RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000503051.1

USP46-AS1-201, USP46 antisense RNA 1, humanhuman

TSL 3 BASIC

Gene USP46-AS1, Length 1,048 nt, Biotype lincRNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP46-AS1-201ENST00000503051 TEAD1P28347 426 aa19.1■□□□□ 0.65
USP46-AS1-201ENST00000503051 CXCR5P32302 372 aa19.1■□□□□ 0.65
USP46-AS1-201ENST00000503051 CHRNA4P43681 627 aa19.1■□□□□ 0.65
USP46-AS1-201ENST00000503051 DPTQ07507 201 aa19.1■□□□□ 0.65
USP46-AS1-201ENST00000503051 ILF3Q12906 894 aaKnown RBP eCLIP19.1■□□□□ 0.65
USP46-AS1-201ENST00000503051 OASLQ15646 514 aaKnown RBP19.1■□□□□ 0.65
USP46-AS1-201ENST00000503051 SLC1A5Q15758 541 aa19.1■□□□□ 0.65
USP46-AS1-201ENST00000503051 ISXQ2M1V0 245 aa19.1■□□□□ 0.65
USP46-AS1-201ENST00000503051 COL28A1Q2UY09 1125 aa19.1■□□□□ 0.65
USP46-AS1-201ENST00000503051 C3orf38Q5JPI3 329 aa19.1■□□□□ 0.65
USP46-AS1-201ENST00000503051 SIRPB2Q5JXA9 342 aa19.1■□□□□ 0.65
USP46-AS1-201ENST00000503051 ARHGEF18Q6ZSZ5 1173 aa19.1■□□□□ 0.65
USP46-AS1-201ENST00000503051 RAVER1Q8IY67 606 aaKnown RBP19.1■□□□□ 0.65
USP46-AS1-201ENST00000503051 NRSN1Q8IZ57 195 aa19.1■□□□□ 0.65
USP46-AS1-201ENST00000503051 SLC25A41Q8N5S1 370 aa19.1■□□□□ 0.65
USP46-AS1-201ENST00000503051 FICDQ9BVA6 458 aa19.1■□□□□ 0.65
USP46-AS1-201ENST00000503051 GSDMCQ9BYG8 508 aa19.1■□□□□ 0.65
USP46-AS1-201ENST00000503051 ZFYVE1Q9HBF4 777 aa19.1■□□□□ 0.65
USP46-AS1-201ENST00000503051 MAGEE1Q9HCI5 957 aa19.1■□□□□ 0.65
USP46-AS1-201ENST00000503051 PKD2L2Q9NZM6 624 aa19.1■□□□□ 0.65
USP46-AS1-201ENST00000503051 RALYQ9UKM9 306 aaKnown RBP19.1■□□□□ 0.65
USP46-AS1-201ENST00000503051 FREM2Q5SZK8 3169 aa19.1■□□□□ 0.65
USP46-AS1-201ENST00000503051 PKD1L2Q7Z442 2459 aa19.09■□□□□ 0.65
USP46-AS1-201ENST00000503051 RRP8O43159 456 aaKnown RBP19.09■□□□□ 0.65
USP46-AS1-201ENST00000503051 FGGP02679 453 aa19.09■□□□□ 0.65
USP46-AS1-201ENST00000503051 HLA-DPA1P20036 260 aa19.09■□□□□ 0.65
USP46-AS1-201ENST00000503051 ABCG1P45844 678 aa19.09■□□□□ 0.65
USP46-AS1-201ENST00000503051 SPINT3P49223 89 aa19.09■□□□□ 0.65
USP46-AS1-201ENST00000503051 PRPSAP1Q14558 356 aa19.09■□□□□ 0.65
USP46-AS1-201ENST00000503051 SIX1Q15475 284 aaPredicted RBP19.09■□□□□ 0.65
USP46-AS1-201ENST00000503051 C1orf54Q8WWF1 131 aa19.09■□□□□ 0.65
USP46-AS1-201ENST00000503051 EID2BQ96D98 161 aa19.09■□□□□ 0.65
USP46-AS1-201ENST00000503051 PPP1R2P1Q96PQ5 205 aa19.09■□□□□ 0.65
USP46-AS1-201ENST00000503051 RIOK2Q9BVS4 552 aaKnown RBP19.09■□□□□ 0.65
USP46-AS1-201ENST00000503051 FRMD8Q9BZ67 464 aaPredicted RBP19.09■□□□□ 0.65
USP46-AS1-201ENST00000503051 GPR63Q9BZJ6 419 aa19.09■□□□□ 0.65
USP46-AS1-201ENST00000503051 CDH19Q9H159 772 aa19.09■□□□□ 0.65
USP46-AS1-201ENST00000503051 SUFUQ9UMX1 484 aa19.09■□□□□ 0.65
USP46-AS1-201ENST00000503051 AAR2Q9Y312 384 aaKnown RBP19.09■□□□□ 0.65
USP46-AS1-201ENST00000503051 JRKLQ9Y4A0 524 aa19.09■□□□□ 0.65
USP46-AS1-201ENST00000503051 TLX3O43711 291 aaPredicted RBP19.08■□□□□ 0.64
USP46-AS1-201ENST00000503051 KIF5CO60282 957 aa19.08■□□□□ 0.64
USP46-AS1-201ENST00000503051 CEP104O60308 925 aa19.08■□□□□ 0.64
USP46-AS1-201ENST00000503051 FGF1P05230 155 aa19.08■□□□□ 0.64
USP46-AS1-201ENST00000503051 BIRC2Q13490 618 aa19.08■□□□□ 0.64
USP46-AS1-201ENST00000503051 TBC1D25Q3MII6 688 aa19.08■□□□□ 0.64
USP46-AS1-201ENST00000503051 ZNF569Q5MCW4 686 aa19.08■□□□□ 0.64
USP46-AS1-201ENST00000503051 ADAMTSL4Q6UY14 1074 aa19.08■□□□□ 0.64
USP46-AS1-201ENST00000503051 LSMEM2Q8N112 164 aa19.08■□□□□ 0.64
USP46-AS1-201ENST00000503051 SLC35F6Q8N357 371 aa19.08■□□□□ 0.64
USP46-AS1-201ENST00000503051 CCL4L1Q8NHW4 92 aa19.08■□□□□ 0.64
USP46-AS1-201ENST00000503051 GRAMD1AQ96CP6 724 aa19.08■□□□□ 0.64
USP46-AS1-201ENST00000503051 RTP4Q96DX8 246 aa19.08■□□□□ 0.64
USP46-AS1-201ENST00000503051 GFM1Q96RP9 751 aaKnown RBP19.08■□□□□ 0.64
USP46-AS1-201ENST00000503051 SRPK1Q96SB4 655 aaKnown RBP19.08■□□□□ 0.64
USP46-AS1-201ENST00000503051 AGAP2Q99490 1192 aa19.08■□□□□ 0.64
USP46-AS1-201ENST00000503051 POLR1BQ9H9Y6 1135 aa19.08■□□□□ 0.64
USP46-AS1-201ENST00000503051 PYCARDQ9ULZ3 195 aa19.08■□□□□ 0.64
USP46-AS1-201ENST00000503051 SATB2Q9UPW6 733 aa19.08■□□□□ 0.64
USP46-AS1-201ENST00000503051 ANKRD11Q6UB99 2663 aaPredicted RBP19.08■□□□□ 0.64
USP46-AS1-201ENST00000503051 RGSL1A5PLK6 1076 aa19.07■□□□□ 0.64
USP46-AS1-201ENST00000503051 USP27XA6NNY8 438 aa19.07■□□□□ 0.64
USP46-AS1-201ENST00000503051 AURKAO14965 403 aa19.07■□□□□ 0.64
USP46-AS1-201ENST00000503051 INPP4BO15327 924 aa19.07■□□□□ 0.64
USP46-AS1-201ENST00000503051 ASMTLO95671 621 aa19.07■□□□□ 0.64
USP46-AS1-201ENST00000503051 AGTP01019 485 aa19.07■□□□□ 0.64
USP46-AS1-201ENST00000503051 RPLP0P05388 317 aaKnown RBP19.07■□□□□ 0.64
USP46-AS1-201ENST00000503051 CEACAM5P06731 702 aa19.07■□□□□ 0.64
USP46-AS1-201ENST00000503051 ADRA1AP35348 466 aa19.07■□□□□ 0.64
USP46-AS1-201ENST00000503051 CCDC173Q0VFZ6 552 aa19.07■□□□□ 0.64
USP46-AS1-201ENST00000503051 OLIG2Q13516 323 aa19.07■□□□□ 0.64
USP46-AS1-201ENST00000503051 SNX1Q13596 522 aa19.07■□□□□ 0.64
USP46-AS1-201ENST00000503051 PEX6Q13608 980 aa19.07■□□□□ 0.64
USP46-AS1-201ENST00000503051 P3H1Q32P28 736 aa19.07■□□□□ 0.64
USP46-AS1-201ENST00000503051 C14orf28Q4W4Y0 310 aa19.07■□□□□ 0.64
USP46-AS1-201ENST00000503051 HENMT1Q5T8I9 393 aaKnown RBP19.07■□□□□ 0.64
USP46-AS1-201ENST00000503051 ALS2CLQ60I27 953 aa19.07■□□□□ 0.64
USP46-AS1-201ENST00000503051 FOXR1Q6PIV2 292 aa19.07■□□□□ 0.64
USP46-AS1-201ENST00000503051 TRIM74Q86UV6 250 aa19.07■□□□□ 0.64
USP46-AS1-201ENST00000503051 NLRP8Q86W28 1048 aa19.07■□□□□ 0.64
USP46-AS1-201ENST00000503051 CCNJLQ8IV13 435 aa19.07■□□□□ 0.64
USP46-AS1-201ENST00000503051 GPR156Q8NFN8 814 aa19.07■□□□□ 0.64
USP46-AS1-201ENST00000503051 SNIP1Q8TAD8 396 aaKnown RBP19.07■□□□□ 0.64
USP46-AS1-201ENST00000503051 BLOC1S5Q8TDH9 187 aa19.07■□□□□ 0.64
USP46-AS1-201ENST00000503051 FGF11Q92914 225 aa19.07■□□□□ 0.64
USP46-AS1-201ENST00000503051 ATXN7L3BQ96GX2 97 aa19.07■□□□□ 0.64
USP46-AS1-201ENST00000503051 HIC2Q96JB3 615 aa19.07■□□□□ 0.64
USP46-AS1-201ENST00000503051 OR2M4Q96R27 311 aa19.07■□□□□ 0.64
USP46-AS1-201ENST00000503051 APOL2Q9BQE5 337 aa19.07■□□□□ 0.64
USP46-AS1-201ENST00000503051 FAM83DQ9H4H8 585 aa19.07■□□□□ 0.64
USP46-AS1-201ENST00000503051 TRNAU1APQ9NX07 287 aaKnown RBP19.07■□□□□ 0.64
USP46-AS1-201ENST00000503051 ENTPD2Q9Y5L3 495 aa19.07■□□□□ 0.64
USP46-AS1-201ENST00000503051 DMXL2Q8TDJ6 3036 aa19.07■□□□□ 0.64
USP46-AS1-201ENST00000503051 CFAP47Q6ZTR5 3102 aa19.07■□□□□ 0.64
USP46-AS1-201ENST00000503051 A0A087WV48 116 aa19.06■□□□□ 0.64
USP46-AS1-201ENST00000503051 METTL18O95568 372 aa19.06■□□□□ 0.64
USP46-AS1-201ENST00000503051 IFNB1P01574 187 aa19.06■□□□□ 0.64
USP46-AS1-201ENST00000503051 IVLP07476 585 aa19.06■□□□□ 0.64
USP46-AS1-201ENST00000503051 LSSP48449 732 aa19.06■□□□□ 0.64
USP46-AS1-201ENST00000503051 POLD2P49005 469 aa19.06■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 31 ms