RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000497675.2

FAAP20-214, Transcript of FA core complex associated protein 20, humanhuman

TSL 2

Gene FAAP20, Length 4,478 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAAP20-214ENST00000497675 CA9Q16790 459 aa14.61□□□□□ -0.07
FAAP20-214ENST00000497675 SNX30Q5VWJ9 437 aa14.61□□□□□ -0.07
FAAP20-214ENST00000497675 CREG2Q8IUH2 290 aa14.61□□□□□ -0.07
FAAP20-214ENST00000497675 ZNF248Q8NDW4 579 aa14.61□□□□□ -0.07
FAAP20-214ENST00000497675 CCDC90BQ9GZT6 254 aa14.61□□□□□ -0.07
FAAP20-214ENST00000497675 RPL26L1Q9UNX3 145 aaKnown RBP14.61□□□□□ -0.07
FAAP20-214ENST00000497675 H0Y3Z8 333 aa14.6□□□□□ -0.07
FAAP20-214ENST00000497675 TSPAN6O43657 245 aa14.6□□□□□ -0.07
FAAP20-214ENST00000497675 KDELR3O43731 214 aa14.6□□□□□ -0.07
FAAP20-214ENST00000497675 IPO13O94829 963 aaKnown RBP14.6□□□□□ -0.07
FAAP20-214ENST00000497675 MASP1P48740 699 aa14.6□□□□□ -0.07
FAAP20-214ENST00000497675 SERINC3Q13530 473 aa14.6□□□□□ -0.07
FAAP20-214ENST00000497675 RASA2Q15283 850 aa14.6□□□□□ -0.07
FAAP20-214ENST00000497675 SH3PXD2AQ5TCZ1 1133 aa14.6□□□□□ -0.07
FAAP20-214ENST00000497675 GPRIN3Q6ZVF9 776 aa14.6□□□□□ -0.07
FAAP20-214ENST00000497675 SUN3Q8TAQ9 357 aa14.6□□□□□ -0.07
FAAP20-214ENST00000497675 TCP10LQ8TDR4 215 aa14.6□□□□□ -0.07
FAAP20-214ENST00000497675 SIX2Q9NPC8 291 aa14.6□□□□□ -0.07
FAAP20-214ENST00000497675 CORO1CQ9ULV4 474 aaPredicted RBP14.6□□□□□ -0.07
FAAP20-214ENST00000497675 SLC7A4O43246 635 aa14.6□□□□□ -0.07
FAAP20-214ENST00000497675 ITGA2BP08514 1039 aa14.6□□□□□ -0.07
FAAP20-214ENST00000497675 BGNP21810 368 aa14.6□□□□□ -0.07
FAAP20-214ENST00000497675 CTSOP43234 321 aaPredicted RBP14.6□□□□□ -0.07
FAAP20-214ENST00000497675 CYP4F2P78329 520 aa14.6□□□□□ -0.07
FAAP20-214ENST00000497675 SMYD5Q6GMV2 418 aa14.6□□□□□ -0.07
FAAP20-214ENST00000497675 SPPL3Q8TCT6 385 aa14.6□□□□□ -0.07
FAAP20-214ENST00000497675 KCTD4Q8WVF5 259 aa14.6□□□□□ -0.07
FAAP20-214ENST00000497675 GPR21Q99679 349 aa14.6□□□□□ -0.07
FAAP20-214ENST00000497675 PTPRHQ9HD43 1115 aa14.6□□□□□ -0.07
FAAP20-214ENST00000497675 CHRAC1Q9NRG0 131 aa14.6□□□□□ -0.07
FAAP20-214ENST00000497675 GSTM1P09488 218 aa14.6□□□□□ -0.07
FAAP20-214ENST00000497675 ITPKAP23677 461 aa14.6□□□□□ -0.07
FAAP20-214ENST00000497675 DPP6P42658 865 aa14.6□□□□□ -0.07
FAAP20-214ENST00000497675 NUDT2P50583 147 aa14.6□□□□□ -0.07
FAAP20-214ENST00000497675 LMAN2Q12907 356 aa14.6□□□□□ -0.07
FAAP20-214ENST00000497675 ZNF662Q6ZS27 426 aa14.6□□□□□ -0.07
FAAP20-214ENST00000497675 PRSS58Q8IYP2 241 aa14.6□□□□□ -0.07
FAAP20-214ENST00000497675 CDYL2Q8N8U2 506 aa14.6□□□□□ -0.07
FAAP20-214ENST00000497675 ZNF641Q96N77 438 aaPredicted RBP14.6□□□□□ -0.07
FAAP20-214ENST00000497675 CNPPD1Q9BV87 410 aa14.6□□□□□ -0.07
FAAP20-214ENST00000497675 AK5Q9Y6K8 562 aa14.6□□□□□ -0.07
FAAP20-214ENST00000497675 PIGNO95427 931 aa14.6□□□□□ -0.07
FAAP20-214ENST00000497675 TFE3P19532 575 aaPredicted RBP14.6□□□□□ -0.07
FAAP20-214ENST00000497675 BUD31P41223 144 aaPredicted RBP14.6□□□□□ -0.07
FAAP20-214ENST00000497675 AQP5P55064 265 aa14.6□□□□□ -0.07
FAAP20-214ENST00000497675 R3HCC1LQ7Z5L2 792 aaKnown RBP14.6□□□□□ -0.07
FAAP20-214ENST00000497675 ICA1LQ8NDH6 482 aa14.6□□□□□ -0.07
FAAP20-214ENST00000497675 PLEKHO2Q8TD55 490 aa14.6□□□□□ -0.07
FAAP20-214ENST00000497675 UBE2ZQ9H832 354 aaPredicted RBP14.6□□□□□ -0.07
FAAP20-214ENST00000497675 L2HGDHQ9H9P8 463 aa14.6□□□□□ -0.07
FAAP20-214ENST00000497675 THAP1Q9NVV9 213 aa14.6□□□□□ -0.07
FAAP20-214ENST00000497675 E9PBE3 544 aa14.59□□□□□ -0.07
FAAP20-214ENST00000497675 KLHL41O60662 606 aa14.59□□□□□ -0.07
FAAP20-214ENST00000497675 APBB3O95704 486 aa14.59□□□□□ -0.07
FAAP20-214ENST00000497675 PIM1P11309 404 aaPredicted RBP14.59□□□□□ -0.07
FAAP20-214ENST00000497675 SERPINB5P36952 375 aa14.59□□□□□ -0.07
FAAP20-214ENST00000497675 HSD17B2P37059 387 aa14.59□□□□□ -0.07
FAAP20-214ENST00000497675 SRSF11Q05519 484 aaKnown RBP14.59□□□□□ -0.07
FAAP20-214ENST00000497675 CHRNB3Q05901 458 aa14.59□□□□□ -0.07
FAAP20-214ENST00000497675 SLC8B1Q6J4K2 584 aa14.59□□□□□ -0.07
FAAP20-214ENST00000497675 SLC9B2Q86UD5 537 aa14.59□□□□□ -0.07
FAAP20-214ENST00000497675 NIPA2Q8N8Q9 360 aa14.59□□□□□ -0.07
FAAP20-214ENST00000497675 ATG10Q9H0Y0 220 aa14.59□□□□□ -0.07
FAAP20-214ENST00000497675 FAM237BA0A1B0GVD1 139 aa14.59□□□□□ -0.07
FAAP20-214ENST00000497675 SRPRAP08240 638 aaKnown RBP14.59□□□□□ -0.07
FAAP20-214ENST00000497675 AVPR1BP47901 424 aa14.59□□□□□ -0.07
FAAP20-214ENST00000497675 CLCNKAP51800 687 aa14.59□□□□□ -0.07
FAAP20-214ENST00000497675 PPIDQ08752 370 aaKnown RBP14.59□□□□□ -0.07
FAAP20-214ENST00000497675 ZNF805Q5CZA5 627 aa14.59□□□□□ -0.07
FAAP20-214ENST00000497675 DNAJC14Q6Y2X3 702 aaPredicted RBP14.59□□□□□ -0.07
FAAP20-214ENST00000497675 CENPLQ8N0S6 344 aaPredicted RBP14.59□□□□□ -0.07
FAAP20-214ENST00000497675 MIER2Q8N344 545 aa14.59□□□□□ -0.07
FAAP20-214ENST00000497675 TMEM132CQ8N3T6 1108 aa14.59□□□□□ -0.07
FAAP20-214ENST00000497675 MAFAQ8NHW3 353 aaPredicted RBP14.59□□□□□ -0.07
FAAP20-214ENST00000497675 ARHGEF3Q9NR81 526 aa14.59□□□□□ -0.07
FAAP20-214ENST00000497675 TMEM248Q9NWD8 314 aa14.59□□□□□ -0.07
FAAP20-214ENST00000497675 SCML1Q9UN30 329 aa14.59□□□□□ -0.07
FAAP20-214ENST00000497675 C16orf96A6NNT2 1141 aa14.59□□□□□ -0.07
FAAP20-214ENST00000497675 LBPP18428 481 aa14.59□□□□□ -0.07
FAAP20-214ENST00000497675 PBX1P40424 430 aa14.59□□□□□ -0.07
FAAP20-214ENST00000497675 SLC1A6P48664 564 aa14.59□□□□□ -0.07
FAAP20-214ENST00000497675 MIPOL1Q8TD10 442 aa14.59□□□□□ -0.07
FAAP20-214ENST00000497675 C1orf74Q96LT6 269 aa14.59□□□□□ -0.07
FAAP20-214ENST00000497675 AARSD1Q9BTE6 412 aaKnown RBP14.59□□□□□ -0.07
FAAP20-214ENST00000497675 PRRG4Q9BZD6 226 aa14.59□□□□□ -0.07
FAAP20-214ENST00000497675 RXFP1Q9HBX9 757 aa14.59□□□□□ -0.07
FAAP20-214ENST00000497675 HCFC1R1Q9NWW0 138 aa14.59□□□□□ -0.07
FAAP20-214ENST00000497675 POLR1DQ9Y2S0 133 aa14.59□□□□□ -0.07
FAAP20-214ENST00000497675 STON1Q9Y6Q2 735 aa14.59□□□□□ -0.07
FAAP20-214ENST00000497675 V9GYQ6 96 aa14.59□□□□□ -0.07
FAAP20-214ENST00000497675 TRIOBPQ9H2D6 2365 aa14.59□□□□□ -0.07
FAAP20-214ENST00000497675 A0A1W2PQU0 124 aa14.58□□□□□ -0.07
FAAP20-214ENST00000497675 C2orf71A6NGG8 1288 aa14.58□□□□□ -0.07
FAAP20-214ENST00000497675 KMOO15229 486 aa14.58□□□□□ -0.07
FAAP20-214ENST00000497675 CNTN5O94779 1100 aa14.58□□□□□ -0.07
FAAP20-214ENST00000497675 PROZP22891 400 aa14.58□□□□□ -0.07
FAAP20-214ENST00000497675 DRG2P55039 364 aaKnown RBP14.58□□□□□ -0.07
FAAP20-214ENST00000497675 HNRNPKP61978 463 aaKnown RBP eCLIP14.58□□□□□ -0.076e-12■■■■□ 21.4
FAAP20-214ENST00000497675 HNRNPLLQ8WVV9 542 aaKnown RBP14.58□□□□□ -0.07
FAAP20-214ENST00000497675 POLR3BQ9NW08 1133 aaPredicted RBP14.58□□□□□ -0.07
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 27.3 ms