15247 247 aa7.05□□□□□ -1.28
PDE4D-222ENST00000514552 POLR2DO15514 142 aaKnown RBP7.05□□□□□ -1.28
PDE4D-222ENST00000514552 UNC5CO95185 931 aa7.05□□□□□ -1.28
PDE4D-222ENST00000514552 VNN1O95497 513 aa7.05□□□□□ -1.28
PDE4D-222ENST00000514552 FAM200BP0CF97 657 aa7.05□□□□□ -1.28
PDE4D-222ENST00000514552 KITP10721 976 aa7.05□□□□□ -1.28
PDE4D-222ENST00000514552 EGR2P11161 476 aaPredicted RBP7.05□□□□□ -1.28
PDE4D-222ENST00000514552 HOXB2P14652 356 aa7.05□□□□□ -1.28
PDE4D-222ENST00000514552 ENGP17813 658 aa7.05□□□□□ -1.28
PDE4D-222ENST00000514552 SLC7A1P30825 629 aa7.05□□□□□ -1.28
PDE4D-222ENST00000514552 ATP5C1P36542 298 aaKnown RBP7.05□□□□□ -1.28
PDE4D-222ENST00000514552 PTGER3P43115 390 aa7.05□□□□□ -1.28
PDE4D-222ENST00000514552 KDSRQ06136 332 aa7.05□□□□□ -1.28
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PDE4D-222ENST00000514552 SLC14A1Q13336 389 aa7.05□□□□□ -1.28
PDE4D-222ENST00000514552 HLXQ14774 488 aaPredicted RBP7.05□□□□□ -1.28
PDE4D-222ENST00000514552 DUOXA1Q1HG43 343 aa7.05□□□□□ -1.28
PDE4D-222ENST00000514552 BBS7Q8IWZ6 715 aa7.05□□□□□ -1.28
PDE4D-222ENST00000514552 NELFCDQ8IXH7 590 aa7.05□□□□□ -1.28
PDE4D-222ENST00000514552 CEP57L1Q8IYX8 460 aa7.05□□□□□ -1.28
PDE4D-222ENST00000514552 CCDC33Q8N5R6 958 aa7.05□□□□□ -1.28
PDE4D-222ENST00000514552 AMER2Q8N7J2 671 aa7.05□□□□□ -1.28
PDE4D-222ENST00000514552 FAM46DQ8NEK8 389 aa7.05□□□□□ -1.28
PDE4D-222ENST00000514552 ZMIZ2Q8NF64 920 aa7.05□□□□□ -1.28
PDE4D-222ENST00000514552 SCAMP5Q8TAC9 235 aa7.05□□□□□ -1.28
PDE4D-222ENST00000514552 SLC2A14Q8TDB8 520 aa7.05□□□□□ -1.28
PDE4D-222ENST00000514552 HMGB4Q8WW32 186 aa7.05□□□□□ -1.28
PDE4D-222ENST00000514552 ASB10Q8WXI3 467 aa7.05□□□□□ -1.28
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PDE4D-222ENST00000514552 SNX21Q969T3 373 aa7.05□□□□□ -1.28
PDE4D-222ENST00000514552 HNRNPABQ99729 332 aaKnown RBP7.05□□□□□ -1.28
PDE4D-222ENST00000514552 MED10Q9BTT4 135 aa7.05□□□□□ -1.28
PDE4D-222ENST00000514552 KRTAP4-7Q9BYR0 210 aa7.05□□□□□ -1.28
PDE4D-222ENST00000514552 DPH1Q9BZG8 443 aa7.05□□□□□ -1.28
PDE4D-222ENST00000514552 CYP3A43Q9HB55 503 aa7.05□□□□□ -1.28
PDE4D-222ENST00000514552 EXOC1Q9NV70 894 aa7.05□□□□□ -1.28
PDE4D-222ENST00000514552 TBCCD1Q9NVR7 557 aa7.05□□□□□ -1.28
PDE4D-222ENST00000514552 MRPS18AQ9NVS2 196 aaKnown RBP7.05□□□□□ -1.28
PDE4D-222ENST00000514552 CLIC5Q9NZA1 410 aa7.05□□□□□ -1.28
PDE4D-222ENST00000514552 LSM7Q9UK45 103 aaKnown RBP7.05□□□□□ -1.28
PDE4D-222ENST00000514552 CFAP45Q9UL16 551 aa7.05□□□□□ -1.28
PDE4D-222ENST00000514552 TRAF3IP3Q9Y228 551 aa7.05□□□□□ -1.28
PDE4D-222ENST00000514552 ZNF510Q9Y2H8 683 aa7.05□□□□□ -1.28
PDE4D-222ENST00000514552 SLC27A6Q9Y2P4 619 aa7.05□□□□□ -1.28
PDE4D-222ENST00000514552 UTP18Q9Y5J1 556 aaKnown RBP eCLIP7.05□□□□□ -1.28
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