RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000514384.1

SMIM20-202, Transcript of small integral membrane protein 20, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene SMIM20, Length 774 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMIM20-202ENST00000514384 SRGAP2CP0DJJ0 459 aa7.21□□□□□ -1.26
SMIM20-202ENST00000514384 NCF2P19878 526 aaPredicted RBP7.21□□□□□ -1.26
SMIM20-202ENST00000514384 MGAT1P26572 445 aa7.21□□□□□ -1.26
SMIM20-202ENST00000514384 ARL4AP40617 200 aa7.21□□□□□ -1.26
SMIM20-202ENST00000514384 CDK9P50750 372 aaKnown RBP7.21□□□□□ -1.26
SMIM20-202ENST00000514384 ATXN3P54252 364 aaPredicted RBP7.21□□□□□ -1.26
SMIM20-202ENST00000514384 DNAJB13P59910 316 aa7.21□□□□□ -1.26
SMIM20-202ENST00000514384 MYBPC1Q00872 1141 aa7.21□□□□□ -1.26
SMIM20-202ENST00000514384 SEMG2Q02383 582 aa7.21□□□□□ -1.26
SMIM20-202ENST00000514384 MTM1Q13496 603 aa7.21□□□□□ -1.26
SMIM20-202ENST00000514384 DCTN2Q13561 401 aaKnown RBP7.21□□□□□ -1.26
SMIM20-202ENST00000514384 FLOT2Q14254 428 aa7.21□□□□□ -1.26
SMIM20-202ENST00000514384 MYBPC3Q14896 1274 aa7.21□□□□□ -1.26
SMIM20-202ENST00000514384 PON2Q15165 354 aa7.21□□□□□ -1.26
SMIM20-202ENST00000514384 MAPRE2Q15555 327 aa7.21□□□□□ -1.26
SMIM20-202ENST00000514384 SLC10A6Q3KNW5 377 aa7.21□□□□□ -1.26
SMIM20-202ENST00000514384 LARP7Q4G0J3 582 aaKnown RBP eCLIP7.21□□□□□ -1.26
SMIM20-202ENST00000514384 NADK2Q4G0N4 442 aa7.21□□□□□ -1.26
SMIM20-202ENST00000514384 LIPMQ5VYY2 423 aa7.21□□□□□ -1.26
SMIM20-202ENST00000514384 SEL1L3Q68CR1 1132 aa7.21□□□□□ -1.26
SMIM20-202ENST00000514384 PMS2CLQ68D20 193 aa7.21□□□□□ -1.26
SMIM20-202ENST00000514384 JADE1Q6IE81 842 aa7.21□□□□□ -1.26
SMIM20-202ENST00000514384 PMF1Q6P1K2 205 aa7.21□□□□□ -1.26
SMIM20-202ENST00000514384 KLHDC10Q6PID8 442 aa7.21□□□□□ -1.26
SMIM20-202ENST00000514384 RBM44Q6ZP01 1051 aaKnown RBP7.21□□□□□ -1.26
SMIM20-202ENST00000514384 CHSY3Q70JA7 882 aa7.21□□□□□ -1.26
SMIM20-202ENST00000514384 PDZD4Q76G19 769 aaPredicted RBP7.21□□□□□ -1.26
SMIM20-202ENST00000514384 LIMS2Q7Z4I7 341 aa7.21□□□□□ -1.26
SMIM20-202ENST00000514384 TTC30AQ86WT1 665 aa7.21□□□□□ -1.26
SMIM20-202ENST00000514384 COLGALT2Q8IYK4 626 aa7.21□□□□□ -1.26
SMIM20-202ENST00000514384 CRYBG2Q8N1P7 616 aa7.21□□□□□ -1.26
SMIM20-202ENST00000514384 TMEM102Q8N9M5 508 aaPredicted RBP7.21□□□□□ -1.26
SMIM20-202ENST00000514384 ANKRD52Q8NB46 1076 aa7.21□□□□□ -1.26
SMIM20-202ENST00000514384 UBA3Q8TBC4 463 aa7.21□□□□□ -1.26
SMIM20-202ENST00000514384 STYXQ8WUJ0 223 aa7.21□□□□□ -1.26
SMIM20-202ENST00000514384 NT5C3BQ969T7 300 aa7.21□□□□□ -1.26
SMIM20-202ENST00000514384 ELSPBP1Q96BH3 223 aa7.21□□□□□ -1.26
SMIM20-202ENST00000514384 ASB9Q96DX5 294 aa7.21□□□□□ -1.26
SMIM20-202ENST00000514384 ZNF668Q96K58 619 aaPredicted RBP7.21□□□□□ -1.26
SMIM20-202ENST00000514384 VAT1Q99536 393 aa7.21□□□□□ -1.26
SMIM20-202ENST00000514384 GPR22Q99680 433 aa7.21□□□□□ -1.26
SMIM20-202ENST00000514384 OCSTAMPQ9BR26 566 aa7.21□□□□□ -1.26
SMIM20-202ENST00000514384 GATA5Q9BWX5 397 aaPredicted RBP7.21□□□□□ -1.26
SMIM20-202ENST00000514384 NUSAP1Q9BXS6 441 aaKnown RBP7.21□□□□□ -1.26
SMIM20-202ENST00000514384 SMARCAD1Q9H4L7 1026 aa7.21□□□□□ -1.26
SMIM20-202ENST00000514384 NMRAL1Q9HBL8 299 aa7.21□□□□□ -1.26
SMIM20-202ENST00000514384 ZBTB26Q9HCK0 441 aa7.21□□□□□ -1.26
SMIM20-202ENST00000514384 PRM3Q9NNZ6 103 aa7.21□□□□□ -1.26
SMIM20-202ENST00000514384 CHCHD3Q9NX63 227 aaKnown RBP7.21□□□□□ -1.26
SMIM20-202ENST00000514384 TRHDEQ9UKU6 1024 aa7.21□□□□□ -1.26
SMIM20-202ENST00000514384 FZD10Q9ULW2 581 aa7.21□□□□□ -1.26
SMIM20-202ENST00000514384 MRPS23Q9Y3D9 190 aaKnown RBP7.21□□□□□ -1.26
SMIM20-202ENST00000514384 AK5Q9Y6K8 562 aa7.21□□□□□ -1.26
SMIM20-202ENST00000514384 KAT6AQ92794 2004 aa7.21□□□□□ -1.26
SMIM20-202ENST00000514384 A0A096LPK6 155 aa7.2□□□□□ -1.26
SMIM20-202ENST00000514384 ZCWPW2A0A1B0GU75 182 aa7.2□□□□□ -1.26
SMIM20-202ENST00000514384 A0A1B0GVG6 124 aa7.2□□□□□ -1.26
SMIM20-202ENST00000514384 SMIM35A0A1B0GVV1 85 aa7.2□□□□□ -1.26
SMIM20-202ENST00000514384 BLACEA4D250 179 aa7.2□□□□□ -1.26
SMIM20-202ENST00000514384 RRN3P2A6NIE6 340 aa7.2□□□□□ -1.26
SMIM20-202ENST00000514384 TRPC5OSA6NMA1 111 aa7.2□□□□□ -1.26
SMIM20-202ENST00000514384 TARM1B6A8C7 271 aa7.2□□□□□ -1.26
SMIM20-202ENST00000514384 F8W810 466 aa7.2□□□□□ -1.26
SMIM20-202ENST00000514384 INO80B-WBP1J3KQ70 363 aa7.2□□□□□ -1.26
SMIM20-202ENST00000514384 RNF103O00237 685 aa7.2□□□□□ -1.26
SMIM20-202ENST00000514384 PIK3R2O00459 728 aa7.2□□□□□ -1.26
SMIM20-202ENST00000514384 GRID2O43424 1007 aa7.2□□□□□ -1.26
SMIM20-202ENST00000514384 CACNG3O60359 315 aa7.2□□□□□ -1.26
SMIM20-202ENST00000514384 DAB1O75553 588 aa7.2□□□□□ -1.26
SMIM20-202ENST00000514384 DDHD2O94830 711 aa7.2□□□□□ -1.26
SMIM20-202ENST00000514384 C22orf31O95567 290 aa7.2□□□□□ -1.26
SMIM20-202ENST00000514384 CFIP05156 583 aa7.2□□□□□ -1.26
SMIM20-202ENST00000514384 RPLP2P05387 115 aaKnown RBP7.2□□□□□ -1.26
SMIM20-202ENST00000514384 FAM200BP0CF97 657 aa7.2□□□□□ -1.26
SMIM20-202ENST00000514384 CDK4P11802 303 aa7.2□□□□□ -1.26
SMIM20-202ENST00000514384 ZNF26P17031 533 aaPredicted RBP7.2□□□□□ -1.26
SMIM20-202ENST00000514384 RHOQP17081 205 aa7.2□□□□□ -1.26
SMIM20-202ENST00000514384 CEBPBP17676 345 aa7.2□□□□□ -1.26
SMIM20-202ENST00000514384 CDH2P19022 906 aaPredicted RBP7.2□□□□□ -1.26
SMIM20-202ENST00000514384 VIPR2P41587 438 aa7.2□□□□□ -1.26
SMIM20-202ENST00000514384 GRIA1P42261 906 aa7.2□□□□□ -1.26
SMIM20-202ENST00000514384 MATKP42679 507 aa7.2□□□□□ -1.26
SMIM20-202ENST00000514384 ACADVLP49748 655 aa7.2□□□□□ -1.26
SMIM20-202ENST00000514384 ATP4BP51164 291 aa7.2□□□□□ -1.26
SMIM20-202ENST00000514384 KPNA1P52294 538 aaPredicted RBP7.2□□□□□ -1.26
SMIM20-202ENST00000514384 THOP1P52888 689 aa7.2□□□□□ -1.26
SMIM20-202ENST00000514384 BCAT1P54687 386 aa7.2□□□□□ -1.26
SMIM20-202ENST00000514384 GALNT1Q10472 559 aaPredicted RBP7.2□□□□□ -1.26
SMIM20-202ENST00000514384 BST2Q10589 180 aaKnown RBP7.2□□□□□ -1.26
SMIM20-202ENST00000514384 NFATC3Q12968 1075 aa7.2□□□□□ -1.26
SMIM20-202ENST00000514384 CEACAM7Q14002 265 aa7.2□□□□□ -1.26
SMIM20-202ENST00000514384 PCBP1Q15365 356 aaKnown RBP eCLIP7.2□□□□□ -1.26
SMIM20-202ENST00000514384 PSMD5Q16401 504 aa7.2□□□□□ -1.26
SMIM20-202ENST00000514384 UGP2Q16851 508 aa7.2□□□□□ -1.26
SMIM20-202ENST00000514384 ANO4Q32M45 955 aa7.2□□□□□ -1.26
SMIM20-202ENST00000514384 MYLK3Q32MK0 819 aa7.2□□□□□ -1.26
SMIM20-202ENST00000514384 SLC25A52Q3SY17 297 aa7.2□□□□□ -1.26
SMIM20-202ENST00000514384 KCTD21Q4G0X4 260 aa7.2□□□□□ -1.26
SMIM20-202ENST00000514384 SLC9B1Q4ZJI4 515 aa7.2□□□□□ -1.26
SMIM20-202ENST00000514384 RAB6CQ53S08 254 aa7.2□□□□□ -1.26
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 28.7 ms