RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000497230.2

PRRX1-207, Transcript of paired related homeobox 1, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene PRRX1, Length 3,501 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRRX1-207ENST00000497230 VPS4AQ9UN37 437 aa11.91□□□□□ -0.5
PRRX1-207ENST00000497230 CNTN6Q9UQ52 1028 aa11.91□□□□□ -0.5
PRRX1-207ENST00000497230 ZNF99A8MXY4 864 aaPredicted RBP11.91□□□□□ -0.5
PRRX1-207ENST00000497230 ACKR2O00590 384 aa11.91□□□□□ -0.5
PRRX1-207ENST00000497230 MSCO60682 206 aa11.91□□□□□ -0.5
PRRX1-207ENST00000497230 C8BP07358 591 aa11.91□□□□□ -0.5
PRRX1-207ENST00000497230 CCT8P50990 548 aa11.91□□□□□ -0.5
PRRX1-207ENST00000497230 TKTL1P51854 596 aa11.91□□□□□ -0.5
PRRX1-207ENST00000497230 RAB15P59190 212 aa11.91□□□□□ -0.5
PRRX1-207ENST00000497230 TP53BP2Q13625 1128 aa11.91□□□□□ -0.5
PRRX1-207ENST00000497230 DAG1Q14118 895 aa11.91□□□□□ -0.5
PRRX1-207ENST00000497230 NDUFA5Q16718 116 aa11.91□□□□□ -0.5
PRRX1-207ENST00000497230 FAM117BQ6P1L5 589 aa11.91□□□□□ -0.5
PRRX1-207ENST00000497230 LCLAT1Q6UWP7 414 aa11.91□□□□□ -0.5
PRRX1-207ENST00000497230 PLEKHG7Q6ZR37 379 aa11.91□□□□□ -0.5
PRRX1-207ENST00000497230 CLYBLQ8N0X4 340 aa11.91□□□□□ -0.5
PRRX1-207ENST00000497230 FEM1CQ96JP0 617 aa11.91□□□□□ -0.5
PRRX1-207ENST00000497230 TSEN34Q9BSV6 310 aaKnown RBP11.91□□□□□ -0.5
PRRX1-207ENST00000497230 KATNAL1Q9BW62 490 aa11.91□□□□□ -0.5
PRRX1-207ENST00000497230 CD320Q9NPF0 282 aa11.91□□□□□ -0.5
PRRX1-207ENST00000497230 COMMD8Q9NX08 183 aa11.91□□□□□ -0.5
PRRX1-207ENST00000497230 ADGRE2Q9UHX3 823 aa11.91□□□□□ -0.5
PRRX1-207ENST00000497230 IPO11Q9UI26 975 aaKnown RBP11.91□□□□□ -0.5
PRRX1-207ENST00000497230 IPPQ9Y573 584 aa11.91□□□□□ -0.5
PRRX1-207ENST00000497230 PCDHGA8Q9Y5G5 932 aa11.91□□□□□ -0.5
PRRX1-207ENST00000497230 KIF13BQ9NQT8 1826 aa11.91□□□□□ -0.5
PRRX1-207ENST00000497230 NUP205Q92621 2012 aa11.91□□□□□ -0.5
PRRX1-207ENST00000497230 SULT1C4O75897 302 aa11.91□□□□□ -0.5
PRRX1-207ENST00000497230 RHOBTB1O94844 696 aa11.91□□□□□ -0.5
PRRX1-207ENST00000497230 CD36P16671 472 aa11.91□□□□□ -0.5
PRRX1-207ENST00000497230 TMBIM6P55061 237 aa11.91□□□□□ -0.5
PRRX1-207ENST00000497230 OR4D2P58180 307 aa11.91□□□□□ -0.5
PRRX1-207ENST00000497230 UFM1P61960 85 aa11.91□□□□□ -0.5
PRRX1-207ENST00000497230 ILF2Q12905 390 aaKnown RBP11.91□□□□□ -0.5
PRRX1-207ENST00000497230 NPTX1Q15818 432 aa11.91□□□□□ -0.5
PRRX1-207ENST00000497230 SMUG1Q53HV7 270 aa11.91□□□□□ -0.5
PRRX1-207ENST00000497230 NOL9Q5SY16 702 aaKnown RBP11.91□□□□□ -0.5
PRRX1-207ENST00000497230 ILDR2Q71H61 639 aa11.91□□□□□ -0.5
PRRX1-207ENST00000497230 TRIM48Q8IWZ4 208 aa11.91□□□□□ -0.5
PRRX1-207ENST00000497230 OR10A6Q8NH74 314 aa11.91□□□□□ -0.5
PRRX1-207ENST00000497230 UTP15Q8TED0 518 aaKnown RBP11.91□□□□□ -0.5
PRRX1-207ENST00000497230 FRS2Q8WU20 508 aa11.91□□□□□ -0.5
PRRX1-207ENST00000497230 TANKQ92844 425 aa11.91□□□□□ -0.5
PRRX1-207ENST00000497230 CDK15Q96Q40 435 aa11.91□□□□□ -0.5
PRRX1-207ENST00000497230 DNAI2Q9GZS0 605 aa11.91□□□□□ -0.5
PRRX1-207ENST00000497230 NT5MQ9NPB1 228 aa11.91□□□□□ -0.5
PRRX1-207ENST00000497230 TCRBV3S1A0A5B6 114 aa11.9□□□□□ -0.5
PRRX1-207ENST00000497230 FFAR3O14843 346 aa11.9□□□□□ -0.5
PRRX1-207ENST00000497230 MDM4O15151 490 aa11.9□□□□□ -0.5
PRRX1-207ENST00000497230 GPR42O15529 346 aa11.9□□□□□ -0.5
PRRX1-207ENST00000497230 MED26O95402 600 aa11.9□□□□□ -0.5
PRRX1-207ENST00000497230 USP17L7P0C7H9 530 aa11.9□□□□□ -0.5
PRRX1-207ENST00000497230 BMP4P12644 408 aa11.9□□□□□ -0.5
PRRX1-207ENST00000497230 UBA1P22314 1058 aaKnown RBP11.9□□□□□ -0.5
PRRX1-207ENST00000497230 CCR1P32246 355 aa11.9□□□□□ -0.5
PRRX1-207ENST00000497230 IFNA8P32881 189 aa11.9□□□□□ -0.5
PRRX1-207ENST00000497230 ARL2P36404 184 aa11.9□□□□□ -0.5
PRRX1-207ENST00000497230 DGKEP52429 567 aa11.9□□□□□ -0.5
PRRX1-207ENST00000497230 BNIP2Q12982 314 aa11.9□□□□□ -0.5
PRRX1-207ENST00000497230 SELENBP1Q13228 472 aa11.9□□□□□ -0.5
PRRX1-207ENST00000497230 CYBRD1Q53TN4 286 aa11.9□□□□□ -0.5
PRRX1-207ENST00000497230 LINC00523Q86TU6 105 aa11.9□□□□□ -0.5
PRRX1-207ENST00000497230 SPARTQ8N0X7 666 aa11.9□□□□□ -0.5
PRRX1-207ENST00000497230 CPSF7Q8N684 471 aaKnown RBP11.9□□□□□ -0.5
PRRX1-207ENST00000497230 NECTIN4Q96NY8 510 aa11.9□□□□□ -0.5
PRRX1-207ENST00000497230 CDK5RAP1Q96SZ6 601 aaKnown RBP11.9□□□□□ -0.5
PRRX1-207ENST00000497230 ZBTB18Q99592 522 aa11.9□□□□□ -0.5
PRRX1-207ENST00000497230 SMAD5Q99717 465 aaKnown RBP11.9□□□□□ -0.5
PRRX1-207ENST00000497230 HOPXQ9BPY8 73 aaPredicted RBP11.9□□□□□ -0.5
PRRX1-207ENST00000497230 HGH1Q9BTY7 390 aa11.9□□□□□ -0.5
PRRX1-207ENST00000497230 ZC4H2Q9NQZ6 224 aa11.9□□□□□ -0.5
PRRX1-207ENST00000497230 MTMR10Q9NXD2 777 aa11.9□□□□□ -0.5
PRRX1-207ENST00000497230 PAQR5Q9NXK6 330 aaPredicted RBP11.9□□□□□ -0.5
PRRX1-207ENST00000497230 CACNG4Q9UBN1 327 aa11.9□□□□□ -0.5
PRRX1-207ENST00000497230 CNOT11Q9UKZ1 510 aaKnown RBP11.9□□□□□ -0.5
PRRX1-207ENST00000497230 ZCWPW2A0A1B0GU75 182 aa11.9□□□□□ -0.5
PRRX1-207ENST00000497230 PNMA8CA0A1B0GUJ8 204 aa11.9□□□□□ -0.5
PRRX1-207ENST00000497230 ARHGEF9O43307 516 aa11.9□□□□□ -0.5
PRRX1-207ENST00000497230 CPNE3O75131 537 aaKnown RBP11.9□□□□□ -0.5
PRRX1-207ENST00000497230 IL18RAPO95256 599 aa11.9□□□□□ -0.5
PRRX1-207ENST00000497230 ATG7O95352 703 aa11.9□□□□□ -0.5
PRRX1-207ENST00000497230 CYBBP04839 570 aa11.9□□□□□ -0.5
PRRX1-207ENST00000497230 PIM1P11309 404 aaPredicted RBP11.9□□□□□ -0.5
PRRX1-207ENST00000497230 POU1F1P28069 291 aa11.9□□□□□ -0.5
PRRX1-207ENST00000497230 HOXA10P31260 410 aaPredicted RBP11.9□□□□□ -0.5
PRRX1-207ENST00000497230 INPP1P49441 399 aa11.9□□□□□ -0.5
PRRX1-207ENST00000497230 YBX1P67809 324 aaKnown RBP11.9□□□□□ -0.5
PRRX1-207ENST00000497230 AQP6Q13520 282 aa11.9□□□□□ -0.5
PRRX1-207ENST00000497230 PTPRCAPQ14761 206 aa11.9□□□□□ -0.5
PRRX1-207ENST00000497230 C6orf141Q5SZD1 244 aa11.9□□□□□ -0.5
PRRX1-207ENST00000497230 BTBD8Q5XKL5 378 aa11.9□□□□□ -0.5
PRRX1-207ENST00000497230 DESI1Q6ICB0 168 aa11.9□□□□□ -0.5
PRRX1-207ENST00000497230 CCBE1Q6UXH8 406 aaPredicted RBP11.9□□□□□ -0.5
PRRX1-207ENST00000497230 GADL1Q6ZQY3 521 aa11.9□□□□□ -0.5
PRRX1-207ENST00000497230 ADGRG5Q8IZF4 528 aa11.9□□□□□ -0.5
PRRX1-207ENST00000497230 EID3Q8N140 333 aa11.9□□□□□ -0.5
PRRX1-207ENST00000497230 FLCNQ8NFG4 579 aa11.9□□□□□ -0.5
PRRX1-207ENST00000497230 MTFMTQ96DP5 389 aaKnown RBP11.9□□□□□ -0.5
PRRX1-207ENST00000497230 ITPKCQ96DU7 683 aa11.9□□□□□ -0.5
PRRX1-207ENST00000497230 ZNF486Q96H40 463 aaPredicted RBP11.9□□□□□ -0.5
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 19.2 ms