RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000489247.1

ATG4A-208, Transcript of autophagy related 4A cysteine peptidase, human

TSL 2

Gene ATG4A, Length 623 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
ATG4A-208	ENST00000489247	CPXM2	Q8N436	756 aa		5.57	□□□□□ -1.52
ATG4A-208	ENST00000489247	ARHGEF39	Q8N4T4	335 aa		5.57	□□□□□ -1.52
ATG4A-208	ENST00000489247	FIBCD1	Q8N539	461 aa		5.57	□□□□□ -1.52
ATG4A-208	ENST00000489247	DCLK2	Q8N568	766 aa		5.57	□□□□□ -1.52
ATG4A-208	ENST00000489247	IPMK	Q8NFU5	416 aa		5.57	□□□□□ -1.52
ATG4A-208	ENST00000489247	GPR150	Q8NGU9	434 aa		5.57	□□□□□ -1.52
ATG4A-208	ENST00000489247	RDH11	Q8TC12	318 aa		5.57	□□□□□ -1.52
ATG4A-208	ENST00000489247	CALML6	Q8TD86	181 aa		5.57	□□□□□ -1.52
ATG4A-208	ENST00000489247	USP33	Q8TEY7	942 aa		5.57	□□□□□ -1.52
ATG4A-208	ENST00000489247	ATP2A3	Q93084	1043 aa		5.57	□□□□□ -1.52
ATG4A-208	ENST00000489247	ALG14	Q96F25	216 aa		5.57	□□□□□ -1.52
ATG4A-208	ENST00000489247	TCTN2	Q96GX1	697 aa		5.57	□□□□□ -1.52
ATG4A-208	ENST00000489247	VPS39	Q96JC1	886 aa		5.57	□□□□□ -1.52
ATG4A-208	ENST00000489247	EXOC2	Q96KP1	924 aa		5.57	□□□□□ -1.52
ATG4A-208	ENST00000489247	MRGPRX3	Q96LB0	322 aa		5.57	□□□□□ -1.52
ATG4A-208	ENST00000489247	ZNF512	Q96ME7	567 aa	Predicted RBP	5.57	□□□□□ -1.52
ATG4A-208	ENST00000489247	ALPK1	Q96QP1	1244 aa		5.57	□□□□□ -1.52
ATG4A-208	ENST00000489247	KLF6	Q99612	283 aa	Predicted RBP	5.57	□□□□□ -1.52
ATG4A-208	ENST00000489247	CDC6	Q99741	560 aa		5.57	□□□□□ -1.52
ATG4A-208	ENST00000489247	FAM167B	Q9BTA0	163 aa		5.57	□□□□□ -1.52
ATG4A-208	ENST00000489247	AARSD1	Q9BTE6	412 aa	Known RBP	5.57	□□□□□ -1.52
ATG4A-208	ENST00000489247	IQCG	Q9H095	443 aa	Known RBP	5.57	□□□□□ -1.52
ATG4A-208	ENST00000489247	MFSD1	Q9H3U5	465 aa		5.57	□□□□□ -1.52
ATG4A-208	ENST00000489247	STN1	Q9H668	368 aa	Known RBP	5.57	□□□□□ -1.52
ATG4A-208	ENST00000489247	ZNF334	Q9HCZ1	680 aa	Predicted RBP	5.57	□□□□□ -1.52
ATG4A-208	ENST00000489247	SLCO1B3	Q9NPD5	702 aa		5.57	□□□□□ -1.52
ATG4A-208	ENST00000489247	CHRAC1	Q9NRG0	131 aa		5.57	□□□□□ -1.52
ATG4A-208	ENST00000489247	SNX15	Q9NRS6	342 aa		5.57	□□□□□ -1.52
ATG4A-208	ENST00000489247	C20orf96	Q9NUD7	363 aa	Predicted RBP	5.57	□□□□□ -1.52
ATG4A-208	ENST00000489247	TXNDC16	Q9P2K2	825 aa		5.57	□□□□□ -1.52
ATG4A-208	ENST00000489247	AGO1	Q9UL18	857 aa	Known RBP	5.57	□□□□□ -1.52
ATG4A-208	ENST00000489247	CORO1C	Q9ULV4	474 aa	Predicted RBP	5.57	□□□□□ -1.52
ATG4A-208	ENST00000489247	ANKRD6	Q9Y2G4	727 aa		5.57	□□□□□ -1.52
ATG4A-208	ENST00000489247	ZNF510	Q9Y2H8	683 aa		5.57	□□□□□ -1.52
ATG4A-208	ENST00000489247	EMC9	Q9Y3B6	208 aa		5.57	□□□□□ -1.52
ATG4A-208	ENST00000489247	ZFP37	Q9Y6Q3	630 aa	Predicted RBP	5.57	□□□□□ -1.52
ATG4A-208	ENST00000489247	CEP350	Q5VT06	3117 aa		5.57	□□□□□ -1.52
ATG4A-208	ENST00000489247	DNAH12	Q6ZR08	3092 aa		5.56	□□□□□ -1.52
ATG4A-208	ENST00000489247	TRAV20	A0A0B4J274	112 aa		5.56	□□□□□ -1.52
ATG4A-208	ENST00000489247	CFAP73	A6NFT4	308 aa		5.56	□□□□□ -1.52
ATG4A-208	ENST00000489247	TARM1	B6A8C7	271 aa		5.56	□□□□□ -1.52
ATG4A-208	ENST00000489247	C5orf67	F2Z3F1	127 aa		5.56	□□□□□ -1.52
ATG4A-208	ENST00000489247		H0Y8X5	98 aa		5.56	□□□□□ -1.52
ATG4A-208	ENST00000489247	TRAFD1	O14545	582 aa	Predicted RBP	5.56	□□□□□ -1.52
ATG4A-208	ENST00000489247	MUSK	O15146	869 aa		5.56	□□□□□ -1.52
ATG4A-208	ENST00000489247	TGM5	O43548	720 aa		5.56	□□□□□ -1.52
ATG4A-208	ENST00000489247	LDB2	O43679	373 aa		5.56	□□□□□ -1.52
ATG4A-208	ENST00000489247	SIGLEC6	O43699	453 aa		5.56	□□□□□ -1.52
ATG4A-208	ENST00000489247	H2AFY	O75367	372 aa	Known RBP	5.56	□□□□□ -1.52
ATG4A-208	ENST00000489247	DCTN3	O75935	186 aa		5.56	□□□□□ -1.52
ATG4A-208	ENST00000489247	ATP5H	O75947	161 aa		5.56	□□□□□ -1.52
ATG4A-208	ENST00000489247	FGF19	O95750	216 aa		5.56	□□□□□ -1.52
ATG4A-208	ENST00000489247	NDST3	O95803	873 aa		5.56	□□□□□ -1.52
ATG4A-208	ENST00000489247	AHSG	P02765	367 aa		5.56	□□□□□ -1.52
ATG4A-208	ENST00000489247	SERPINE1	P05121	402 aa		5.56	□□□□□ -1.52
ATG4A-208	ENST00000489247	HMBS	P08397	361 aa		5.56	□□□□□ -1.52
ATG4A-208	ENST00000489247	CNP	P09543	421 aa	Known RBP	5.56	□□□□□ -1.52
ATG4A-208	ENST00000489247	DLD	P09622	509 aa	Known RBP	5.56	□□□□□ -1.52
ATG4A-208	ENST00000489247	TROVE2	P10155	538 aa	Known RBP eCLIP	5.56	□□□□□ -1.52
ATG4A-208	ENST00000489247	ALOX15	P16050	662 aa	Predicted RBP	5.56	□□□□□ -1.52
ATG4A-208	ENST00000489247	HOXB8	P17481	243 aa	Predicted RBP	5.56	□□□□□ -1.52
ATG4A-208	ENST00000489247	BGN	P21810	368 aa		5.56	□□□□□ -1.52
ATG4A-208	ENST00000489247	CD9	P21926	228 aa		5.56	□□□□□ -1.52
ATG4A-208	ENST00000489247	DDX6	P26196	483 aa	Known RBP eCLIP	5.56	□□□□□ -1.52
ATG4A-208	ENST00000489247	CRABP2	P29373	138 aa		5.56	□□□□□ -1.52
ATG4A-208	ENST00000489247	ALDH3A1	P30838	453 aa		5.56	□□□□□ -1.52
ATG4A-208	ENST00000489247	CORO1A	P31146	461 aa	Known RBP	5.56	□□□□□ -1.52
ATG4A-208	ENST00000489247	HOXA9	P31269	272 aa		5.56	□□□□□ -1.52
ATG4A-208	ENST00000489247	ELF1	P32519	619 aa		5.56	□□□□□ -1.52
ATG4A-208	ENST00000489247	ACVRL1	P37023	503 aa		5.56	□□□□□ -1.52
ATG4A-208	ENST00000489247	SLC26A3	P40879	764 aa		5.56	□□□□□ -1.52
ATG4A-208	ENST00000489247	CD86	P42081	329 aa		5.56	□□□□□ -1.52
ATG4A-208	ENST00000489247	CTSK	P43235	329 aa		5.56	□□□□□ -1.52
ATG4A-208	ENST00000489247	LEPR	P48357	1165 aa	Known RBP	5.56	□□□□□ -1.52
ATG4A-208	ENST00000489247	CSNK1D	P48730	415 aa		5.56	□□□□□ -1.52
ATG4A-208	ENST00000489247	CLCN5	P51795	746 aa		5.56	□□□□□ -1.52
ATG4A-208	ENST00000489247	HK2	P52789	917 aa		5.56	□□□□□ -1.52
ATG4A-208	ENST00000489247	PLK1	P53350	603 aa		5.56	□□□□□ -1.52
ATG4A-208	ENST00000489247	DSC2	Q02487	901 aa		5.56	□□□□□ -1.52
ATG4A-208	ENST00000489247	TEK	Q02763	1124 aa		5.56	□□□□□ -1.52
ATG4A-208	ENST00000489247	TWF1	Q12792	350 aa		5.56	□□□□□ -1.52
ATG4A-208	ENST00000489247	SIRPB2	Q5JXA9	342 aa		5.56	□□□□□ -1.52
ATG4A-208	ENST00000489247	MBLAC2	Q68D91	279 aa		5.56	□□□□□ -1.52
ATG4A-208	ENST00000489247	FSTL4	Q6MZW2	842 aa		5.56	□□□□□ -1.52
ATG4A-208	ENST00000489247	ESRP1	Q6NXG1	681 aa	Known RBP	5.56	□□□□□ -1.52
ATG4A-208	ENST00000489247	PSRC1	Q6PGN9	363 aa	Predicted RBP	5.56	□□□□□ -1.52
ATG4A-208	ENST00000489247	CES3	Q6UWW8	571 aa		5.56	□□□□□ -1.52
ATG4A-208	ENST00000489247	FAM47E	Q6ZV65	393 aa		5.56	□□□□□ -1.52
ATG4A-208	ENST00000489247	FITM2	Q8N6M3	262 aa		5.56	□□□□□ -1.52
ATG4A-208	ENST00000489247	CCDC63	Q8NA47	563 aa		5.56	□□□□□ -1.52
ATG4A-208	ENST00000489247	DCAF4L2	Q8NA75	395 aa		5.56	□□□□□ -1.52
ATG4A-208	ENST00000489247	HJURP	Q8NCD3	748 aa	Predicted RBP	5.56	□□□□□ -1.52
ATG4A-208	ENST00000489247	OR52K2	Q8NGK3	314 aa		5.56	□□□□□ -1.52
ATG4A-208	ENST00000489247	OR13J1	Q8NGT2	312 aa		5.56	□□□□□ -1.52
ATG4A-208	ENST00000489247	GABPB2	Q8TAK5	448 aa	Predicted RBP	5.56	□□□□□ -1.52
ATG4A-208	ENST00000489247	BRSK1	Q8TDC3	778 aa		5.56	□□□□□ -1.52
ATG4A-208	ENST00000489247	BTN2A2	Q8WVV5	523 aa		5.56	□□□□□ -1.52
ATG4A-208	ENST00000489247	PPM1E	Q8WY54	764 aa		5.56	□□□□□ -1.52
ATG4A-208	ENST00000489247	HERVK_113	Q902F9	699 aa		5.56	□□□□□ -1.52
ATG4A-208	ENST00000489247	E2F7	Q96AV8	911 aa		5.56	□□□□□ -1.52

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